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当前共找到 38777 篇文献,本页显示第 1701 - 1720 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1701 2026-04-04
Female iPSC X-chromosome inactivation (XCI) erosion and its transcriptomic effects during CRISPR gene editing and neural differentiation
2026-Mar-01, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了女性诱导多能干细胞在CRISPR基因编辑和神经分化过程中X染色体失活侵蚀的转录组效应 首次系统研究了CRISPR编辑和神经分化对女性iPSC中XCI侵蚀的影响,揭示了其对X连锁和常染色体基因表达的影响机制 研究仅基于有限供体细胞系(4个)和编辑基因(66个),可能无法完全代表所有情况 探究女性iPSC在CRISPR编辑和神经分化过程中X染色体失活侵蚀的转录组效应及其对差异表达基因分析的混淆影响 女性诱导多能干细胞及其衍生的神经细胞 单细胞转录组学 神经发育障碍 CRISPR基因编辑,RNA-seq NA 转录组数据 数百个CRISPR编辑的女性iPSC细胞系(来自4个供体,涉及66个基因),以及iPSC衍生神经细胞的单细胞RNA-seq数据(涉及42个编辑基因) NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
1702 2026-04-04
Bayesian Hyperspherical Graph Mixture-of-Experts Deciphers Cell-Cell Interaction in Spatial Transcriptomics
2026 Mar-Apr, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
研究论文 本文提出了一种名为B-HGME的无监督贝叶斯框架,用于从空间转录组数据中联合推断空间域和细胞-细胞相互作用网络 提出了首个结合超球面嵌入和贝叶斯混合专家模型的框架,用于无监督地推断具有方向性和长程性的细胞-细胞相互作用,并提供了原则性的不确定性量化 未明确说明模型的计算复杂度或在大规模数据集上的可扩展性限制 开发一种计算框架,以无监督和可解释的方式从空间转录组数据中准确推断细胞-细胞相互作用和空间域 空间转录组数据中的细胞及其相互作用 空间转录组学 NA 空间转录组学 贝叶斯超球面图混合专家模型 空间转录组数据 来自六个主要空间转录组平台的多个数据集 NA 空间转录组学 NA NA
1703 2026-04-04
Molecular profiling of sacral chordomas through methylation, spatial transcriptomics and multiplexed immunofluorescence
2026-Mar, ESMO rare cancers
研究论文 本研究通过DNA甲基化分析、空间转录组学和多重免疫荧光技术,对骶骨脊索瘤的分子异质性进行了综合分析 首次结合甲基化分析、空间转录组学和多重免疫荧光技术,揭示了骶骨脊索瘤中与复发相关的独特表观遗传特征,并识别了免疫检查点标记物TIM3、CD47和PD-1的表达模式 研究为回顾性设计,样本量相对较小(29例患者),且缺乏功能验证实验 探究骶骨脊索瘤的分子异质性和肿瘤微环境特征 骶骨脊索瘤患者及其存档组织 数字病理学 脊索瘤 DNA甲基化分析,空间转录组学,多重免疫荧光 无监督聚类,多元线性回归分析 甲基化数据,空间基因表达数据,免疫荧光图像数据 29例骶骨脊索瘤患者 NA 空间转录组学 Digital Spatial Profiler (DSP) NA
1704 2026-04-04
scDBic: a novel deep learning-based biclustering algorithm for analyzing scRNA-seq data
2026-Feb-28, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文提出了一种名为scDBic的新型深度学习双聚类算法,专门用于分析单细胞RNA测序数据,以改善细胞聚类性能并识别关键基因 scDBic结合了深度自编码器进行细胞聚类、基因聚类以及使用反向策略识别关键基因簇,解决了传统聚类算法在捕获局部一致性和双聚类算法在细胞丢失、高维数据适应性及迭代选择方面的不足 NA 开发一种针对单细胞RNA测序数据的深度学习双聚类算法,以更有效地发现细胞群并识别其关键基因 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 深度自编码器 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1705 2026-04-04
Transient activation of potent progenitor cells is required for spinal cord regeneration
2026-Feb-28, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞测序和遗传谱系追踪,揭示了成年斑马鱼脊髓损伤后表达特定基因的祖细胞的分子多样性和贡献,并发现Bach1转录因子作为双功能调控开关控制祖细胞的瞬时激活与静息恢复 首次系统鉴定斑马鱼脊髓再生中关键祖细胞的分子身份和命运贡献,并发现Bach1作为双功能转录因子调控损伤后祖细胞激活与再生后静息恢复的新机制 研究主要基于斑马鱼模型,哺乳动物脊髓再生的机制可能不同;单细胞测序样本量有限,需进一步验证 探究脊髓损伤后神经再生的细胞与分子机制 成年斑马鱼脊髓中的祖细胞群体 发育生物学与再生医学 脊髓损伤 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、遗传谱系追踪、转录因子筛选 NA 单细胞转录组数据、遗传谱系数据 未明确样本数量,但涉及稳态和再生脊髓组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1706 2026-03-01
Single-cell RNA sequencing of adenoid cystic carcinoma of the breast reveals cellular heterogeneity and tumor microenvironment features
2026-Feb-27, BMC medical genomics IF:2.1Q3
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1707 2026-04-04
TGF-β regulated Tim-3 sustains macrophage phagocytic function and confers protection in Plasmodium yoelii NSM-infected mice
2026-Feb-27, Parasites & vectors IF:3.0Q1
研究论文 本研究揭示了在疟疾感染中,TGF-β调控的Tim-3通过维持巨噬细胞的吞噬功能发挥保护作用 首次揭示了TGF-β-Tim-3轴在疟疾感染中调控巨噬细胞功能的新机制,并证明Tim-3在巨噬细胞上的保护性作用 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人体中得到验证 探究Tim-3在疟疾感染期间调控巨噬细胞功能的作用及其上游调控机制 约氏疟原虫NSM感染的小鼠模型、脾脏巨噬细胞、体外共培养系统 免疫学 疟疾 单细胞RNA测序、流式细胞术、功能测定 NA 单细胞转录组数据、流式细胞数据、功能实验数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1708 2026-04-04
Tumor-infiltrating lymphocytes demonstrate potent anti-tumor efficacy and synergize with PD-1 blockade in bladder cancer
2026-Feb-26, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究评估了从膀胱癌患者中分离并扩增的肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)的抗肿瘤功效,并探索了其与PD-1抑制剂Nivolumab联用的协同效应 首次在膀胱癌中系统评估TIL的扩增、表型特征及其与PD-1阻断的协同抗肿瘤作用,并利用患者来源类器官(PDO)作为功能评估平台 研究样本量有限(48例),且体内验证仅使用了细胞系来源的异种移植模型,缺乏患者来源的异种移植模型验证 评估TIL在膀胱癌中的抗肿瘤潜力及其与免疫检查点抑制剂联用的协同疗效 膀胱癌患者的肿瘤浸润淋巴细胞、膀胱癌细胞系、患者来源的膀胱癌类器官 肿瘤免疫学 膀胱癌 单细胞RNA测序、T细胞受体测序、流式细胞术、细胞活力检测、细胞因子释放测定、细胞凋亡检测 NA 单细胞转录组数据、T细胞受体序列数据、流式细胞术数据、体外功能测定数据 48例膀胱癌患者样本(其中33例成功扩增TIL) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1709 2026-04-04
Single-cell hdWGCNA and experimental validation identify an innovative T-cell-associated prognostic model and immune microenvironment in lung adenocarcinoma with lymph node metastasis
2026-Feb-25, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和高维加权基因共表达网络分析,构建了一个基于T细胞相关基因(CD69、GOLGA8A、IL16)的预后模型,用于评估淋巴结转移性肺腺癌患者的预后 首次结合单细胞RNA测序和高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA)构建T细胞相关预后模型,并整合临床变量提升模型可解释性 研究依赖于公共数据库数据,样本量可能有限,且实验验证主要在细胞系中进行,需进一步临床验证 建立基于T细胞的预后模型,评估淋巴结转移性肺腺癌患者的预后并优化治疗策略 淋巴结转移性肺腺癌患者 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA)、差异表达分析、Cox/LASSO回归、qRT-PCR、免疫组化、多重免疫荧光 预后风险模型 单细胞RNA测序数据、基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1710 2026-04-04
Decoding muscle-resident Schwann cell dynamics during neuromuscular junction remodeling
2026-Feb-23, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,通过比较稳定神经支配模型与部分或完全去神经支配后的再神经支配模型,揭示了肌肉驻留施万细胞在神经肌肉接头重塑中的作用 发现了多种不同的施万细胞亚型,包括一个在去神经-再神经循环中起关键作用的终末施万细胞亚型,并确定了SPP1信号通路是调节神经肌肉接头动态、促进施万细胞增殖和肌肉再神经支配的关键调控因子 未在摘要中明确说明 阐明肌肉驻留施万细胞在神经肌肉接头重塑中的贡献 肌肉驻留施万细胞 单细胞组学 神经肌肉疾病、神经退行性疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1711 2026-04-04
Single-cell and spatial transcriptomics define 20E-driven developmental reprogramming in silkworm wing disc
2026-Feb-23, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究构建了家蚕翅盘10个时间点的时空单细胞图谱,揭示了20-羟基蜕皮酮驱动的发育重编程过程 首次构建家蚕翅盘的高分辨率时空单细胞图谱,提出基因转换模型描述渐进性命运决定过程,并发现20-羟基蜕皮酮可在数小时内加速发育进程 研究主要基于家蚕模型,结论在其他昆虫中的普适性有待验证 解析昆虫翅发育的时空调控逻辑和激素驱动机制 家蚕翅盘细胞 单细胞组学 NA 单细胞核RNA测序(snRNA-seq),空间转录组学 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据 10个时间点的家蚕翅盘样本 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
1712 2026-04-04
Calibrating tissue level PDE models of ligand dynamics using single cell and spatial transcriptomics data
2026-Feb-19, NPJ systems biology and applications IF:3.5Q1
研究论文 本研究开发了一个计算流程,整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,用于校准组织水平的配体动力学偏微分方程模型 首次提出利用单细胞RNA测序和空间转录组学数据校准组织水平机制模型的计算框架,结合了近似贝叶斯计算和梯度优化方法 仅使用两个开源人类皮肤数据集作为案例研究,尚未在其他组织或疾病模型中验证 开发一个整合现代转录组学数据的计算框架,用于校准组织水平的配体动力学机制模型 人类皮肤组织中的转化生长因子β配体动力学 计算生物学 组织修复与纤维化 单细胞RNA测序, 空间转录组学 偏微分方程模型, 近似贝叶斯计算, 梯度优化 转录组数据, 空间数据 两个开源人类皮肤数据集 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
1713 2026-02-17
IL-8 positive cancer-associated fibroblasts drive breast cancer progression and immune evasion: insights from GWAS and single-cell transcriptomics
2026-Feb-16, BMC cancer IF:3.4Q2
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1714 2026-04-04
NINJ1-mediated macrophage ferroptosis impairs diabetic wound healing attenuated by Ruan Jian Qing Mai formula
2026-Feb-11, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1
研究论文 本研究探讨了巨噬细胞铁死亡在糖尿病足溃疡愈合中的作用,并揭示了软坚清脉方通过靶向NINJ1-STAT3-铁死亡通路促进伤口愈合的机制 首次结合人伤口组织单细胞RNA测序与糖尿病小鼠模型,系统阐明了巨噬细胞铁死亡在糖尿病伤口愈合中的关键作用,并发现中药复方软坚清脉方通过调控NINJ1-STAT3-铁死亡轴发挥治疗作用 研究主要基于动物模型和体外细胞实验,尚未在大型临床队列中验证软坚清脉方的疗效;对中药复方中具体活性成分的作用机制解析仍可进一步深入 探究巨噬细胞铁死亡在糖尿病足溃疡发病机制中的作用,并评估软坚清脉方的治疗效果及分子机制 人糖尿病伤口组织、链脲佐菌素诱导的糖尿病小鼠模型、高糖和LPS刺激的巨噬细胞、内皮细胞 数字病理学 糖尿病足溃疡 单细胞RNA测序,HPLC-MS,Western blot,qPCR,流式细胞术,迁移实验,管形成实验 NA 基因表达数据,蛋白质数据,化学组成数据,细胞表型数据 未明确样本数量,涉及人伤口组织、糖尿病小鼠模型及体外细胞模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1715 2026-04-04
Aging-induced decrease in progenitor B cells enhances the osteoclastogenesis of bone marrow macrophages via ROS-activated Fos/CCL3 signaling‌ pathway
2026-Feb-10, Immunity & ageing : I & A IF:5.2Q1
研究论文 本研究揭示了衰老过程中骨髓微环境中ROS水平升高导致祖B细胞减少,进而通过激活Fos/CCL3信号通路促进破骨细胞生成,从而引发老年性骨质疏松的机制 首次通过单细胞RNA测序等多组学整合策略,阐明了骨髓微环境中ROS诱导的祖B细胞减少通过Fos/CCL3-CCR1轴促进破骨细胞生成的新机制 研究主要基于SAMP6小鼠模型,人体内的验证尚需进一步研究;体外细胞实验使用了BaF3和RAW 264.7细胞系,可能与体内原代细胞存在差异 探究免疫细胞改变在老年性骨质疏松中的机制作用 SAMP6衰老加速小鼠、SAMR1对照小鼠、BaF3细胞系、RAW 264.7细胞系 数字病理学 老年性疾病 单细胞RNA测序、转录组测序、流式细胞术、微CT、分子生物学、组织学技术、多色免疫荧光、多重细胞因子分析 NA 基因表达数据、图像数据、细胞计数数据 SAMP6与SAMR1小鼠模型,具体数量未在摘要中明确 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1716 2026-04-04
Short-Chain Fatty Acid Supplementation After Traumatic Brain Injury Attenuates Neurologic Injury Via the Gut-Brain-Microglia Axis
2026-Feb-01, Shock (Augusta, Ga.)
研究论文 本研究探讨了补充短链脂肪酸(SCFAs)对创伤性脑损伤(TBI)后神经损伤的改善作用及其通过肠道-大脑-小胶质细胞轴的潜在机制 首次系统性地研究了TBI后补充SCFAs(乙酸盐、丁酸盐和丙酸盐)对神经损伤的改善作用,并揭示了其通过调节肠道微生物组、保护白质连接性、改变小胶质细胞转录谱以及诱导神经保护性热休克蛋白表达等多重机制发挥作用 研究仅使用雄性C57BL/6小鼠模型,样本量相对有限(n=52),且未探讨SCFAs补充的最佳剂量、时间窗口或长期效果,也未在人类或更复杂的动物模型中进行验证 探究创伤性脑损伤(TBI)后补充短链脂肪酸(SCFAs)是否能够减轻神经损伤并阐明其作用机制 14周龄雄性C57BL/6小鼠 神经科学 创伤性脑损伤 16s rRNA基因扩增子测序,单细胞RNA测序(scRNAseq),3D对比增强磁共振成像 NA 微生物组测序数据,神经影像数据,行为学数据,单细胞转录组数据 52只14周龄雄性C57BL/6小鼠 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1717 2026-04-04
In vivo CRISPR screen reveals regulation of macrophage states in neuroinflammation
2026-Feb, Nature neuroscience IF:21.2Q1
研究论文 本研究建立了一个体内CRISPR筛选流程,用于在小鼠多发性硬化模型中解析巨噬细胞调控机制 开发了基于可编辑祖细胞的体内CRISPR筛选方法,结合单细胞转录组学和生物传感器,实现了对巨噬细胞状态的高分辨率分析 研究基于小鼠模型,可能不完全反映人类疾病复杂性;筛选范围限于100多个细胞因子受体和信号分子 解析神经炎症中巨噬细胞状态的调控机制 小鼠多发性硬化模型中的巨噬细胞和中枢神经系统髓系细胞 单细胞组学 多发性硬化 CRISPR筛选, 单细胞转录组学, Perturb-seq NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1718 2026-04-04
Ubiquitous and Brain Cell-Type-Specific Promoters and Enhancers in Lentiviral Vectors
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
综述 本章讨论了在慢病毒载体中开发和应用组成型及脑细胞类型特异性启动子和增强子,以实现精确高效的基因递送 利用单细胞转录组学和ATAC测序等新技术识别新型增强子区域,推动更精细和靶向的慢病毒载体开发 NA 提高慢病毒载体在特定脑细胞群体中转基因表达的特异性和效率 兴奋性和抑制性神经元、星形胶质细胞、小胶质细胞等脑细胞群体 基因治疗 NA 单细胞转录组学、ATAC测序 NA NA NA NA NA NA NA
1719 2026-04-04
Genetic Association Between Polymyositis/Dermatomyositis and Epilepsy: Insights From Mendelian Randomization and Bioinformatic Analyses
2026-Jan, Brain and behavior IF:2.6Q3
研究论文 本研究通过孟德尔随机化和生物信息学分析,探讨了多发性肌炎/皮肌炎与癫痫之间的遗传关联及免疫介导机制 首次结合孟德尔随机化与单细胞转录组学,揭示了多发性肌炎与癫痫之间的因果关联及免疫细胞浸润模式 研究主要基于公开数据库数据,缺乏大规模临床队列验证,且皮肌炎与癫痫的关联未得到证实 探索多发性肌炎/皮肌炎与癫痫之间的潜在因果联系及免疫介导机制 多发性肌炎、皮肌炎和癫痫患者相关的基因组和转录组数据 生物信息学 多发性肌炎/皮肌炎和癫痫 GWAS, 孟德尔随机化, 转录组分析, 单细胞转录组学, PCR NA 基因组数据, 转录组数据 基于公开GWAS数据库的汇总数据,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1720 2026-04-04
The Role of Sphingolipid Metabolism and Neuron Death in Ischemic Stroke: A New Perspective from Bioinformatics
2026-Jan, Brain and behavior IF:2.6Q3
研究论文 本研究通过生物信息学方法探讨了鞘脂代谢与神经元死亡在缺血性脑卒中中的作用 结合bulk和单细胞转录组学数据,首次系统分析了鞘脂代谢通路在缺血性脑卒中中的变化,并鉴定了与神经元死亡相关的关键基因App 研究主要基于生物信息学分析,体内验证仅限于MCAO大鼠模型,缺乏临床样本的直接验证 探索鞘脂代谢与神经元死亡在缺血性脑卒中发病机制中的关系 缺血性脑卒中患者和小鼠模型的转录组数据,以及MCAO大鼠模型 生物信息学 缺血性脑卒中 bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, 基因集富集分析, 免疫浸润分析, 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 NA 转录组数据 人类外周血bulk数据(GSE16561)和MCAO小鼠外周血scRNA-seq数据(GSE225948),以及MCAO大鼠模型 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
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