单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 17061 - 17080 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 17061 | 2024-08-07 |
Development of Spondyloarthritis After COVID-19 in HLA-B27-Positive Monozygotic Twins: Case Reports With Single Cell Transcriptome Profiling
2023-Jan-01, Journal of rheumatic diseases
IF:2.2Q3
DOI:10.4078/jrd.22.0027
PMID:37476527
|
病例报告 | 本文描述了两名23岁同卵双胞胎在COVID-19后被诊断为脊柱关节病的病例，并通过单细胞转录组分析探讨了其与典型放射性轴性脊柱关节病的差异。 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了COVID-19后脊柱关节病患者外周血单个核细胞的转录组特征与典型放射性轴性脊柱关节病的差异。 | 病例数量有限，需要更多研究来验证这些发现。 | 探讨COVID-19与脊柱关节病之间的可能联系，并通过单细胞转录组分析揭示其分子机制。 | 两名23岁同卵双胞胎在COVID-19后被诊断为脊柱关节病的病例。 | NA | 脊柱关节病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 两名患者 |
| 17062 | 2024-08-07 |
Insight of a lipid metabolism prognostic model to identify immune landscape and potential target for retroperitoneal liposarcoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1209396
PMID:37483592
|
研究论文 | 本研究通过基于脂质代谢相关基因（LMAGs）的预测模型，探索了腹膜后脂肪肉瘤（RPLS）的潜在靶点和免疫景观 | 本研究首次基于脂质代谢相关基因构建了预测模型，并识别了与抗原呈递细胞负相关的潜在靶点ELOVL2 | NA | 旨在通过脂质代谢相关基因探索腹膜后脂肪肉瘤的潜在靶点和免疫景观 | 腹膜后脂肪肉瘤（RPLS） | 数字病理学 | 腹膜后脂肪肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO算法 | 基因表达数据 | 234例样本，包括TCGA队列（58例）、GSE30929队列（92例）、FD队列（50例）、scRNA-seq队列（4例）和验证队列（30例） |
| 17063 | 2024-08-07 |
Sox, Fox, and Lmx1b binding sites differentially regulate a Gdf5-Associated regulatory region during elbow development
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1215406
PMID:37492222
|
研究论文 | 本文研究了转录因子Sox、Fox和Lmx1b结合位点在肘关节发育过程中对Gdf5相关调控区域的差异化调控作用 | 首次揭示了Fox/Sox结合位点对Gdf5相关调控区域活性的正向调控作用，以及Sox-only位点的抑制作用 | 研究主要集中在鸡和小鼠模型上，可能不完全适用于其他物种 | 探究Gdf5相关调控区域在肘关节发育中的调控机制 | Gdf5相关调控区域及其结合位点在肘关节发育中的作用 | 生物学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、原位杂交（ISH）、定点突变 | NA | 基因表达数据 | 鸡和小鼠的肢体和膝盖样本 |
| 17064 | 2024-08-07 |
Identifying SARS-CoV-2 infected cells with scVDN
2023, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2023.1236653
PMID:37492254
|
研究论文 | 本研究提出了一种深度学习框架——单细胞病毒检测网络（scVDN），用于预测单细胞的感染状态，特别是在识别SARS-CoV-2感染细胞方面表现出色 | scVDN在识别SARS-CoV-2感染细胞方面优于四种最先进的机器学习模型，即使在真实数据中标签极度不平衡的情况下也能达到完美的AUC评分 | NA | 开发一种有效的工具来识别单细胞水平的SARS-CoV-2感染细胞，以促进病毒研究和改善公共卫生 | SARS-CoV-2感染细胞的识别 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 深度学习框架 | 单细胞RNA测序数据 | 多个鼻拭子样本来自多个贡献者，包含多种细胞类型 |
| 17065 | 2024-08-07 |
A risk score combining co-expression modules related to myeloid cells and alternative splicing associates with response to PD-1/PD-L1 blockade in non-small cell lung cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1178193
PMID:37492578
|
研究论文 | 本研究通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）探讨了非小细胞肺癌（NSCLC）中与PD-1/PD-L1免疫检查点阻断（ICB）反应相关的转录组特征，并构建了一个风险评分模型。 | 本研究首次结合髓系细胞相关的共表达模块和选择性剪接事件，开发了一个与ICB反应相关的风险评分，作为潜在的预测生物标志物。 | NA | 探讨非小细胞肺癌中与PD-1/PD-L1免疫检查点阻断反应相关的转录组特征，并开发预测生物标志物。 | 非小细胞肺癌患者接受ICB治疗的转录组数据。 | 数字病理学 | 肺癌 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | Lasso-COX回归 | 转录组数据 | 两个NSCLC数据集（GSE135222和GSE126044）中的患者样本 |
| 17066 | 2024-08-07 |
Rapamycin and Low-dose IL-2 Mediate an Immunosuppressive Microenvironment to Inhibit Benign Prostatic Hyperplasia
2023, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.85089
PMID:37497009
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析老年不同前列腺体积患者的过渡区组织，揭示了前列腺增生症（BPH）的免疫微环境特征，并验证了雷帕霉素和低剂量IL-2的免疫抑制治疗效果。 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了BPH患者前列腺组织中Treg/CD4+ T细胞比例降低和免疫微环境激活的现象，并证实了免疫抑制药物对BPH进展的抑制作用。 | 研究主要基于老年患者和动物模型，可能不完全适用于所有年龄段的患者；单细胞RNA测序的样本量和多样性可能有限。 | 探讨前列腺增生症（BPH）的病因及其免疫微环境特征，并评估免疫抑制治疗的效果。 | 老年不同前列腺体积患者的前列腺过渡区组织及BPH的免疫微环境。 | NA | 前列腺增生 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织 | 老年不同前列腺体积患者的过渡区组织 |
| 17067 | 2024-08-07 |
Integration analysis of senescence-related genes to predict prognosis and immunotherapy response in soft-tissue sarcoma: evidence based on machine learning and experiments
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1229233
PMID:37497116
|
研究论文 | 本研究通过机器学习和实验方法，分析了衰老相关基因（SRGs）在软组织肉瘤（STS）中的表达，并构建了预测预后和免疫治疗反应的模型 | 首次在STS中系统分析了SRGs的分子特征，并建立了基于SRGs的聚类和评分模型，用于指导临床管理 | NA | 研究衰老相关基因在软组织肉瘤中的表达及其对预后和免疫治疗反应的影响 | 软组织肉瘤中的衰老相关基因 | 机器学习 | 软组织肉瘤 | 单细胞RNA测序 | PCA | 基因表达数据 | 使用了TCGA和GEO数据库中的队列数据以及qPCR和自测序数据进行验证 |
| 17068 | 2024-08-07 |
PreCanCell: An ensemble learning algorithm for predicting cancer and non-cancer cells from single-cell transcriptomes
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.07.009
PMID:37501705
|
研究论文 | 本文提出了一种名为PreCanCell的新算法，用于从单细胞转录组数据中预测恶性与非恶性细胞 | PreCanCell通过识别五种常见癌症类型中恶性与非恶性细胞的差异表达基因，并使用多数投票机制进行分类，显示出比其他七种算法更高的准确性和更简单的实现 | NA | 开发一种新的算法来预测单细胞转录组数据中的癌症与非癌症细胞 | 五种常见癌症类型的单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | NA | 集成学习算法 | 转录组数据 | 19个单细胞数据集 |
| 17069 | 2024-08-07 |
The interaction of macrophages and CD8 T cells in bronchoalveolar lavage fluid is associated with latent tuberculosis infection
2023-Dec, Emerging microbes & infections
IF:8.4Q1
DOI:10.1080/22221751.2023.2239940
PMID:37470432
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了支气管肺泡灌洗液中的免疫细胞群体，特别是巨噬细胞和CD8 T细胞在潜伏性结核感染中的相互作用 | 发现巨噬细胞MM-CCL23在潜伏性结核感染中的保护性免疫作用，及其通过CCL20/CCR6招募CD8-CCR6 T细胞的机制 | 对从潜伏性结核感染进展到活动性结核的免疫机制仍定义不明确 | 探究潜伏性结核感染进展到活动性结核的免疫机制 | 支气管肺泡灌洗液中的免疫细胞群体，特别是巨噬细胞和CD8 T细胞 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自潜伏性结核感染或活动性结核患者的支气管肺泡灌洗液样本 |
| 17070 | 2024-08-05 |
Construction of a hepatocytes-related and protein kinase-related gene signature in HCC based on ScRNA-Seq analysis and machine learning algorithm
2023-Nov, Journal of physiology and biochemistry
IF:3.7Q1
DOI:10.1007/s13105-023-00973-1
PMID:37458958
|
研究论文 | 本研究基于单细胞测序和机器学习算法构建了一个与肝细胞相关的蛋白激酶相关基因特征 | 该研究通过机器学习算法建立了PKRG预测模型，并识别出潜在的HCC治疗靶点 | 该研究没有提及样本的多样性和外部验证的结果 | 分析HCC的单细胞数据并构建预测模型，以促进个性化医学 | 肝细胞癌患者的单细胞数据，重点研究蛋白激酶相关基因 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 来自多个数据集（如TCGA、ICGC和GEO）的大量HCC患者样本 |
| 17071 | 2024-08-05 |
Multi-omics analysis of expression profile and prognostic values of connexin family in LUAD
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05075-5
PMID:37458803
|
研究论文 | 本研究首次探讨了连接蛋白家族在肺腺癌（LUAD）中的表达差异和预后意义 | 开发了一个综合预后模型，揭示了GJB2-5在LUAD患者预后中的关键作用 | NA | 全面分析连接蛋白基因家族在LUAD中的表达谱和预后意义 | 连接蛋白基因家族及其在LUAD中的表达和功能 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | 风险模型 | NA | NA |
| 17072 | 2024-08-05 |
Targeting histone deacetylase suppresses tumor growth through eliciting METTL14-modified m6 A RNA methylation in ocular melanoma
2023-11, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12471
PMID:37466203
|
研究论文 | 本研究探讨了组蛋白去乙酰化酶抑制剂如何通过调控METTL14修饰的m6 A RNA甲基化抑制眼黑色素瘤的肿瘤生长 | 揭示了HDAC/METTL14/FAT4表观遗传级联中的组蛋白和RNA之间的相互作用 | 研究主要集中在眼黑色素瘤细胞，对其他癌症类型的适用性尚待验证 | 探讨组蛋白乙酰化和m6 A修饰在眼黑色素瘤肿瘤发生调控中的作用 | 眼黑色素瘤细胞及其相关的分子机制 | 数字病理学 | 眼黑色素瘤 | RNA测序, 免疫沉淀-qPCR, 单细胞测序等 | 细胞模型和正位异种移植模型 | RNA数据 | NA |
| 17073 | 2024-08-07 |
Establishment of a prognostic model based on m6A regulatory factors and stemness of hepatocellular carcinoma using RNA-seq data and scRNA-seq data
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05045-x
PMID:37466793
|
研究论文 | 本研究基于m6A调控因子和肝细胞癌的干细胞特性，利用RNA-seq和scRNA-seq数据建立了一个预测肝细胞癌预后的模型 | 研究首次综合分析了m6A调控因子与肝细胞癌干细胞之间的关系，并建立了一个临床工具来预测肝细胞癌的预后 | NA | 旨在建立一个预测肝细胞癌预后的临床工具 | 肝细胞癌的m6A调控因子和干细胞特性 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA-seq, scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了ICGC和TCGA数据集 |
| 17074 | 2024-08-07 |
Corrigendum to "A single-cell RNA-seq analysis of early larval cell-types of the starfish, Patiria pectinifera: Insights into evolution of the chordate body plan" [Dev. Biol. 496 (2023) 52-62]
2023-Oct, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2023.06.014
PMID:37454579
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17075 | 2024-08-07 |
Cross-species analysis and comparison of the inner ear between chickens and mice
2023-10, The Journal of comparative neurology
IF:2.3Q1
DOI:10.1002/cne.25524
PMID:37462291
|
研究论文 | 本研究通过比较鸡和鼠的内耳结构，利用RNA测序技术分析了同源基因的表达，并探讨了内耳结构形成的基因表达模式 | 首次进行了鸡和鼠内耳结构的跨物种比较分析，并利用单细胞RNA测序和批量RNA-Seq技术揭示了内耳结构形成的基因表达模式 | NA | 探讨不同物种内耳结构的细胞和分子基础 | 鸡和鼠的内耳结构 | NA | NA | RNA测序 | NA | RNA | 鸡和鼠的内耳组织 |
| 17076 | 2024-08-05 |
Spatial-MGCN: a novel multi-view graph convolutional network for identifying spatial domains with attention mechanism
2023-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad262
PMID:37466210
|
研究论文 | 本文提出了一种名为Spatial-MGCN的新型深度学习方法，用于识别空间域 | 该方法结合了注意力机制的多视角图卷积网络，能够自适应学习基因表达与空间信息之间的复杂关系 | 本文未提及具体的限制条件 | 研究旨在通过有效整合基因表达谱与空间信息来准确识别空间域 | 研究对象为基因表达谱和空间信息 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | 多视角图卷积网络 | 基因表达数据 | NA |
| 17077 | 2024-08-07 |
Integrated analysis reveals Atf3 promotes neuropathic pain via orchestrating JunB mediated release of inflammatory cytokines in DRG macrophage
2023-Sep-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2023.121939
PMID:37451398
|
研究论文 | 本研究通过综合分析揭示了Atf3通过调控JunB介导的炎症细胞因子释放促进背根神经节（DRG）巨噬细胞中的神经病理性疼痛（NP） | 首次揭示了Atf3通过JunB介导的炎症细胞因子释放机制在DRG巨噬细胞中促进神经病理性疼痛的作用 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型，需要进一步的人体实验验证 | 探讨背根神经节在神经病理性疼痛中的调控机制 | 背根神经节（DRG）中的免疫相关基因（IRGs）和巨噬细胞 | 神经科学 | 神经病理性疼痛 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 使用了来自神经损伤（SNI）模型小鼠的DRG样本 |
| 17078 | 2024-08-05 |
Siglec-9 acts as an immune-checkpoint molecule on macrophages in glioblastoma, restricting T-cell priming and immunotherapy response
2023-09, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-023-00598-9
PMID:37460871
|
研究论文 | 这篇文章研究了Siglec-9作为胶质母细胞瘤中巨噬细胞的免疫检查点分子。 | 本研究首次揭示了Siglec-9在胶质母细胞瘤中作为免疫检查点分子的作用，并探讨了其对T细胞活化和免疫治疗反应的限制。 | 研究局限于小鼠模型，可能无法完全反映人类患者的反应。 | 本研究旨在探索胶质母细胞瘤中的免疫调节机制并提高免疫治疗效果。 | 研究对象为接受过新辅助抗PD-1治疗的胶质母细胞瘤患者及相应的小鼠模型。 | 数字病理学 | 胶质癌 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 研究涉及的样本数量及类型不详 |
| 17079 | 2024-08-05 |
Transmorph: a unifying computational framework for modular single-cell RNA-seq data integration
2023-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqad069
PMID:37448589
|
研究论文 | 提出了一个用于整合单细胞RNA测序数据的统一计算框架 | 提供一个灵活的软件生态系统，以便用户针对特定场景构建强大的数据集成管道 | 针对多种特定场景时的灵活性不足仍可能存在问题 | 解决单细胞RNA测序数据整合中的多种实际挑战 | 单细胞RNA测序数据集的整合 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 数据集 | NA |
| 17080 | 2024-08-05 |
CD4 Phenotypes Are Associated with Reduced Expansion of Tumor-Infiltrating Lymphocytes in Melanoma Patients Treated with Adoptive Cell Therapy
2023-09-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300250
PMID:37466381
|
研究论文 | 本研究探讨了CD4表型与黑色素瘤患者肿瘤浸润淋巴细胞扩展的关系 | 发现CD4+细胞频率与TIL扩展呈负相关，为肿瘤浸润淋巴细胞的疗效提供了新见解 | 研究可能受到患者样本量和特定基因表达变化的局限 | 评估影响肿瘤浸润淋巴细胞扩展的相关因素 | 黑色素瘤患者的肿瘤浸润淋巴细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | RNA测序 | NA | 基因组数据 | 通过中位数分组的黑色素瘤患者数据，包括'TIL高'和'TIL低'患者 |