单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27648 篇文献，本页显示第 17141 - 17160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 17141 | 2024-08-07 |
Biwhitening Reveals the Rank of a Count Matrix
2022, SIAM journal on mathematics of data science
IF:1.9Q1
DOI:10.1137/21m1456807
PMID:37576699
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研究论文 | 本文提出了一种名为Biwhitening的简单方法，用于估计包含计数随机变量的数据矩阵的秩，特别是在泊松随机矩阵的情况下 | 该方法通过同时缩放数据矩阵的行和列，使得相应的噪声谱与标准的Marchenko-Pastur定律一致，从而无需任何先验知识即可估计信号矩阵的秩 | NA | 研究如何在没有先验知识的情况下估计受污染数据矩阵的秩 | 泊松随机矩阵及其扩展到满足均值和方差之间二次关系的分布族 | 机器学习 | NA | Sinkhorn-Knopp算法 | NA | 计数矩阵 | 涉及单细胞RNA测序(scRNA-seq)、高通量染色体构象捕获(Hi-C)和文档主题建模等多个实际数据集 |
| 17142 | 2024-08-05 |
Analysis of single-cell sequencing results of an elderly patient with myeloid leukemia reveals high expression of multiple oncogenes in monocytes and hematopoietic stem cells
2023-Dec, Hematology (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1080/16078454.2023.2240129
PMID:37535066
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研究论文 | 本研究分析了一名老年急性髓性白血病患者的单细胞基因组测序结果 | 该研究发现单核细胞和造血干细胞中多种癌基因的高表达，对急性髓性白血病的进展和治疗提供新见解 | 研究只针对一例老年急性髓性白血病患者，样本量较小，结果可能不具普遍性 | 分析老年急性髓性白血病患者的基因序列以提供新的治疗思路 | 一名64岁的急性髓性白血病患者的外周血和骨髓细胞 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 1名患者的外周血和骨髓细胞 |
| 17143 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals prominent expression of IL-14, IL-18, and IL-32 in psoriasis
2023-11, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202250354
PMID:37540729
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组分析揭示了牛皮癣中IL-14、IL-18和IL-32的重要表达。 | 首次在牛皮癣的不同细胞类型中部分确定IL-14、IL-18和IL-32的突出表达。 | 样本量仅限于八名患者，可能影响结果的普遍性。 | 深入描述牛皮癣中免疫细胞及其炎症介质的类型。 | 本研究的对象为牛皮癣患者的皮肤损伤及其相关免疫细胞。 | 数字病理学 | 牛皮癣 | 单细胞技术 | NA | 人类和小鼠的组织样本 | 8名牛皮癣患者的皮肤损伤样本 |
| 17144 | 2024-08-05 |
Transcriptome-wide association study-derived genes as potential visceral adipose tissue-specific targets for type 2 diabetes
2023-11, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-023-05978-5
PMID:37540242
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研究论文 | 本研究评估了内脏肥胖与2型糖尿病之间的因果关系，并筛选了针对2型糖尿病的内脏脂肪组织特异性靶点 | 本研究通过转录组广泛关联研究筛选了10个与2型糖尿病相关的内脏脂肪特异性候选基因 | 本研究的限制在于尚需通过进一步的功能研究验证这些候选基因 | 研究内脏脂肪组织与2型糖尿病之间的因果关系 | 分析2型糖尿病患者及其对照组的数据 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | Mendelian随机化，转录组广泛关联研究（TWAS） | 无 | 基因组数据 | 74,124例病例和824,006例对照 |
| 17145 | 2024-08-05 |
Exploring the human microbiome - A step forward for precision medicine in breast cancer
2023-11, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/cnr2.1877
PMID:37539732
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综述 | 这篇综述文章探讨了微生物失调对乳腺癌发生的影响及其与乳腺癌特定分子亚型的相互作用 | 文章创新地讨论了微生物组作为癌症生物标志物的潜力，并整合了最新的微生物组研究技术和人工智能的进展 | 文章可能没有提供具体的实验数据和临床案例来支持其假设 | 旨在描述微生物失调如何影响乳腺癌的发生以及其与肿瘤微生物群的关系 | 主要研究肠道微生物群与乳腺癌发生之间的关系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 下一代测序(NGS)、基因组测序、单细胞测序、微生物代谢组学 | NA | NA | NA |
| 17146 | 2024-08-05 |
A novel coiled-coil domain containing-related gene signature for predicting prognosis and treatment effect of breast cancer
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05222-y
PMID:37558766
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研究论文 | 本研究开发了一种基因特征用于预测乳腺癌的预后和治疗效果。 | 本研究首次利用旋 coils 结构域相关基因建立乳腺癌预后风险模型，并与免疫通路相关性进行了分析。 | 该研究可能受限于使用的数据来源，且未讨论模型在不同种族或人群中的适用性。 | 研究旨在通过构建基因特征模型来预测乳腺癌患者的预后和治疗反应。 | 研究对象为乳腺癌患者的基因表达和临床数据。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 基因表达分析、单细胞测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据、临床数据 | 样本量未提供，包含来自TCGA、METABRIC和GEO数据库的数据 |
| 17147 | 2024-08-07 |
Integration of scRNA-seq and bulk RNA-seq constructs a stemness-related signature for predicting prognosis and immunotherapy responses in hepatocellular carcinoma
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05202-2
PMID:37535162
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq）数据，构建了一个与干细胞特性相关的标志物，用于预测肝细胞癌（HCC）的预后和免疫治疗反应 | 本研究创新性地构建了一个新的干细胞特性相关预后模型，该模型包含十个基因，能够独立预测肝细胞癌的总体生存率，并有助于预测化疗药物敏感性和免疫治疗反应 | NA | 研究目的是开发一个新的干细胞特性相关标志物，用于改善肝细胞癌的预后预测和免疫治疗反应评估 | 研究对象是肝细胞癌患者及其干细胞特性相关基因标志物 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | LASSO, Cox回归 | 基因表达数据 | NA |
| 17148 | 2024-08-07 |
A comprehensive analysis of the potential role of necroptosis in hepatocellular carcinoma using single-cell RNA Seq and bulk RNA Seq
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05208-w
PMID:37535163
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序分析了坏死在肝细胞癌中的潜在作用，并构建了一个基于坏死相关基因的预后预测模型 | 本研究首次揭示了肝细胞癌中两种不同的坏死亚型，并开发了一个具有出色预测准确性的预后模型 | NA | 研究坏死在肝细胞癌发展和进展中的作用 | 肝细胞癌患者及坏死相关基因 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序 | CIBERSORT算法 | 基因表达数据 | 使用来自TCGA数据库的数据 |
| 17149 | 2024-08-07 |
Myofibroblasts: A New Factor Affecting the Hyperlipidemia-Induced Elastic Abnormality of Corpus Cavernosum in Rabbits Detected by 2-D Shear Wave Elastography
2023-11, Ultrasound in medicine & biology
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研究论文 | 本研究使用二维剪切波弹性成像（2-D SWE）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）探讨了高脂血症诱导的兔阴茎海绵体弹性异常及其细胞学因素。 | 发现了高脂血症组中一种新的成纤维细胞亚型——肌成纤维细胞，并通过免疫荧光染色和基因本体分析验证了其存在。 | NA | 研究高脂血症对兔阴茎海绵体弹性的影响及其细胞学机制。 | 兔阴茎海绵体的弹性异常及其细胞学因素。 | 数字病理学 | 高脂血症 | 二维剪切波弹性成像（2-D SWE），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 图像 | 新西兰白兔被随机分为高脂血症组和对照组 |
| 17150 | 2024-08-07 |
Single cell RNA-seq in phytohormone signaling: a promising future
2023-Nov, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2023.07.010
PMID:37550122
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在植物激素信号传导中的应用 | 利用scRNA-seq技术揭示了激素介导的时空基因调控网络 | NA | 研究植物激素信号传导机制 | 植物细胞中的激素信号网络 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 时间序列的单细胞样本 |
| 17151 | 2024-08-07 |
Uncovering the prominent role of satellite cells in paravertebral muscle development and aging by single-nucleus RNA sequencing
2023-Nov, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2023.01.005
PMID:37554180
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序构建了小鼠棘旁肌在胚胎至老年阶段的单核转录组图谱，揭示了卫星细胞在肌肉发育和衰老中的作用 | 首次构建了涵盖胚胎至老年阶段的小鼠棘旁肌单核转录组图谱，并发现了与肌肉能量代谢相关的基因集在卫星细胞中的富集 | NA | 揭示卫星细胞在棘旁肌发育和衰老中的作用 | 小鼠棘旁肌的卫星细胞、快肌细胞和慢肌细胞 | 数字病理学 | 骨骼肌疾病 | 单核RNA测序 | NA | 转录组 | 630,040个骨骼肌细胞 |
| 17152 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Analysis Reveals Cell-Intrinsic Functions of CAR T Cells Correlating with Response in a Phase II Study of Lymphoma Patients
2023-Oct-13, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-23-0178
PMID:37540566
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了CAR-T细胞的细胞内在功能与淋巴瘤患者临床反应之间的关系 | 首次通过单细胞RNA测序技术，分析了CAR-T细胞的细胞内在功能与临床反应之间的关联 | 研究样本量较小，仅包括23名B细胞淋巴瘤患者和1名白血病患者 | 探讨CAR-T细胞的细胞内在功能与淋巴瘤患者临床反应之间的关系 | B细胞淋巴瘤和白血病患者 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 23名B细胞淋巴瘤患者和1名白血病患者 |
| 17153 | 2024-08-07 |
Determination of key events in mouse hepatocyte maturation at the single-cell level
2023-Oct-09, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.07.006
PMID:37557173
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research paper | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核RNA测序（snRNA-seq）探索了小鼠肝细胞发育过程，定义了三个成熟阶段，并揭示了肝细胞成熟过程中的基因调控网络和转录因子。 | 本研究首次详细描述了小鼠肝细胞成熟过程中的转录组特征，并结合基因调控网络分析和体内遗传操作，识别了关键的成熟和区域化相关转录因子。 | NA | 深入研究肝细胞成熟过程中的关键事件和调控因子。 | 小鼠肝细胞的成熟过程。 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 17154 | 2024-08-05 |
Fate Specification of GFAP-Negative Primitive Neural Stem Cells and Their Progeny at Clonal Resolution
2023-10, Stem cells and development
IF:2.5Q2
DOI:10.1089/scd.2023.0038
PMID:37551982
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研究论文 | 本研究探讨了GFAP阴性原始神经干细胞及其后代的命运特性 | 通过克隆谱系追踪机制，提供了单细胞层面上对神经前体细胞谱系的解析 | 研究集中于小鼠大脑，可能不适用于其他物种或人类 | 深入理解神经干细胞的胚胎功能与谱系关系 | GFAP阴性原始神经干细胞及其后代的神经前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 细胞谱系数据 | 从原始神经干细胞和成熟神经干细胞中获得的多克隆神经前体细胞 |
| 17155 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA-Sequencing in Astrocyte Development, Heterogeneity, and Disease
2023-Oct, Cellular and molecular neurobiology
IF:3.6Q2
DOI:10.1007/s10571-023-01397-7
PMID:37552355
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综述 | 本文综述了星形胶质细胞的发育、异质性及其在中枢神经系统疾病中的角色 | 文章强调了单细胞RNA测序在揭示星形胶质细胞发育和异质性方面的关键作用 | NA | 探讨星形胶质细胞在健康和疾病中的复杂功能与角色 | 星形胶质细胞及其亚群体和活化状态 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 17156 | 2024-08-05 |
Phase II trial of hypomethylating agent combined with nivolumab for acute myeloid leukaemia relapse after allogeneic haematopoietic cell transplantation-Immune signature correlates with response
2023-Oct, British journal of haematology
IF:5.1Q1
DOI:10.1111/bjh.19007
PMID:37539479
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研究论文 | 本研究探讨了在异基因造血干细胞移植后，使用低甲基化剂和nivolumab治疗急性髓性白血病复发的效果 | 结合低甲基化剂和免疫检查点抑制剂的治疗方案在异基因造血干细胞移植后的应用及其免疫特征的关联分析 | 关于该组合方案在异基因造血干细胞移植后的使用数据有限，样本量较小 | 评估低甲基化剂和nivolumab结合治疗急性髓性白血病复发的有效性 | 急性髓性白血病患者在接受异基因造血干细胞移植后复发 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞技术评估 | NA | DNA、RNA和蛋白数据 | 16名患者接受了nivolumab治疗 |
| 17157 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA-seq Analysis of a Human Embryonic Stem Cell to Endothelial Cell System Based on Transcription Factor Overexpression
2023-Oct, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-023-10598-y
PMID:37537495
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研究论文 | 本研究对一种高效的人类胚胎干细胞-内皮细胞诱导系统进行单细胞RNA测序分析 | 提出了一种新的FLI1-PKC诱导系统，具有不同于其他诱导方法的诱导路径 | 该研究主要集中在FLI1-PKC系统，未涵盖其他诱导系统的比较分析 | 研究人类胚胎干细胞向内皮细胞转化的转录谱和细胞动态 | 使用FLI1-PKC系统的分化细胞进行单细胞RNA测序分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达谱 | 在不同时间点进行的多次分化细胞样本分析 |
| 17158 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of a poorly metastatic melanoma cell line and its subclones with high lung and brain metastasis potential reveals gene expression signature of metastasis with prognostic implication
2023-Oct, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.14900
PMID:37534569
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了一个低转移性黑色素瘤细胞系及其具有高肺和脑转移潜能的亚克隆，揭示了与转移相关的基因表达特征及其预后意义 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术，揭示了黑色素瘤细胞系中与转移潜能相关的基因表达特征，并发现这些特征与患者的预后相关 | 研究仅限于特定的黑色素瘤细胞系及其亚克隆，可能需要进一步的研究来验证这些发现是否适用于其他黑色素瘤细胞系或临床样本 | 阐明黑色素瘤转移过程中基因表达变化的机制，并鉴定出具有转移潜能的亚克隆 | 一个低转移性黑色素瘤细胞系WM239A及其具有高肺和脑转移潜能的亚克隆 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 8173个黑色素瘤细胞 |
| 17159 | 2024-08-07 |
Enolase represents a metabolic checkpoint controlling the differential exhaustion programmes of hepatitis virus-specific CD8+ T cells
2023-10, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2022-328734
PMID:37541771
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研究论文 | 本文研究了肝炎病毒特异性CD8+ T细胞的代谢检查点，特别是酶醇，如何控制不同疲劳程序的差异，并探讨了抗病毒治疗对这些细胞代谢状态的影响。 | 首次识别酶醇作为疲劳T细胞的代谢检查点，并展示了代谢旁路如何改善糖酵解和T细胞效应功能。 | 研究主要集中在体外和动物模型中，需要进一步的人体临床试验来验证这些发现。 | 探讨代谢调控如何影响慢性肝炎B和C病毒感染中的T细胞疲劳状态，并评估抗病毒治疗对此的影响。 | 慢性HBV和HCV感染患者的病毒特异性CD8+ T细胞的代谢状态、疲劳程度和转录组。 | 免疫学 | 肝炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | 慢性HBV感染患者31例，HCV感染患者52例 |
| 17160 | 2024-08-07 |
Function and therapeutic value of astrocytes in diabetic cognitive impairment
2023-10, Neurochemistry international
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.neuint.2023.105591
PMID:37543309
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综述 | 本文综述了星形胶质细胞在糖尿病认知障碍中的作用及其治疗价值 | 首次系统总结了糖尿病环境对脑星形胶质细胞的影响及其机制，并强调了反应性星形胶质增生对糖尿病认知障碍的贡献和潜在治疗靶点 | NA | 探讨星形胶质细胞在糖尿病认知障碍中的病理机制和潜在治疗价值 | 星形胶质细胞在糖尿病认知障碍中的作用 | NA | 糖尿病认知障碍 | 单细胞转录组、原位测序 | NA | NA | NA |