单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 17221 - 17240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 17221 | 2024-08-05 |
Epigenetically regulated RNA-binding proteins signify malaria hypnozoite dormancy
2023-07-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112727
PMID:37392389
|
研究论文 | 本研究探讨了调控假疟疾休眠状态的RNA结合蛋白。 | 首次揭示了调控假疟疾休眠的RNA结合蛋白及其基因沉默机制。 | 本研究主要集中在特定基因和模型的分析，可能未涵盖所有相关因子。 | 探索假疟疾休眠的基因调控机制。 | 假疟疾寄生虫，包括Plasmodium vivax和cynomolgi。 | 数字病理学 | 无效疟疾 | 单细胞转录组学，染色质可及性分析，荧光原位RNA杂交 | NA | 基因组数据 | NA |
| 17222 | 2024-08-05 |
Glutamine supplementation reverses manganese neurotoxicity by eliciting the mitochondrial unfolded protein response
2023-Jul-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107136
PMID:37408687
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研究论文 | 这篇文章研究了谷氨酰胺补充如何通过激发线粒体未折叠蛋白反应来逆转锰神经毒性 | 该研究揭示了谷氨酰胺通过增加谷胱甘肽浓度来触发线粒体未折叠蛋白反应，从而减轻锰引起的神经毒性 | 研究主要集中于斑马鱼和人类神经母细胞瘤细胞，结果可能不完全适用于其他神经组织或动物模型 | 探索改善神经线粒体代谢以治疗锰引起的神经毒性的潜在机制 | 研究对象包括斑马鱼多巴胺能神经元和人类神经母细胞瘤SH-SY5Y细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序和代谢组学分析 | NA | 细胞数据 | 斑马鱼和人类神经母细胞瘤细胞 |
| 17223 | 2024-08-07 |
Identification of BST2 as a conjunctival epithelial stem/progenitor cell marker
2023-Jul-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107016
PMID:37389178
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，从人诱导多能干细胞（hiPSCs）衍生的结膜上皮细胞群体中鉴定出结膜上皮干细胞/祖细胞的特异性标记物BST2 | 首次鉴定出BST2作为结膜上皮干细胞/祖细胞的特异性标记物，并验证了其在分离和扩增这些细胞中的应用 | NA | 鉴定结膜上皮干细胞/祖细胞的特异性标记物 | 结膜上皮干细胞/祖细胞及其标记物 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从人诱导多能干细胞（hiPSCs）衍生的结膜上皮细胞群体 |
| 17224 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of human fetal epicardium reveals its cellular composition and identifies CRIP1 as a modulator of EMT
2023-07-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2023.06.002
PMID:37390825
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了人类胎儿心外膜的细胞组成，并鉴定了CRIP1作为上皮-间质转化（EMT）的调节因子 | 本研究首次鉴定了CRIP1作为心外膜上皮-间质转化的未知调节因子，并提供了人类胎儿心外膜细胞的高质量数据集 | 研究中观察到的特定亚群较少，可能限制了对心外膜异质性的全面理解 | 旨在定义人类胎儿心外膜的细胞组成，并识别发育过程中的调节因子 | 人类胎儿心外膜细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 17225 | 2024-08-07 |
The tumor suppressor CREBBP and the oncogene MYCN cooperate to induce malignant brain tumors in mice
2023-Jul-05, Oncogenesis
IF:5.9Q1
DOI:10.1038/s41389-023-00481-3
PMID:37407554
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研究论文 | 研究CREBBP肿瘤抑制基因和MYCN癌基因在诱导小鼠恶性脑肿瘤中的协同作用 | 首次通过hGFAP-cre::Crebbp::lsl-MYCN小鼠模型，结合CREBBP缺失和MYCN在神经干细胞中的过表达，研究了这两种基因在脑肿瘤形成中的协同作用 | NA | 探究CREBBP和MYCN基因在脑肿瘤形成中的协同作用及其机制 | CREBBP和MYCN基因在神经干细胞中的功能及其在脑肿瘤形成中的作用 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | hGFAP-cre::Crebbp::lsl-MYCN小鼠模型中的神经干细胞 |
| 17226 | 2024-08-07 |
Premature aging of skeletal stem/progenitor cells rather than osteoblasts causes bone loss with decreased mechanosensation
2023-Jul-05, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-023-00269-6
PMID:37407584
|
研究论文 | 本研究通过条件性敲除小鼠中的Zmpste24（Z24）建立了早衰模型，发现Prx1依赖的Z24缺失导致显著的骨丢失，而Acan相关的Z24缺失仅导致小梁骨丢失。单细胞RNA测序揭示了两群骨骼干细胞/祖细胞（SSPCs）在早衰中的减少，这些细胞表现出凋亡信号通路的激活和机械感受的减少。 | 本研究首次确定了两种早衰相关骨丢失的SSPCs群体，并揭示了Z24缺陷SSPCs中机械感受受损的新机制，为通过体育锻炼预防骨老化提供了新见解。 | NA | 研究早衰相关的骨丢失机制及其与机械感受的关系。 | 骨骼干细胞/祖细胞（SSPCs）及其在早衰中的变化。 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 17227 | 2024-08-05 |
Robustness of single-cell RNA-seq for identifying differentially expressed genes
2023-Jul-03, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09487-y
PMID:37394518
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研究论文 | 本研究探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在识别差异表达基因（DEGs）方面的稳健性。 | 本研究首次量化了识别DEGs所需的细胞数量，为研究设计提供了参考。 | 研究仅限于人类诱导多能干细胞衍生的细胞，可能不适用于其他类型的细胞。 | 旨在评估在不同细胞数量下识别DEGs的有效性。 | 研究对象为人类诱导多能干细胞衍生的血管内皮细胞和平滑肌细胞。 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和聚腺苷酸依赖的RNA测序（bulk RNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 实验涉及的细胞数量范围从50到2000个 |
| 17228 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing analysis of peripheral blood in patients with moyamoya disease
2023-07-03, Orphanet journal of rare diseases
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s13023-023-02781-8
PMID:37400835
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研究论文 | 本研究首次展示了人群中脑血管疾病的一种外周血单细胞测序景观，揭示了细胞异质性和基因表达异质性 | 首次采用单细胞测序技术研究了颅内动脉狭窄症的外周血样本，为该疾病提供了新的基因组快照 | 样本量较小，仅涉及两名患者，可能影响结果的普遍性 | 探索颅内动脉狭窄症的发生和发展机制 | 颅内动脉狭窄症患者的外周血样本 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 2名患者的外周血样本和4个正常对照样本 |
| 17229 | 2024-08-07 |
Author Correction: Single-cell RNA sequencing reveals the effects of chemotherapy on human pancreatic adenocarcinoma and its tumor microenvironment
2023-Jul-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39680-2
PMID:37400453
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17230 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing for the study of kidney disease
2023-07-03, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-023-00693-8
PMID:37400792
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在肾脏疾病研究中的应用及其相关技术平台 | scRNA-seq技术在肾脏病学中的应用发展迅速，有助于深入理解肾脏疾病的起始和发展机制 | NA | 总结scRNA-seq技术在肾脏疾病研究中的应用，为肾脏疾病的诊断、治疗和预后提供参考 | 主要涉及狼疮性肾炎、肾细胞癌、糖尿病肾病和急性肾损伤等常见肾脏疾病 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 17231 | 2024-08-05 |
[Mechanism of intestinal injury induced by WNT2B high-expressed fibroblasts in Crohn's disease]
2023-Jul-02, Zhonghua er ke za zhi = Chinese journal of pediatrics
|
研究论文 | 本研究探讨了WNT2B高表达成纤维细胞诱导的巨噬细胞介导的肠组织损伤机制 | 揭示了WNT2B高表达成纤维细胞与巨噬细胞之间的相互作用，以及这一过程如何促进克罗恩病的肠道炎症发展 | 样本量较小，只涉及10名患有克罗恩病的儿童，可能影响结果的普遍性 | 旨在阐明克罗恩病中由WNT2B高表达成纤维细胞诱导的肠组织损伤机制 | 对10名克罗恩病儿童的肠道组织进行病理研究和细胞实验 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞测序、HE染色、免疫荧光、实时定量PCR、酶联免疫吸附测定(ELISA)、西方印迹 | NA | 组织、细胞 | 10名克罗恩病儿童（9.3±3.8岁，7名男性和3名女性） |
| 17232 | 2024-08-05 |
Dissecting the effect of ileal faecal diversion on the intestine using single-cell sequencing
2023-07, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1321
PMID:37400975
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研究论文 | 本研究揭示了回肠粪便分流对肠道的影响及潜在机制 | 通过单细胞RNA测序，我们揭示了功能正常与功能失常肠道之间细胞亚群的不同转录组景观 | 样本量较小，仅来自三名患者 | 探讨回肠粪便分流对肠道的影响及相关机制 | 来自三名接受回肠粪便分流患者的肠道粘膜样本 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 3名患者的肠道粘膜样本 |
| 17233 | 2024-08-05 |
Multi-omics analysis of DNA replication-associated primase polymerase (PRIMPOL) in pan-cancer: a potential target for prognosis and immune response
2023-Jun-30, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-023-01181-9
PMID:37391787
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研究论文 | 本研究系统分析了DNA复制相关的引物聚合酶（PRIMPOL）在泛癌症中的功能角色 | 首次对PRIMPOL在多种癌症中的作用进行了全面的多组学分析 | 缺乏针对不同类型癌症的具体机制探讨 | 阐明PRIMPOL在多种人类癌症中的生物学角色 | 重点研究PRIMPOL在多种癌症中的表达模式和预后价值 | 数字病理学 | NA | 生物信息学算法 | NA | 多组学数据 | NA |
| 17234 | 2024-08-05 |
Robust reconstruction of single-cell RNA-seq data with iterative gene weight updates
2023-06-30, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad253
PMID:37387155
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研究论文 | 本文提出一种算法，通过迭代基因权重更新，以改善单细胞RNA-seq数据的组织重建质量 | 创新之处在于提出了一种迭代识别丰富信息基因的算法，以增强组织重建的准确性 | 在缺乏信息可用时，生物重建依然面临计算挑战 | 旨在通过改进算法来提升单细胞RNA序列数据的组织重建质量 | 研究对象为不同合成和真实的单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 数据集 | 包括来自哺乳动物肠上皮和肝小叶的数据 |
| 17235 | 2024-08-07 |
Cell type matching across species using protein embeddings and transfer learning
2023-06-30, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad248
PMID:37387141
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研究论文 | 本文介绍了一种名为TACTiCS的模型，用于跨物种分析中的细胞类型转移和匹配 | TACTiCS模型利用自然语言处理模型匹配基因的蛋白质序列，并通过神经网络和迁移学习在不同物种间传播细胞类型标签，从而在跨物种细胞类型匹配中表现优异 | NA | 旨在解决跨物种细胞类型匹配的问题，以便更好地将实验结果从啮齿类动物翻译到人类 | 人类、小鼠和狨猴的初级运动皮层scRNA-seq数据 | 自然语言处理 | NA | scRNA-seq | 神经网络 | 序列 | 涉及人类、小鼠和狨猴的初级运动皮层数据 |
| 17236 | 2024-08-07 |
CellBRF: a feature selection method for single-cell clustering using cell balance and random forest
2023-06-30, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad216
PMID:37387178
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CellBRF的特征选择方法，该方法利用细胞平衡和随机森林来提高单细胞聚类的准确性和可解释性 | CellBRF通过考虑基因对细胞类型的相关性，并采用类平衡策略来减轻不平衡细胞类型分布对特征重要性评估的影响，从而提高了单细胞聚类的性能 | NA | 提高单细胞RNA测序数据聚类的准确性和细胞邻域一致性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞亚群识别 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | 随机森林 | 基因表达数据 | 33个scRNA-seq数据集 |
| 17237 | 2024-08-07 |
Atoh1 drives the heterogeneity of the pontine nuclei neurons and promotes their differentiation
2023-06-30, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adg1671
PMID:37390208
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探讨了Atoh1在脑桥核神经元发育中的细胞状态特异性功能 | 发现了六种先前未知的脑桥核神经元亚型，这些亚型在分子和空间上具有独特性 | NA | 阐明Atoh1在脑桥核神经元发育中的作用及其对神经元亚型多样性的影响 | 脑桥核神经元及其亚型 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 17238 | 2024-08-05 |
Comprehensive analysis of angiogenesis pattern and related immune landscape for individual treatment in osteosarcoma
2023-Jun-29, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-023-00415-7
PMID:37386055
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研究论文 | 本研究深入探讨了骨肉瘤的血管生成模式及相关免疫微环境，以构建预后模型ANGscore | 通过综合分析血管生成基因的表达模式，建立了新的ANGscore系统，能够准确区分骨肉瘤人群的预后和免疫特征 | 本研究未详细讨论ANGscore在不同癌症类型中的适用性 | 探索骨肉瘤的血管生成模式和免疫微环境，以预测预后与免疫治疗反应 | 骨肉瘤患者及其免疫微环境中的细胞 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | RNA-seq | NA | 生物数据 | 多个数据集，包括bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据集 |
| 17239 | 2024-08-05 |
Multiomics data analyses to identify SLC25A17 as a novel biomarker to predict the prognosis and immune microenvironment in head and neck squamous cell carcinoma
2023-Jun-29, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05399-6
PMID:37386359
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研究论文 | 本研究旨在探索SLC25A17在头颈鳞状细胞癌(HNSCC)预后和肿瘤微环境中的预测价值 | 首次提出SLC25A17作为HNSCC患者预后和免疫微环境的新生物标志物 | 未提及具体的样本量和添加的外部验证结果的局限性 | 研究SLC25A17对HNSCC患者预后和肿瘤微环境的预测能力 | HNSCC患者的SLC25A17表达及其与预后的关系 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序，基因集富集分析 | Cox比例风险模型 | 生物标志物表达数据，临床信息 | 未具体提及，但包含TCGA数据和GSE65858队列的患者 |
| 17240 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics uncovers EGFR signaling-mediated gastric progenitor cell differentiation in stomach homeostasis
2023-06-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39113-0
PMID:37386010
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研究论文 | 该研究利用单细胞转录组学揭示了EGFR信号介导的胃祖细胞分化在胃稳态中的作用 | 本研究首次发现EGFR信号在正常胃稳态中具有促分化功能，而不是促增殖功能 | 尚未深入探讨EGFR信号在不同胃病中的作用 | 研究胃祖细胞在健康状态下的多谱系分化机制 | 健康成年小鼠的胃组织中的祖细胞分化 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 健康成年小鼠的胃组织样本 |