单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27648 篇文献，本页显示第 17241 - 17260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 17241 | 2024-08-07 |
Targeting the Immunoglobulin IGSF9 Enhances Antitumor T-cell Activity and Sensitivity to Anti-PD-1 Immunotherapy
2023-Oct-13, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-3115
PMID:37506192
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研究论文 | 本文研究了免疫球蛋白超家族成员9（IGSF9）在肿瘤细胞和肿瘤浸润免疫细胞中的表达，并探讨了其作为免疫检查点在肿瘤免疫逃逸中的作用 | 发现IGSF9通过抑制T细胞增殖和激活促进肿瘤免疫逃逸，为免疫治疗提供了新的靶点 | 研究主要集中在体外和小鼠模型中，需要进一步的人体临床试验验证 | 探索新的免疫检查点以改善癌症患者的免疫治疗反应 | 免疫球蛋白超家族成员9（IGSF9）在肿瘤免疫逃逸中的作用 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及多种癌症类型的肿瘤细胞和肿瘤浸润免疫细胞 |
| 17242 | 2024-08-05 |
Single-cell profiling of muscle-infiltrating T cells in idiopathic inflammatory myopathies
2023-10-11, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.15252/emmm.202217240
PMID:37522383
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研究论文 | 本研究深入分析了特发性炎症性肌病患者中浸润肌肉的T细胞 | 揭示了特发性炎症性肌病患者肌肉组织中存在的记忆T细胞特征，并提供了识别新的治疗靶点的转录组图谱 | 样本量较小，仅涉及六名患者，可能限制结果的普遍性 | 探讨特发性炎症性肌病患者浸润肌肉的T细胞特征 | 六名最近被诊断为特发性炎症性肌病的患者 | 数字病理学 | 特发性炎症性肌病 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 六名患者的肌肉和外周血记忆T细胞 |
| 17243 | 2024-08-05 |
Emerging Concepts in Precision Medicine in Axial Spondyloarthritis
2023-10, Current rheumatology reports
IF:5.7Q1
DOI:10.1007/s11926-023-01113-w
PMID:37505349
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研究论文 | 本文回顾了轴性脊柱关节炎中精准医学的新兴概念和最近发展 | 探讨了多基因风险评分、孟德尔随机化、药物基因组学、单细胞测序和空间转录组学等新思想 | 在临床应用之前，需要大量研究和实施策略 | 探索精准医学在轴性脊柱关节炎患者中的应用 | 关注于轴性脊柱关节炎患者的遗传风险因素和免疫反应 | 数字病理学 | NA | 多基因风险评分、孟德尔随机化、药物基因组学、单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 17244 | 2024-08-07 |
NLRRC: A Novel Clustering Method of Jointing Non-Negative LRR and Random Walk Graph Regularized NMF for Single-Cell Type Identification
2023-10, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2023.3299748
PMID:37506010
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研究论文 | 本文提出了一种名为NLRRC的新型矩阵分解方法，用于单细胞类型识别，结合非负低秩表示和随机游走图正则化NMF | NLRRC方法通过非负低秩表示和随机游走图正则化NMF，有效地揭示了细胞的自然分组，提高了单细胞类型识别的准确性 | NA | 研究旨在提高单细胞RNA测序数据分析中细胞聚类的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞聚类 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NMF | 基因表达数据 | 模拟和真实单细胞数据集 |
| 17245 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing identifies macrophage signatures correlated with clinical features and tumour microenvironment in meningiomas
2023-10, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.12074
PMID:37515398
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术识别与脑膜瘤相关的巨噬细胞特征，并分析这些特征与临床特征及肿瘤微环境的关系 | 本研究首次使用高维度加权基因共表达网络分析（hdWGCNA）识别与脑膜瘤相关的巨噬细胞模块基因，并构建了基于这些基因的机器学习模型来预测肿瘤等级 | NA | 旨在识别与脑膜瘤相关的巨噬细胞模块基因，并分析其与临床特征和免疫浸润的相关性 | 脑膜瘤及其相关的巨噬细胞 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 两对脑膜瘤和正常脑膜样本 |
| 17246 | 2024-08-07 |
scDeepInsight: a supervised cell-type identification method for scRNA-seq data with deep learning
2023-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad266
PMID:37523217
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研究论文 | 本文提出了一种名为scDeepInsight的监督式细胞类型识别方法，用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据 | scDeepInsight方法通过将表格形式的scRNA-seq数据转换为图像，并使用卷积神经网络进行特征提取，实现了更精确的细胞类型识别 | NA | 旨在提高单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | CNN | 图像 | 未具体说明样本数量 |
| 17247 | 2024-08-07 |
Approximate estimation of cell-type resolution transcriptome in bulk tissue through matrix completion
2023-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad273
PMID:37529921
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研究论文 | 本文介绍了一种基于矩阵完成的方法ENIGMA，用于将批量组织RNA-seq数据准确地反卷积为具有细胞类型分辨率的读数，通过利用scRNA-seq数据信息 | ENIGMA方法通过矩阵完成策略，最小化批量测序获得的混合转录组与细胞类型特异性表达加权组合之间的距离，从而量化细胞类型比例并重建细胞类型特异性转录组 | NA | 开发一种方法，以较低成本从批量组织RNA-seq数据中获得细胞类型分辨率的转录组信息 | 批量组织RNA-seq数据和scRNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 矩阵完成 | RNA-seq数据 | NA |
| 17248 | 2024-08-07 |
The Critical Interplay of CAF Plasticity and Resistance in Prostate Cancer
2023-09-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-2260
PMID:37504898
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研究论文 | 研究揭示了前列腺癌中CAF可塑性与耐药性的关键相互作用 | 首次通过单细胞RNA测序在基因工程小鼠模型中揭示了SPP1+肌成纤维细胞样癌症相关成纤维细胞（myCAF）在去势抵抗性前列腺癌（CRPC）发展中的重要作用 | 研究主要集中在小鼠模型中，未来需在人类样本中验证这些发现 | 探讨肿瘤微环境在前列腺癌复发和药物耐药中的作用 | 前列腺癌中的癌症相关成纤维细胞（CAF）及其在去势抵抗性前列腺癌（CRPC）中的作用 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用不同阶段的前列腺肿瘤的基因工程小鼠模型 |
| 17249 | 2024-08-07 |
Targeting CD301+ macrophages inhibits endometrial fibrosis and improves pregnancy outcome
2023-09-11, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.15252/emmm.202317601
PMID:37519221
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、批量RNA测序和实验验证，发现CD301+巨噬细胞在宫腔粘连（IUA）患者中的数量显著增加，并促进子宫内膜纤维化，影响妊娠结局。 | 首次报道CD301+巨噬细胞在子宫内膜纤维化中的作用及其机制，为治疗子宫内膜纤维化提供新的治疗靶点。 | NA | 探讨CD301+巨噬细胞在子宫内膜纤维化中的作用及其治疗潜力。 | CD301+巨噬细胞在宫腔粘连患者中的作用及其对子宫内膜纤维化的影响。 | NA | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 17250 | 2024-08-05 |
Chromatin accessibility memory of donor cells disrupts bovine somatic cell nuclear transfer blastocysts development
2023-09, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202300131RRR
PMID:37531300
|
研究论文 | 本研究探讨了牛体细胞核转移（SCNT）胚泡发育中的染色质可及性异常。 | 首次在SCNT胚泡阶段探讨了染色质可及性对基因转录活性的影响，揭示了与内细胞团（ICM）发育相关的转录因子可及性的异常。 | 研究主要集中在SCNT胚泡阶段的特定转录因子，并未涵盖所有可能影响胚泡发育的因素。 | 研究染色质可及性对牛SCNT胚泡发育的影响，旨在提高SCNT的效率。 | 牛SCNT胚泡与体内发育胚泡。 | 数字病理学 | NA | scATAC-seq | NA | NA | NA |
| 17251 | 2024-08-05 |
Deep learning exploration of single-cell and spatially resolved cancer transcriptomics to unravel tumour heterogeneity
2023-09, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107274
PMID:37506451
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研究论文 | 本研究探讨了深度学习在单细胞和空间转录组学中的应用，以揭示肿瘤异质性 | 提出了利用深度学习框架解决单细胞和空间转录组数据挑战的新方法 | 单细胞转录组数据噪声大，稀疏特性和掉失可能导致基因表达解读错误 | 旨在利用深度学习探讨肿瘤异质性 | 研究对象为肿瘤细胞的转录组数据 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞测序和空间转录组测序 | 深度学习框架 | 转录组数据 | NA |
| 17252 | 2024-08-05 |
[Interactions between vascular endothelium and immune cells: A key control point of radiation-induced digestive lesions]
2023-Sep, Cancer radiotherapie : journal de la Societe francaise de radiotherapie oncologique
IF:1.5Q3
DOI:10.1016/j.canrad.2023.06.013
PMID:37516639
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研究论文 | 本研究探讨了血管内皮与免疫细胞之间的相互作用在放射性诱导的消化损伤中的关键作用 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，对组织内异质细胞群体进行综合研究，揭示了细胞间的相互作用网络 | 当前研究对临床人类样本的应用仍有限，系统学挑战仍待解决 | 理解放射性诱导消化损伤的病理机制及细胞通信网络 | 异质性细胞群体，包括上皮细胞、免疫细胞和内皮细胞等 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 17253 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing: New insights for intervertebral disc degeneration
2023-Sep, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2023.115224
PMID:37516017
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review | 本综述介绍了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在椎间盘退变（IVDD）研究中的应用 | 首次介绍了scRNA-seq技术在IVDD中的应用，重点是最新研究中细胞类型群体和细胞间相互作用的定义 | NA | 研究IVDD的生物机制，特别是细胞异质性及其与炎症的关系 | IVDD中的主要靶细胞，包括髓核细胞、纤维环细胞、软骨终板细胞和巨噬细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | NA |
| 17254 | 2024-08-05 |
CL-Impute: A contrastive learning-based imputation for dropout single-cell RNA-seq data
2023-09, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107263
PMID:37531858
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研究论文 | 本文提出了一种新颖的方法CL-Impute，用于估计缺失的基因数据 | CL-Impute模型利用对比学习和自注意力网络来解决高缺失率下的scRNA-seq数据插补问题 | 目前尚未提到CL-Impute在特定应用场景中的表现，可能在实际应用中有不确定性 | 研究如何通过无依赖的方式处理单细胞RNA测序中的缺失数据 | 缺失基因数据的插补任务 | 数字病理学 | NA | 对比学习 | 自注意力网络 | 单细胞RNA-seq数据 | 四个基准数据集的实验结果 |
| 17255 | 2024-08-07 |
Atonal homolog 7 (ATOH7) confers neuroprotection for photoreceptor cells in glaucoma via inhibition of the notch pathway
2023-09, Journal of neurochemistry
IF:4.2Q2
DOI:10.1111/jnc.15905
PMID:37526008
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序数据，揭示了青光眼相关的基因及其下游具有神经保护作用的通路 | 首次发现ATOH7基因通过抑制Notch信号通路在青光眼中对光感受器细胞具有神经保护作用 | 研究主要基于体外细胞实验和单细胞RNA测序数据，需要进一步的体内实验验证 | 探究青光眼中光感受器细胞的神经保护机制 | 人类和ATOH7基因敲除小鼠的视网膜组织样本 | 数字病理学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类视网膜组织样本中获得74个顶级标记基因和20个细胞集群，ATOH7基因敲除小鼠视网膜组织样本中进行伪时间推断 |
| 17256 | 2024-08-07 |
Sex shapes cell-type-specific transcriptional signatures of stress exposure in the mouse hypothalamus
2023-08-29, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112874
PMID:37516966
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术，研究了雄性和雌性小鼠下丘脑室旁核在急性束缚应激下的细胞类型特异性转录组特征 | 首次揭示了慢性轻度应激对细胞类型特异性转录组特征的性别特异性影响，并识别了寡突胶质细胞作为这些性别特异性效应的主要目标 | NA | 探索细胞类型对转录性别二态性的贡献，并深入解析细胞类型与性别在应激反应机制中的相互作用 | 雄性和雌性小鼠的下丘脑室旁核在急性束缚应激下的细胞类型特异性转录组特征 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 数千个单个细胞的转录组数据 |
| 17257 | 2024-08-05 |
sox1a:eGFP transgenic line and single-cell transcriptomics reveal the origin of zebrafish intraspinal serotonergic neurons
2023-Aug-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107342
PMID:37529101
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研究论文 | 本研究揭示了斑马鱼脊髓内5-羟色胺神经元的起源 | 通过单细胞转录组学分析，发现脊髓内5-羟色胺神经元源自侧地板板祖细胞 | 未在标题和摘要中明确提及局限性 | 探究斑马鱼脊髓内5-羟色胺神经元的起源及其发育轨迹 | 斑马鱼胚胎发育过程中脊髓中的祖细胞和神经元 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 在四个胚胎发育时期进行的单细胞分析 |
| 17258 | 2024-08-07 |
Dendritic cell type 3 arises from Ly6C+ monocyte-dendritic cell progenitors
2023-08-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2023.07.001
PMID:37506694
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研究论文 | 本研究通过LEGENDScreen分析树突状细胞与单核细胞谱系，利用命运图谱模型、单细胞RNA测序和过继转移技术，揭示了小鼠CD16/32CD172a DC3细胞系起源于Ly6C单核细胞-树突状细胞前体细胞，与DC2细胞系不同 | 发现了DC3作为与单核细胞和DC2在表型上相关但发育上不同的树突状细胞系 | NA | 探究树突状细胞的亚型及其发育起源 | 树突状细胞的亚型和发育路径 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和人类样本 |
| 17259 | 2024-08-05 |
M7G methylated core genes (METTL1 and WDR4) and associated RNA risk signatures are associated with prognosis and immune escape in HCC
2023-08-01, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-023-01614-8
PMID:37528384
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研究论文 | 本研究探讨了m7G甲基化核心基因（METTL1和WDR4）及相关RNA风险特征在HCC中的作用 | 识别了METTL1和WDR4作为HCC独立预后标志物，构建了与其相关的mRNA和lncRNA风险特征 | 研究中对其他可能影响预后的因素探讨不足 | 研究m7G甲基化核心基因对肝细胞癌（HCC）的影响 | 针对肝细胞癌细胞系和组织中的METTL1和WDR4进行分析 | NA | 肝癌 | 加权共表达网络分析(WGCNA)和最小绝对收缩选择运算符法（lasso） | NA | mRNA和lncRNA | 使用了四个HCC细胞系及相关HCC组织 |
| 17260 | 2024-08-05 |
Multiomics analyses reveal pathological mechanisms of HBV infection and integration in liver cancer
2023-08, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.28980
PMID:37522289
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研究论文 | 本研究揭示了HBV感染与整合在肝癌中的病理机制 | 该研究首次结合多组学分析，识别了HBV感染相关的风险位点及其在肝癌中的作用 | 研究主要集中在HBV关联的HCC，未涵盖其他类型肝病的机制 | 探讨HBV感染与肝细胞癌发展的机制 | 研究对象为HBV感染的肝细胞癌患者及其肝细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序技术与大规模测序技术 | NA | 基因组数据 | 多个独立患者队列 |