单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27648 篇文献，本页显示第 17301 - 17320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 17301 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals tumor immune microenvironment in human hypopharygeal squamous cell carcinoma and lymphatic metastasis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1168191
PMID:37503341
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了人喉下鳞状细胞癌及其淋巴转移的肿瘤免疫微环境 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了喉下鳞状细胞癌及其淋巴转移中的肿瘤免疫微环境，并识别了特定的细胞群和标记基因 | 研究样本仅来自五名患者，可能影响结果的普遍性 | 研究喉下鳞状细胞癌的肿瘤免疫微环境，以提供新的治疗靶点和策略 | 喉下鳞状细胞癌、癌旁组织及淋巴组织 | 数字病理学 | 头颈部癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 132,869个单细胞样本，来自五名喉下鳞状细胞癌患者 |
| 17302 | 2024-08-07 |
A chemotherapy response prediction model derived from tumor-promoting B and Tregs and proinflammatory macrophages in HGSOC
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1171582
PMID:37519793
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研究论文 | 本研究开发了一种基于肿瘤促进B细胞、Tregs和促炎性巨噬细胞的高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）化疗反应预测模型 | 该模型包含43个特征基因，AUC值达到0.97，显著优于现有预测模型 | NA | 开发新的预测标志物，以准确预测高级别浆液性卵巢癌患者的化疗反应 | 高级别浆液性卵巢癌患者的化疗反应 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 预测模型 | RNA-seq数据 | 88个样本 |
| 17303 | 2024-08-07 |
Aerosolized miR-138-5p and miR-200c targets PD-L1 for lung cancer prevention
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1166951
PMID:37520581
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研究论文 | 本研究探讨了通过吸入方式递送miR-138-5p和miR-200c模拟物在肺癌预防中的联合效果 | 采用吸入方式递送微小RNA（miRNA）作为肺癌预防的新方法 | NA | 研究通过吸入方式递送miR-138-5p和miR-200c在肺癌预防中的效果 | miR-138-5p和miR-200c在肺癌预防中的作用 | NA | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和成像质谱流式细胞术（IMC） | NA | NA | 小鼠 |
| 17304 | 2024-08-07 |
Smart Microfluidics: Synergy of Machine Learning and Microfluidics in the Development of Medical Diagnostics for Chronic and Emerging Infectious Diseases
2023, Critical reviews in biomedical engineering
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研究论文 | 本文探讨了机器学习与微流控技术在慢性及新兴传染病医疗诊断中的协同作用 | 结合微流控技术和机器学习算法，开发智能微流控即时诊断设备，以应对传染病和慢性疾病的挑战 | 微流控系统的设计、制造和操作复杂性限制了其广泛应用 | 开发适用于发展中国家的智能微流控即时诊断设备，以改善临床结果 | 慢性及新兴传染病 | 机器学习 | NA | 微流控技术 | 机器学习算法 | NA | NA |
| 17305 | 2024-08-07 |
Identifying Network Biomarkers for Alzheimer's Disease Using Single-Cell RNA Sequencing Data
2023, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-31978-5_19
PMID:37525046
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研究论文 | 本文提出了一种R工作流程，用于从通路网络中提取疾病扰动的子通路，并结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）表达谱构建基因-基因相互作用网络，以识别阿尔茨海默病（AD）的网络生物标志物。 | 本文采用了单细胞RNA测序技术，并结合系统层面的网络方法，提取疾病扰动的子通路，为复杂疾病如阿尔茨海默病的研究提供了新的网络生物标志物。 | NA | 开发一种新的方法来识别阿尔茨海默病的网络生物标志物。 | 阿尔茨海默病（AD）的网络生物标志物。 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 17306 | 2024-08-07 |
Oral cavity infection by the SARS-CoV-2: emphasizing the essence of masking and peptide therapeutics
2022, The Egyptian journal of medical human genetics
DOI:10.1186/s43042-022-00213-z
PMID:37521842
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研究论文 | 本文研究了SARS-CoV-2通过口腔黏膜感染的机制，并探讨了口罩预防和肽类治疗药物的潜在应用 | 设计了一种潜在的肽类治疗药物，用于抑制TMPRSS2，并强调了预防性口罩的重要性 | NA | 探讨SARS-CoV-2通过口腔黏膜感染的机制及开发新的治疗方法 | SARS-CoV-2的感染机制及TMPRSS2的抑制 | NA | COVID-19 | scRNA-Seq | NA | 蛋白质表达数据 | NA |
| 17307 | 2024-08-07 |
Comprehensive analysis of anoikis-related genes in prognosis and immune infiltration of gastric cancer based on bulk and single-cell RNA sequencing data
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05157-4
PMID:37474682
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研究论文 | 本研究基于批量和单细胞RNA测序数据，全面分析了与胃癌预后和免疫浸润相关的凋亡相关基因 | 建立了基于七个凋亡相关基因的预后风险模型，该模型在多个数据集中表现良好，并能指导药物治疗 | NA | 探索凋亡抵抗在胃癌细胞转移中的关键作用，并开发新的胃癌治疗方法 | 胃癌患者的预后和免疫细胞浸润情况 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA测序 | Cox回归模型 | RNA测序数据 | 涉及多个数据集的胃癌样本 |
| 17308 | 2024-08-07 |
Invariant natural killer T cells drive hepatic homeostasis in nonalcoholic fatty liver disease via sustained IL-10 expression in CD170+ Kupffer cells
2023-11, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350474
PMID:37489253
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研究论文 | 通过高维单细胞RNA测序技术，研究了胚胎来源的枯否细胞（KCs）在非酒精性脂肪肝病（NAFLD）中的作用，并揭示了不变自然杀伤T细胞（iNKT）通过维持CD170+枯否细胞中的IL-10表达来驱动肝脏稳态的机制 | 首次鉴定了两种具有不同基因表达谱的枯否细胞亚群（KC-1和KC-2），并揭示了iNKT细胞与KC-1细胞之间的CD206介导的交叉对话对IL-10表达的影响 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步在人类样本中验证这些发现 | 探讨枯否细胞亚群在非酒精性脂肪肝病中的作用及其与iNKT细胞的相互作用 | 枯否细胞亚群、iNKT细胞、IL-10表达 | NA | 非酒精性脂肪肝病 | 高维单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胚胎来源的枯否细胞 |
| 17309 | 2024-08-07 |
MTHFD2 ablation in T cells protects against heart transplant rejection by perturbing IRF4/PD-1 pathway through the metabolic-epigenetic nexus
2023-Nov, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2023.07.009
PMID:37495036
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研究论文 | 本研究探讨了一碳代谢酶MTHFD2在T细胞中的缺失如何通过代谢-表观遗传机制影响IRF4/PD-1通路，从而保护心脏移植免受排斥反应。 | 首次揭示了一碳代谢酶MTHFD2在心脏移植排斥反应中的作用，并阐明了其通过代谢-表观遗传机制影响IRF4/PD-1通路的机制。 | NA | 研究一碳代谢酶MTHFD2在心脏移植排斥反应中的作用及其机制。 | 心脏移植排斥反应中的T细胞和一碳代谢酶MTHFD2。 | NA | 心血管疾病 | 转录组学、代谢组学、单细胞RNA测序、免疫荧光、流式细胞术、酶联免疫吸附试验、Cleavage Under Targets and Tagmentation assay | NA | 转录组数据、代谢数据、单细胞RNA数据 | 人类和小鼠心脏移植受者的组织样本 |
| 17310 | 2024-08-05 |
SCM is potential resource for non-invasive preimplantation genetic testing based on human embryos single-cell sequencing
2023-Oct-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2023.147647
PMID:37473972
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研究论文 | 本研究探讨了使用胎胚单细胞测序的非侵入性植入前基因检测的潜力 | 本文章创新点在于提出了使用花球液（SCM）作为更有效的胚胎DNA来源进行植入前基因检测 | 目前非侵入性植入前基因检测的临床应用受到灵敏度和特异性不足的限制 | 本研究旨在提高非侵入性植入前基因检测的有效性 | 本研究的对象为218个人胚胎 | 数字病理学 | NA | 单细胞全基因组扩增（WGA） | NA | 基因组数据 | 218个人胚胎 |
| 17311 | 2024-08-05 |
T-cell subsets in allergy and tolerance induction
2023-10, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202249983
PMID:37489248
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研究论文 | 讨论抗原特异性T淋巴细胞在过敏和耐受诱导中的作用 | 介绍了通过多参数流式细胞术和单细胞测序直接表征过敏原特异性T细胞的新技术 | 目前对过敏免疫治疗（AIT）机制的理解仍不完全 | 研究T细胞亚群在健康状态、过敏敏感化过程和AIT中的作用 | 抗原特异性T细胞的不同表型和功能特征 | 数字病理学 | 过敏 | 单细胞测序、多参数流式细胞术 | NA | 细胞 | NA |
| 17312 | 2024-08-05 |
m6A regulator-mediated RNA methylation modification remodels immune microenvironment in dilated cardiomyopathy
2023-Oct, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31085
PMID:37475583
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研究论文 | 本研究探讨了m6A调节因子介导的RNA甲基化对扩张型心肌病中的免疫微环境的重塑作用 | 本研究首次验证了IGFBP2在扩张型心肌病中的关键作用及其在免疫微环境中的重塑机制 | 此研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类的病理情况 | 探讨m6A RNA甲基化如何影响扩张型心肌病患者的免疫微环境 | 扩张型心肌病小鼠模型及相关免疫细胞的研究 | 数字病理 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | RNA、蛋白质 | N/A |
| 17313 | 2024-08-05 |
High expression of centromere protein A and its molecular mechanism and clinical significance in prostate cancer: A study based on data mining and immunohistochemistry
2023-10, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.12073
PMID:37488766
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研究论文 | 这项研究揭示了中心体蛋白A在前列腺癌中的重要作用及其分子机制和临床意义 | 本研究首次将中心体蛋白A的表达与前列腺癌和转移性前列腺癌的临床病理特征关联起来 | 本研究的局限性在于需要进一步实验验证CENPA在前列腺癌中的具体作用 | 阐明中心体蛋白A在前列腺癌中的重要作用及其临床意义 | 本研究的对象为前列腺癌及转移性前列腺癌患者的数据 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA测序和免疫组化 | NA | RNA数据 | 使用了大量的RNA测序数据及内部免疫组化数据 |
| 17314 | 2024-08-05 |
Transcriptomic evidence for Brachyury expression in the caudal tip region of adult Ptychodera flava (Hemichordata)
2023-Oct, Development, growth & differentiation
DOI:10.1111/dgd.12882
PMID:37483093
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研究论文 | 本文展示了在成年Ptychodera flava的尾端区域中Brachyury基因的表达情况 | 首次在成年阶段发现Brachyury基因的表达，扩展了对这一基因在发育过程中作用的理解 | 需要进一步研究Brachyury在成年个体中的具体功能 | 探讨Brachyury基因在成年Ptychodera flava中的表达模式及其潜在功能 | 成人Ptychodera flava的尾端区域细胞 | NA | NA | Iso-Seq, 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA序列数据 | 使用了成年Ptychodera flava的样本 |
| 17315 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis profiles cellular and molecular alterations in submandibular gland and blood in IgG4-related disease
2023-10, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-224363
PMID:37474274
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了IgG4相关疾病中颌下腺和外周血单个核细胞的细胞和分子改变 | 发现了IgG4相关疾病中颌下腺内三种新的组织驻留免疫细胞亚群，并揭示了免疫细胞与非免疫细胞间的通信模式变化 | NA | 旨在通过单细胞水平分析IgG4相关疾病受累组织和外周血单个核细胞的转录组图谱，以识别细胞群体及其间的相互作用，从而理解IgG4相关疾病的病因 | IgG4相关疾病患者的颌下腺和外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | IgG4相关疾病患者和匹配对照组的颌下腺和外周血单个核细胞样本 |
| 17316 | 2024-08-07 |
Dual-GCN-based deep clustering with triplet contrast for ScRNA-seq data analysis
2023-Oct, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本文提出了一种基于双图卷积网络（Dual-GCN）和三元组对比的深度聚类方法（scDGDC），用于单细胞RNA测序（ScRNA-seq）数据分析中的降维和聚类 | 引入了双图卷积网络编码器以捕获更全面的拓扑信息，并使用三元组对比来减少图卷积网络的过度平滑问题 | 现有的基于图的深度聚类算法在构建细胞图时忽略了节点的分布信息，导致嵌入表示中的信息不完整 | 优化单细胞RNA测序数据分析中的聚类和降维任务 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（ScRNA-seq） | 图卷积网络（GCN） | 基因表达数据 | 八个真实单细胞RNA测序数据集 |
| 17317 | 2024-08-07 |
Glyoxal as an alternative fixative for single-cell RNA sequencing
2023-09-30, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkad160
PMID:37494060
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研究论文 | 本文开发并测试了使用甘油醛作为固定剂进行单细胞RNA测序的协议 | 提出甘油醛作为单细胞RNA测序的新型固定剂，有效保留了细胞转录组状态 | NA | 探索甘油醛作为单细胞RNA测序固定剂的效果 | 果蝇和人类细胞的转录组 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 果蝇和人类细胞 |
| 17318 | 2024-08-07 |
AtacAnnoR: a reference-based annotation tool for single cell ATAC-seq data
2023-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad268
PMID:37497729
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研究论文 | 本文介绍了一种基于参考的单细胞ATAC-seq数据注释工具AtacAnnoR | AtacAnnoR采用两轮注释方法，使用高质量注释的scRNA-seq数据作为参考，并实现了'Combine and Discard'策略以提高多参考注释的准确性 | NA | 开发和评估一种新的单细胞ATAC-seq数据注释方法 | 单细胞ATAC-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 序列数据 | 11个基准数据集 |
| 17319 | 2024-08-07 |
Combining single-cell RNA sequencing with spatial transcriptome analysis reveals dynamic molecular maps of cambium differentiation in the primary and secondary growth of trees
2023-09-11, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2023.100665
PMID:37491818
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和空间转录组测序技术，揭示了树木初生和次生生长过程中形成层分化的转录组图谱 | 研究首次详细比较了初生和次生生长组织的细胞图谱和分化轨迹，揭示了不同的调控网络 | NA | 深入理解树木初生和次生生长过程中的细胞身份和分化过程 | 树木初生和次生生长组织中的形成层分化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组测序 | NA | 转录组数据 | 涉及杨树茎部的初生和次生生长组织 |
| 17320 | 2024-08-05 |
Voltage-Seq: all-optical postsynaptic connectome-guided single-cell transcriptomics
2023-09, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-01965-1
PMID:37474808
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研究论文 | 本研究介绍了一种新方法Voltage-Seq，通过全光学技术对神经元连接进行功能特征化，为单细胞转录组学提供指导 | 创新点在于结合全光学电压成像和单细胞RNA测序，能够基于特定的突触后反应类型精准选取神经元 | 本研究的局限性可能在于仅使用小鼠模型，不能代表其他物种或更广泛的生理条件 | 本研究的目的是开发一种新方法，以改进神经元的信息路由分析 | 研究对象为小鼠的周脑导水管灰质中的8347个神经元 | 数字病理学 | NA | 全光学电压成像，单细胞RNA测序 | NA | 神经元电活动数据 | 8347个神经元 |