单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 17361 - 17380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 17361 | 2024-08-07 |
Immuno-PET Imaging of CD69 Visualizes T-Cell Activation and Predicts Survival Following Immunotherapy in Murine Glioblastoma
2023-07, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-22-0434
PMID:37426447
|
研究论文 | 本研究评估了CD69作为胶质母细胞瘤（GBM）免疫治疗反应的成像生物标志物的潜力，通过免疫正电子发射断层扫描（Immuno-PET）技术监测CD69表达，并探讨其与生存率的关系。 | 首次使用CD69免疫正电子发射断层扫描（Immuno-PET）技术来可视化T细胞激活并预测胶质母细胞瘤免疫治疗后的生存率。 | NA | 评估CD69作为胶质母细胞瘤免疫治疗反应的成像生物标志物的潜力。 | 人源和鼠源T细胞的CD69表达，以及其在免疫治疗后的变化。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），免疫正电子发射断层扫描（Immuno-PET） | NA | 图像 | 包括接受免疫检查点抑制剂（ICI）治疗的患者和对照组的肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）样本。 |
| 17362 | 2024-08-07 |
LRT: Integrative analysis of scRNA-seq and scTCR-seq data to investigate clonal differentiation heterogeneity
2023-07, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011300
PMID:37428794
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研究论文 | 本文开发了一种名为LRT的计算框架，用于整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞T细胞受体测序（scTCR-seq）数据，以探索克隆分化轨迹的异质性 | LRT框架结合了scRNA-seq和scTCR-seq数据，提供了全面的分析流程，包括预处理、细胞轨迹推断、克隆型聚类、轨迹偏倚评估和克隆型集群特征化 | NA | 研究目的是开发一种计算工具，以整合scRNA-seq和scTCR-seq数据，探索T细胞克隆的分化轨迹异质性 | 研究对象包括CD8+ T细胞和CD4+ T细胞在急性淋巴细胞性脑膜炎病毒感染下的scRNA-seq和scTCR-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞T细胞受体测序（scTCR-seq） | 计算框架 | 基因表达数据，T细胞受体序列数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 17363 | 2024-08-05 |
Screening of novel biomarkers for breast cancer based on WGCNA and multiple machine learning algorithms
2023-Jun-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-23-3
PMID:37434679
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研究论文 | 本文研究了基于WGCNA和多种机器学习算法的新型乳腺癌生物标志物 | 提出了利用WGCNA和机器学习算法筛选乳腺癌的潜在生物标志物 | 未提及具体的临床验证及样本的多样性限制 | 调查乳腺癌患者的新兴诊断和预后靶标 | 主要针对乳腺癌相关的差异表达基因进行分析 | 生物医学 | 乳腺癌 | 基于基因表达的分析，WGCNA，机器学习 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 99个正常组织和1081个乳腺癌组织 |
| 17364 | 2024-08-05 |
Spatial Multiomics Analysis in Psychiatric Disorders
2023-Jun-01, EC psychology and psychiatry
PMID:37424930
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研究论文 | 本研究提供了精神疾病中空间多组学分析的全面概述 | 该研究整合了多种数据模态，识别了与精神疾病相关的风险基因，提供了对疾病进展的预测和诊断治疗的新见解 | NA | 探讨空间多组学分析在精神疾病中的应用和重要性 | 三种常见精神疾病：阿尔茨海默病、精神分裂症和自闭症谱系障碍 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病，精神分裂症，自闭症谱系障碍 | 空间组学 | NA | 基因数据，转录组数据，蛋白组数据 | NA |
| 17365 | 2024-08-05 |
ScRNA-seq and spatial transcriptomics: exploring the occurrence and treatment of coronary-related diseases starting from development
2023, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2023.1064949
PMID:37416923
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综述 | 本文回顾了冠状动脉病的发展及治疗的分子机制 | 结合单细胞RNA测序和空间转录组技术，探讨了冠状动脉病的新治疗方案 | 没有明显的局限性信息 | 探讨冠状动脉发展与疾病的分子机制及其潜在治疗 | 单细胞和冠状动脉疾病 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序和空间转录组技术 | NA | NA | NA |
| 17366 | 2024-08-05 |
ACME Dissociation-Fixation, Flow Cytometry, and Cell Sorting of Freshwater Planarian Cells
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3275-8_10
PMID:37428377
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研究论文 | 本文描述了一种用于平面虫细胞解离的方法 | 提出了一种基于醋酸和甲醇的ACME解离-固定方法，解决了传统酶法引起的细胞应激反应问题 | 不适用于所有类型的细胞，可能需要进一步验证 | 改善平面虫细胞的解离和固定过程，以便用于单细胞转录组学研究 | 平面虫细胞 | 数字病理学 | NA | ACME解离-固定方法 | NA | NA | NA |
| 17367 | 2024-08-05 |
Redistribution of the astrocyte phenotypes in the medial vestibular nuclei after unilateral labyrinthectomy
2023, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2023.1146147
PMID:37434761
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研究论文 | 本研究探讨了单侧迷路切除后内侧前庭核中星形胶质细胞亚型的变化。 | 发现了四种内侧前庭核中的星形胶质细胞亚型，并揭示了它们在迷路损伤后的适应性变化。 | 未深入探讨星形胶质细胞亚型对神经系统功能的具体影响和机制。 | 研究单侧迷路切除后内侧前庭核中星形胶质细胞的响应状态。 | 使用单细胞测序技术分析小鼠模型中的星形胶质细胞亚型。 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | 小鼠模型 | 基因数据 | NA |
| 17368 | 2024-08-05 |
Comprehensive analysis of the role of immune-related PANoptosis lncRNA model in renal clear cell carcinoma based on RNA transcriptome and single-cell sequencing
2023, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2023.029563
PMID:37415739
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研究论文 | 本文综合分析了免疫相关的PANoptosis lncRNA模型在肾透明细胞癌中的作用 | 建立了基于免疫相关PANoptosis lncRNAs的新预测模型，并发现LINC00944与癌细胞迁移和浸润显著相关 | NA | 探索免疫相关PANoptosis lncRNAs在肾透明细胞癌中的生物学价值 | 肾透明细胞癌患者的免疫相关PANoptosis lncRNAs | 数字病理学 | 肾癌 | RNA转录组和单细胞测序 | 风险模型 | 转录组数据和单细胞数据 | 使用了来自The Cancer Genome Atlas和Gene Expression Omnibus数据库的数据，样本数量未具体说明 |
| 17369 | 2024-08-05 |
TERT expression is associated with metastasis from thin primaries, exhausted CD4+ T cells in melanoma and with DNA repair across cancer entities
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0281487
PMID:37418389
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研究论文 | 本文研究TERT表达与黑色素瘤转移及免疫抵抗的关系 | 揭示了TERT表达与CD4+ T细胞衰竭和肿瘤进展之间的联系，及其在多种肿瘤类型中的非经典功能 | 未能在免疫检查点抑制的黑色素瘤队列中找到TERT启动子突变或表达与生存率的持续关联 | 扩展对TERT启动子突变及表达改变在肿瘤进展中影响的认识 | 分析数个高度注释的黑色素瘤队列 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 (RNA-seq) | 多变量模型 | 基因表达数据 | 涉及多个黑色素瘤队列的样本 |
| 17370 | 2024-08-07 |
Editorial: Statistical and computational methods for single-cell sequencing analysis
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1235174
PMID:37415605
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17371 | 2024-08-07 |
System analysis based on the T cell exhaustion‑related genes identifies CD38 as a novel therapy target for ovarian cancer
2023, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2023.029282
PMID:37415732
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析探讨卵巢癌中T细胞亚群的异质性，并筛选出与T细胞耗竭相关的基因，特别是CD38作为新的治疗靶点 | 首次通过单细胞转录组分析揭示卵巢癌中T细胞耗竭的异质性，并构建基于T细胞耗竭基因的预后模型，为精准治疗提供新思路 | 研究样本量较小，仅基于五个卵巢癌患者的单细胞RNA测序数据，可能影响结果的普遍性 | 探讨卵巢癌中T细胞亚群的异质性及其临床意义，并开发基于T细胞耗竭基因的预后模型 | 卵巢癌患者的T细胞亚群及其相关基因 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 随机森林 | 转录组数据 | 五个卵巢癌患者 |
| 17372 | 2024-08-07 |
Comprehensive immune landscape of lung-resident memory CD8+ T cells after influenza infection and reinfection in a mouse model
2023, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2023.1184884
PMID:37415817
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研究论文 | 本研究利用综合转录组数据和体内实验，探讨了流感病毒感染和再感染后肺驻留记忆CD8+ T细胞的关键特征及其功能转换和调控机制。 | 本研究首次详细描述了流感感染和再感染后肺中CD8+ T细胞亚群的景观，并揭示了CD8+ Trm细胞在感染后的动态变化和关键信号通路。 | NA | 探讨流感病毒感染和再感染后肺驻留记忆CD8+ T细胞的功能转换和调控机制。 | 肺驻留记忆CD8+ T细胞 | 免疫学 | 流感 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），RNA测序（RNA-seq） | Seurat，scCODE，Monocle 3，CellChat | 转录组数据 | 两个单细胞RNA测序数据集和一个RNA测序数据集 |
| 17373 | 2024-08-07 |
Characterization of tumor-associated reactive astrocytes in gliomas by single-cell and bulk tumor sequencing
2023, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2023.1193844
PMID:37416308
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研究论文 | 本文通过单细胞和整体肿瘤测序技术，全面评估了胶质瘤中的肿瘤相关反应性星形细胞（TARAs），并分析了其在胶质瘤中的作用和潜在的临床应用 | 首次系统地研究了TARAs在胶质瘤中的浸润水平及其与临床和分子特征的关联，并探讨了其在免疫治疗中的预测价值 | NA | 探讨肿瘤相关反应性星形细胞（TARAs）在胶质瘤中的作用及其临床意义 | 胶质瘤中的肿瘤相关反应性星形细胞（TARAs） | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 35,563个细胞来自23名患者，1,379个弥漫性星形细胞瘤和胶质母细胞瘤样本 |
| 17374 | 2024-08-07 |
Integrated analysis of single-cell and Bulk RNA sequencing reveals a malignancy-related signature in lung adenocarcinoma
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1198746
PMID:37427142
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，揭示了肺腺癌中与恶性相关的特征 | 识别了一种新的与恶性相关的特征，用于预测肺腺癌患者的预后，并强调了这一特征作为肺腺癌患者预后和治疗标记的潜力 | NA | 建立基于恶性相关风险评分（MRRS）的肺腺癌预后模型 | 肺腺癌（LUAD） | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 随机生存森林分析 | RNA测序数据 | 使用了来自Tumor Immune Single Cell Hub数据库的单细胞RNA测序数据和来自The Cancer Genome Atlas数据库的RNA-seq数据，以及GSE68465和GSE72094数据集进行验证 |
| 17375 | 2024-08-07 |
Accumulation of plasmacytoid dendritic cell is associated with a treatment response to DNA-damaging treatment and favorable prognosis in lung adenocarcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1154881
PMID:37435086
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫荧光及免疫组织化学染色方法，探讨了吸烟与非吸烟者肺腺癌肿瘤微环境中的免疫细胞组成差异，并验证了相关生物标志物的临床意义。 | 首次揭示了吸烟者肺腺癌肿瘤微环境中浆细胞样树突状细胞（pDCs）的积累与DNA损伤治疗反应及良好预后之间的关联。 | NA | 研究吸烟状态对肺腺癌肿瘤微环境的影响，并探讨pDCs在免疫检查点抑制剂治疗反应中的作用。 | 吸烟与非吸烟者的肺腺癌组织及其邻近正常肺组织。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，免疫荧光，免疫组织化学染色 | NA | 组织 | 来自吸烟与非吸烟者的肺腺癌组织及邻近正常肺组织样本 |
| 17376 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptomic Profiling of Müller Glia in the rd10 Retina
2023, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-27681-1_55
PMID:37440060
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，分析了rd10视网膜模型中穆勒胶质细胞对杆状细胞退化的反应。 | 发现了Pde6b穆勒胶质细胞中组织相容性复合体成员的表达增加，这可能是穆勒胶质细胞在视网膜色素变性中的一种新型免疫功能。 | NA | 探讨穆勒胶质细胞在视网膜色素变性中的反应及其潜在机制。 | 穆勒胶质细胞在rd10视网膜模型中的转录组变化。 | 数字病理学 | 视网膜色素变性 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 17377 | 2024-08-05 |
scFED: Clustering Identifying Cell Types of scRNA-Seq Data Based on Feature Engineering Denoising
2023-Dec, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-023-00574-y
PMID:37402002
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研究论文 | 本文介绍了scFED，一种基于特征工程的基因选择框架，用于消除单细胞RNA-seq数据的噪声波动 | scFED通过工程化的基因选择框架，提高了单细胞聚类和分类的效果 | 计算负担重且高表达基因可能无法提供稳定和预测的特征集 | 研究单细胞RNA-seq数据的特征选择，以改善聚类和细胞类型识别 | 应用scFED方法在四个真实的单细胞数据集上进行分析 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 四个真实的单细胞数据集 |
| 17378 | 2024-08-07 |
Discovery and Validation of Novel Genes in a Large Chinese Autism Spectrum Disorder Cohort
2023-11-15, Biological psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1016/j.biopsych.2023.06.025
PMID:37393044
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研究论文 | 本文通过对中国大规模自闭症谱系障碍（ASD）群体进行全外显子测序和单细胞RNA测序，发现并验证了新的ASD候选基因 | 本文首次在东亚人群中进行大规模ASD遗传分析，并发现了9个未在当前ASD基因数据库中的新候选基因 | 研究主要集中在中国ASD群体，未来需要更多不同种族背景的ASD群体进行验证 | 旨在发现和验证中国ASD群体中的新基因，并探讨不同种族背景下的ASD遗传结构 | 中国ASD群体及其遗传变异 | 遗传学 | 自闭症谱系障碍 | 全外显子测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 1141个中国ASD三联体样本 |
| 17379 | 2024-08-07 |
SKIL/SnoN attenuates TGF-β1/SMAD signaling-dependent collagen synthesis in hepatic fibrosis
2023-Nov-03, Biomolecules & biomedicine
DOI:10.17305/bb.2023.9000
PMID:37389959
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研究论文 | 本研究探讨了SKIL/SnoN在肝纤维化中的作用及其对TGF-β1/SMAD信号通路的调控 | 首次综合运用bulk RNA测序和单细胞RNA测序分析肝纤维化患者样本，验证了SKIL/SnoN在肝纤维化中的作用 | 研究主要基于动物模型和细胞系，需要进一步的人体临床研究验证 | 评估SnoN在肝纤维化中的作用及其对TGF-β1信号通路的调控 | 肝星状细胞（HSC）和肝纤维化 | NA | 肝纤维化 | RNA测序, 免疫组织化学, 免疫荧光, PCR, 蛋白质印迹 | NA | RNA | 包括肝纤维化患者样本和转染的HSC-T6及LX-2细胞系的大鼠肝样本 |
| 17380 | 2024-08-07 |
Cancer-associated fibroblasts contribute to the immunosuppressive landscape and influence the efficacy of the combination therapy of PD-1 inhibitors and antiangiogenic agents in hepatocellular carcinoma
2023-Nov-01, Cancer
IF:6.1Q1
DOI:10.1002/cncr.34935
PMID:37395148
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研究论文 | 本研究探讨了癌症相关成纤维细胞（CAFs）在肝细胞癌（HCC）肿瘤微环境中的作用及其对PD-1抑制剂和抗血管生成药物联合治疗效果的影响 | 研究揭示了CAFs丰度对HCC患者预后和治疗反应的影响，并证实了PD-1抑制剂和抗血管生成药物联合治疗在CAFs高丰度患者中的潜在价值 | NA | 研究CAFs在HCC肿瘤微环境中的作用及其对特定治疗方案疗效的影响 | 肝细胞癌患者及其肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 基于39个与CAFs相关的基因对HCC患者的单细胞RNA测序数据进行无监督聚类，将患者分为CAFs低丰度群和高丰度群 |