单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 17181 - 17200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 17181 | 2024-08-05 |
ACME Dissociation-Fixation, Flow Cytometry, and Cell Sorting of Freshwater Planarian Cells
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3275-8_10
PMID:37428377
|
研究论文 | 本文描述了一种用于平面虫细胞解离的方法 | 提出了一种基于醋酸和甲醇的ACME解离-固定方法，解决了传统酶法引起的细胞应激反应问题 | 不适用于所有类型的细胞，可能需要进一步验证 | 改善平面虫细胞的解离和固定过程，以便用于单细胞转录组学研究 | 平面虫细胞 | 数字病理学 | NA | ACME解离-固定方法 | NA | NA | NA |
| 17182 | 2024-08-05 |
Redistribution of the astrocyte phenotypes in the medial vestibular nuclei after unilateral labyrinthectomy
2023, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2023.1146147
PMID:37434761
|
研究论文 | 本研究探讨了单侧迷路切除后内侧前庭核中星形胶质细胞亚型的变化。 | 发现了四种内侧前庭核中的星形胶质细胞亚型，并揭示了它们在迷路损伤后的适应性变化。 | 未深入探讨星形胶质细胞亚型对神经系统功能的具体影响和机制。 | 研究单侧迷路切除后内侧前庭核中星形胶质细胞的响应状态。 | 使用单细胞测序技术分析小鼠模型中的星形胶质细胞亚型。 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | 小鼠模型 | 基因数据 | NA |
| 17183 | 2024-08-05 |
Comprehensive analysis of the role of immune-related PANoptosis lncRNA model in renal clear cell carcinoma based on RNA transcriptome and single-cell sequencing
2023, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2023.029563
PMID:37415739
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研究论文 | 本文综合分析了免疫相关的PANoptosis lncRNA模型在肾透明细胞癌中的作用 | 建立了基于免疫相关PANoptosis lncRNAs的新预测模型，并发现LINC00944与癌细胞迁移和浸润显著相关 | NA | 探索免疫相关PANoptosis lncRNAs在肾透明细胞癌中的生物学价值 | 肾透明细胞癌患者的免疫相关PANoptosis lncRNAs | 数字病理学 | 肾癌 | RNA转录组和单细胞测序 | 风险模型 | 转录组数据和单细胞数据 | 使用了来自The Cancer Genome Atlas和Gene Expression Omnibus数据库的数据，样本数量未具体说明 |
| 17184 | 2024-08-05 |
TERT expression is associated with metastasis from thin primaries, exhausted CD4+ T cells in melanoma and with DNA repair across cancer entities
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0281487
PMID:37418389
|
研究论文 | 本文研究TERT表达与黑色素瘤转移及免疫抵抗的关系 | 揭示了TERT表达与CD4+ T细胞衰竭和肿瘤进展之间的联系，及其在多种肿瘤类型中的非经典功能 | 未能在免疫检查点抑制的黑色素瘤队列中找到TERT启动子突变或表达与生存率的持续关联 | 扩展对TERT启动子突变及表达改变在肿瘤进展中影响的认识 | 分析数个高度注释的黑色素瘤队列 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 (RNA-seq) | 多变量模型 | 基因表达数据 | 涉及多个黑色素瘤队列的样本 |
| 17185 | 2024-08-07 |
Editorial: Statistical and computational methods for single-cell sequencing analysis
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1235174
PMID:37415605
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17186 | 2024-08-07 |
System analysis based on the T cell exhaustion‑related genes identifies CD38 as a novel therapy target for ovarian cancer
2023, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2023.029282
PMID:37415732
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析探讨卵巢癌中T细胞亚群的异质性，并筛选出与T细胞耗竭相关的基因，特别是CD38作为新的治疗靶点 | 首次通过单细胞转录组分析揭示卵巢癌中T细胞耗竭的异质性，并构建基于T细胞耗竭基因的预后模型，为精准治疗提供新思路 | 研究样本量较小，仅基于五个卵巢癌患者的单细胞RNA测序数据，可能影响结果的普遍性 | 探讨卵巢癌中T细胞亚群的异质性及其临床意义，并开发基于T细胞耗竭基因的预后模型 | 卵巢癌患者的T细胞亚群及其相关基因 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 随机森林 | 转录组数据 | 五个卵巢癌患者 |
| 17187 | 2024-08-07 |
Comprehensive immune landscape of lung-resident memory CD8+ T cells after influenza infection and reinfection in a mouse model
2023, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2023.1184884
PMID:37415817
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研究论文 | 本研究利用综合转录组数据和体内实验，探讨了流感病毒感染和再感染后肺驻留记忆CD8+ T细胞的关键特征及其功能转换和调控机制。 | 本研究首次详细描述了流感感染和再感染后肺中CD8+ T细胞亚群的景观，并揭示了CD8+ Trm细胞在感染后的动态变化和关键信号通路。 | NA | 探讨流感病毒感染和再感染后肺驻留记忆CD8+ T细胞的功能转换和调控机制。 | 肺驻留记忆CD8+ T细胞 | 免疫学 | 流感 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），RNA测序（RNA-seq） | Seurat，scCODE，Monocle 3，CellChat | 转录组数据 | 两个单细胞RNA测序数据集和一个RNA测序数据集 |
| 17188 | 2024-08-07 |
Characterization of tumor-associated reactive astrocytes in gliomas by single-cell and bulk tumor sequencing
2023, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2023.1193844
PMID:37416308
|
研究论文 | 本文通过单细胞和整体肿瘤测序技术，全面评估了胶质瘤中的肿瘤相关反应性星形细胞（TARAs），并分析了其在胶质瘤中的作用和潜在的临床应用 | 首次系统地研究了TARAs在胶质瘤中的浸润水平及其与临床和分子特征的关联，并探讨了其在免疫治疗中的预测价值 | NA | 探讨肿瘤相关反应性星形细胞（TARAs）在胶质瘤中的作用及其临床意义 | 胶质瘤中的肿瘤相关反应性星形细胞（TARAs） | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 35,563个细胞来自23名患者，1,379个弥漫性星形细胞瘤和胶质母细胞瘤样本 |
| 17189 | 2024-08-07 |
Integrated analysis of single-cell and Bulk RNA sequencing reveals a malignancy-related signature in lung adenocarcinoma
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1198746
PMID:37427142
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，揭示了肺腺癌中与恶性相关的特征 | 识别了一种新的与恶性相关的特征，用于预测肺腺癌患者的预后，并强调了这一特征作为肺腺癌患者预后和治疗标记的潜力 | NA | 建立基于恶性相关风险评分（MRRS）的肺腺癌预后模型 | 肺腺癌（LUAD） | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 随机生存森林分析 | RNA测序数据 | 使用了来自Tumor Immune Single Cell Hub数据库的单细胞RNA测序数据和来自The Cancer Genome Atlas数据库的RNA-seq数据，以及GSE68465和GSE72094数据集进行验证 |
| 17190 | 2024-08-07 |
Accumulation of plasmacytoid dendritic cell is associated with a treatment response to DNA-damaging treatment and favorable prognosis in lung adenocarcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1154881
PMID:37435086
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫荧光及免疫组织化学染色方法，探讨了吸烟与非吸烟者肺腺癌肿瘤微环境中的免疫细胞组成差异，并验证了相关生物标志物的临床意义。 | 首次揭示了吸烟者肺腺癌肿瘤微环境中浆细胞样树突状细胞（pDCs）的积累与DNA损伤治疗反应及良好预后之间的关联。 | NA | 研究吸烟状态对肺腺癌肿瘤微环境的影响，并探讨pDCs在免疫检查点抑制剂治疗反应中的作用。 | 吸烟与非吸烟者的肺腺癌组织及其邻近正常肺组织。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，免疫荧光，免疫组织化学染色 | NA | 组织 | 来自吸烟与非吸烟者的肺腺癌组织及邻近正常肺组织样本 |
| 17191 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptomic Profiling of Müller Glia in the rd10 Retina
2023, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-27681-1_55
PMID:37440060
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，分析了rd10视网膜模型中穆勒胶质细胞对杆状细胞退化的反应。 | 发现了Pde6b穆勒胶质细胞中组织相容性复合体成员的表达增加，这可能是穆勒胶质细胞在视网膜色素变性中的一种新型免疫功能。 | NA | 探讨穆勒胶质细胞在视网膜色素变性中的反应及其潜在机制。 | 穆勒胶质细胞在rd10视网膜模型中的转录组变化。 | 数字病理学 | 视网膜色素变性 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 17192 | 2024-08-05 |
scFED: Clustering Identifying Cell Types of scRNA-Seq Data Based on Feature Engineering Denoising
2023-Dec, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-023-00574-y
PMID:37402002
|
研究论文 | 本文介绍了scFED，一种基于特征工程的基因选择框架，用于消除单细胞RNA-seq数据的噪声波动 | scFED通过工程化的基因选择框架，提高了单细胞聚类和分类的效果 | 计算负担重且高表达基因可能无法提供稳定和预测的特征集 | 研究单细胞RNA-seq数据的特征选择，以改善聚类和细胞类型识别 | 应用scFED方法在四个真实的单细胞数据集上进行分析 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 四个真实的单细胞数据集 |
| 17193 | 2024-08-07 |
Discovery and Validation of Novel Genes in a Large Chinese Autism Spectrum Disorder Cohort
2023-11-15, Biological psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1016/j.biopsych.2023.06.025
PMID:37393044
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研究论文 | 本文通过对中国大规模自闭症谱系障碍（ASD）群体进行全外显子测序和单细胞RNA测序，发现并验证了新的ASD候选基因 | 本文首次在东亚人群中进行大规模ASD遗传分析，并发现了9个未在当前ASD基因数据库中的新候选基因 | 研究主要集中在中国ASD群体，未来需要更多不同种族背景的ASD群体进行验证 | 旨在发现和验证中国ASD群体中的新基因，并探讨不同种族背景下的ASD遗传结构 | 中国ASD群体及其遗传变异 | 遗传学 | 自闭症谱系障碍 | 全外显子测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 1141个中国ASD三联体样本 |
| 17194 | 2024-08-07 |
SKIL/SnoN attenuates TGF-β1/SMAD signaling-dependent collagen synthesis in hepatic fibrosis
2023-Nov-03, Biomolecules & biomedicine
DOI:10.17305/bb.2023.9000
PMID:37389959
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研究论文 | 本研究探讨了SKIL/SnoN在肝纤维化中的作用及其对TGF-β1/SMAD信号通路的调控 | 首次综合运用bulk RNA测序和单细胞RNA测序分析肝纤维化患者样本，验证了SKIL/SnoN在肝纤维化中的作用 | 研究主要基于动物模型和细胞系，需要进一步的人体临床研究验证 | 评估SnoN在肝纤维化中的作用及其对TGF-β1信号通路的调控 | 肝星状细胞（HSC）和肝纤维化 | NA | 肝纤维化 | RNA测序, 免疫组织化学, 免疫荧光, PCR, 蛋白质印迹 | NA | RNA | 包括肝纤维化患者样本和转染的HSC-T6及LX-2细胞系的大鼠肝样本 |
| 17195 | 2024-08-07 |
Cancer-associated fibroblasts contribute to the immunosuppressive landscape and influence the efficacy of the combination therapy of PD-1 inhibitors and antiangiogenic agents in hepatocellular carcinoma
2023-Nov-01, Cancer
IF:6.1Q1
DOI:10.1002/cncr.34935
PMID:37395148
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研究论文 | 本研究探讨了癌症相关成纤维细胞（CAFs）在肝细胞癌（HCC）肿瘤微环境中的作用及其对PD-1抑制剂和抗血管生成药物联合治疗效果的影响 | 研究揭示了CAFs丰度对HCC患者预后和治疗反应的影响，并证实了PD-1抑制剂和抗血管生成药物联合治疗在CAFs高丰度患者中的潜在价值 | NA | 研究CAFs在HCC肿瘤微环境中的作用及其对特定治疗方案疗效的影响 | 肝细胞癌患者及其肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 基于39个与CAFs相关的基因对HCC患者的单细胞RNA测序数据进行无监督聚类，将患者分为CAFs低丰度群和高丰度群 |
| 17196 | 2024-08-07 |
mTORC2 acts as a gatekeeper for mTORC1 deficiency-mediated impairments in ILC3 development
2023-Nov, Acta pharmacologica Sinica
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41401-023-01120-8
PMID:37407703
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研究论文 | 本研究探讨了mTORC1在ILC3发育中的关键作用及其与mTORC2的相互作用 | 首次揭示了mTORC1缺乏通过mTORC2介导的机制影响ILC3发育和肠道稳态 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 探究mTORC1和mTORC2在ILC3发育和肠道免疫中的作用 | 先天性淋巴细胞3组（ILC3s）及其在肠道免疫和屏障功能中的作用 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 17197 | 2024-08-05 |
TALKIEN: crossTALK IntEraction Network. A web-based tool for deciphering molecular communication through ligand-receptor interactions
2023-Oct-30, Molecular omics
IF:3.0Q3
DOI:10.1039/d3mo00049d
PMID:37403821
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研究论文 | TALKIEN是一个用于通过配体-受体相互作用解析分子通信的在线工具 | 提供了一种简单直观的在线应用程序来可视化分子交互信息，并构建和分析蛋白质-蛋白质相互作用网络 | 具体的单细胞序列或空间转录组数据解析能力仍然未详细讨论 | 研究不同细胞类型之间的分子交流及其在癌症研究中的重要性 | 输入基因或蛋白质列表，以代表不同的细胞谱系 | 数字病理学 | 癌症 | 系统生物学技术 | NA | 基因或蛋白质列表 | NA |
| 17198 | 2024-08-05 |
Spatial regulation of plant hormone action
2023-10-13, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erad244
PMID:37401809
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研究论文 | 本文综述了植物激素作用的空间调控机制 | 探讨了植物激素传感器技术的新发展，提供了前所未有的空间域分辨率 | NA | 研究植物激素在不同植物部分的空间特异性作用及其调控机制 | 植物激素及其对植物生长和发育的影响 | NA | NA | FRET和单细胞RNA-seq | NA | NA | NA |
| 17199 | 2024-08-05 |
Clonal dynamics and copy number variants by single-cell analysis in leukemic evolution of myeloproliferative neoplasms
2023-10, American journal of hematology
IF:10.1Q1
DOI:10.1002/ajh.27013
PMID:37399248
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了骨髓增生性肿瘤（MPN）向急性转变的克隆动态和拷贝数变异 | 首次利用单细胞测序技术揭示了MPN在急性转变过程中的克隆轨迹和拷贝数变异 | 仅分析了10名患者的配对样本，样本量较小可能影响广泛适用性 | 探讨骨髓增生性肿瘤从慢性相向急性相转化的机制 | 研究对象为10名骨髓增生性肿瘤患者的慢性和急性配对样本 | 数字病理学 | 血液癌症 | 单细胞测序 (SCS) | NA | 基因拷贝数数据 | 10名患者的慢性和急性配对样本 |
| 17200 | 2024-08-05 |
Heterogeneity of T cells in periapical lesions and in vitro validation of the proangiogenic effect of GZMA on HUVECs
2023-Oct, International endodontic journal
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/iej.13951
PMID:37400946
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研究论文 | 本研究探讨了T细胞在慢性根尖周炎中的作用，并验证了GZMA对HUVECs的促血管生成效应 | 本研究提供了T细胞在根尖周病变中的异质性新见解，并揭示了GZMA在调节HUVECs血管生成中的潜在作用 | 样本数量有限，仅包括五个慢性根尖周炎病例 | 研究慢性根尖周炎中T细胞的作用及GZMA在血管生成中的调节机制 | 慢性根尖周炎患者的T细胞及其对HUVECs的影响 | 数字病理学 | 慢性根尖周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 五个慢性根尖周炎病例的样本 |