单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 17241 - 17260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 17241 | 2024-08-05 |
A novel approach for the analysis of single-cell RNA sequencing identifies TMEM14B as a novel poor prognostic marker in hepatocellular carcinoma
2023-06-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-36650-y
PMID:37380717
|
研究论文 | 提出了一种新方法分析单细胞RNA测序，确定TMEM14B作为肝细胞癌的新预后标志物 | 开发了一种物理链接和共表达组合网络构建方法（PLACE），用于快速分析基因组测序数据集 | 研究中的某些数据可能仅限于特定的样本集，缺乏更广泛的验证 | 识别肝细胞癌患者的关键基因以改进预后评估 | 选取了来自肝细胞癌患者的单细胞测序数据 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | PLACE方法 | 基因组数据 | 使用了GSE149614数据集的样本 |
| 17242 | 2024-08-07 |
Chronic social defeat alters brain vascular-associated cell gene expression patterns leading to vascular dysfunction and immune system activation
2023-Jun-28, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-023-02827-5
PMID:37380974
|
研究论文 | 研究探讨了慢性社会挫败（CSD）对大脑血管相关细胞基因表达模式的影响，导致血管功能障碍和免疫系统激活 | 开发了一种新技术来分离大脑屏障相关细胞，并进行了单细胞RNA测序，以研究大脑血管相关细胞（BVACs）在健康和疾病中的作用 | NA | 研究大脑血管完整性在脑健康中的作用，以及其在心理疾病中的影响 | 大脑血管相关细胞（BVACs）及其在慢性社会挫败（CSD）下的基因表达模式 | 神经科学 | 精神疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用CSD和非应激对照的小鼠模型 |
| 17243 | 2024-08-07 |
Intrahepatic macrophage reprogramming associated with lipid metabolism in hepatitis B virus-related acute-on-chronic liver failure
2023-06-28, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04294-1
PMID:37380987
|
研究论文 | 本研究探讨了慢性乙型肝炎相关急性慢性肝衰竭（ACLF）中肝脏内巨噬细胞的重编程与脂质代谢的关系 | 首次揭示了ACLF中肝脏内巨噬细胞的免疫抑制功能及其与脂质代谢的关联 | NA | 描绘ACLF期间肝脏的免疫微环境，并探索脂质代谢紊乱对免疫的作用 | 肝脏非实质细胞（NPCs）和外周血单个核细胞（PBMCs） | NA | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 健康对照组、肝硬化患者和ACLF患者的肝脏非实质细胞及外周血单个核细胞 |
| 17244 | 2024-08-07 |
Integrative analysis of single-cell and bulk RNA sequencing unveils the senescence landscape in ischemic stroke
2023-06-28, Aging
DOI:10.18632/aging.204804
PMID:37382646
|
研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞和批量RNA测序数据，揭示了缺血性中风中的衰老景观 | 本研究首次通过综合分析多个数据集的转录组数据，识别了与衰老相关的关键基因，并验证了其在缺血性中风病理过程中的作用 | NA | 探索细胞衰老在缺血性中风病理过程中的潜在作用 | 缺血性中风中的细胞衰老及相关基因 | 数字病理学 | 中风 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多个数据集（GSE163654, GSE16561, GSE119121, GSE174574） |
| 17245 | 2024-08-07 |
Identification of potential biomarkers for idiopathic pulmonary fibrosis and validation of TDO2 as a potential therapeutic target
2023-Jun-26, World journal of cardiology
IF:1.9Q3
DOI:10.4330/wjc.v15.i6.293
PMID:37397828
|
研究论文 | 本研究通过公共数据集识别特发性肺纤维化（IPF）患者与健康捐赠者之间的差异表达基因，并验证TDO2作为潜在治疗靶点的有效性 | 发现TDO2在IPF患者中上调并预测不良预后，且在单细胞RNA测序数据中在肺泡成纤维细胞中显著富集，表明TDO2可能参与增殖和生存的调控 | NA | 探索IPF治疗的新枢纽基因 | 特发性肺纤维化（IPF）患者 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 定量实时聚合酶链反应 | NA | RNA测序数据 | 实验中使用了IPF患者和健康捐赠者的样本，以及TGF-β诱导的肺纤维化小鼠模型 |
| 17246 | 2024-08-05 |
GENE EXPRESSION WITHIN A HUMAN CHOROIDAL NEOVASCULAR MEMBRANE USING SPATIAL TRANSCRIPTOMICS
2023-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.16.544770
PMID:37398429
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析了人类眼睛中与年龄相关的黄斑变性相关的黄斑新生血管膜内的基因表达 | 首次使用空间RNA测序技术揭示了黄斑新生血管化区域内不同细胞类型的基因表达变化 | 该研究仅基于有限的样本量，主要为单一供体的眼睛 | 探究年龄相关性黄斑变性中的黄斑新生血管化过程中的基因表达变化 | 对比分析黄斑新生血管化患者与健康供体眼睛的基因表达 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 空间RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1个黄斑新生血管化供体和1个健康供体 |
| 17247 | 2024-08-05 |
SCS: cell segmentation for high-resolution spatial transcriptomics
2023-Jun-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.11.523658
PMID:37398213
|
研究论文 | 本文提出了SCS，一种结合成像数据和测序数据以提高细胞分割准确性的技术 | SCS使用变换器神经网络自适应地学习每个点相对于其细胞中心的位置，从而提高细胞分割精度 | 传统的基于图像的分割方法存在限制，未充分利用空间转录组学提供的信息 | 提高高分辨率空间转录组学中的细胞分割精度 | 测试SCS在两种新型亚细胞空间转录组学技术中的表现 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 变换器神经网络 | 成像数据和测序数据 | NA |
| 17248 | 2024-08-05 |
Combined near infrared photoacoustic imaging and ultrasound detects vulnerable atherosclerotic plaque
2023-Jun-12, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.06.11.23291099
PMID:37398016
|
研究论文 | 本文展示了近红外光声成像与超声结合用于检测易损斑块 | 文章创新性地将近红外光声成像与超声成像结合，以区分稳定与易损斑块 | 目前的研究仅限于25名患者的切除斑块 | 研究目的在于有效识别和表征动脉粥样硬化斑块的形态和脆弱性 | 研究对象为25名患者的动脉粥样硬化斑块样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 近红外光声成像 | NA | 斑块样本 | 25个切除的斑块样本 |
| 17249 | 2024-08-05 |
Spatially resolved expression landscape and gene-regulatory network of human gastric corpus epithelium
2023-06-07, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwac059
PMID:37402315
|
研究论文 | 文章揭示了人类胃体上皮的空间表达景观和基因调控网络 | 首次系统性地分析了人类胃体上皮的细胞多样性和稳态 | 研究可能缺乏对胃体其他区域的广泛性分析 | 揭示人类胃体上皮的分子特征和基因调控机制 | 研究了人类胃体上皮细胞及其干/前体细胞群体 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学、单细胞可接触染色质测序(scATAC-seq) | NA | NA | NA |
| 17250 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing of individual retinal organoids reveals determinants of cell fate heterogeneity
2023-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.31.543087
PMID:37398481
|
研究论文 | 本文探讨了利用单细胞测序分析视网膜类器官中细胞命运异质性的决定因素 | 创新地应用了sci-Plex方法来扩展对视网膜类器官细胞组成的分析 | 当前技术对处理条件的限制阻碍了类器官异质性的研究 | 研究类器官的异质性及其对人类发展和疾病模型的贡献 | 视网膜类器官及其细胞类别的组成 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 细胞组成数据 | 410个类器官 |
| 17251 | 2024-08-07 |
Single-cell lineage tracing reveals hierarchy and mechanism of adipocyte precursor maturation
2023-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.01.543318
PMID:37398135
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序技术揭示了皮肤中脂肪细胞前体细胞的特征及其成熟机制 | 发现了新的未成熟前脂肪细胞群体，揭示了前体细胞的分化潜能偏向性，并首次识别出Sox9作为驱动前体细胞向脂肪细胞分化的关键因子 | NA | 探究脂肪细胞前体细胞的成熟过程及其分子机制 | 皮肤中的脂肪细胞前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未提及 |
| 17252 | 2024-08-07 |
Boosting Single-Cell RNA Sequencing Analysis with Simple Neural Attention
2023-Jun-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.29.542760
PMID:37398136
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scANNA的新型可解释深度学习模型，用于单细胞RNA测序研究，利用神经注意力学习基因关联 | scANNA模型通过神经注意力机制提高了单细胞RNA测序分析的可解释性，并能在不重新训练的情况下进行下游分析 | 当前深度学习方法在单细胞RNA测序分析中缺乏可解释性，且现有流程是为特定任务设计的，不适用于分析的不同阶段 | 开发一种可解释的深度学习模型，以提高单细胞RNA测序分析的效率和可解释性 | 单细胞RNA测序数据分析 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经注意力模型 | 基因表达数据 | NA |
| 17253 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals microenvironment context-specific routes for epithelial-mesenchymal transition in pancreas cancer cells
2023-May-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.30.542969
PMID:37398348
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术探讨胰腺癌细胞在缺氧或生长因子诱导下上皮-间质转化（EMT）的转录基础 | 发现FAT1蛋白在上皮细胞中富集并抑制EMT，以及AXL受体酪氨酸激酶在缺氧条件下与YAP核定位相关，这些发现为胰腺癌治疗提供了新的潜在药物靶点 | 研究主要集中在单细胞RNA测序数据分析，未涉及临床试验验证 | 揭示胰腺癌细胞在不同微环境条件下EMT的特定信号通路 | 胰腺癌细胞在缺氧或生长因子诱导下的上皮-间质转化 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 17254 | 2024-08-05 |
Transcriptome sequencing and single-cell sequencing analysis identify GARS1 as a potential prognostic and immunotherapeutic biomarker for multiple cancers, including bladder cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1169588
PMID:37404826
|
研究论文 | 本研究识别GARS1作为多种癌症（包括膀胱癌）的潜在预后和免疫治疗生物标志物 | GARS1在多种癌症中表现出预后价值，并与免疫调节通路紧密相关，未被广泛探索 | GARS1的角色在肿瘤免疫学中的影响仍然未完全理解 | 研究GARS1在多种癌症中的表达及其预后和免疫学影响 | 人类癌症中的GARS1表达及其在膀胱癌细胞中的生物学功能 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 转录组测序和单细胞测序 | NA | mRNA和蛋白表达数据，单细胞数据 | NA |
| 17255 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing reveals tumor heterogeneity and a signature based on NK cell marker genes for predicting prognosis in hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1200114
PMID:37397471
|
研究论文 | 本文构建了一个基于NK细胞相关基因的肝细胞 carcinoma (HCC) 患者预后预测模型 | 使用NK细胞标记基因作为创新生物标志物进行HCC的预后评估 | NA | 研究旨在评估NK细胞相关基因预测HCC患者预后的可行性 | 以肝细胞癌患者为研究对象 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序 | Cox回归和lasso回归 | 基因表达数据 | 从TCGA数据集中获得数据，涉及161个HCC相关的NK细胞标记基因 |
| 17256 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics and data analyses for prokaryotes-Past, present and future concepts
2023, Advances in applied microbiology
DOI:10.1016/bs.aambs.2023.04.002
PMID:37400172
|
研究论文 | 这篇文章探讨了原核生物的单细胞转录组学及其数据分析的过去、现在和未来概念 | 提出了针对细菌的单细胞RNA测序新方法，并讨论了实验与数据分析中面临的挑战 | 在实验工作流程和数据处理分析中仍然存在难题，例如放大过程中引入的偏差 | 研究原核生物单细胞转录组学的应用以及如何优化实验和数据分析 | 主要针对原核生物，尤其是细菌的单细胞mRNA测序 | 数字病理学 | NA | mRNA测序 | NA | NA | NA |
| 17257 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA sequencing of leaf sheath cells reveals the mechanism of rice resistance to brown planthopper (Nilaparvata lugens)
2023, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2023.1200014
PMID:37404541
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术揭示了水稻对褐飞虱的抗性机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术分析了不同水稻细胞类型在抵抗褐飞虱中的作用 | 研究的细胞类型尚不全面，可能遗漏其他相关细胞的作用 | 探讨水稻对褐飞虱的抗性分子机制 | 比较易感和抗性水稻品种的叶鞘细胞反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 共分析了30,000个细胞来自两个水稻品种 |
| 17258 | 2024-08-05 |
Deciphering the contributions of cuproptosis in the development of hypertrophic scar using single-cell analysis and machine learning techniques
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1207522
PMID:37409114
|
研究论文 | 本研究探讨了铜诱导细胞死亡在肥厚性瘢痕形成中的作用。 | 通过单细胞分析和机器学习算法，鉴定出新的治疗靶标基因（如ATP7A、ULK1和MTF1）并提出治疗新思路。 | 未提及样本量和具体实验设置的详细信息，可能影响结果的普适性。 | 研究铜诱导细胞死亡在肥厚性瘢痕形成中的潜在作用。 | 主要关注肥厚性瘢痕及相关细胞（如成纤维细胞）。 | 数字病理学 | 肥厚性瘢痕 | 单细胞测序，转录组数据分析，qRT-PCR | 随机森林，支持向量机 | 基因表达数据 | 未提供具体的样本量 |
| 17259 | 2024-08-05 |
Integration analysis of single-cell and spatial transcriptomics reveal the cellular heterogeneity landscape in glioblastoma and establish a polygenic risk model
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1109037
PMID:37397378
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组测序分析了胶质母细胞瘤的细胞异质性，建立了一个多基因风险模型 | 该研究提出了一种基于恶性细胞转变的TPRGRS，通过整合分析bulkRNA-seq和scRNA-seq数据，为胶质母细胞瘤患者提供个性化药物方案的可能性 | 未提及研究的具体局限性 | 探究胶质母细胞瘤中的细胞异质性及其对肿瘤进展的影响 | 胶质母细胞瘤中的恶性细胞亚群体 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 空间转录组测序 (stRNA-seq), bulk RNA测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 涉及三个数据集的患者样本 |
| 17260 | 2024-08-05 |
A tricarboxylic acid cycle-based machine learning model to select effective drug targets for the treatment of esophageal squamous cell carcinoma
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1195195
PMID:37383713
|
研究论文 | 本文基于TCA循环相关基因构建了一种预测食管鳞状细胞癌的风险评分模型 | 创新性地将TCA循环基因与食管鳞状细胞癌相关联，并建立预测模型 | 未全面探讨TCA循环在食管鳞状细胞癌中的所有潜在作用 | 研究TCA循环基因在食管鳞状细胞癌中的角色，并预测患者预后 | 食管鳞状细胞癌样本及相关TCA循环基因 | 机器学习 | 食管癌 | 单细胞测序 | Cox回归和Lasso回归模型 | 基因表达数据 | 38类8种细胞类型的单细胞序列数据 |