单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28561 篇文献，本页显示第 17041 - 17060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 17041 | 2024-08-07 |
Spatial transcriptomics drives a new era in plant research
2023-Dec, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.16437
PMID:37651723
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17042 | 2024-08-07 |
Targeted single-cell RNA sequencing analysis reveals metabolic reprogramming and the ferroptosis-resistant state in hematologic malignancies
2023-Dec, Cell biochemistry and function
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/cbf.3869
PMID:37823726
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）与靶向致癌基因面板，对急性髓系白血病进行转录组测序，揭示了血液恶性肿瘤中的代谢重编程和铁死亡抵抗状态 | 本研究克服了scRNA-seq在检测致癌突变方面的局限性，通过靶向方法识别了骨髓样本中每种细胞类型的致癌IDH1、IDH2和KRAS突变分布 | NA | 探讨血液恶性肿瘤中的代谢重编程和铁死亡抵抗状态的机制 | 急性髓系白血病患者的骨髓细胞 | 数字病理学 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 多个患者的骨髓样本 |
| 17043 | 2024-08-07 |
Decreased oxidative stress response and oxidant detoxification of skin during aging
2023-Dec, Mechanisms of ageing and development
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.mad.2023.111878
PMID:37827221
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据和微阵列转录组数据，探讨了皮肤细胞在老化过程中氧化应激反应和抗氧化能力的改变，并寻找可能参与调控皮肤老化的氧化应激相关基因 | 首次详细分析了不同类型皮肤细胞在老化过程中的氧化应激反应和抗氧化能力的改变，并识别了可能的关键氧化应激相关基因 | NA | 探究皮肤细胞在老化过程中的氧化应激反应和抗氧化能力的改变及其相关基因 | 皮肤细胞及其氧化应激反应和抗氧化能力 | NA | 老年病 | 单细胞RNA测序, 微阵列转录组 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 17044 | 2024-08-07 |
Integrated single cell transcriptome sequencing analysis reveals species-specific genes and molecular pathways for pig spermiogenesis
2023-Dec, Reproduction in domestic animals = Zuchthygiene
DOI:10.1111/rda.14493
PMID:37874861
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研究论文 | 本文通过综合睾丸单细胞RNA测序分析，比较了人类和猪的精子发生过程，特别是精子形成阶段，揭示了物种特异性的基因和分子通路 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了猪和人类的精子形成过程，识别了特定类型的精子细胞的标记基因和分子通路 | NA | 研究人类和猪的精子形成过程中特异性的基因和分子通路 | 人类和猪的精子形成过程 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | 人类和猪的睾丸细胞被分为26个不同的组 |
| 17045 | 2024-08-05 |
Attention-based deep clustering method for scRNA-seq cell type identification
2023-Nov, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011641
PMID:37948464
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研究论文 | 提出了一种基于注意力机制的scRNA-seq数据聚类方法AttentionAE-sc | 结合了ZINB和GAE两种聚类策略，通过注意力机制进行融合，改善了传统聚类方法的不足 | 未具体提及传统聚类方法的局限性细节 | 开发一种新的单细胞RNA测序数据聚类方法，以应对高维和稀疏数据的挑战 | 研究对象为单细胞RNA测序数据，特别是在乳腺癌单细胞图谱数据集中的应用 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 基于注意力的自动编码器 | 数据集 | 16个真实的scRNA-seq数据集 |
| 17046 | 2024-08-07 |
Distinct mononuclear diploid cardiac subpopulation with minimal cell-cell communications persists in embryonic and adult mammalian heart
2023-Oct, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-023-0987-9
PMID:37294383
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了胚胎和成年哺乳动物心脏中的单核二倍体心肌细胞（MNDCMs）的异质性及其在发育过程中的变化 | 揭示了一种新的非增殖性MNDCM亚群，该亚群具有最小的细胞间通讯，并强调了微环境对心肌细胞成熟过程中命运的重要性 | NA | 阐明单核二倍体心肌细胞的异质性及其在心脏发育过程中的变化 | 胚胎和成年哺乳动物心脏中的单核二倍体心肌细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 12645个心脏细胞 |
| 17047 | 2024-08-05 |
[Advances of spatial omics in the individualized diagnosis and treatment of head and neck cancer]
2023-Sep, Lin chuang er bi yan hou tou jing wai ke za zhi = Journal of clinical otorhinolaryngology, head, and neck surgery
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研究论文 | 本文总结了空间组学在头颈癌诊断和治疗中的最新进展 | 介绍了空间组学如何弥补单细胞测序技术无法获取细胞空间分布信息的缺陷 | NA | 探讨空间组学在头颈癌中的应用进展 | 头颈癌的病理机制、靶点探索和药物开发 | 数字病理学 | 头颈癌 | NA | NA | NA | NA |
| 17048 | 2024-08-07 |
Multilineage contribution of CD34+ cells in cardiac remodeling after ischemia/reperfusion injury
2023-05-05, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-023-00981-8
PMID:37147443
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序和可诱导的Cd34谱系追踪小鼠模型，探讨了Cd34细胞在心脏重塑中的生物学功能及其对心脏重塑的净效应 | 本研究首次揭示了Cd34细胞在心脏重塑过程中的多谱系贡献，并阐明了其在心脏纤维化、血管新生和炎症反应中的具体作用 | NA | 旨在阐明异质性Cd34细胞群的生物学功能，并研究Cd34细胞干预对心脏重塑的净效应 | Cd34细胞在心脏重塑中的作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及人和小鼠的缺血心脏样本 |
| 17049 | 2024-08-07 |
Ploidy-stratified single cardiomyocyte transcriptomics map Zinc Finger E-Box Binding Homeobox 1 to underly cardiomyocyte proliferation before birth
2023-03-02, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-023-00979-2
PMID:36862248
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了出生前后心肌细胞的转录组变化，特别是锌指E盒结合同源盒1（ZEB1）在心肌细胞增殖中的作用 | 首次揭示了ZEB1在心肌细胞增殖和内复制中的关键作用，并提供了高分辨率的心肌细胞单细胞转录组图谱 | 研究仅限于小鼠模型，且样本量相对较小 | 识别出生前后心肌细胞增殖和终末分化相关的转录因子 | 心肌细胞的转录组和增殖机制 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 来自发育中（E16.5、P1和P5）小鼠心脏的固定心肌细胞 |
| 17050 | 2024-08-05 |
Somatosensory neurons express specific sets of lincRNAs, and lincRNA CLAP promotes itch sensation in mice
2023-02-06, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202154313
PMID:36524339
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研究论文 | 这篇文章探讨了体感神经元中特定类型的长非编码RNA（lincRNAs）的分布及其在痒感中的作用 | 首次揭示了特定类型的lincRNAs在体感神经元中的丰富性及其与痒感的关系 | 对lincRNAs在其他神经元类型中的作用尚未进行探索 | 研究体感神经元中特定lincRNAs的分布及其在感觉传递中的功能 | 小鼠的体感神经元及其特定类型的lincRNAs | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和Smart-seq2全长测序 | NA | RNA数据 | 分析了位于背根神经节（DRG）的单个神经元中的200个lincRNAs |
| 17051 | 2024-08-07 |
Decoding the Spermatogenesis Program: New Insights from Transcriptomic Analyses
2022-11-30, Annual review of genetics
IF:8.7Q1
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了精细的细胞图谱，揭示了测试中已知和新型细胞类型及其功能状态，为跨物种比较提供了参考系统 | 利用单细胞RNA测序技术提供了对测试细胞类型多样性和分子特征的深入见解，并构建了精细的细胞图谱 | 目前缺乏高分辨率数据来探索组织环境中生殖细胞与体细胞的相互作用 | 旨在通过单细胞研究提高对配子发生机制的理解，以探索不孕的潜在原因并开发新的治疗干预措施 | 研究对象为精子的发生过程及其细胞和分子特征 | NA | 不孕症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 17052 | 2024-08-05 |
Functional Pdgfra fibroblast heterogeneity in normal and fibrotic mouse lung
2023-Nov-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.164380
PMID:37824216
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研究论文 | 本研究探讨了正常与纤维化小鼠肺中Pdgfra+成纤维细胞的功能异质性 | 首次通过单细胞RNA测序和PdgfraGFP谱系追踪描绘了在小鼠肺损伤后的Pdgfra+成纤维细胞的转录组谱 | 尚不清楚肺损伤对LipoFB功能的具体影响 | 揭示肺损伤对Pdgfra+成纤维细胞功能和转录组变化的影响 | 正常与受损小鼠肺中的Pdgfra+成纤维细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | 3D器官模型 | 转录组数据 | 包含正常和受损小鼠的Pdgfra+成纤维细胞 |
| 17053 | 2024-08-05 |
Altered Sox9 and FGF signaling gene expression in Aga2 OI mice negatively affects linear growth
2023-Nov-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.171984
PMID:37796615
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研究论文 | 本研究探讨了Osteogenesis imperfecta (OI)小鼠中Sox9和FGF信号基因表达的改变对线性生长的负面影响 | 揭示了OI中突变型I胶原蛋白对软骨生长板的影响，以及FGF和MAPK信号通路的激活与细胞分化加速之间的关系 | 研究局限于Aga2+/-小鼠模型，可能无法完全外推至其他类型的OI或人类病例 | 探讨OI对软骨生长板的影响及其对线性生长的生物学机制 | 使用Aga2+/-小鼠模型分析生长板细胞类型的转录后果 | 数字病理学 | 骨生成不全症 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | Aga2+/-小鼠的胫骨和股骨生长板组织 |
| 17054 | 2024-08-07 |
Virus-specific TRM cells of both donor and recipient origin reside in human kidney transplants
2023-Nov-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.172681
PMID:37751288
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研究论文 | 本研究旨在描述人类肾移植中的组织驻留淋巴细胞（TRLs）并探讨其在抗病毒免疫中的潜在作用 | 首次揭示了肾移植中存在供体和受体来源的组织驻留记忆T细胞（TRM），并展示了它们在抗病毒免疫中的作用 | NA | 研究肾移植中的组织驻留淋巴细胞及其在抗病毒免疫中的作用 | 人类肾移植中的组织驻留淋巴细胞 | NA | NA | 单细胞转录组和T细胞受体（TCR）测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 43%的肾移植样本 |
| 17055 | 2024-08-07 |
Islet-autoreactive CD4+ T cells are linked with response to alefacept in type 1 diabetes
2023-Nov-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.167881
PMID:37751304
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研究论文 | 本文研究了胰岛自身反应性CD4+ T细胞与alefacept治疗在1型糖尿病中的反应之间的关系 | 首次发现具有特定转录组特征的胰岛抗原反应性CD4+ T细胞（集群3）的频率与alefacept治疗后的C肽保留呈负相关 | 研究仅限于T1DAL试验中的样本，需要进一步研究以验证这些发现 | 探索胰岛自身反应性CD4+ T细胞作为预测1型糖尿病治疗反应的潜在生物标志物 | 胰岛抗原反应性CD4+ T细胞的表型和转录组特征 | 免疫学 | 1型糖尿病 | 流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 外周血单个核细胞样本 | 来自alefacept和安慰剂治疗个体的样本 |
| 17056 | 2024-08-07 |
Mutant RB1 enhances therapeutic efficacy of PARPis in lung adenocarcinoma by triggering the cGAS/STING pathway
2023-Nov-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.165268
PMID:37937640
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研究论文 | 研究探讨了突变型RB1基因如何通过激活cGAS/STING途径增强PARPi在肺腺癌中的治疗效果 | 首次揭示了RB1突变通过激活cGAS/STING途径和上调免疫浸润，介导肺腺癌对PARPi的敏感性 | NA | 探索RB1突变对肺腺癌中PARPi敏感性的影响 | 肺腺癌细胞系及RB1突变的影响 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了多种LUAD细胞系和RB1-KO小鼠模型 |
| 17057 | 2024-08-05 |
Ubiquitin Ligases Siah1a/2 Control Alveolar Macrophage Functions to Limit Carcinogen-Induced Lung Adenocarcinoma
2023-06-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-0258
PMID:37078793
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研究论文 | 本文主要探讨了泛素连接酶Siah1a/2在调节肺腺癌中的肺泡巨噬细胞功能方面的作用 | 本研究首次揭示了Siah1a/2作为肺泡巨噬细胞的调节因子在致癌物诱导的肺腺癌中的关键角色 | 研究中仅针对巨噬细胞特异性Siah1a/2的作用进行了观察，未探讨其他细胞类型的影响 | 研究Siah1a/2在肺腺癌进展中调节肺泡巨噬细胞功能的机制 | 主要观察肺泡巨噬细胞及其在肺腺癌发展中的作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 基因剔除模型 | 细胞、基因表达数据 | 研究涉及野生型小鼠及肺腺癌患者的样本 |
| 17058 | 2024-08-07 |
As in Real Estate, Location Matters: Cellular Expression of Complement Varies Between Macular and Peripheral Regions of the Retina and Supporting Tissues
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.895519
PMID:35784369
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研究论文 | 本研究通过基因表达分析、质谱分析和免疫组织化学方法，探讨了视网膜和脉络膜细胞类型在决定补体稳态中的作用，特别是在年龄相关性黄斑变性（AMD）中的作用 | 本研究发现早期AMD中，脉络膜中的成纤维细胞、周细胞和内皮细胞对补体反应更为强烈；晚期AMD中，视网膜中补体变化更为显著，尤其是经典途径启动子的表达。此外，研究还揭示了这些差异的空间偏好性 | NA | 探讨视网膜和脉络膜细胞类型在决定补体稳态中的作用，特别是在年龄相关性黄斑变性（AMD）中的作用 | 视网膜和脉络膜细胞类型 | NA | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、质谱分析、免疫组织化学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 17059 | 2024-08-07 |
Cell Type Catalog of Middle Turbinate Epithelium (Cell Catalog of Turbinate Epithelium)
2023 Oct-Dec, OTO open
IF:1.8Q2
DOI:10.1002/oto2.91
PMID:38093720
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术创建了人类中鼻甲黏膜的首个单细胞转录组目录 | 首次为中鼻甲黏膜创建了单细胞转录组目录 | NA | 揭示健康中鼻甲上皮的细胞层级基因表达谱，为鼻窦疾病的分子发病机制和靶向治疗研究奠定基础 | 中鼻甲黏膜的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自一名健康志愿者的中鼻甲头部样本 |
| 17060 | 2024-08-05 |
Deciphering the age-dependent changes of pulmonary fibroblasts in mice by single-cell transcriptomics
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1287133
PMID:38094618
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研究论文 | 这项研究揭示了小鼠肺组织中肺成纤维细胞随年龄变化的转录组特征。 | 本研究首次系统性描述了老化过程中肺成纤维细胞的分化轨迹和转录表型变化。 | 该研究主要基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类。 | 本研究旨在阐明年老肺组织中成纤维细胞的转录谱和分化途径。 | 本研究的研究对象为小鼠的肺成纤维细胞及其在衰老过程中的变化。 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞转录组测序 | NA | 细胞数据 | 共分析了22,826个细胞 |