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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 1701 - 1720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1701 | 2025-10-05 |
Benchmarking sketching methods on spatial transcriptomics data
2025-Sep-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.26.672376
PMID:40909701
|
研究论文 | 系统评估不同采样方法在空间转录组数据上的表现 | 首次系统评估空间转录组数据的采样方法，提出空间平滑杠杆评分方法能平衡转录组异质性和组织结构保持 | 研究仅基于有限的数据集进行验证，需要更多样化的数据集进一步确认 | 评估和优化空间转录组数据的采样方法以减少计算负担 | 空间转录组数据集（小鼠卵巢、MERFISH大脑、人类乳腺癌、肺组织）和模拟数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌, 肺癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | PCA, 随机SVD, 空间权重矩阵 | 空间转录组数据, 基因表达数据, 空间坐标 | 多个真实ST数据集和模拟数据 | NA | 空间转录组学, MERFISH | NA | NA |
| 1702 | 2025-10-05 |
Exploration of potential therapeutic target genes for preeclampsia through genetic analysis
2025-Sep, Journal of human hypertension
IF:2.7Q2
DOI:10.1038/s41371-025-01054-0
PMID:40715499
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研究论文 | 通过遗传分析探索先兆子痫的潜在治疗靶基因 | 首次通过整合cis-eQTL、孟德尔随机化、SMR和共定位分析系统筛选先兆子痫的潜在药物靶基因 | 研究主要基于血液样本的eQTL数据，未直接使用胎盘组织数据 | 识别先兆子痫的潜在治疗靶基因 | 先兆子痫相关基因 | 生物信息学 | 先兆子痫 | cis-eQTL分析，孟德尔随机化，功能富集分析，SMR分析，共定位分析，单细胞RNA测序 | 孟德尔随机化模型 | 基因表达数据，遗传数据 | eQTLGen联盟提供的血液样本数据 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1703 | 2025-10-05 |
Isotope-encoded spatial biology identifies plaque-age-dependent maturation and synaptic loss in an Alzheimer's disease mouse model
2025-Sep-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63328-y
PMID:40890115
|
研究论文 | 本研究通过同位素编码的空间生物学技术追踪阿尔茨海默病小鼠模型中Aβ斑块的年龄依赖性成熟过程及其与突触丧失的关联 | 结合质谱成像与稳定同位素标记技术对Aβ斑块进行时间标记，实现从初始沉积开始的斑块老化空间追踪 | 研究基于小鼠模型，结果向人类临床转化的适用性需要进一步验证 | 探究Aβ斑块演化过程如何影响周围组织及其与神经毒性的关系 | App基因敲入Aβ小鼠模型 | 空间生物学 | 阿尔茨海默病 | 质谱成像, 稳定同位素标记, 空间转录组学 | NA | 质谱成像数据, 基因表达数据, 结构染色数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1704 | 2025-10-05 |
Patterns of Mitochondrial ATP Predict Tissue Folding
2025-Aug-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.31.673364
PMID:40909554
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研究论文 | 本研究揭示了线粒体ATP的空间分布模式可预测胚胎发育过程中的组织折叠 | 首次发现线粒体在顶端收缩过程中局部富集于上皮细胞顶端，且这种亚细胞模式可计算预测组织折叠 | 未详细探讨线粒体空间分布调控的具体分子机制 | 探究胚胎形态发生过程中化学能量的空间分布模式及其与组织折叠的关系 | 果蝇、鸡和小鼠胚胎的上皮组织 | 发育生物学 | NA | 时间序列成像、空间转录组学、耗氧率测量 | 计算预测模型 | 图像、基因表达、代谢数据 | 多物种胚胎样本（果蝇、鸡、小鼠） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1705 | 2025-10-06 |
A simple liquid 3D cell culture paradigm models oxidative mitochondrial metabolism of epithelial breast cancer cells with relevance for lung metastases
2025-Aug-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.24.671623
PMID:40909564
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研究论文 | 本研究比较了两种3D细胞培养模型在模拟乳腺癌细胞代谢特性和肺转移能力方面的差异 | 开发了一种新型的液体3D细胞培养模型（EmC），能够更好地模拟乳腺癌细胞的氧化磷酸化代谢和肺转移特性 | 研究仅针对三种乳腺癌细胞系（SUM149、IBC-3、MDA-MB-468），需要更多细胞系验证 | 比较不同3D细胞培养模型对乳腺癌细胞代谢特性和转移能力的影响 | 乳腺癌细胞系（SUM149、IBC-3、MDA-MB-468） | 细胞生物学 | 乳腺癌 | 蛋白质组学、单细胞转录组学、代谢流分析、电子显微镜 | 3D细胞培养模型 | 图像、蛋白质组数据、转录组数据、代谢数据 | 三种乳腺癌细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1706 | 2025-10-05 |
Rethinking large-scale phylogenomics with EukPhylo v.1.0, a flexible toolkit to enable phylogeny-informed data curation and analyses of diverse eukaryotic lineages
2025-Aug-27, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01770-25
PMID:40862604
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研究论文 | 介绍EukPhylo v.1.0工具包，用于真核生物系统发育基因组学数据管理和分析 | 开发了模块化、用户友好的流程，通过系统发育信息指导的污染去除和同源基因家族估计来改进真核生物系统发育分析 | 未明确说明工具在处理特定类型污染或极端数据情况下的局限性 | 解决真核生物系统发育基因组学分析中的数据污染和可重复性问题 | 真核生物、细菌和古菌的多样化谱系 | 生物信息学 | NA | 系统发育基因组学分析、单细胞测序、同源基因家族分析 | NA | 基因组序列数据、基因家族数据 | 1,000个多样化物种，包含约15,000个古老基因家族 | NA | 系统发育分析、基因家族估计、多序列比对 | EukPhylo v.1.0工具包 | 包含Hook数据库（约15,000个古老基因家族）和独立实用程序套件的模块化流程 |
| 1707 | 2025-10-05 |
Precision and Accuracy in Quantitative Measurement of Gene Expression from Single-cell/nuclei RNA Sequencing Data
2025-Aug-26, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf077
PMID:40857558
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研究论文 | 系统评估单细胞/单核RNA测序数据中基因表达定量测量的精确度和准确性 | 首次系统评估sc/snRNA-seq数据的定量精确度和准确性，建立了数据驱动的优化研究设计阈值，并开发了VICE工具评估数据质量 | 研究主要基于单核吞噬细胞数据，可能不适用于所有细胞类型 | 提高单细胞/单核RNA测序研究的可靠性和可重复性 | 单细胞和单核RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3,682,576个细胞，来自339个样本，23个数据集 | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | NA |
| 1708 | 2025-10-05 |
Large-scale single-cell profiling of stem cells identifies redundant regulators of shoot development and yield trait variation
2025-Aug-25, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.07.024
PMID:40865519
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研究论文 | 通过大规模单细胞分析鉴定植物茎尖分生组织干细胞调控因子及其与产量性状的关联 | 首次成功捕获数千个CLAVATA3和WUSCHEL表达细胞，实现跨物种保守调控因子的鉴定，并将单细胞分析与等位基因变异关联研究相结合 | NA | 鉴定植物茎尖分生组织干细胞的关键调控因子及其对产量性状的影响 | 玉米和拟南芥的茎尖分生组织干细胞 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 数千个干细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1709 | 2025-10-05 |
An engineered glioblastoma model yields macrophage-secreted drivers of invasion
2025-Aug-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.181903
PMID:40857405
|
研究论文 | 本研究通过工程化胶质母细胞瘤模型揭示肿瘤相关巨噬细胞分泌的侵袭驱动因子 | 结合工程化3D水凝胶肿瘤微环境模型与多组学分析，首次发现并验证TGFBI作为巨噬细胞分泌的可靶向促肿瘤因子 | 对肿瘤相关巨噬细胞功能的认知仍不完整，临床转化效果需进一步验证 | 研究肿瘤相关巨噬细胞与胶质母细胞瘤干细胞之间的相互作用机制 | 胶质母细胞瘤干细胞和M2极化巨噬细胞 | 肿瘤微环境研究 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组学,蛋白质组学,3D水凝胶模型 | 工程化3D水凝胶肿瘤微环境模型 | 转录组数据,蛋白质组数据 | 胶质母细胞瘤患者单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1710 | 2025-10-05 |
Subcellular spatial transcriptomics reveals immune-stromal crosstalk within the synovium of patients with juvenile idiopathic arthritis
2025-Aug-08, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.08.05.25332835
PMID:40894156
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研究论文 | 通过亚细胞分辨率空间转录组分析揭示幼年特发性关节炎患者滑膜中免疫-基质细胞的相互作用 | 开发了新的空间共定位分析流程，首次在亚细胞分辨率下解析JIA滑膜空间组织，发现NOTCH信号介导的内皮-成纤维细胞互作和CXCL9-CXCR3信号轴等新型微解剖结构 | 样本仅来自活动期JIA患者，未包含缓解期或不同亚型患者对照 | 解析幼年特发性关节炎滑膜组织的空间分子结构 | 幼年特发性关节炎患者的滑膜组织 | 空间转录组学 | 幼年特发性关节炎 | 空间转录组测序 | 空间共定位分析流程 | 空间转录组数据 | 活动期JIA患者滑膜组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | 亚细胞分辨率空间转录组分析 |
| 1711 | 2025-10-05 |
Obesity hinders the efficacy of adipose-derived stem cells for knee osteoarthritis by reducing the proportion of DPP4+ stem cells
2025-Jul-24, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szaf004
PMID:40913785
|
研究论文 | 本研究探讨肥胖如何通过减少DPP4+干细胞比例影响脂肪来源干细胞对膝骨关节炎的治疗效果 | 首次揭示肥胖通过改变脂肪来源干细胞亚群比例（特别是DPP4+细胞减少）影响其治疗效果的机制 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类患者中验证 | 探究肥胖对脂肪来源干细胞治疗骨关节炎疗效的影响机制 | 野生型和ob/ob肥胖小鼠的脂肪来源干细胞 | 干细胞治疗 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序, 荧光激活细胞分选, 组织学分析 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据, 行为数据, 组织学图像 | 野生型和肥胖小鼠的脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1712 | 2025-10-05 |
Synovial tissue atlas in juvenile idiopathic arthritis reveals pathogenic niches associated with disease severity
2025-Jul-02, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adt6050
PMID:40601776
|
研究论文 | 本研究通过单细胞技术构建了幼年特发性关节炎滑膜组织图谱，揭示了与疾病严重程度相关的致病微环境 | 首次在初治JIA患儿中建立滑膜组织细胞图谱，识别了与关节炎严重程度相关的空间组织微环境和特定细胞群体 | 样本来自疾病早期初治患者，可能无法代表所有JIA亚型或疾病阶段 | 解析幼年特发性关节炎滑膜组织的细胞组成和空间结构，指导靶向治疗 | 幼年特发性关节炎患儿的滑膜组织活检样本、滑液和外周血 | 数字病理学 | 幼年特发性关节炎 | 单细胞RNA测序,多重免疫荧光,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,免疫荧光图像 | 初治JIA患儿的滑膜组织活检样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1713 | 2025-10-05 |
Chikungunya virus persists in joint-associated macrophages and promotes chronic disease
2025-Jun-25, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6917990/v1
PMID:40678223
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组学技术发现基孔肯雅病毒在关节相关巨噬细胞中持续存在并促进慢性疾病 | 首次发现关节相关巨噬细胞中持续存在复制型病毒RNA，并揭示CD4 T细胞在关节炎症中的潜在作用 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类患者中验证 | 探究甲病毒引起慢性关节疾病的机制 | 甲病毒感染的小鼠关节相关组织 | 数字病理学 | 病毒性关节炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 甲病毒感染小鼠的关节组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1714 | 2025-10-05 |
Comparative single cell analysis of transcriptional bursting reveals the role of genome organization on de novo transcript origination
2025-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.29.591771
PMID:38746255
|
研究论文 | 通过比较单细胞分析研究转录爆发在精子发生过程中对新转录本起源的作用 | 开发新的统计程序识别198个核心基因，揭示基因组组织对转录爆发和新基因起源的影响机制 | 仅在三密切相关的物种中进行研究，时间跨度2500-3000万年 | 研究转录爆发在精子发生过程中对新转录本起源的调控机制 | 三种密切相关的物种的生殖细胞 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, RNA荧光原位杂交 | 统计模型 | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 三种物种的生殖细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1715 | 2025-10-05 |
NAD+ prevents chronic kidney disease by activating renal tubular metabolism
2025-Mar-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.181443
PMID:40059824
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研究论文 | 本研究揭示了NAD+补充通过激活肾小管代谢预防慢性肾脏病的机制 | 首次在Alport综合征小鼠模型中应用单核RNA测序和空间转录组学技术，并首次报道该模型中转录水平的性别差异 | 研究仅限于Alport综合征小鼠模型，人类临床相关性尚需验证 | 探究NAD+补充保护慢性肾脏病的分子机制和涉及的细胞类型 | Alport综合征小鼠模型和肾近端小管细胞 | 肾脏病学 | 慢性肾脏病 | RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学, 正交成像技术, 生化分析 | 小鼠疾病模型 | 转录组数据, 图像数据, 生化数据 | Alport综合征小鼠模型 | NA | bulk RNA-seq, 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1716 | 2025-10-05 |
Metabolic stress and age drive inflammation and cognitive decline in mice and humans
2025-Mar, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.70060
PMID:40110679
|
研究论文 | 本研究探讨代谢应激和年龄如何通过炎症机制导致小鼠和人类认知功能下降 | 首次结合小鼠高脂饮食模型与人类死后脑组织分析，揭示代谢应激通过小胶质细胞介导的炎症机制导致认知障碍，并识别SPP1作为潜在治疗靶点 | 研究主要基于动物模型和死后组织，难以完全模拟人类疾病进程；样本量有限 | 阐明代谢应激因素通过免疫系统失调和炎症机制导致认知障碍的病理机制 | 高脂饮食喂养的小鼠模型；阿尔茨海默病和2型糖尿病患者的死后脑组织与对照组 | 神经科学 | 阿尔茨海默病, 2型糖尿病 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 认知行为数据, 代谢数据 | 小鼠模型和人类死后脑组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1717 | 2025-10-05 |
mTOR signaling regulates multiple metabolic pathways in human lung fibroblasts after TGF-β and in pulmonary fibrosis
2025-Feb-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00189.2024
PMID:39745695
|
研究论文 | 本研究探讨mTOR信号通路在TGF-β处理后的人肺成纤维细胞及肺纤维化中调控多种代谢途径的作用机制 | 首次系统揭示mTOR和ATF4在肺成纤维细胞中调控氨基酸稳态、糖酵解和TCA循环代谢物的新机制，并通过单细胞RNA-seq数据验证这些代谢重编程在IPF患者肺中的存在 | 研究主要基于体外细胞模型，需要进一步体内实验验证；代谢调控机制的具体下游效应仍需深入探索 | 阐明mTOR信号通路在肺纤维化过程中调控成纤维细胞代谢重编程的分子机制 | 人肺成纤维细胞和特发性肺纤维化(IPF)患者肺组织 | 分子生物学 | 肺纤维化 | RNA测序, 代谢组学分析, 单细胞RNA-seq数据分析 | NA | 基因表达数据, 代谢物数据, 单细胞转录组数据 | 人肺成纤维细胞系及公开可用的IPF患者单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 1718 | 2025-10-05 |
Diethylhexyl phthalate induces immune dysregulation and is an environmental immune disruptor
2024-12-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136244
PMID:39442302
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯(DEHP)对小鼠免疫系统的破坏作用 | 首次在单细胞水平系统揭示DEHP通过抑制炎症信号和热休克蛋白表达导致免疫失调的机制 | 研究仅使用小鼠模型，未直接验证对人体免疫系统的影响 | 探究DEHP对环境免疫系统的破坏作用及其机制 | 小鼠脾脏组织和外周血免疫细胞 | 免疫毒理学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠脾脏组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1719 | 2025-10-05 |
Pulmonary surfactant biogenesis blockage mediated polyhexamethylene guanidine disinfectant induced pulmonary fibrosis
2024-12-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136307
PMID:39488979
|
研究论文 | 本研究揭示了聚六亚甲基胍消毒剂通过阻断肺表面活性物质生物合成诱发肺纤维化的机制 | 首次发现PHMG通过破坏自噬流导致AT2细胞内肺表面活性物质生物合成受阻的机制 | NA | 探究PHMG消毒剂吸入暴露诱发肺纤维化的时间效应和分子机制 | 肺泡II型上皮细胞(AT2细胞) | 毒理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1720 | 2025-10-05 |
TCGAimmunosurv: An R package to identify genes associated with patient survival and immune cell state transitions using TCGA and single-cell RNA-seq data
2025-Dec, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 开发了一个名为TCGAimmunosurv的R软件包，用于整合TCGA大块RNA-seq数据和单细胞RNA-seq数据，识别与患者生存和免疫细胞状态转换相关的基因 | 开发了首个整合大块RNA-seq和单细胞RNA-seq数据的泛癌分析工具，能够进行突变特异性免疫动态分析 | 依赖于用户提供的单细胞数据集，分析结果可能受数据质量影响 | 识别与癌症患者生存和免疫细胞状态转换相关的驱动基因 | 癌症基因组数据和免疫细胞数据 | 生物信息学 | 癌症 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 伪时间轨迹分析 | 基因表达数据 | TCGA数据库中的泛癌样本 | NA | 大块RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |