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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1701 | 2026-03-13 |
Patient-Derived Tumor Organoids Combined with Function-Associated ScRNA-Seq for Dissecting the Local Immune Response of Lung Cancer
2024-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202400185
PMID:38896792
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研究论文 | 本研究开发了一种结合患者来源的肺癌类器官和功能关联单细胞RNA测序的平台,用于解析肺癌局部免疫微环境对免疫治疗的动态响应 | 开发了功能关联单细胞RNA测序平台,可在单个类器官水平同时进行表型评估和scRNA-seq,并利用该平台揭示了患者来源的肺癌类器官保留了亲本肿瘤组织的免疫微环境异质性 | 研究样本量相对较小,仅来自7名患者,且为体外模型研究 | 解析肺癌局部肿瘤免疫微环境对免疫检查点阻断治疗的动态响应 | 患者来源的原发性肺癌类器官及其中的浸润免疫细胞 | 单细胞组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自7名患者的171个个体pLCOs | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 功能关联单细胞RNA测序平台 |
| 1702 | 2026-03-13 |
Sexually Dimorphic Response to Hepatic Injury in Newborn Suffering from Intrauterine Growth Restriction
2024-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202403095
PMID:38867614
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了宫内生长受限(IUGR)新生仔猪肝脏损伤的性别依赖性模式,并探索了ApoA4作为新型生物标志物的潜力 | 首次通过单细胞RNA测序创建IUGR仔猪肝脏细胞图谱,揭示了性别依赖性的损伤反应机制,并发现ApoA4在雄性中的保护性作用 | 研究仅使用仔猪模型,结果向人类转化的适用性需进一步验证;样本量可能有限 | 探究IUGR诱导的肝脏损伤的性别依赖性分子机制,并寻找潜在的治疗靶点 | 宫内生长受限(IUGR)的新生仔猪 | 单细胞组学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 来自同一胎的仔猪(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1703 | 2026-03-13 |
Identification and Characterization of Metastasis-Initiating Cells in ESCC in a Multi-Timepoint Pulmonary Metastasis Mouse Model
2024-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202401590
PMID:38864342
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研究论文 | 本研究通过多时间点肺转移小鼠模型,利用单细胞RNA测序技术识别并表征了食管鳞状细胞癌(ESCC)中的转移起始细胞(MICs)及其特征基因 | 首次在多时间点肺转移小鼠模型中,结合单细胞RNA测序识别了ESCC的转移起始细胞(MICs),并定义了一组7个转移起始特征基因(MIS),包括CD44和TACSTD2,用于预测临床预后 | 研究基于小鼠模型和有限细胞系(KYSE30),可能无法完全反映人类ESCC的异质性;临床样本验证仅限于部分MIS基因 | 探究食管鳞状细胞癌(ESCC)肺转移的早期微环境及转移起始细胞的特性 | 食管鳞状细胞癌(ESCC)细胞系(KYSE30)及临床样本 | 单细胞组学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),多重免疫组化(mIHC) | NA | 单细胞RNA测序数据,免疫组化图像数据 | 小鼠模型中的ESCC细胞及临床ESCC样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1704 | 2026-03-13 |
TRIM24 Cooperates with Ras Mutation to Drive Glioma Progression through snoRNA Recruitment of PHAX and DNA-PKcs
2024-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202400023
PMID:38828688
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研究论文 | 本研究揭示了表观遗传调控因子TRIM24与Ras突变协同驱动胶质瘤进展的机制,通过snoRNA招募PHAX和DNA-PKcs促进上皮样胶质母细胞瘤转化 | 首次发现TRIM24在胶质瘤进展中的驱动作用,并阐明其通过U3 snoRNA招募DNA-PKcs导致TRIM24磷酸化的新机制 | 研究主要基于动物模型和细胞实验,临床样本验证相对有限,且治疗策略的临床转化潜力尚需进一步评估 | 探究胶质瘤进展的表观遗传调控机制,并寻找潜在治疗靶点 | 胶质瘤细胞、人类神经干细胞、临床上皮样胶质母细胞瘤标本 | 肿瘤生物学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 临床上皮样胶质母细胞瘤标本及实验模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1705 | 2026-03-13 |
Kidney Organoid Modeling of WT1 Mutations Reveals Key Regulatory Paths Underlying Podocyte Development
2024-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308556
PMID:38810140
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研究论文 | 本研究通过生成胎儿肾脏和肾脏类器官的单细胞染色质可及性与基因表达图谱,揭示了WT1突变在足细胞发育中的关键调控路径 | 首次结合单细胞染色质可及性图谱与基因表达图谱,利用患者来源的iPSCs生成肾脏类器官模型,并通过CRISPR-Cas9基因编辑验证WT1突变的功能重要性 | 研究仅针对一种WT1杂合错义突变,可能未涵盖所有WT1突变类型的影响 | 阐明WT1在足细胞发育中的表观基因组机制及其突变导致的疾病作用 | 胎儿肾脏、肾脏类器官以及携带WT1杂合错义突变患者的诱导多能干细胞(iPSCs) | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 单细胞染色质可及性数据、基因表达数据 | 胎儿肾脏和肾脏类器官样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1706 | 2026-03-13 |
Podocyte Pathogenic Bone Morphogenetic Protein-2 Pathway and Immune Cell Behaviors in Primary Membranous Nephropathy
2024-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202404151
PMID:38785168
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了原发性膜性肾病(PMN)患者和健康对照的肾脏活检样本,揭示了足细胞中补体诱导的BMP2/pSMAD1/COL4通路是PMN的关键致病途径,并描述了免疫细胞的浸润和激活情况 | 首次在PMN中通过单细胞RNA测序识别出足细胞的补体诱导BMP2/pSMAD1/COL4通路,连接了补体系统激活和肾小球基底膜增厚两个关键事件,并详细描绘了免疫细胞的精细互作 | 样本量相对较小(11例患者和7例对照),且为横断面研究,无法确定因果关系 | 探究原发性膜性肾病的潜在病理机制,特别是足细胞和免疫细胞的作用 | 原发性膜性肾病患者的肾脏活检样本和健康对照样本 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 11例PMN患者和7例健康对照,共分析44,060个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1707 | 2026-03-13 |
Modulating inflammation with interleukin 37 treatment ameliorates murine Autosomal Dominant Polycystic Kidney Disease
2024-04, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2023.12.006
PMID:38158181
|
研究论文 | 本研究探讨了抗炎细胞因子IL37b在治疗常染色体显性多囊肾病(ADPKD)中的潜力,通过基因小鼠模型证明其能减少囊肿负担并促进干扰素信号通路 | 首次揭示IL37b通过促进肾脏驻留巨噬细胞中的干扰素信号通路来抑制ADPKD囊肿形成,为其作为潜在疗法提供了新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床转化效果尚需验证,且未详细探讨IL37b在其他细胞类型中的作用 | 评估IL37b作为ADPKD治疗策略的有效性及其作用机制 | ADPKD基因小鼠模型(包括早期和成年发病型)及肾脏组织 | 数字病理学 | 常染色体显性多囊肾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 基因工程小鼠模型 | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1708 | 2026-03-13 |
Single-cell RNA sequencing reveals transdifferentiation of parathyroid chief cells into oxyphil cells in patients with uremic secondary hyperparathyroidism
2024-03, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2023.11.027
PMID:38142040
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进患者中甲状旁腺主细胞向嗜酸性细胞转分化的过程 | 首次建立了人类甲状旁腺的单细胞转录组图谱,并发现了主细胞向嗜酸性细胞的转分化过程,该过程与尿毒症环境中线粒体逐渐富集相关 | 研究样本量较小(仅3名患者),且动物模型(裸鼠移植)可能无法完全模拟人体内的复杂生理环境 | 探究尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进患者中甲状旁腺嗜酸性细胞的起源和增殖机制 | 从尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进患者切除的甲状旁腺结节(主细胞结节、嗜酸性细胞结节和混合结节) | 单细胞组学 | 继发性甲状旁腺功能亢进 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3名尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进患者的甲状旁腺混合结节 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1709 | 2026-03-13 |
Advancing parathyroid anatomy understanding through single-cell RNA sequencing in uremic secondary hyperparathyroidism
2024-03, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2023.12.005
PMID:38388141
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评论 | 本文探讨了单细胞RNA测序在尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进症研究中的最新应用,揭示了甲状旁腺内的细胞动态 | 通过单细胞RNA测序技术,对主细胞和嗜酸性细胞的分化过程提供了新见解,挑战了传统观点 | NA | 利用单细胞RNA测序技术增进对甲状旁腺解剖结构的理解 | 尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进症中的甲状旁腺细胞 | 数字病理学 | 尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1710 | 2026-03-13 |
A Cell Cycle-aware Network for Data Integration and Label Transferring of Single-cell RNA-seq and ATAC-seq
2024-Feb-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.31.578213
PMID:38352302
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研究论文 | 本文开发了一种细胞周期感知网络(CCAN),用于在整合单细胞多组学数据时去除细胞周期效应,同时保留细胞类型特异性变异 | 这是首个研究单细胞多组学数据整合中细胞周期效应的计算模型 | NA | 研究单细胞多组学数据整合中的细胞周期效应,并开发去除该效应的方法 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞ATAC测序(scATAC-seq)数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | 细胞周期感知网络(CCAN) | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1711 | 2026-03-13 |
Tracking early mammalian organogenesis - prediction and validation of differentiation trajectories at whole organism scale
2024-02-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201867
PMID:37982461
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序追踪小鼠早期器官发生过程,结合计算预测和实验验证,揭示了细胞分化轨迹 | 整合了高密度时间点单细胞数据(从E6.5到E9.5),首次在整体生物尺度上预测并验证了分化轨迹,发现了新的体节来源内皮程序 | 研究主要基于小鼠模型,可能不完全适用于其他物种;时间范围限于早期器官发生阶段 | 追踪早期哺乳动物器官发生过程,建立细胞状态与命运关系的高分辨率图谱 | 小鼠胚胎(E6.5至E9.5阶段) | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 计算谱系重建模型 | 单细胞转录组数据 | 超过400,000个细胞(包括300,000个新采样细胞) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1712 | 2026-03-13 |
Loss of p73 Expression Contributes to Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2024-01-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202303-0503OC
PMID:37931077
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研究论文 | 本研究探讨了p73表达缺失在慢性阻塞性肺疾病(COPD)中的作用,通过小鼠模型和人类样本分析揭示了p73缺失导致多纤毛细胞损失并促进COPD样病理 | 首次在小鼠模型中证明p73功能缺失导致多纤毛细胞缺失并自发发展出COPD样病理,同时发现吸烟和COPD患者中p73表达降低 | 样本量相对有限(人类样本n=82/69/11/12),机制研究仍需深入,动物模型与人类疾病的直接对应性有待验证 | 确定p73缺失是否导致小鼠出现COPD样表型,并探索吸烟或COPD是否影响p73表达 | 小鼠模型(p73缺陷小鼠)、人类气道上皮细胞、吸烟者和COPD患者的气道样本 | NA | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序、电子显微镜、流式细胞术、形态计量学、强迫振荡技术 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、形态学图像数据、生理功能数据 | 小鼠模型未指定具体数量,人类样本包括当前吸烟者82例、既往吸烟者69例、COPD患者11例、非COPD对照12例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1713 | 2026-03-13 |
scFED: Clustering Identifying Cell Types of scRNA-Seq Data Based on Feature Engineering Denoising
2023-Dec, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-023-00574-y
PMID:37402002
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研究论文 | 本研究提出了一种基于特征工程去噪的单细胞RNA测序数据聚类方法scFED,用于识别细胞类型 | 提出了一种结合特征工程去噪和组织特异性细胞分类参考数据库(CellMatch)的基因选择框架,通过重建方法减少噪声并放大关键信息 | 仅在四个真实单细胞数据集上进行了验证,未提及方法在更大规模或更复杂数据集上的适用性 | 提高单细胞RNA测序数据的聚类效果和细胞类型识别准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 特征工程框架 | 基因表达数据 | 四个真实单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1714 | 2026-03-13 |
Understanding cervical cancer at single-cell resolution
2023-Nov-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2023.216408
PMID:37769795
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综述 | 本文综述了利用单细胞测序技术解析宫颈癌生态系统异质性的最新进展 | 通过单细胞测序技术高分辨率地解析宫颈癌生态系统的演变,为靶向治疗和个性化医疗提供新视角 | NA | 深入理解宫颈癌生态系统以改善患者预后 | 宫颈癌 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1715 | 2026-03-13 |
Multi-omics analysis defines a cuproptosis-related prognostic model for ovarian cancer: Implication of WASF2 in cuproptosis resistance
2023-Nov-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2023.122081
PMID:37717621
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研究论文 | 本研究通过多组学分析构建了一个与铜死亡相关的卵巢癌预后模型,并验证了WASF2基因在铜死亡抵抗中的作用 | 首次将单细胞测序与批量转录组数据结合,构建了基于铜死亡相关基因的卵巢癌预后模型,并实验验证了WASF2在铜死亡抵抗和铂类耐药中的功能 | 研究主要基于公共数据库数据,实验验证部分可能样本量有限,需要进一步扩大临床样本验证 | 探索铜死亡相关特征在卵巢癌中的作用,构建预后预测模型 | 卵巢癌患者样本(包括单细胞和批量转录组数据) | 生物信息学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,基因集富集分析,随机森林建模 | 随机森林 | 单细胞测序数据,批量转录组数据,临床数据 | 单细胞数据来自GSE154600,批量数据包括TCGA的378例,GSE140082的379例和GSE53963的173例卵巢癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 1716 | 2026-03-13 |
Single-cell profiling reveals the heterogeneity of NK cells during anti-PD-1 therapy in non-small-cell lung cancer
2023-Nov, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.110743
PMID:37657247
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,揭示了非小细胞肺癌抗PD-1治疗期间NK细胞的异质性及其与治疗反应的关联 | 首次在NSCLC抗PD-1治疗背景下,通过单细胞测序识别出6个不同的NK细胞亚群,并发现未成熟NK细胞在应答组中的富集及其与免疫调节过程的关联 | 研究基于患者活检样本的单细胞数据,样本量可能有限,且机制验证主要在转录组层面进行 | 探索NK细胞在非小细胞肺癌抗PD-1治疗疗效中的作用及机制 | 接受抗PD-1治疗的非小细胞肺癌患者的肿瘤浸润免疫细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1717 | 2026-03-13 |
Two distinct molecular faces of preeclampsia revealed by single-cell transcriptomics
2023-Oct-13, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2023.07.005
PMID:37572658
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了子痫前期的两种不同分子亚型,重点关注胎盘细胞类型中的基因表达失调 | 首次使用单细胞和单核转录组学系统比较早发和晚发子痫前期的胎盘分子变化,揭示了早发子痫前期中广泛的细胞自主性基因失调,而晚发子痫前期影响较小 | 研究样本可能有限,未详细说明样本数量或人口统计学特征,且主要关注转录组层面,可能未涵盖蛋白质或表观遗传变化 | 解析子痫前期两种形式中胎盘功能的影响,通过分子变化区分疾病亚型 | 早发和晚发子痫前期患者的胎盘细胞,包括合胞体、基质细胞、血管系统和免疫细胞 | 数字病理学 | 子痫前期 | 单细胞转录组学,单核转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1718 | 2026-03-13 |
Determination of key events in mouse hepatocyte maturation at the single-cell level
2023-10-09, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.07.006
PMID:37557173
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和单核RNA测序,探索了小鼠肝细胞成熟过程中的关键事件和调控因子 | 定义了肝细胞成熟的三个阶段,揭示了多倍体肝细胞在分区分布和成熟异步性中的偏好,并结合基因调控网络分析与体内遗传操作鉴定了关键转录因子 | 研究主要基于小鼠模型,结果在人类肝细胞中的适用性需进一步验证 | 深入探究肝细胞成熟过程中的关键事件和调控机制 | 小鼠肝细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 1719 | 2026-03-13 |
DNA damage repair profiling of esophageal squamous cell carcinoma uncovers clinically relevant molecular subtypes with distinct prognoses and therapeutic vulnerabilities
2023-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2023.104801
PMID:37725855
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研究论文 | 本研究通过分析食管鳞状细胞癌的DNA损伤修复特征,识别出两种具有不同预后和治疗脆弱性的分子亚型 | 首次在食管鳞状细胞癌中基于DNA损伤修复特征定义分子亚型,并验证了其预后价值和指导联合免疫治疗策略的潜力 | 研究主要基于转录组学数据,缺乏蛋白质水平验证;且结果在转移性食管鳞状细胞癌中未显示预后价值 | 表征食管鳞状细胞癌的DNA损伤修复特征,评估其预后价值,并探索个性化治疗策略 | 食管鳞状细胞癌患者样本和同基因小鼠模型 | 数字病理学 | 食管癌 | bulk转录组学, single-cell转录组学 | NA | 转录组数据 | 377例食管鳞状细胞癌病例 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1720 | 2026-03-13 |
Single-Cell Sequencing Reveals the Optimal Time Window for Anti-Inflammatory Treatment in Spinal Cord Injury
2023-Oct, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202300098
PMID:37085744
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析脊髓损伤后不同时间点的组织,揭示了抗炎治疗的最佳时间窗口为损伤后1-3天,并验证了甲基强的松龙琥珀酸钠的机制 | 首次利用单细胞测序技术结合组织化学观察,提出针对脊髓损伤的抗炎治疗精确时间窗口,并阐明典型抗炎药物的作用机制 | 未明确说明样本来源(如动物模型或人类组织),且可能未涵盖所有炎症相关细胞类型或长期效应 | 确定脊髓损伤后抗炎治疗的最佳时间窗口,并探索抗炎药物的作用机制 | 脊髓损伤部位附近组织中的细胞 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |