单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
17301 2024-08-05
MSdb: An integrated expression atlas of human musculoskeletal system
2023-Jun-16, iScience IF:4.6Q1
研究论文 介绍了一个用于人类肌肉骨骼系统下一代测序数据的数据库MSdb。 MSdb整合了各种数据,提供统一分析和比较的功能,是针对肌肉骨骼疾病研究的重要资源。 没有提及具体的样本量或数据集的局限性 促进肌肉骨骼疾病的病理机制研究和治疗方法开发 人类肌肉骨骼系统的下一代测序数据 数字病理学 肌肉骨骼疾病 下一代测序(NGS) NA 数据集 NA
17302 2024-08-05
Spatial Transcriptomics Identifies Expression Signatures Specific to Lacrimal Gland Adenoid Cystic Carcinoma Cells
2023-Jun-16, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学识别了与泪腺腺样囊性癌细胞特异的表达特征 整合了大面积RNA测序和空间转录组学以识别LGACC特定基因特征,提供了新的靶向治疗线索 由于LGACC的稀有性,其病理生物学尚不完全了解,限制了研究的广度 揭示泪腺腺样囊性癌特有的分子和细胞特征 泪腺腺样囊性癌细胞及其相关的基因表达 数字病理学 泪腺癌 RNA测序,空间转录组学 NA 基因表达数据 分析了3499个差异表达基因
17303 2024-08-05
MBD3 as a Potential Biomarker for Colon Cancer: Implications for Epithelial-Mesenchymal Transition (EMT) Pathways
2023-Jun-14, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 本研究探讨了MBD3在结肠癌中的作用及其与上皮-间质转变(EMT)的关系 首次明确了MBD3在结肠癌中的表达差异及其与肿瘤发生、发展之间的关联 尚未全面阐明MBD3在结肠癌中的确切机制 探讨MBD3作为结肠癌潜在生物标志物的作用及其在EMT通路中的影响 结肠癌细胞和临床数据 数字病理学 结肠癌 qRT-PCR, western blotting, 单细胞测序 NA 临床数据 NA
17304 2024-08-07
Differences in the Tumor Microenvironment of EBV-Associated Gastric Cancers Revealed Using Single-Cell Transcriptome Analysis
2023-Jun-14, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了EBV相关胃癌肿瘤微环境的差异 首次详细探索了EBV相关胃癌中细胞亚群的组成和分子特征 需要进一步研究以确定这些细胞亚群和表型与患者预后的关联 探索EBV相关胃癌肿瘤微环境的细胞组成和分子特征 EBV相关胃癌的肿瘤微环境 NA 胃癌 单细胞转录组分析 NA 转录组数据 未具体说明样本数量
17305 2024-08-07
Intervertebral Disc Progenitors: Lessons Learned from Single-Cell RNA Sequencing and the Role in Intervertebral Disc Regeneration
2023-Jun-12, Bioengineering (Basel, Switzerland)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨椎间盘祖细胞的异质性和发育模式,并比较间充质基质细胞与椎间盘祖细胞,以确定椎间盘再生的最佳细胞来源 利用单细胞RNA测序技术揭示了椎间盘祖细胞的新颖异质性和发育模式 NA 深入理解椎间盘祖细胞在椎间盘再生中的早期发育和作用,以提高干细胞/祖细胞疗法治疗腰痛的有效性 椎间盘祖细胞及其在椎间盘再生中的作用 NA 腰痛 单细胞RNA测序 NA RNA NA
17306 2024-08-07
Integrated Single-Cell and Transcriptome Sequencing Analyses Identify Dipeptidase 2 as an Immune-Associated Prognostic Biomarker for Lung Adenocarcinoma
2023-Jun-12, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
研究论文 本研究通过整合单细胞和转录组测序分析,鉴定了二肽酶2(DPEP2)作为肺腺癌的免疫相关预后生物标志物 首次揭示了DPEP2在肺腺癌中的表达模式及其与免疫细胞的关联,并探讨了其在免疫检查点抑制剂反应中的作用 研究主要基于生物信息学分析和临床样本,未来需要更多的实验验证 探讨DPEP2在肺腺癌中的表达及其作为预后生物标志物的潜力 DPEP2在肺腺癌中的表达及其生物学功能 数字病理学 肺腺癌 单细胞和转录组测序 NA 转录组数据 涉及正常肺组织和肺腺癌组织的临床样本
17307 2024-08-05
Dysregulation of Immune Cell Subpopulations in Atypical Hemolytic Uremic Syndrome
2023-Jun-11, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本文研究了在非典型溶血性尿毒综合征(aHUS)中免疫细胞亚群的失调 首次确认了aHUS发病机制中免疫细胞的失调,提供了新诊断及疾病活动性标志物的潜在见解 样本数量有限,仅涉及部分患者及对照组 探索非典型溶血性尿毒综合征中的分子标志物以及免疫细胞的变化 研究对象包括13名aHUS患者、3名未受影响的家庭成员及4名健康对照者 数字病理 非典型溶血性尿毒综合征 单细胞测序 NA 外周血单核细胞 共研究了20个样本(13名患者,3名家庭成员和4名健康对照者)
17308 2024-08-07
The ndrg2 Gene Regulates Hair Cell Morphogenesis and Auditory Function during Zebrafish Development
2023-Jun-11, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究探讨了ndrg2基因在斑马鱼毛细胞形态发生和听觉功能中的作用 首次揭示了ndrg2基因在斑马鱼毛细胞分化和听觉功能中的关键作用,并提出了通过阻断Notch信号通路来恢复毛细胞的可能性 研究主要集中在斑马鱼模型上,未来需要进一步在其他物种中验证ndrg2基因的功能 探究ndrg2基因在斑马鱼毛细胞发育和听觉功能中的作用及其机制 斑马鱼的毛细胞和听觉功能 发育生物学 听力损失 原位杂交和单细胞RNA测序 NA RNA 斑马鱼幼体
17309 2024-08-05
The Promise of Single-Cell RNA Sequencing to Redefine the Understanding of Crohn's Disease Fibrosis Mechanisms
2023-Jun-07, Journal of clinical medicine IF:3.0Q1
研究论文 本文讨论了单细胞RNA测序对克罗恩病纤维化机制理解的前景 探讨了单细胞测序带来的新机会,可能帮助开发新的抗纤维化治疗药物 目前尚未有特定的抗纤维化疗法可用 旨在深入了解克罗恩病的纤维化病理机制 克罗恩病及其相关的纤维化 NA 克罗恩病 单细胞RNA测序 NA NA NA
17310 2024-08-05
Prospects of Cytomegalovirus-Specific T-Cell Receptors in Clinical Diagnosis and Therapy
2023-06-07, Viruses
研究论文 本文探讨了细胞介导的免疫反应中T细胞受体(TCR)在HCMV感染的临床诊断和治疗中的作用 提出TCR在新型诊断和预后方法开发中的重要性,并强调其在临床HCMV感染监测中的深远影响 虽然取得了一些进展,但目前仍存在许多缺陷和发展限制 开发创新、安全和有效的HCMV感染治疗及早期诊断策略 人类巨细胞病毒(HCMV)及其感染对免疫系统的影响 数字病理学 NA 高通量和单细胞测序技术 NA TCR序列 NA
17311 2024-08-07
Crafting a Personalized Prognostic Model for Malignant Prostate Cancer Patients Using Risk Gene Signatures Discovered through TCGA-PRAD Mining, Machine Learning, and Single-Cell RNA-Sequencing
2023-Jun-07, Diagnostics (Basel, Switzerland)
研究论文 本研究通过TCGA数据挖掘、机器学习和单细胞RNA测序,为恶性前列腺癌患者构建并验证了一个基于风险基因特征的个性化预后模型。 本研究创新性地利用TCGA数据和机器学习技术,开发了一个基于五个基因特征的预后模型,为前列腺癌患者的风险评估和生存预测提供了新的见解。 NA 本研究旨在为高Gleason评分的前列腺癌患者构建并验证一个基于患者特征的风险模型,用于早期识别和预后预测。 本研究主要针对高Gleason评分的前列腺癌患者。 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序 LASSO回归 基因表达数据 83个差异表达基因,使用来自TCGA和ICGC的独立数据集进行验证。
17312 2024-08-07
scRNA-Seq of Cultured Human Amniotic Fluid from Fetuses with Spina Bifida Reveals the Origin and Heterogeneity of the Cellular Content
2023-06-07, Cells IF:5.1Q2
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序技术,分析了来自脊柱裂胎儿和健康胎儿的人羊水细胞的组织来源和标记表达 首次在单细胞水平上揭示了培养的羊水细胞的异质性,并识别了脊柱裂胎儿羊水中的神经源性细胞类型 NA 明确羊水细胞的细胞组成和精确的组织来源,以促进其在再生医学和组织工程中的应用 来自脊柱裂和健康胎儿的人羊水细胞 数字病理学 脊柱裂 单细胞RNA测序 NA 细胞 来自脊柱裂胎儿和健康胎儿的人羊水细胞
17313 2024-08-07
Decreased Expression of KLF4 Leading to Functional Deficit in Pediatric Patients with Intestinal Failure and Potential Therapeutic Strategy Using Decanoic Acid
2023-Jun-07, Nutrients IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了小儿肠衰竭患者的肠道功能缺陷,发现KLF4表达下降可能是导致成熟肠上皮细胞功能缺陷的关键基因,并探讨了癸酸作为潜在治疗策略的可能性。 首次揭示了KLF4在小儿肠衰竭中的作用,并提出癸酸作为促进细胞成熟和功能改善的潜在治疗策略。 研究主要基于体外模型和小鼠模型,需要进一步的临床试验验证。 探讨小儿肠衰竭的分子机制及潜在治疗策略。 小儿肠衰竭患者及相关的肠道功能缺陷。 NA 小儿疾病 单细胞RNA测序 NA RNA 小儿肠衰竭患者
17314 2024-08-07
Single-Cell Transcriptome Analysis Identifies Subclusters with Inflammatory Fibroblast Responses in Localized Scleroderma
2023-Jun-06, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了局限性硬皮病患者的皮肤样本,识别出具有炎症反应的成纤维细胞亚群 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析局限性硬皮病中的成纤维细胞亚群,揭示了其炎症基因表达特征 研究样本仅包括14名局限性硬皮病患者和14名健康对照,样本量有限 探究局限性硬皮病中成纤维细胞的亚群及其炎症反应特征 局限性硬皮病患者的皮肤成纤维细胞 数字病理学 自身免疫疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 14名局限性硬皮病患者和14名健康对照
17315 2024-08-07
Single-Cell RNA-Sequencing Reveals the Skeletal Cellular Dynamics in Bone Repair and Osteoporosis
2023-Jun-06, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
综述 本文综述了单细胞RNA测序技术在揭示骨骼细胞在骨修复和骨质疏松中的动态变化方面的应用 利用单细胞RNA测序技术揭示了骨骼细胞的异质性和层次差异,以及这些细胞在骨再生和骨质疏松中的作用 NA 探讨骨骼细胞在骨稳态、再生和骨质疏松中的动态变化 骨骼细胞,包括骨骼干细胞和祖细胞(SSPCs)及其分化细胞 数字病理学 骨质疏松症 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA NA
17316 2024-08-07
MitoTrace: A Computational Framework for Analyzing Mitochondrial Variation in Single-Cell RNA Sequencing Data
2023-06-04, Genes IF:2.8Q2
研究论文 介绍了一个名为MitoTrace的R包,用于分析单细胞RNA测序数据中的线粒体遗传变异 MitoTrace能够从单细胞RNA测序数据中稳健地恢复遗传变异,并适用于来自不同平台的scRNAseq数据 NA 研究单细胞RNA测序数据中的线粒体遗传变异 线粒体遗传变异 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 使用了多个公开可用的数据集
17317 2024-08-07
A single-cell atlas of the sexually dimorphic Drosophila foreleg and its sensory organs during development
2023-06, PLoS biology IF:7.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了雄性果蝇前肢第一跗节在蛹发育期间的细胞类型多样性及其遗传基础 首次揭示了果蝇前肢感觉器官的细胞景观,识别了一种新的细胞类型,并解析了支持细胞在不同感觉器官间的转录组差异 NA 探究果蝇前肢感觉器官的细胞类型多样性及其遗传基础 雄性果蝇前肢的第一跗节及其感觉器官 生物学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA序列 NA
17318 2024-08-07
Identification and Functional Analysis of Transcriptome Profiles, Long Non-Coding RNAs, Single-Nucleotide Polymorphisms, and Alternative Splicing from the Oocyte to the Preimplantation Stage of Sheep by Single-Cell RNA Sequencing
2023-05-25, Genes IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,从卵母细胞到胚胎着床前阶段,对绵羊细胞的转录组特征、长非编码RNA、单核苷酸多态性和选择性剪接进行了鉴定和功能分析 首次系统地分析了从卵母细胞到胚胎着床前各阶段绵羊细胞的转录组特征、长非编码RNA、单核苷酸多态性和选择性剪接,并构建了单细胞图谱 NA 研究胚胎发育过程中转录组特征、长非编码RNA、单核苷酸多态性和选择性剪接的作用 绵羊从卵母细胞到胚胎着床前阶段的细胞 基因组学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 从卵母细胞到胚胎着床前各阶段的绵羊细胞
17319 2024-08-05
Prognostic, Immunological, and Mutational Analysis of MTA2 in Pan-Cancer and Drug Screening for Hepatocellular Carcinoma
2023-05-24, Biomolecules IF:4.8Q1
研究论文 本研究探讨了MTA2在33种癌症中的预后价值及其潜在的免疫功能 提供了MTA2在不同癌症类型中的系统性分析及其与肿瘤突变负担和免疫细胞浸润的关联 缺乏长期的临床数据验证,实验结果在体外环境下可能无法完全代表体内情况 探究MTA2在全癌症中的预后作用及免疫功能 33种癌症类型中MTA2的表达和功能 数字病理学 肝细胞癌 单细胞测序(scRNA-seq)和免疫组织化学实验 NA 数据集分析和生物信息学方法 HCC细胞系HepG2和不同癌症类型的样本
17320 2024-08-07
Revealing the roles of TLR7, a nucleic acid sensor for COVID-19 in pan-cancer
2023-May-09, Biosafety and health IF:3.5Q1
研究论文 本研究提出了一种计算框架,全面研究了TLR7在COVID-19和泛癌中的作用,涉及遗传、基因表达、蛋白质、表观遗传和单细胞水平 首次系统研究了TLR7在不同癌症中的表达模式及其与COVID-19的关联 NA 探讨TLR7在COVID-19和泛癌中的作用及其机制 TLR7在不同癌症中的表达及其与COVID-19的关联 数字病理学 COVID-19 计算框架 NA 基因表达数据 包括TCGA、GTEx、CCLE、HPA等多个数据库的数据
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