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当前共找到 38157 篇文献,本页显示第 1701 - 1720 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1701 2026-03-18
Spatiotemporal transcriptomic profiling reveals metabolic dysfunction prior to overt tauopathy in the PS19 mouse model
2025-Jul-10, Research square
研究论文 本研究利用PS19小鼠模型,通过空间转录组学分析揭示了tau蛋白病前期海马和皮层区域的代谢功能障碍 首次在PS19小鼠模型中,通过空间转录组学技术,在可检测的tau缠结病理出现前,识别出CA3区域糖酵解通路基因的早期上调,揭示了代谢失调与区域脆弱性的关联 研究基于转基因小鼠模型,可能无法完全模拟人类神经退行性疾病的复杂性,且样本量有限 探究tau蛋白病中区域脆弱性与tau驱动转录组变化之间的关系,特别是代谢功能障碍在疾病早期的作用 PS19转基因小鼠模型的海马和皮层区域 空间转录组学 阿尔茨海默病 空间转录组学分析 NA 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
1702 2026-03-18
PINK1 link mitochondria-ER contacts controls deposition of intramuscular fat in pigs
2025-05-20, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究探讨了PINK1蛋白通过调控线粒体-内质网相互作用来调节猪肌肉内脂肪沉积的分子机制 首次揭示了PINK1在猪肌肉内脂肪沉积中的关键作用,并发现其通过调控线粒体-内质网接触来影响脂肪沉积过程 研究主要基于猪模型,结果在人类或其他物种中的适用性尚需验证 探究PINK1如何调控猪肌肉内脂肪沉积的分子机制 猪的肌肉组织、纤维-脂肪祖细胞和脂肪细胞 分子生物学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 多个猪品种的肌肉组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1703 2026-03-18
Murine Aortic Valve Cell Heterogeneity at Birth
2025-May, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 本研究通过单细胞转录组学分析新生小鼠主动脉瓣细胞异质性,揭示了出生时瓣膜内皮细胞和间质细胞的新亚群 首次在出生后第1天小鼠主动脉瓣中发现新的瓣膜内皮细胞亚群和三个先前未被认识的瓣膜间质细胞亚群(原始型、重塑型和生物活性型),并通过谱系追踪揭示了原始型间质细胞在出生后成熟过程中的时空轨迹 研究仅针对出生后第1天的小鼠主动脉瓣,未涵盖更广泛的发育阶段或人类样本,可能限制了结果的普遍性 探究主动脉瓣在出生后成熟过程中建立结构-功能关系的细胞机制 新生小鼠(出生后第1天)的主动脉瓣结构 数字病理学 心血管疾病 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1704 2026-03-18
Dissecting the Single-Cell Diversity and Heterogeneity Underlying Cervical Precancerous Lesions and Cancer Tissues
2025-05, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
研究论文 本文通过整合单细胞数据集,研究了从宫颈癌前病变到宫颈鳞状细胞癌的细胞多样性和异质性 利用单细胞组成数据分析(scCODA)揭示细胞类型组成变化,并通过ATAC-seq分析将表观遗传改变与基因表达谱关联,识别了关键转录因子(如YY1) 研究依赖于现有数据集整合,可能受样本来源和技术差异影响,且新队列数据(HRA001742)的相似性评估仅基于逻辑回归模型 探究宫颈癌前病变到宫颈鳞状细胞癌的细胞多样性和异质性,为靶向治疗提供基础 正常组织、癌旁组织、癌前病变和宫颈肿瘤的单细胞数据 数字病理学 宫颈癌 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, RT-qPCR, 免疫组化(IHC) 逻辑回归模型 单细胞测序数据, 表观遗传数据, 基因表达数据 四个单细胞数据集,包括正常组织、癌旁组织、癌前病变和宫颈肿瘤样本 NA 单细胞RNA-seq, ATAC-seq NA NA
1705 2026-03-18
Systematic evaluation of single-cell multimodal data integration for comprehensive human reference atlas
2025-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究系统评估了单细胞多模态数据整合方法在构建人类肾脏皮质参考图谱中的应用 开发了可解释的机器学习工具scOMM,并首次系统评估了水平整合(scRNA与snRNA-seq)和垂直整合(snRNA-seq与snATAC-seq)策略在复杂组织中的效果 研究仅针对肾脏皮质组织,未验证在其他复杂组织中的普适性 评估多模态单细胞数据整合策略对构建全面人类参考图谱的影响 人类肾脏皮质组织 单细胞组学 NA scRNA-seq, snRNA-seq, snATAC-seq 机器学习(scOMM工具) 单细胞多模态组学数据 19名捐赠者的119,744个高质量细胞核/细胞 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
1706 2026-03-18
Mixed exposure to PFOA and PFOS induces oocyte apoptosis and subfertility in mice by activating the Hippo signaling pathway
2025-03, Reproductive toxicology (Elmsford, N.Y.)
研究论文 本研究探讨了PFOA和PFOS混合物暴露通过激活Hippo信号通路诱导小鼠卵母细胞凋亡并导致生育力下降的机制 首次揭示了PFOA和PFOS混合物通过激活Hippo信号通路损害卵母细胞质量和生育能力的分子机制,并利用单细胞转录组分析证实了其对能量代谢和凋亡的影响 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证;混合物暴露的具体剂量和比例对结果的普适性有待进一步研究 探究PFOA和PFOS混合物暴露对卵母细胞质量和雌性生育能力的影响及其分子机制 雌性小鼠的卵母细胞 生殖毒理学 生殖系统疾病 单细胞转录组分析 动物模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1707 2026-03-18
Eliminating the persistent HIV reservoir based on biomarker expression - How do we get there?
2025-02, Virology IF:2.8Q3
综述 本文讨论了基于生物标志物表达来消除持久性HIV病毒库的挑战与前景 系统分析了导致HIV潜伏感染细胞生物标志物异质性的因素,并提出了通过识别共表达蛋白的最小组合来定义所有病毒库亚群的新策略 目前缺乏能够定义所有HIV潜伏感染细胞的单一特异性分子标志物,且对组织微环境和髓系细胞中潜伏感染细胞的表征仍不充分 探讨如何识别和利用生物标志物来靶向消除持久性HIV病毒库,以实现HIV治愈 HIV潜伏感染细胞及其相关的生物标志物 NA HIV感染 空间转录组学、蛋白质组学 NA NA NA NA 空间转录组学 NA NA
1708 2026-03-18
ImageDoubler: image-based doublet identification in single-cell sequencing
2025-01-02, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究提出了一种基于图像的模型ImageDoubler,用于识别单细胞测序中的双联体 首次利用Fluidigm单细胞测序图像数据进行双联体识别,相比传统基于基因组模拟数据的方法,F1分数至少提升33.1% 方法目前主要针对Fluidigm平台图像数据,在其他单细胞测序平台上的适用性有待验证 开发更有效的单细胞测序双联体检测方法 单细胞测序数据中的双联体(两个或多个细胞被一起测序) 数字病理学 NA 单细胞测序 图像识别模型 图像 NA Fluidigm 单细胞测序 NA Fluidigm单细胞测序图像数据
1709 2026-03-18
HIV-SEQ REVEALS GLOBAL HOST GENE EXPRESSION DIFFERENCES BETWEEN HIV-TRANSCRIBING CELLS FROM VIREMIC AND SUPPRESSED PEOPLE WITH HIV
2024-Dec-20, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究开发了一种名为HIV-seq的新方法,用于更有效地捕获HIV转录本,并通过单细胞RNA-seq分析HIV感染者细胞,揭示了病毒转录细胞在病毒血症和抑制期间的基因表达差异 开发了HIV-seq方法,通过添加针对HIV基因组保守区域的自定义捕获序列,提高了HIV RNA+细胞的检测效率达44%,并结合CITE-seq进行表面表型分析,首次系统比较了病毒血症和ART抑制期间HIV转录细胞的转录特征 样本量相对较小,仅基于配对血液样本,可能无法完全代表所有组织中的HIV转录细胞,且方法依赖于自定义捕获序列的设计,可能对HIV变异株的覆盖不完全 研究HIV感染者中病毒转录细胞的基因表达差异,特别是在病毒血症和抗逆转录病毒治疗抑制期间的比较,以理解活跃病毒库细胞的持久性机制 HIV感染者的血液样本,包括病毒血症和ART抑制期间的配对样本 单细胞测序 HIV感染 单细胞RNA-seq, CITE-seq NA 单细胞转录组数据, 表面表型数据 配对血液样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq, 表面表型分析 NA NA
1710 2026-03-18
Human Anti-Glycan Reactivity is Driven by the Selection of B cells Utilizing Private Antibody Gene Rearrangements that are Affinity Maturated in Germinal Centers
2024-Oct-18, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过BCR受体克隆、表达及单细胞转录组学分析,探讨了人类对普遍存在的N-乙酰-D-葡萄糖胺(GlcNAc)表位的B细胞库,并揭示了抗糖抗体在生发中心依赖的亲和力成熟过程 结合BCR克隆表达与单细胞转录组学,首次系统分析了人类抗GlcNAc B细胞库的免疫系统发育史,揭示了其在早期儿童期通过生发中心进行亲和力成熟的新机制 研究主要关注GlcNAc表位,可能未全面覆盖其他糖类抗原;样本队列和年龄范围可能限制结论的普遍性 解析人类抗体库对碳水化合物抗原的广泛反应性机制,特别是针对GlcNAc表位的B细胞选择与成熟过程 人类队列中的循环抗GlcNAc B细胞及其BCR受体 免疫学 NA BCR受体克隆与表达、单细胞转录组学 NA 单细胞转录组数据、BCR序列数据 人类队列(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1711 2026-03-18
Single-cell multidimensional profiling of tumor cell heterogeneity in supratentorial ependymomas
2024-Aug-09, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组学、空间转录组学和活细胞成像技术,系统描绘了幕上室管膜瘤的肿瘤细胞异质性、空间组织和动态行为 首次在单细胞和空间维度上整合分析了幕上室管膜瘤的细胞状态、空间架构及微环境影响,揭示了肿瘤内两种不同的祖细胞样状态,并发现了脑内常驻细胞对肿瘤细胞向神经元样表型转化的新作用 未明确说明样本数量及具体技术平台细节,且研究聚焦于特定亚型,结论的普适性有待进一步验证 解析幕上室管膜瘤的肿瘤异质性、空间组织模式及其与神经微环境的相互作用 幕上室管膜瘤(一种儿童侵袭性脑肿瘤)的肿瘤细胞及其微环境 数字病理学 脑肿瘤(幕上室管膜瘤) 单细胞转录组测序, 空间转录组学, 活细胞成像 NA 转录组数据, 空间位置数据, 影像数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1712 2026-03-18
Development of robust antiviral assays using relevant apical-out human airway organoids
2024-Jul-12, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究开发了一种使用顶端向外人类气道类器官进行高通量抗病毒药物筛选的标准化方法 引入了具有反向双极性的气道类器官,实现了单类器官每孔的高通量培养和分析,提高了病毒感染效率和药物筛选的标准化水平 研究主要作为SARS-CoV-2的概念验证应用,尚未广泛扩展到其他病毒或疾病模型 开发标准化的类器官平台用于抗病毒药物发现和评估 人类气道类器官和SARS-CoV-2病毒株 数字病理学 呼吸道疾病 单细胞RNA测序,免疫组织化学 类器官模型 转录组数据,图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1713 2026-03-18
An update on methods for detection of prognostic and predictive biomarkers in melanoma
2023, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
综述 本文综述了黑色素瘤中预后和预测性免疫生物标志物检测的最新方法 整合了从批量组织基因表达谱到单细胞空间转录组学和基于人工智能的图像分析等多种技术,以全面表征黑色素瘤免疫微环境 作为综述文章,未提供原始实验数据或新方法验证,主要总结现有研究 改进黑色素瘤的免疫基础预测和预后生物标志物检测方法 黑色素瘤患者,特别是II-IV期患者 数字病理学 黑色素瘤 基因表达谱分析,空间转录组学,人工智能图像分析 NA 图像,文本(基因表达数据) NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
1714 2026-03-18
A novel lncRNA-mediated epigenetic regulatory mechanism in periodontitis
2023, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 本研究探讨了长链非编码RNA lncR-APDC在牙周炎进展中的调控作用及其治疗潜力 首次揭示了lncR-APDC在牙周炎中的关键调控作用,发现了一个新的上皮细胞亚群,并提出了lncR-APDC与特定蛋白直接结合的可能性 研究主要基于小鼠模型,需要进一步在人类样本中验证;部分分子相互作用机制尚未完全阐明 理解lncR-APDC在牙周炎进展中的调控作用 lncR-APDC基因敲除小鼠、实验性牙周炎模型、牙周组织免疫细胞 表观遗传学 牙周炎 单细胞RNA测序、基因敲除、AAV9介导的基因治疗 NA 基因表达数据、单细胞转录组数据 基因敲除小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1715 2026-03-18
Manifold Interpolating Optimal-Transport Flows for Trajectory Inference
2022-Dec, Advances in neural information processing systems
PMID:37397786
研究论文 提出了一种名为MIOFlow的方法,用于从稀疏时间点采集的静态快照样本中学习随机、连续的群体动态 结合动态模型、流形学习和最优传输,通过训练神经常微分方程在静态群体快照之间进行插值,并利用流形地面距离的最优传输进行惩罚 未在摘要中明确说明 从静态快照样本推断连续群体动态轨迹 模拟数据(含分叉与合并)和scRNA-seq数据(胚状体分化和急性髓系白血病治疗) 机器学习 急性髓系白血病 scRNA-seq 神经常微分方程(Neural ODE)、自编码器(GAE) 单细胞RNA测序数据、模拟数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1716 2026-03-17
Integrative single-cell and spatial transcriptomic reveals S100A16+ tumor endothelial cells drive angiogenesis and immunosuppression in hepatocellular carcinoma
2026-May-01, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和空间转录组学,揭示了S100A16+肿瘤内皮细胞在肝细胞癌中驱动血管生成和免疫抑制的关键作用 首次在肝细胞癌中鉴定出S100A16+肿瘤内皮细胞亚群,并阐明其通过CCL20和TGF-β2促进血管生成和Treg分化、导致免疫抑制的双重机制 样本量相对有限(49个单细胞样本,12个空间样本),临床验证队列规模较小,机制研究主要在体外和动物模型中进行 探究肝细胞癌中肿瘤相关内皮细胞的分子特征、功能及其在肿瘤进展中的作用 肝细胞癌组织、正常肝组织、肿瘤边界区域、人脐静脉内皮细胞、内皮细胞特异性敲除小鼠 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,RNA测序,多重免疫荧光分析 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据,临床数据 49个样本(145,692个高质量单细胞),12个空间样本(49,091个空间点),90对配对HCC样本的组织微阵列,一个免疫治疗晚期HCC队列 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
1717 2026-03-17
Aflatoxin B1 accelerates diabetic nephropathy progression via ITGA11/LTBP1-dependent oxidative and fibrotic pathways: Evidence from multi-omics and molecular simulations
2026-May-01, Chemico-biological interactions IF:4.7Q1
研究论文 本研究通过多组学和分子模拟揭示了黄曲霉毒素B1通过ITGA11/LTBP1依赖的氧化和纤维化通路加速糖尿病肾病进展的机制 首次系统性地整合了批量转录组学、单细胞转录组学、空间转录组学及分子模拟技术,全面解析了AFB1在糖尿病肾病中的分子调控网络,并识别出ITGA11和LTBP1作为关键分子介导物 研究主要基于计算和模拟分析,缺乏体内或体外实验验证AFB1与ITGA11/LTBP1的直接相互作用及其功能影响 阐明AFB1在糖尿病肾病进展中的作用机制,识别相关的分子通路和细胞间通讯轴 糖尿病肾病相关的分子和细胞通路,特别是AFB1响应的基因和蛋白 计算生物学 糖尿病肾病 批量转录组学, 单细胞转录组学, 空间转录组学, 免疫去卷积, 细胞间通讯推断, 伪时间轨迹分析, 分子对接, 分子动力学模拟 NA 转录组数据, 空间数据, 模拟数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1718 2026-03-17
MIF-CD74 axis facilitates MDSC infiltration in the tumor microenvironment of pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-May-01, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究探讨了胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤微环境中MIF-CD74轴如何促进髓源性抑制细胞(MDSCs)浸润,揭示了其与癌症相关成纤维细胞(CAFs)的相互作用及其对免疫抑制微环境的影响 首次在PDAC组织中通过单细胞RNA测序和空间转录组学发现MDSCs特征性表达CD74,并揭示MIF-CD74轴在CAFs与MDSCs相互作用中的关键作用,为免疫治疗提供了新靶点 研究主要基于手术标本和鼠模型,临床样本量有限,且未深入探讨MIF-CD74轴在其他癌症类型中的普适性 研究PDAC肿瘤微环境的免疫抑制特性,特别是MDSCs的浸润机制及其与CAFs的相互作用 胰腺导管腺癌(PDAC)组织样本、髓源性抑制细胞(MDSCs)、癌症相关成纤维细胞(CAFs) 数字病理学 胰腺癌 流式细胞术(FCM)、单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 单细胞RNA测序数据、空间转录组学数据、流式细胞术数据 PDAC手术标本(具体数量未明确) NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
1719 2026-03-17
Formononetin, an active component of RAS-RH, ameliorates radiation-induced mitochondrial fission dysfunction in endothelial cells via TCs-ECs crosstalk
2026-May, Microvascular research IF:2.9Q2
研究论文 本研究揭示了中药复方RAS-RH的活性成分芒柄花素通过调控心脏端细胞介导的旁分泌信号,减轻X射线辐射诱导的大鼠心脏微血管内皮细胞损伤的机制 首次阐明了芒柄花素通过AR/miR-151a-5p/Fis1轴介导心脏端细胞与内皮细胞之间的串扰,抑制线粒体过度分裂的核心机制 研究为体外细胞模型,缺乏体内实验验证;机制研究主要聚焦于Fis1通路,可能存在其他调控途径 探究RAS-RH及其活性成分芒柄花素缓解辐射诱导内皮细胞损伤的作用机制 大鼠心脏微血管内皮细胞、心脏端细胞 细胞生物学 辐射损伤 单细胞RNA测序、网络药理学、分子对接、分子动力学模拟、Western blot、免疫荧光、流式细胞术 NA 基因表达数据、蛋白质数据、细胞成像数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1720 2026-03-17
BRIP1-mediated RINT1 acetylation and NF-κB activation promote DNA repair and immunosuppressive microenvironment in lung adenocarcinoma
2026-May-01, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究揭示了BRIP1通过调控RINT1乙酰化和NF-κB信号通路,促进肺腺癌DNA修复和免疫抑制微环境形成的分子机制 首次发现BRIP1通过两条相互关联的通路协调DNA修复能力和先天免疫抑制,并建立了BRIP1作为DNA修复能力与免疫抑制之间分子联系的新角色 研究主要在细胞和动物模型中进行,临床转化效果需进一步验证;BRIP1调控的具体分子细节仍需深入探索 探究BRIP1在肺腺癌DNA修复和免疫逃逸中的作用机制,为联合免疫治疗提供新靶点 肺腺癌细胞、肿瘤组织、动物模型 肿瘤免疫学 肺腺癌 空间转录组学、单细胞RNA测序、多重免疫组化、功能实验 NA 基因表达数据、空间转录组数据、单细胞RNA测序数据、免疫组化图像 未明确说明具体样本数量,涉及肿瘤组织和多个细胞系 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
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