单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 17121 - 17140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 17121 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA-Seq Identifies Pathways and Genes Contributing to the Hyperandrogenemia Associated with Polycystic Ovary Syndrome
2023-Jun-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241310611
PMID:37445796
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析多囊卵巢综合症（PCOS）中与高雄激素血症相关的通路和基因 | 揭示了在PCOS中卵巢黄体细胞与正常排卵女性中的基因表达差异，并识别了潜在的分子诊断和治疗靶点 | 仅基于细胞培养数据，可能缺乏对体内真实情况的全面反映 | 探讨PCOS高雄激素血症的分子机制 | 从正常排卵女性和PCOS女性中分离并传代的卵巢黄体细胞 | 数字病理学 | 多囊卵巢综合症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 17122 | 2024-08-05 |
Immune Cell-Related Genes in Juvenile Idiopathic Arthritis Identified Using Transcriptomic and Single-Cell Sequencing Data
2023-Jun-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241310619
PMID:37445800
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研究论文 | 本研究利用转录组和单细胞测序数据识别了与青少年特发性关节炎相关的免疫细胞基因 | 首次使用单细胞RNA测序揭示青少年特发性关节炎中免疫细胞的异质性以及相关基因 | 研究样本量及数据来源的单一性可能限制结果的普遍适用性 | 探讨青少年特发性关节炎中的免疫细胞基因及其表达差异 | 青少年特发性关节炎患者的免疫细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 青少年特发性关节炎 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | JIA样本与正常对照样本的对比分析，具体样本数量未提供 |
| 17123 | 2024-08-05 |
Improved single-cell genome amplification by a high-efficiency phi29 DNA polymerase
2023, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2023.1233856
PMID:37456715
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研究论文 | 本文介绍了一种改进的单细胞基因组扩增方法，称为iSGA。 | 通过phi29 DNA聚合酶工程和过程工程，开发出了一种效率更高的酶HotJa Phi29 DNA聚合酶，改善了扩增覆盖率。 | NA | 提高单细胞基因组扩增的效率和覆盖率。 | 单细胞样本及商业益生菌样本。 | 数字病理学 | NA | DNA聚合酶工程 | NA | 基因组数据 | 包括单细胞样本和商业益生菌样本 |
| 17124 | 2024-08-05 |
Scdrake: a reproducible and scalable pipeline for scRNA-seq data analysis
2023, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbad089
PMID:37465398
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研究论文 | 本文开发了一个完全自动化的工作流程scdrake，用于scRNA-seq数据的二次分析 | 该工作流程以内置于drake框架的R语言中实现，遵循最佳编程实践，支持完全自动化 | 未提及具体的局限性 | 研究的目的是提供一个可重复性和可扩展性的scRNA-seq数据分析管道 | 研究对象为scRNA-seq数据的特征条形码矩阵 | 数字病理学 | NA | NA | NA | RNA-seq数据 | NA |
| 17125 | 2024-08-05 |
Lineage Tracing and Single-Cell RNA-seq in C. elegans to Analyze Transgenerational Epigenetic Phenotypes Inherited from Germ Cells
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3259-8_3
PMID:37464235
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研究论文 | 本文探讨了C. elegans中的跨代表观遗传继承及其对胚胎发育的影响 | 提供了自动谱系追踪与单细胞RNA-seq结合的实用指南，以促进其在研究C. elegans胚胎中的跨代表观遗传继承方面的应用 | 这些技术的普及受到困难的限制 | 研究跨代表观遗传继承对胚胎发育的影响 | C. elegans胚胎 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | NA |
| 17126 | 2024-08-05 |
Exploring PANoptosis in breast cancer based on scRNA-seq and bulk-seq
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1164930
PMID:37455906
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研究论文 | 这篇文章探讨了PANoptosis在乳腺癌中的作用和预后特征 | 首次全面分析了PANoptosis在乳腺癌中的分子聚类和预后预测潜力 | 研究可能受限于单一的数据集，未能整合更多相关研究 | 研究PANoptosis与乳腺癌肿瘤细胞之间的相互作用 | 重点研究乳腺癌的PANoptosis相关基因及其在预后中的应用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | scRNA-seq和bulk-seq | COX和LASSO回归 | 基因表达数据 | 使用了GSE176078单细胞测序数据集及其他乳腺癌数据 |
| 17127 | 2024-08-07 |
Single-cell chromatin accessibility profiling of cell-state-specific gene regulatory programs during mouse organogenesis
2023, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2023.1170355
PMID:37440917
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研究论文 | 本研究通过单细胞ATAC-seq技术分析了小鼠胚胎E8.5-E10.5阶段的染色质可及性，揭示了早期器官发生过程中的细胞状态特异性基因调控程序 | 首次通过单细胞ATAC-seq技术揭示了小鼠早期器官发生过程中的细胞状态特异性基因调控程序，并发现了与人类疾病相关的潜在单核苷酸变异 | NA | 揭示小鼠早期器官发生过程中细胞状态特异性基因调控程序的分子机制 | 小鼠胚胎E8.5-E10.5阶段的细胞 | 数字病理学 | 发育畸形 | 单细胞ATAC-seq | NA | 基因组数据 | 101,599个单细胞 |
| 17128 | 2024-08-07 |
Variability of the innate immune response is globally constrained by transcriptional bursting
2023, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2023.1176107
PMID:37441161
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研究论文 | 本文利用单细胞基因组学数据和转录的随机模型，对 toll 样受体（TLR）诱导的基因表达变异性进行了全局分析 | 本文展示了单细胞基因表达变异性可以通过群体均值的线性函数进行经验描述，并揭示了转录爆发动力学的线性关系 | NA | 探讨哺乳动物基因转录的基本控制机制及其对单细胞响应的影响 | TLR 诱导的基因表达变异性 | 基因组学 | NA | 单细胞基因组学 | 随机模型 | 基因表达数据 | 超过 2000 个 TLR 响应基因 |
| 17129 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-sequencing identifies various proportions of excitatory and inhibitory neurons in cultured human fetal brain cortical tissues
2023, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2023.1177747
PMID:37449269
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了不同胎龄的人类胎儿前额叶皮质组织中兴奋性和抑制性神经元的比例 | 首次展示了从胎儿皮质组织培养中获取兴奋性和抑制性神经细胞的新策略 | NA | 探究皮质神经前体细胞分化为兴奋性和抑制性神经元的精确比例 | 人类胎儿前额叶皮质组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 收集了不同胎龄的人类胎儿前额叶皮质组织 |
| 17130 | 2024-08-07 |
Exploration of the shared gene signatures and molecular mechanisms between periodontitis and inflammatory bowel disease: evidence from transcriptome data
2023, Gastroenterology report
IF:3.8Q2
DOI:10.1093/gastro/goad041
PMID:37456714
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研究论文 | 本研究通过转录组数据分析，探索了牙周炎与炎症性肠病之间的共享基因特征和分子机制 | 揭示了牙周炎与炎症性肠病之间通过交叉基因和嗜中性粒细胞的先前未被认识的机制 | NA | 探索牙周炎与炎症性肠病之间的共享基因特征和分子机制 | 牙周炎和炎症性肠病 | NA | 牙周炎, 炎症性肠病 | 差异表达基因分析, 加权基因共表达网络分析 (WGCNA), 单样本基因集富集分析 | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 17131 | 2024-08-07 |
HDAC inhibition delays photoreceptor loss in Pde6b mutant mice of retinitis pigmentosa: insights from scRNA-seq and CUT&Tag
2023, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.15659
PMID:37456870
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研究论文 | 研究旨在确定组蛋白去乙酰化酶（HDAC）抑制对视网膜光感受器细胞的保护作用，使用单细胞RNA测序和CUT&Tag方法在Pde6brd1小鼠模型中进行研究。 | 本研究揭示了HDAC和PARP异构体在光感受器细胞死亡中的不同作用，并发现HDAC抑制剂SAHA能显著延缓光感受器细胞的损失，减少HDAC和PARP活性。 | NA | 研究HDAC抑制对视网膜光感受器细胞的保护作用 | Pde6brd1小鼠模型中的视网膜光感受器细胞 | 数字病理学 | 视网膜色素变性 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），CUT&Tag | NA | 基因表达数据 | 野生型（WT）和Pde6b突变rd1小鼠的视网膜组织样本 |
| 17132 | 2024-08-07 |
Mitochondrial DNA methylation is a predictor of immunotherapy response and prognosis in breast cancer: scRNA-seq and bulk-seq data insights
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1219652
PMID:37457713
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序和批量测序数据，分析了线粒体DNA甲基化（MTDM）在乳腺癌中的作用及其对免疫治疗反应和预后的预测价值。 | 首次全面评估了MTDM在乳腺癌中的多方面作用，并发现MTDM水平不仅能够预测免疫治疗反应，还可作为乳腺癌患者的准确预后指标。 | NA | 探讨线粒体DNA甲基化在乳腺癌发展中的作用及其对免疫治疗反应和预后的影响。 | 乳腺癌患者及其线粒体DNA甲基化水平。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量测序 | 加权共表达网络分析（WGCNA）、COX回归和LASSO回归 | 基因表达数据 | TCGA/GEO数据集中的乳腺癌患者 |
| 17133 | 2024-08-07 |
Inhibitory Neurons in Nucleus Tractus Solitarius Are Involved in Decrease of Heart Rate Variability and Development of Depression-Like Behaviors in Temporal Lobe Epilepsy
2023-10-19, The international journal of neuropsychopharmacology
DOI:10.1093/ijnp/pyad033
PMID:37417335
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研究论文 | 研究抑制性神经元在延髓孤束核中对颞叶癫痫患者心率变异性下降和抑郁样行为发展的作用 | 首次报道了心率变异性与颞叶癫痫合并抑郁症在不同阶段的相关性，并发现心率变异性中枢控制相关的抑制性神经元在颞叶癫痫中抑郁的发展中起作用 | NA | 探讨心率变异性在颞叶癫痫尤其是伴有抑郁障碍的癫痫中的机制 | 心率变异性、自发反复发作和抑郁样行为在匹鲁卡平诱导的颞叶癫痫小鼠不同阶段的表现 | 神经科学 | 癫痫 | 单细胞RNA测序分析 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 17134 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing and bulk RNA data reveal the tumor microenvironment infiltration characteristics of disulfidptosis related genes in breast cancer
2023-Oct, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05109-y
PMID:37428249
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研究论文 | 本研究揭示了与二硫化物凋亡相关基因在乳腺癌肿瘤微环境中的浸润特征 | 本研究首次探讨了二硫化物凋亡在乳腺癌中的预后价值及其在免疫微环境中的作用 | 未对二硫化物凋亡在其他癌症类型中的影响进行评估 | 研究二硫化物凋亡相关基因在乳腺癌中的作用及其对免疫治疗的影响 | 乳腺癌患者的单细胞测序数据和散装RNA数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序，bulk RNA测序 | 风险评估模型 | 基因表达数据 | NA |
| 17135 | 2024-08-05 |
A multi-omics integrative approach unravels novel genes and pathways associated with senescence escape after targeted therapy in NRAS mutant melanoma
2023-10, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-023-00640-z
PMID:37420093
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研究论文 | 本研究揭示了NRAS突变黑色素瘤在靶向治疗后与衰老逃逸相关的新基因和通路 | 首次将胰岛素信号传导与持续衰老表型的维持相关联，并提出干扰素γ在衰老逃逸中的新角色 | 尚未明确实验的临床适用性和结果的真实世界验证 | 研究癌细胞如何逃逸衰老，以优化靶向疗法的临床效果 | 三种不同的NRAS突变黑色素瘤细胞系的反应特征 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | RNA-seq | NA | 转录组数据、miRNA相互作用组数据 | 三种不同类型的NRAS突变黑色素瘤细胞系 |
| 17136 | 2024-08-07 |
Lsd1 safeguards T-cell development via suppressing endogenous retroelements and interferon responses
2023-10, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202302042
PMID:37429639
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研究论文 | 本研究探讨了组蛋白去甲基化酶Lsd1在胸腺细胞发育中的生理功能 | 首次揭示了Lsd1通过抑制内源性逆转录元件和干扰素反应来维持早期T细胞发育中的内源性逆转录元件稳态 | NA | 探究Lsd1在胸腺细胞发育中的作用 | 胸腺细胞中的Lsd1功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序、链特异性总RNA-seq和ChIP-seq分析 | NA | RNA | 小鼠胸腺细胞 |
| 17137 | 2024-08-05 |
Identifying mitophagy-related genes as prognostic biomarkers and therapeutic targets of gastric carcinoma by integrated analysis of single-cell and bulk-RNA sequencing data
2023-09, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107227
PMID:37413850
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研究论文 | 本研究结合单细胞测序数据和转录组学筛选与胃癌进展相关的线粒体自噬基因并分析其临床价值 | 提出了GABARAPL2和CDC37作为胃癌的预后生物标志物和候选治疗靶标的创新观点 | 没有明确提到研究的局限性 | 寻找与胃癌预后相关的新型预测生物标志物 | 与胃癌进展相关的线粒体自噬基因 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序和转录组学 | NA | 基因表达数据 | 确定了18个差异表达的线粒体自噬基因 |
| 17138 | 2024-08-05 |
Molecular phylogenetics of sessile Dolium sedentarium, a petalomonad euglenid
2023 Sep-Oct, The Journal of eukaryotic microbiology
IF:2.1Q3
DOI:10.1111/jeu.12991
PMID:37424051
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研究论文 | 本文报告了Dolium sedentarium的分子测序数据，为euglenid的进化提供了新的见解 | 首次使用单细胞转录组学对Dolium进行分子序列分析 | 关于Dolium sedentarium的分子数据仍然稀少 | 探讨euglenid的进化及分子和形态数据的关系 | 研究对象为Dolium sedentarium，一种稀有的摄食性euglenid | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 分子序列数据 | NA |
| 17139 | 2024-08-05 |
State of CD8+ T cells in progression from nonalcoholic steatohepatitis to hepatocellular carcinoma: From pathogenesis to immunotherapy
2023-Sep, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2023.115131
PMID:37429231
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研究论文 | 探讨了CD8+ T细胞在从非酒精性脂肪性肝炎（NASH）进展到肝细胞癌（HCC）过程中的状态 | 该研究揭示了NASH驱动的HCC中CD8 T细胞状态的特征和机制 | 对CD8 T细胞状态的具体机制理解仍不够全面 | 研究NASH对CD8 T细胞状态的影响及其在HCC中的作用 | 重点关注NASH驱动的纤维化和HCC中的CD8 T细胞状态表型 | 免疫疗法 | 肝细胞癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 17140 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptomics of Bone Marrow Stromal Cells in Diversity Outbred Mice: A Model for Population-Level scRNA-Seq Studies
2023-09, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1002/jbmr.4882
PMID:37436066
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析了多样性散系小鼠的骨髓基质细胞的转录组 | 提出了一种新的模型，使用骨髓来源的基质细胞生成特定细胞类型的转录组特征，适用于群体水平的基因研究 | 主要聚焦于小鼠模型，可能未能完全代表人类骨骼生物学 | 确定BMSCs是否可以作为生成大规模小鼠群体中特定细胞类型转录组特征的模型 | 使用来自五只多样性散系小鼠的骨髓来源的基质细胞 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 五只多样性散系小鼠的样本 |