单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28561 篇文献，本页显示第 17221 - 17240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 17221 | 2024-08-07 |
Expansion of Fcγ Receptor IIIa-Positive Macrophages, Ficolin 1-Positive Monocyte-Derived Dendritic Cells, and Plasmacytoid Dendritic Cells Associated With Severe Skin Disease in Systemic Sclerosis
2022-02, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.41813
PMID:34042322
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了2465个来自12名弥漫性皮肤系统性硬化症（dcSSc）患者和10名健康对照者的皮肤活检样本中的髓系细胞转录组，以全面理解驱动dcSSc皮肤纤维化的髓系细胞类型。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了dcSSc特异性的髓系细胞集群，并发现与正常对照相比，dcSSc中存在高度表达Fcγ受体IIIA的巨噬细胞集群和高度表达FCN-1等单核细胞标志物的mo-DCs，这些细胞与更严重的皮肤疾病相关。 | 本研究仅分析了12名dcSSc患者和10名健康对照者的皮肤样本，样本量相对较小，可能影响结果的普遍性。此外，髓系细胞的活化在不同患者间存在差异，表明潜在的病理机制和/或疾病活动的时间差异，但具体机制未深入探讨。 | 旨在全面理解驱动弥漫性皮肤系统性硬化症皮肤纤维化的髓系细胞类型。 | 弥漫性皮肤系统性硬化症患者的皮肤活检样本中的髓系细胞。 | 数字病理学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 2465个髓系细胞样本，来自12名dcSSc患者和10名健康对照者 |
| 17222 | 2024-08-07 |
The critical role of B4GALT4 in promoting microtubule spindle assembly in HCC through the regulation of PLK1 and RHAMM expression
2022-01, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.30531
PMID:34270095
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研究论文 | 本文通过生物信息学方法研究了B4GALT家族糖基转移酶在肝细胞癌（HCC）中的表达及其与临床病理参数和下游靶基因的相关性，特别是B4GALT4在微管纺锤体组装中的作用。 | 首次揭示了B4GALT4通过调节PLK1和RHAMM的表达在HCC中促进微管纺锤体组装的关键作用，并通过基因本体分析和单细胞RNA测序数据验证了这一发现。 | NA | 探讨B4GALT家族成员在肝细胞癌中的作用及其对患者预后的影响。 | B4GALT家族糖基转移酶在肝细胞癌中的表达及其生物学功能。 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 生物信息学分析 | NA | RNA测序数据 | 涉及多个数据库中的肿瘤组织样本和HCC患者数据 |
| 17223 | 2024-08-07 |
On the Origin of Pancreatic Cancer: Molecular Tumor Subtypes in Perspective of Exocrine Cell Plasticity
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2021.11.010
PMID:34875393
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综述 | 本文综述了胰腺导管腺癌（PDAC）的起源，特别是外分泌细胞可塑性对分子肿瘤亚型的影响 | 探讨了外分泌细胞的不同分化状态与PDAC分子亚型之间的转录组和表观遗传学关系，提出了不同肿瘤亚型的不同起源 | NA | 旨在深入理解PDAC的生物学特性，特别是外分泌细胞在PDAC起源中的作用 | 胰腺导管腺癌及其细胞起源 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组和表观遗传组数据 | NA |
| 17224 | 2024-08-07 |
Genetic ancestry effects on the response to viral infection are pervasive but cell type specific
2021-Nov-26, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abg0928
PMID:34822289
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了欧洲和非洲血统男性在流感感染后外周血单核细胞的反应差异 | 发现遗传血统对病毒感染反应的影响普遍存在但具有细胞类型特异性，且与COVID-19疾病严重性相关的基因富集 | NA | 探究遗传血统对病毒感染免疫反应的影响 | 欧洲和非洲血统男性的外周血单核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 欧洲和非洲血统男性 |
| 17225 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptome Profiling of Thyroid Hormone Effectors in the Human Fetal Neocortex: Expression of SLCO1C1, DIO2, and THRB in Specific Cell Types
2021-10, Thyroid : official journal of the American Thyroid Association
IF:5.8Q1
DOI:10.1089/thy.2021.0057
PMID:34114484
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了人胎脑新皮质中甲状腺激素效应蛋白SLCO1C1、DIO2和THRB在特定细胞类型中的表达 | 发现甲状腺激素效应蛋白在特定细胞类型中的独特表达模式，特别是在中间神经元中的表达，这一发现具有新的病理生理意义 | NA | 填补关于人胎脑中甲状腺激素作用的知识的空白 | 人胎脑新皮质中的甲状腺激素效应蛋白 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 分析了来自三个不同研究的公开单细胞转录组数据集，涉及393至近40,000个细胞 |
| 17226 | 2024-08-07 |
Cortical overgrowth in a preclinical forebrain organoid model of CNTNAP2-associated autism spectrum disorder
2021-09-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-24358-4
PMID:34471112
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研究论文 | 本研究利用从患有综合征型自闭症谱系障碍（ASD）的患者诱导多能干细胞生成的前脑类器官，研究了CNTNAP2基因突变对胚胎期皮层发育的影响 | 首次使用前脑类器官模型研究CNTNAP2突变对ASD的影响，并成功利用CRISPR-Cas9技术纠正突变以恢复类器官的生长表型 | NA | 研究CNTNAP2基因突变对自闭症谱系障碍患者胚胎期皮层发育的影响 | 前脑类器官及单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 从患有CNTNAP2基因突变的ASD患者中获取的诱导多能干细胞生成的前脑类器官 |
| 17227 | 2024-08-07 |
Extrathymic Aire-expressing cells support maternal-fetal tolerance
2021-07-16, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abf1968
PMID:34272228
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研究论文 | 研究探讨了AIRE表达细胞在母体-胎儿耐受中的作用，发现母体中AIRE表达细胞的缺失会导致小鼠早期妊娠中的宫内生长受限 | 报道了一种维持母体-胎儿免疫稳态的新机制，并证明外胸腺AIRE表达细胞（eTACs）保护胚胎免受免疫介导的宫内生长受限 | NA | 研究AIRE表达细胞在母体-胎儿耐受中的作用 | AIRE表达细胞在母体-胎儿耐受中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠妊娠模型 |
| 17228 | 2024-08-07 |
Smek1 deficiency exacerbates experimental autoimmune encephalomyelitis by activating proinflammatory microglia and suppressing the IDO1-AhR pathway
2021-Jun-28, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-021-02193-0
PMID:34183017
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研究论文 | 研究探讨了抑制MEK1的调节亚基SMEK1的部分功能丧失如何促进多发性硬化症（MS）和实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）的发病机制 | 首次揭示了Smek1在维持免疫抑制功能中的作用，并通过调节吲哚胺2,3-双加氧酶（IDO1）-芳香烃受体（AhR）途径来保护自身免疫性脱髓鞘病理过程 | NA | 探究SMEK1基因缺陷如何影响MS和EAE的发病 | C57BL/6小鼠 | NA | 多发性硬化症 | 免疫组织化学染色、定量聚合酶链反应（qPCR）、蛋白质印迹分析、酶联免疫吸附试验（ELISA）、流式细胞术、单细胞测序 | NA | 组织样本 | C57BL/6小鼠接种髓鞘少突胶质细胞糖蛋白35-55（MOG35-55）后的EAE模型 |
| 17229 | 2024-08-07 |
Differential RA responsiveness among subsets of mouse late progenitor spermatogonia
2021-05-05, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1530/REP-21-0031
PMID:33835049
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研究论文 | 本文研究了小鼠晚期生殖干细胞在不同子集对视黄酸（RA）的反应差异 | 首次功能性地测试了表达视黄酸受体γ（RARG）的生殖干细胞对RA的反应，并发现RARG单独不足以在小鼠睾丸中启动生殖干细胞对RA的反应 | NA | 探究小鼠晚期生殖干细胞在不同子集对视黄酸的反应差异 | 小鼠晚期生殖干细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个小鼠睾丸样本 |
| 17230 | 2024-08-07 |
Single-Cell Sequencing of Brain Cell Transcriptomes and Epigenomes
2021-01-06, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2020.12.010
PMID:33412093
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research paper | 本文讨论了单细胞转录组和表观基因组测序的基本原理、数据的整合计算分析以及在神经科学中的关键应用 | 单细胞测序技术通过直接测量数千到数百万个单个细胞中的多种分子特征，全面表征了脑细胞类型的多样性，揭示了塑造细胞身份的基因调控机制 | NA | 深入理解神经回路的细胞构成，揭示脑细胞群体之间的发育和进化关系 | 脑细胞的转录组和表观基因组 | digital pathology | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组和表观基因组数据 | 数千到数百万个单个细胞 |
| 17231 | 2024-08-07 |
Genomic Profiling of Virulence in the Soybean Cyst Nematode Using Single-Nematode Sequencing
2021-Jan, Phytopathology
IF:2.6Q2
DOI:10.1094/PHYTO-08-20-0348-FI
PMID:33100145
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研究论文 | 本研究使用单个线虫的单细胞RNA测序方法，分析了豆杆囊线虫（SCN）的基因组特征，以识别可能参与抗性基因突破的SCN基因 | 首次建立了单个SCN个体的完整转录组，并识别出一系列针对主要SCN抗性源的假定毒力基因 | NA | 旨在揭示豆杆囊线虫克服抗性基因的机制 | 豆杆囊线虫（SCN）及其在抗性大豆品种上的毒力基因 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 单个SCN个体 |
| 17232 | 2024-08-07 |
Pattern Recognition Receptors (PRRs) in Macrophages Possess Prognosis and Immunotherapy Potential for Melanoma
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.765615
PMID:34858419
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研究论文 | 本研究分析了20种典型的模式识别受体（PRRs）在9502名患者33种肿瘤样本中的表达，并构建了基于PRRs表达的皮肤黑色素瘤（SKCM）预后模型，探讨了PRRs在黑色素瘤中的预后潜力和免疫治疗价值。 | 首次全面评估了PRRs家族在不同癌症临床预后中的意义，并发现PRRs在黑色素瘤中的表达与预后呈显著正相关，且PRR-based Cox模型比单一PRR具有更好的预后潜力。 | 研究主要集中在皮肤黑色素瘤，对其他肿瘤类型的PRRs预后潜力分析较少。 | 探讨PRRs在黑色素瘤中的预后潜力和免疫治疗价值。 | 分析PRRs在不同肿瘤中的表达及其对预后和免疫治疗的影响。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞测序 | Cox预后模型 | 基因表达数据 | 9502名患者的肿瘤样本 |
| 17233 | 2024-08-07 |
Single cell characterization of B-lymphoid differentiation and leukemic cell states during chemotherapy in ETV6-RUNX1-positive pediatric leukemia identifies drug-targetable transcription factor activities
2020-11-20, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-020-00799-2
PMID:33218352
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了ETV6-RUNX1阳性儿童白血病中B淋巴细胞分化和白血病细胞状态在化疗期间的变化，并确定了可作为药物靶点的转录因子活性。 | 本文首次通过单细胞RNA测序技术揭示了ETV6-RUNX1阳性白血病中B淋巴细胞分化路径上的转录因子活性，并发现了与化疗耐药性相关的细胞周期状态和分化相关调控网络的变化。 | NA | 研究ETV6-RUNX1阳性儿童白血病中B淋巴细胞分化和白血病细胞状态在化疗期间的变化，并确定可作为药物靶点的转录因子活性。 | ETV6-RUNX1阳性儿童白血病中的B淋巴细胞分化和白血病细胞状态。 | 数字病理学 | 儿童白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 17234 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing highlights the role of inflammatory cancer-associated fibroblasts in bladder urothelial carcinoma
2020-10-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-18916-5
PMID:33033240
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析膀胱尿路上皮癌样本，揭示了肿瘤微环境中细胞异质性及其在肿瘤进展中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示膀胱尿路上皮癌中炎症相关成纤维细胞（iCAFs）在肿瘤进展中的作用及其与不良预后的关联 | NA | 探究膀胱尿路上皮癌中肿瘤微环境的作用及其对临床预后的影响 | 膀胱尿路上皮癌的肿瘤微环境及其中不同细胞类型的功能 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 8个肿瘤样本和3个肿瘤旁样本 |
| 17235 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis of tumor and stromal compartments of pancreatic ductal adenocarcinoma primary tumors and metastatic lesions
2020-09-29, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-020-00776-9
PMID:32988401
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了胰腺导管腺癌（PDAC）原发肿瘤和转移病灶中的肿瘤和基质成分的转录组 | 首次对PDAC原发肿瘤和转移病灶的单细胞转录组进行了全面分析，并使用了一种新的监督分类算法SuperCT来识别不同的细胞类型 | 研究主要集中在原发肿瘤和转移病灶的组织样本上，未涉及其他类型的样本 | 深入了解胰腺导管腺癌的细胞组成及其与疾病进展和患者预后的关系 | 胰腺导管腺癌的原发肿瘤和转移病灶中的肿瘤细胞和基质细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | SuperCT | 转录组 | 来自PDAC患者的原发肿瘤和转移活检样本中的单个细胞 |
| 17236 | 2024-08-07 |
Frataxin gene editing rescues Friedreich's ataxia pathology in dorsal root ganglia organoid-derived sensory neurons
2020-08-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-17954-3
PMID:32826895
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研究论文 | 本文通过体外分化人诱导多能干细胞（iPSCs）生成背根神经节类器官（DRG organoids），并研究了弗里德赖希共济失调（FRDA）病理学中Frataxin基因编辑的修复作用。 | 首次展示了通过去除FXN基因第一内含子中的抑制染色质，可以恢复FXN总表达并完全逆转FRDA背根神经节神经元的病理特征。 | NA | 研究Frataxin基因编辑在修复弗里德赖希共济失调病理学中的作用。 | 背根神经节类器官（DRG organoids）及其衍生的感觉神经元。 | 数字病理学 | 弗里德赖希共济失调 | bulk和单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人诱导多能干细胞（iPSCs） |
| 17237 | 2024-08-07 |
CD200 promotes immunosuppression in the pancreatic tumor microenvironment
2020-06, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2019-000189
PMID:32581043
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研究论文 | 本文研究了CD200在胰腺肿瘤微环境中促进免疫抑制的作用 | 首次揭示了CD200在胰腺导管腺癌（PDAC）微环境中通过促进髓源抑制细胞（MDSC）的扩增和活性来限制免疫治疗反应 | NA | 探讨CD200在胰腺导管腺癌微环境中的免疫抑制作用及其对免疫治疗反应的影响 | 胰腺导管腺癌（PDAC）患者及小鼠模型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 免疫荧光染色、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 包括人类胰腺癌细胞系、患者血液样本、小鼠肿瘤模型及健康捐赠者的外周血单个核细胞（PBMC） |
| 17238 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptome Analysis of Mouse Liver Cell-Specific Tropism and Transcriptional Dysregulation Following Intravenous Administration of AAVrh.10 Vectors
2020-05, Human gene therapy
IF:3.9Q2
DOI:10.1089/hum.2019.366
PMID:32143547
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了静脉注射AAVrh.10载体后小鼠肝脏细胞特异性趋向性和转录失调 | 首次详细描述了AAVrh.10载体在小鼠肝脏细胞中的特异性趋向性和转录失调情况 | 仅限于小鼠模型，且样本量相对较小 | 评估AAVrh.10载体在肝脏细胞中的特异性趋向性和转录失调 | 小鼠肝脏细胞 | 基因工程 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 总共46,500个肝脏细胞 |
| 17239 | 2024-08-07 |
Tissue substructure-specific deposition of the β3-containing laminin-332 in the biliary epithelium of human and mouse livers
2020-04-02, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2020.01.104
PMID:32008745
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研究论文 | 本文通过分析公开的单细胞RNA测序数据库，揭示了人肝细胞中层粘连蛋白基因的表达情况，特别是层粘连蛋白-332亚基在胆道上皮细胞中的共表达情况，并探讨了其在肝脏中的功能和潜在的病理生理作用。 | 首次揭示了层粘连蛋白-332亚基在胆道上皮细胞中的异质性表达，并证实了其在小鼠肝脏中的异质性表达与胆道上皮细胞的形态学亚结构有关。 | 研究主要基于公共数据库的分析，缺乏直接的实验验证，且仅探讨了生理条件下的功能，未涉及病理条件下的作用。 | 探讨层粘连蛋白-332亚基在胆道上皮细胞中的表达及其在肝脏中的功能和潜在的病理生理作用。 | 人肝细胞和胆道上皮细胞中的层粘连蛋白-332亚基表达情况。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 17240 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of transcriptome and DNA methylome in human oocyte maturation
2020, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0241698
PMID:33152014
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组和DNA甲基组数据分析，研究了人类卵母细胞成熟过程中基因调控的机制 | 首次探讨了非CpG甲基化在卵母细胞成熟中的潜在调控作用，并发现DNMT3B基因在成熟卵母细胞中的上调可能与非CpG甲基化增加有关 | NA | 深入理解人类卵母细胞成熟过程中的基因调控机制，并促进体外成熟技术的发展 | 人类卵母细胞在不同成熟阶段的单细胞转录组和甲基组数据 | NA | NA | 单细胞转录组分析，单细胞甲基组分析 | NA | 转录组数据，甲基组数据 | 1,077个基因在成熟卵母细胞中上调 |