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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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1721 | 2025-10-05 |
Synovial tissue atlas in juvenile idiopathic arthritis reveals pathogenic niches associated with disease severity
2025-Jul-02, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adt6050
PMID:40601776
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研究论文 | 本研究通过单细胞技术构建了幼年特发性关节炎滑膜组织图谱,揭示了与疾病严重程度相关的致病微环境 | 首次在初治JIA患儿中建立滑膜组织细胞图谱,识别了与关节炎严重程度相关的空间组织微环境和特定细胞群体 | 样本来自疾病早期初治患者,可能无法代表所有JIA亚型或疾病阶段 | 解析幼年特发性关节炎滑膜组织的细胞组成和空间结构,指导靶向治疗 | 幼年特发性关节炎患儿的滑膜组织活检样本、滑液和外周血 | 数字病理学 | 幼年特发性关节炎 | 单细胞RNA测序,多重免疫荧光,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,免疫荧光图像 | 初治JIA患儿的滑膜组织活检样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
1722 | 2025-10-05 |
Chikungunya virus persists in joint-associated macrophages and promotes chronic disease
2025-Jun-25, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6917990/v1
PMID:40678223
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组学技术发现基孔肯雅病毒在关节相关巨噬细胞中持续存在并促进慢性疾病 | 首次发现关节相关巨噬细胞中持续存在复制型病毒RNA,并揭示CD4 T细胞在关节炎症中的潜在作用 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类患者中验证 | 探究甲病毒引起慢性关节疾病的机制 | 甲病毒感染的小鼠关节相关组织 | 数字病理学 | 病毒性关节炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 甲病毒感染小鼠的关节组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
1723 | 2025-10-05 |
Comparative single cell analysis of transcriptional bursting reveals the role of genome organization on de novo transcript origination
2025-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.29.591771
PMID:38746255
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研究论文 | 通过比较单细胞分析研究转录爆发在精子发生过程中对新转录本起源的作用 | 开发新的统计程序识别198个核心基因,揭示基因组组织对转录爆发和新基因起源的影响机制 | 仅在三密切相关的物种中进行研究,时间跨度2500-3000万年 | 研究转录爆发在精子发生过程中对新转录本起源的调控机制 | 三种密切相关的物种的生殖细胞 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, RNA荧光原位杂交 | 统计模型 | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 三种物种的生殖细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1724 | 2025-10-05 |
NAD+ prevents chronic kidney disease by activating renal tubular metabolism
2025-Mar-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.181443
PMID:40059824
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研究论文 | 本研究揭示了NAD+补充通过激活肾小管代谢预防慢性肾脏病的机制 | 首次在Alport综合征小鼠模型中应用单核RNA测序和空间转录组学技术,并首次报道该模型中转录水平的性别差异 | 研究仅限于Alport综合征小鼠模型,人类临床相关性尚需验证 | 探究NAD+补充保护慢性肾脏病的分子机制和涉及的细胞类型 | Alport综合征小鼠模型和肾近端小管细胞 | 肾脏病学 | 慢性肾脏病 | RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学, 正交成像技术, 生化分析 | 小鼠疾病模型 | 转录组数据, 图像数据, 生化数据 | Alport综合征小鼠模型 | NA | bulk RNA-seq, 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
1725 | 2025-10-05 |
Metabolic stress and age drive inflammation and cognitive decline in mice and humans
2025-Mar, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.70060
PMID:40110679
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研究论文 | 本研究探讨代谢应激和年龄如何通过炎症机制导致小鼠和人类认知功能下降 | 首次结合小鼠高脂饮食模型与人类死后脑组织分析,揭示代谢应激通过小胶质细胞介导的炎症机制导致认知障碍,并识别SPP1作为潜在治疗靶点 | 研究主要基于动物模型和死后组织,难以完全模拟人类疾病进程;样本量有限 | 阐明代谢应激因素通过免疫系统失调和炎症机制导致认知障碍的病理机制 | 高脂饮食喂养的小鼠模型;阿尔茨海默病和2型糖尿病患者的死后脑组织与对照组 | 神经科学 | 阿尔茨海默病, 2型糖尿病 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 认知行为数据, 代谢数据 | 小鼠模型和人类死后脑组织样本(具体数量未明确说明) | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1726 | 2025-10-05 |
mTOR signaling regulates multiple metabolic pathways in human lung fibroblasts after TGF-β and in pulmonary fibrosis
2025-Feb-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00189.2024
PMID:39745695
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研究论文 | 本研究探讨mTOR信号通路在TGF-β处理后的人肺成纤维细胞及肺纤维化中调控多种代谢途径的作用机制 | 首次系统揭示mTOR和ATF4在肺成纤维细胞中调控氨基酸稳态、糖酵解和TCA循环代谢物的新机制,并通过单细胞RNA-seq数据验证这些代谢重编程在IPF患者肺中的存在 | 研究主要基于体外细胞模型,需要进一步体内实验验证;代谢调控机制的具体下游效应仍需深入探索 | 阐明mTOR信号通路在肺纤维化过程中调控成纤维细胞代谢重编程的分子机制 | 人肺成纤维细胞和特发性肺纤维化(IPF)患者肺组织 | 分子生物学 | 肺纤维化 | RNA测序, 代谢组学分析, 单细胞RNA-seq数据分析 | NA | 基因表达数据, 代谢物数据, 单细胞转录组数据 | 人肺成纤维细胞系及公开可用的IPF患者单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
1727 | 2025-10-05 |
Diethylhexyl phthalate induces immune dysregulation and is an environmental immune disruptor
2024-12-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136244
PMID:39442302
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯(DEHP)对小鼠免疫系统的破坏作用 | 首次在单细胞水平系统揭示DEHP通过抑制炎症信号和热休克蛋白表达导致免疫失调的机制 | 研究仅使用小鼠模型,未直接验证对人体免疫系统的影响 | 探究DEHP对环境免疫系统的破坏作用及其机制 | 小鼠脾脏组织和外周血免疫细胞 | 免疫毒理学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠脾脏组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1728 | 2025-10-05 |
Pulmonary surfactant biogenesis blockage mediated polyhexamethylene guanidine disinfectant induced pulmonary fibrosis
2024-12-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136307
PMID:39488979
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研究论文 | 本研究揭示了聚六亚甲基胍消毒剂通过阻断肺表面活性物质生物合成诱发肺纤维化的机制 | 首次发现PHMG通过破坏自噬流导致AT2细胞内肺表面活性物质生物合成受阻的机制 | NA | 探究PHMG消毒剂吸入暴露诱发肺纤维化的时间效应和分子机制 | 肺泡II型上皮细胞(AT2细胞) | 毒理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1729 | 2025-10-05 |
TCGAimmunosurv: An R package to identify genes associated with patient survival and immune cell state transitions using TCGA and single-cell RNA-seq data
2025-Dec, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 开发了一个名为TCGAimmunosurv的R软件包,用于整合TCGA大块RNA-seq数据和单细胞RNA-seq数据,识别与患者生存和免疫细胞状态转换相关的基因 | 开发了首个整合大块RNA-seq和单细胞RNA-seq数据的泛癌分析工具,能够进行突变特异性免疫动态分析 | 依赖于用户提供的单细胞数据集,分析结果可能受数据质量影响 | 识别与癌症患者生存和免疫细胞状态转换相关的驱动基因 | 癌症基因组数据和免疫细胞数据 | 生物信息学 | 癌症 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 伪时间轨迹分析 | 基因表达数据 | TCGA数据库中的泛癌样本 | NA | 大块RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1730 | 2025-10-05 |
Crustacean cardioactive peptide (CCAP) negatively regulates sand-diving behaviour in kuruma shrimp, Penaeus japonicus
2025 Oct-Dec, Comparative biochemistry and physiology. Part B, Biochemistry & molecular biology
DOI:10.1016/j.cbpb.2025.111143
PMID:40812679
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研究论文 | 本研究通过基因操作探究了甲壳动物心活肽对日本对虾潜沙行为的调控作用 | 首次在甲壳动物中证实CCAP基因对潜沙行为的负向调控作用,并揭示其对生理节律的潜在影响 | 未阐明CCAP调控行为的具体分子通路,观察时间较短(12小时内) | 探究甲壳动物心活肽(CCAP)在日本对虾潜沙行为中的遗传调控机制 | 日本对虾(Penaeus japonicus) | 分子生物学 | NA | cDNA克隆、RT-qPCR、原位杂交、RNA干扰、基因过表达 | NA | 基因表达数据、行为观察数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞转录组测序(前期研究提及) | NA | NA |
1731 | 2025-10-05 |
Reactive Oxygen Species-Responsive Hydrogel Microspheres Loaded with Epigallocatechin Gallate for Effective Osteoarthritis Therapy
2025-Sep-08, ACS biomaterials science & engineering
IF:5.4Q2
DOI:10.1021/acsbiomaterials.5c00564
PMID:40813306
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研究论文 | 开发了一种活性氧响应的水凝胶微球系统用于靶向递送表没食子儿茶素没食子酸酯治疗骨关节炎 | 首次构建WYRGRL肽修饰的ROS响应型水凝胶微球递送系统,并通过单细胞转录组学和代谢组学联合分析揭示了Tomm70基因在治疗机制中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证 | 开发智能递送系统治疗骨关节炎 | 软骨细胞和OA小鼠模型 | 生物医学工程 | 骨关节炎 | 单细胞转录组学, 代谢组学 | NA | 基因表达数据, 代谢物数据 | OA小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1732 | 2025-10-05 |
Benchmarking Ploidy Estimation Methods for Bulk and Single-Cell Whole Genome Sequencing
2025-Sep-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202507839
PMID:40916931
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研究论文 | 对11种批量WGS和8种单细胞WGS倍性估计方法进行系统性性能评估 | 首次系统比较批量与单细胞全基因组测序的倍性估计工具性能 | 现有工具在整倍体样本或长读长测序数据上表现不佳 | 评估不同计算方法在基因组倍性估计中的准确性和适用性 | 二倍体细胞与异倍体或多倍体细胞的混合样本 | 生物信息学 | 癌症 | 全基因组测序 | NA | 基因组测序数据 | 实验和模拟数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
1733 | 2025-10-05 |
IGHA1 and IGHG1 Expression Panel Predicts Anti-PD-L1 Response in Muscle-Invasive Bladder Cancer
2025-Sep-08, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.70033
PMID:40919684
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组分析,发现IGHA1和IGHG1表达模式可预测肌层浸润性膀胱癌对PD-L1抑制剂的治疗反应 | 首次结合单细胞测序和空间转录组技术揭示三级淋巴结构中B细胞克隆与免疫治疗反应的关系,并建立IGHA1/IGHG1预测模型 | 样本量相对有限,单细胞测序仅9个样本,空间转录组仅5个样本 | 探究肌层浸润性膀胱癌中三级淋巴结构与免疫球蛋白库的关系及其对免疫治疗反应的预测价值 | 肌层浸润性膀胱癌患者 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序, 空间转录组 | 表达特征预测模型 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 临床数据 | 单细胞测序9例(5例来自本中心,4例来自PRJNA662018),空间转录组5例(1例来自本中心,4例来自GSE169379),TCGA数据库405例,IMvigor210试验348例 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | NA | NA |
1734 | 2025-09-09 |
Comments on "tracking adipose-derived stem cell exosomes applied in a mouse crush injury model: insights from fluorescent labeling and spatial transcriptomics - an experimental study"
2025-Sep-08, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003382
PMID:40919925
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1735 | 2025-10-05 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Potential Mechanism of RUNX3 Reshaping Tumor Microenvironment in Non-small-cell Lung Cancer
2025-Sep-07, Annals of surgical oncology
IF:3.4Q1
DOI:10.1245/s10434-025-18034-w
PMID:40916017
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示RUNX3在非小细胞肺癌中重塑肿瘤微环境的潜在机制 | 首次在单细胞水平上分析RUNX3表达状态对非小细胞肺癌肿瘤微环境的影响 | 样本量较小(仅7例患者),需要更大规模研究验证 | 探索RUNX3在非小细胞肺癌中调控肿瘤微环境的具体生物学机制 | 非小细胞肺癌患者的癌组织和癌旁组织 | 单细胞测序分析 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学染色 | Seurat分析流程 | 单细胞转录组数据 | 7例非小细胞肺癌患者,包含3对癌和癌旁组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1736 | 2025-10-05 |
Cutting-edge technologies in neural regeneration
2025-Sep-05, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-025-00260-y
PMID:40911279
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综述 | 本文综述了推动神经再生领域发展的前沿技术及其应用前景 | 系统整合了光遗传学、化学遗传学、3D培养模型、基因编辑、单细胞测序和3D成像等多项前沿技术,并展望了人工智能、高通量体内筛选和脑机接口技术的未来潜力 | 作为综述文章,未涉及具体实验数据和原始研究发现 | 探讨神经再生领域的最新技术进展和治疗策略开发 | 中枢神经系统损伤和神经功能障碍 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 光遗传学、化学遗传学、3D培养、基因编辑、单细胞测序、3D成像、人工智能、高通量筛选、脑机接口 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
1737 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomic atlas of human retina from Chinese donors reveals population-specific cellular diversity
2025-Sep-04, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110623
PMID:40914339
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研究论文 | 构建了中国供体人视网膜首个单细胞转录组图谱,揭示了人群特异性的细胞多样性 | 首次构建中国人群视网膜单细胞转录组图谱,填补了亚洲人群视网膜转录组数据的空白 | 样本量相对有限(18个视网膜标本),仅针对中国人群 | 建立中国人群特异性视网膜单细胞转录组参考图谱 | 人视网膜细胞 | 单细胞转录组学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 约290,000个活细胞,来自18个新鲜视网膜标本(活体供体和死后标本) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 高通量单细胞RNA测序 |
1738 | 2025-10-05 |
Integrated machine learning-based RNA sequencing and single-cell analysis reveal RNA methylation regulation patterns in the immune microenvironment of Alzheimer's disease
2025-Sep-03, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01650
PMID:40903964
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研究论文 | 本研究通过整合机器学习、RNA测序和单细胞分析,揭示了阿尔茨海默病免疫微环境中RNA甲基化的调控模式 | 首次将机器学习与单细胞RNA测序相结合,系统分析阿尔茨海默病中RNA甲基化对免疫微环境的调控作用,并建立了风险预测模型 | 研究主要基于体外实验和生物信息学分析,需要进一步的体内实验验证 | 探索RNA甲基化在阿尔茨海默病免疫微环境中的调控机制及其与疾病进展的关系 | 阿尔茨海默病患者样本、神经元细胞、T细胞、B细胞和NK细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序, 单细胞RNA测序, qRT-PCR, Western blot, 机器学习 | 机器学习算法, 风险预测模型, 列线图 | 转录组数据, 单细胞数据, 分子生物学数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
1739 | 2025-10-05 |
Lhx2 specifically expressed in HSCs promotes liver regeneration and inhibits liver fibrosis
2025-Sep-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001201
PMID:39693275
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研究论文 | 本研究揭示了肝星状细胞特异性转录因子Lhx2在促进肝脏再生和抑制肝纤维化中的双重功能 | 首次发现Lhx2在肝星状细胞中特异性表达,并同时具备促进肝脏再生和抑制纤维化的双重功能 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证仍需进一步研究 | 鉴定肝星状细胞中同时促进再生和抑制纤维化的特异性靶点及其分子机制 | 小鼠和人类肝星状细胞,急慢性肝损伤模型 | 分子生物学 | 肝病 | RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 急性和慢性肝损伤小鼠模型,人类肝组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1740 | 2025-10-05 |
Sour neuronal signalling attenuates macrophage-mediated liver injury
2025-Sep, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.02.026
PMID:40058705
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研究论文 | 本研究揭示了酸味刺激通过神经信号通路减轻巨噬细胞介导的肝脏缺血再灌注损伤的机制 | 首次发现神经元来源的TAFA2蛋白通过CCR2受体招募和激活巨噬细胞导致肝损伤,而酸味刺激可减少TAFA2产生并减轻肝损伤 | 酸味刺激减轻肝损伤的具体分子通路尚未完全阐明 | 探究神经免疫相互作用在肝脏缺血再灌注损伤中的作用机制及治疗策略 | 小鼠动物模型、神经元、巨噬细胞、肝切除手术患者 | 神经免疫学 | 肝脏疾病 | 单细胞测序、RNA测序、基因敲除、临床实验 | 动物模型 | 基因表达数据、临床数据 | 小鼠模型和临床患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |