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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 17281 | 2024-08-05 | 
         Dynamics of human hematopoietic stem and progenitor cell differentiation to the erythroid lineage 
        
          2023-07, Experimental hematology
          
          IF:2.5Q3
          
         
        
          DOI:10.1016/j.exphem.2023.05.001
          PMID:37172755
         
       | 
      
      综述 | 该文章深入探讨了红血球生成过程中所有细胞类型的免疫表型特征 | 文章强调了红血球不同阶段的异质性,并描述了与经典红血球生成模型的偏差 | 尽管scRNA-seq提供了新见解,但流式细胞术仍然是验证新免疫表型的主要方法 | 研究红血球生成过程中细胞类型的免疫表型特征及其异质性 | 研究对象包括人类造血干细胞和其转化为红血球的各个阶段 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 17282 | 2024-08-05 | 
         Unbiased Human Kidney Tissue Proteomics Identifies Matrix Metalloproteinase 7 as a Kidney Disease Biomarker 
        
          2023-07-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
          
          IF:10.3Q1
          
         
        
          DOI:10.1681/ASN.0000000000000141
          PMID:37022120
         
       | 
      
      研究论文 | 该论文通过无偏的蛋白质组学分析确定基质金属蛋白酶7作为肾病生物标志物。 | 首次利用无偏的组织蛋白质组学信息发现MMP7与肾功能和纤维化的显著相关性,并识别MMP7作为未来肾功能下降的生物标志物。 | 研究主要集中于样本数量较小的个体,并可能受限于特定人群的临床信息。 | 研究人类糖尿病肾病(DKD)的无偏组织蛋白质组学,以确定潜在生物标志物。 | 23名DKD患者和10名健康对照的肾脏样本。 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | SomaScan平台与单细胞RNA测序 | NA | 组织样本与血液样本 | 共收集23名DKD患者和10名健康对照的肾脏样本,和11,030份血液样本 | NA | NA | NA | NA | 
| 17283 | 2024-08-05 | 
         The Long Noncoding RNA Cardiac Mesoderm Enhancer-Associated Noncoding RNA (Carmn) Is a Critical Regulator of Gastrointestinal Smooth Muscle Contractile Function and Motility 
        
          2023-07, Gastroenterology
          
          IF:25.7Q1
          
         
        
          DOI:10.1053/j.gastro.2023.03.229
          PMID:37030336
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究揭示了长非编码RNA Carmn在调节胃肠道平滑肌收缩功能和运动性方面的关键作用 | 这是首次研究长非编码RNA在调节内脏平滑肌表型中的重要性 | 仅在小鼠模型中进行研究,人体临床相关性尚需进一步验证 | 研究Carmn在维持胃肠道平滑肌收缩功能中的角色 | 以小鼠为模型,重点研究内脏平滑肌细胞的功能 | 数字病理学 | 肠道疾病 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了小鼠及人类的胚胎、成年胃肠道组织样本 | NA | NA | NA | NA | 
| 17284 | 2024-08-05 | 
         Detection of the effect of microvibrational stimulation on human discarded immature oocytes by single-cell transcriptome sequencing technology 
        
          2023-Jul, Journal of assisted reproduction and genetics
          
          IF:3.2Q2
          
         
        
          DOI:10.1007/s10815-023-02837-5
          PMID:37273164
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究探讨了对人类未成熟卵母细胞施加微振动机械刺激后转录组水平的变化。 | 该研究首次使用单细胞转录组测序技术揭示微振动刺激对卵母细胞基因表达的影响。 | 研究仅使用了有限数量的卵母细胞样本,且主要集中在特定的刺激频率上。 | 研究微振动机械刺激对人类卵母细胞转录组的影响。 | 被收集的为辅助生殖周期中未受精的废弃卵母细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 12个(每组6个,分别为微振动组和静态培养组) | NA | NA | NA | NA | 
| 17285 | 2024-08-05 | 
         Stress promotes the infiltration of peripheral immune cells to the brain 
        
          2023-07, Brain, behavior, and immunity
          
         
        
          DOI:10.1016/j.bbi.2023.05.003
          PMID:37169132
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究报道了应激后海马免疫微环境的变化,揭示了免疫细胞向海马的浸润与其适应或抗压能力之间的关系 | 首次在单细胞水平揭示了应激后海马中免疫细胞浸润的调控机制 | 本研究可能未考虑其他潜在因素对免疫细胞浸润的影响 | 探讨应激对海马中免疫细胞分布和功能的影响 | 研究对象为经历学习无助实验的小鼠,关注其海马区域的免疫细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫荧光 | NA | 生物数据 | 实验中使用了学习无助小鼠的多个样本 | NA | NA | NA | NA | 
| 17286 | 2024-08-04 | 
         Single-cell transcriptomics unveils xylem cell development and evolution 
        
          2023-01-09, Genome biology
          
          IF:10.1Q1
          
         
        
          DOI:10.1186/s13059-022-02845-1
          PMID:36624504
         
       | 
      
      研究论文 | 该研究揭示了木质部细胞在不同植物物种中的发育谱系和进化关系 | 通过单细胞转录组学和激光捕获微切割技术,首次解析了多个木本被子植物的木质部细胞发育谱系 | 研究主要集中在有限数量的木本被子植物上,可能无法全面代表所有植物的木质部细胞发展 | 探索不同植物的木质部细胞类型的发育和进化过程 | 四种不同的木本被子植物的木质部细胞类型 | 数字植物学 | NA | 单细胞转录组分析,激光捕获微切割 | NA | 转录组数据 | 四种木本被子植物的多个样本 | NA | NA | NA | NA | 
| 17287 | 2024-08-05 | 
         H2-O deficiency promotes regulatory T cell differentiation and CD4 T cell hyperactivity 
        
          2023, Frontiers in immunology
          
          IF:5.7Q1
          
         
        
          DOI:10.3389/fimmu.2023.1304798
          PMID:38250071
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究揭示了H2-O缺乏如何增强胸腺调节性T细胞的分化及CD4 T细胞的活性 | 首次提供了H2-O在胸腺调节性T细胞发育中的直接证据 | 缺乏对其他潜在机制的综合考虑 | 深入理解H2-O缺乏对自体免疫性疾病的影响 | 主要研究胸腺调节性T细胞及外周CD4 T细胞 | 免疫学 | 自体免疫疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA数据 | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 17288 | 2024-08-05 | 
         A new gene set identifies senescent cells and predicts senescence-associated pathways across tissues 
        
          2022-08-16, Nature communications
          
          IF:14.7Q1
          
         
        
          DOI:10.1038/s41467-022-32552-1
          PMID:35974106
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究生成了一组基因集(SenMayo),用于识别衰老细胞并预测组织中的衰老相关通路 | 该基因集能在不同组织和物种中高效识别衰老细胞,具有重要的临床应用潜力 | 尚未讨论SenMayo在其他组织类型的识别能力 | 研究衰老细胞的识别和衰老相关通路的预测 | 研究对象包括人类和小鼠的骨髓及骨组织的衰老细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因数据 | 来自两个老年人类队列的骨组织活检和小鼠的基因样本 | NA | NA | NA | NA | 
| 17289 | 2024-08-05 | 
         Spatial Transcriptomics and In Situ Sequencing to Study Alzheimer's Disease 
        
          2020-08-20, Cell
          
          IF:45.5Q1
          
         
        
          DOI:10.1016/j.cell.2020.06.038
          PMID:32702314
         
       | 
      
      研究论文 | 本文研究了阿尔茨海默病小鼠模型中,淀粉样斑块周围的转录变化 | 提供了一种前所未有的方法,通过空间转录组学分析解开阿尔茨海默病及其他脑部疾病致病标志物附近的失调细胞网络 | 该研究主要基于小鼠模型,临床应用可能受限 | 探讨阿尔茨海默病相关的分子变化和细胞相互作用 | 以阿尔茨海默病小鼠模型为研究对象 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学和原位测序 | NA | 组织样本 | 涉及小鼠和人类脑切片 | NA | NA | NA | NA | 
| 17290 | 2024-08-05 | 
         Efficient Generation and Transcriptomic Profiling of Human iPSC-Derived Pulmonary Neuroendocrine Cells 
        
          2020-May-22, iScience
          
          IF:4.6Q1
          
         
        
          DOI:10.1016/j.isci.2020.101083
          PMID:32380423
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究展示了如何通过诱导性多能干细胞生成肺神经内分泌细胞,并进行了转录组特征分析 | 本研究首次利用诱导性多能干细胞生成并表征肺神经内分泌细胞,提供了全新的细胞模型 | 该研究未在临床样本中验证生成的细胞功能 | 研究肺神经内分泌细胞的发生和其在肺部疾病中的作用 | 诱导性多能干细胞衍生的肺神经内分泌细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | iPNECs | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 17291 | 2024-08-05 | 
         Single-cell sequencing reveals the correlation of aggrephagy signaling and multiple myeloma immune microenvironment composition 
        
          2024-Jul, The journal of gene medicine
          
          IF:3.2Q2
          
         
        
          DOI:10.1002/jgm.3712
          PMID:38949072
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究揭示了聚合自噬信号与多发性骨髓瘤免疫微环境成分之间的相关性 | 首次揭示了聚合自噬在多发性骨髓瘤中的作用以及其与免疫微环境和疾病预后的关系 | 尚未全面证明聚合自噬在多发性骨髓瘤中的所有作用 | 研究聚合自噬信号与多发性骨髓瘤免疫微环境的相关性及其对疾病预后的影响 | 包含来自七个多发性骨髓瘤骨髓样本和七个健康骨髓样本的12,187个单细胞的RNA-seq数据 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 12,187个单细胞样本 | NA | NA | NA | NA | 
| 17292 | 2024-08-05 | 
         Activated Clec4nhi Neutrophils Aggravate Lung Injury in an Endothelial IGFBP7-Dependent Manner 
        
          2024-Jul, American journal of respiratory cell and molecular biology
          
          IF:5.9Q1
          
         
        
          DOI:10.1165/rcmb.2024-0017OC
          PMID:38574235
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究探讨了内皮细胞亚型在急性肺损伤中的作用,尤其是IGFBP7在调节炎症反应和屏障功能中的影响 | 揭示了IGFBP7在不同类型内皮细胞中的差异表达及其在急性肺损伤中引发的炎症和屏障功能障碍 | 具体亚型的内皮细胞在临床上的作用仍需进一步研究 | 研究IGFBP7在急性肺损伤中的角色及其潜在的治疗靶点 | 急性肺损伤模型中的内皮细胞和炎症细胞 | 数字病理学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 用脂多糖建立的急性肺损伤模型小鼠 | NA | NA | NA | NA | 
| 17293 | 2024-08-05 | 
         Hypoxia inducible factor 2α promotes tolerogenic macrophage development during cardiac transplantation through transcriptional regulation of colony stimulating factor 1 receptor 
        
          2024-Jun-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
          
          IF:9.4Q1
          
         
        
          DOI:10.1073/pnas.2319623121
          PMID:38889142
         
       | 
      
      研究论文 | 这篇文章探讨了低氧诱导因子2α(HIF-2α)在心脏移植过程中促进耐受性巨噬细胞发育的机制 | 文章首次揭示了HIF-2α作为耐受性单核细胞的关键转录因子,并与CSF1R的表达调控相联系 | 研究中使用的小鼠模型可能限制了结果在临床转化中的适用性 | 探讨介导移植耐受的不同因素 | 急性排斥或耐受性的心脏同种异体移植物 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及急性拒绝或耐受心脏同种异体移植物的样本数量未指定 | NA | NA | NA | NA | 
| 17294 | 2024-08-05 | 
         A single-cell atlas of the murine pancreatic ductal tree identifies novel cell populations with potential implications in pancreas regeneration and exocrine pathogenesis 
        
          2024-Jun-20, Gastroenterology
          
          IF:25.7Q1
          
         
        
          DOI:10.1053/j.gastro.2024.06.008
          PMID:38908487
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究构建了小鼠胰腺导管树的单细胞图谱,识别了具有潜在胰腺再生和外分泌病理学影响的新细胞群体 | 首次识别出15种新型胰腺导管细胞群体及其在胰腺再生和外分泌病理中的潜在作用 | 尚未在体内进一步验证这些新细胞群体的特定功能 | 旨在全面表征小鼠胰腺导管的单细胞异质性及其在再生和病理中的作用 | 研究对象包括小鼠胰腺的导管细胞和胰腺肿瘤样本 | 数字病理学 | 胰腺疾病 | scRNA-seq | NA | 细胞 | 包括健康胰腺、慢性胰腺炎和肿瘤样本的多个细胞群体 | NA | NA | NA | NA | 
| 17295 | 2024-08-05 | 
         Patho-transcriptomic analysis of invasive mucinous adenocarcinoma of the lung (IMA): comparison with lung adenocarcinoma with signet ring cell features (SRCC) 
        
          2024-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
          
         
        
          DOI:10.1101/2024.06.13.598839
          PMID:38948839
         
       | 
      
      研究论文 | 该论文分析了侵袭性粘液腺癌(IMA)与具有印戒细胞特征的肺腺癌(SRCC)之间的病理转录组学比较。 | 通过Visium空间转录组学方法揭示了IMA和SRCC中存在的六种不同细胞簇,并识别了各自特征性基因的表达差异。 | 缺乏有效治疗IMA的措施,且在无法进行手术切除的情况下,研究重点可能受限于分子机制的完整性。 | 研究侵袭性粘液腺癌的分子机制及其与印戒细胞特征肺腺癌的差异。 | 侵袭性粘液腺癌(IMA)和具有印戒细胞特征的肺腺癌(SRCC)。 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 分析了两种腺癌类型的不同细胞群体,具体样本数量未提供 | NA | NA | NA | NA | 
| 17296 | 2024-08-05 | 
         Tissue fibroblasts are versatile immune regulators: An evaluation of their impact on the aging process 
        
          2024-06, Ageing research reviews
          
          IF:12.5Q1
          
         
        
          DOI:10.1016/j.arr.2024.102296
          PMID:38588867
         
       | 
      
      research paper | 本文章探讨了成纤维细胞作为免疫调节剂在老化过程中的作用 | 揭示了成纤维细胞在组织免疫和炎症中的多种功能及其在老化过程中的重要性 | 未明确提及具体的实验数据和样本量 | 探究成纤维细胞与免疫细胞在衰老过程中的相互作用 | 老化组织中分离的成纤维细胞 | 免疫学 | 衰老相关疾病 | 单细胞转录组研究 | NA | 基因表达数据 | 来自老化组织的成纤维细胞 | NA | NA | NA | NA | 
| 17297 | 2024-08-05 | 
         Single-Cell Profiling Reveals the Impact of Genetic Alterations on the Differentiation of Inflammation-Induced Murine Colon Tumors 
        
          2024-May-28, Cancers
          
          IF:4.5Q1
          
         
        
          DOI:10.3390/cancers16112040
          PMID:38893159
         
       | 
      
      研究论文 | 该研究揭示了基因突变如何影响炎症诱导的鼠类结肠肿瘤细胞分化 | 本研究首次明确了在炎症诱导的结肠肿瘤中,BLM和MSH2KO突变对肿瘤细胞分化的不同影响 | 研究主要基于鼠类模型,可能无法完全代表人类结肠癌的复杂性 | 探讨基因突变对炎症诱导的结肠肿瘤细胞分化的影响 | 以炎症诱导的鼠类结肠肿瘤为研究对象 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包含多种突变的鼠类肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA | 
| 17298 | 2024-08-04 | 
         Critical view on oligo(dT)-based RNA-seq: bias arising, modeling, and mitigating 
        
          2024-03-06, Genetics
          
          IF:3.3Q2
          
         
        
          DOI:10.1093/genetics/iyad190
          PMID:37857456
         
       | 
      
      研究论文 | 本文探讨了基于oligo(dT)的RNA测序中存在的偏差及其缓解方法。 | 本研究识别了两个新的未被考虑的偏差,并发展出一种普适的缓解方法以减少这些偏差的影响。 | 研究可能未涵盖所有类型的RNA测序偏差,且其通用性需进一步验证。 | 研究的目的是理解和解决基于oligo(dT)的RNA测序数据中的偏差。 | 研究主要集中在单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据集及其分析上。 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 数据集 | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 17299 | 2024-08-04 | 
         Characterizing hub biomarkers for post-transplant renal fibrosis and unveiling their immunological functions through RNA sequencing and advanced machine learning techniques 
        
          2024-02-20, Journal of translational medicine
          
          IF:6.1Q1
          
         
        
          DOI:10.1186/s12967-024-04971-9
          PMID:38378674
         
       | 
      
      研究论文 | 本文探讨了肾移植后肾纤维化的中心生物标志物及其免疫功能 | 识别了与肾纤维化相关的四个核心基因及其潜在的有效小分子,提出了新的研究思路 | 缺乏临床数据验证所识别生物标志物的实用性 | 研究肾移植后肾纤维化的生物标志物及其机制 | 聚焦于肾纤维化患者的基因组数据和小鼠模型 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | RNA测序、单细胞测序、加权基因共表达网络分析 (WGCNA) | NA | 转录组数据 | 从NCBI基因表达综合体 (GEO) 获取的多名患者的数据和小鼠模型 | NA | NA | NA | NA | 
| 17300 | 2024-08-04 | 
         Senescent fibroblast facilitates re-epithelization and collagen deposition in radiation-induced skin injury through IL-33-mediated macrophage polarization 
        
          2024-02-18, Journal of translational medicine
          
          IF:6.1Q1
          
         
        
          DOI:10.1186/s12967-024-04972-8
          PMID:38369466
         
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      研究论文 | 这篇文章探讨了衰老成纤维细胞在辐射诱导的皮肤损伤中的作用 | 本研究揭示了p16表达的衰老成纤维细胞通过分泌IL-33促进辐射诱导的皮肤愈合的机制 | 本研究的限制在于未完全阐明所有潜在的细胞机制和其他因素 | 研究衰老细胞在辐射诱导的皮肤损伤中的作用及其机制 | 辐射诱导的皮肤损伤中的衰老成纤维细胞及其对愈合过程的影响 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序, 转录组测序 | NA | 单细胞数据, 组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |