单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
17041 2024-08-07
ScRNA-seq reveals the correlation between M2 phenotype of tumor-associated macrophages and lymph node metastasis of breast cancer
2023, Oncology research IF:2.0Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,探讨了肿瘤相关巨噬细胞M2表型与乳腺癌淋巴结转移的关系,并筛选出与M2巨噬细胞激活和迁移相关的关键基因。 首次通过单细胞RNA测序技术,详细分析了M2巨噬细胞在乳腺癌淋巴结转移中的作用及其相关基因,为乳腺癌淋巴结转移的治疗提供了潜在的靶点。 研究仅基于公开数据库的数据,未进行体内外实验验证,因此研究结果的临床应用还需进一步验证。 探讨肿瘤相关巨噬细胞M2表型与乳腺癌淋巴结转移的关系,并筛选出关键的M2巨噬细胞相关基因。 乳腺癌患者的原发肿瘤、阴性淋巴结和阳性淋巴结的单细胞转录组数据。 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 包括乳腺癌患者的原发肿瘤、阴性淋巴结和阳性淋巴结的单细胞转录组数据
17042 2024-08-07
Multi-omics analysis reveals the association between elevated KIF18B expression and unfavorable prognosis, immune evasion, and regulatory T cell activation in nasopharyngeal carcinoma
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了KIF18B高表达与鼻咽癌不良预后、免疫逃逸及调节性T细胞激活的关联 首次全面分析了KIF18B在鼻咽癌中的表达及其对免疫抑制、上皮-间质转化(EMT)和治疗反应的影响 研究主要基于批量和单细胞转录组数据,未来需更多实验验证KIF18B在鼻咽癌中的具体作用机制 探讨KIF18B在鼻咽癌中的表达及其对预后和免疫微环境的影响 鼻咽癌组织及其中的KIF18B表达 数字病理学 鼻咽癌 免疫组化、Cox模型、CIBERSORT、EPIC、quanTIseq、BisqueRNA、CellChat、SRAMP平台 NA 转录组数据 具体样本数量未在摘要中提及
17043 2024-08-07
TAGAP expression influences CD4+ T cell differentiation, immune infiltration, and cytotoxicity in LUAD through the STAT pathway: implications for immunotherapy
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究探讨了T-细胞激活GTP酶激活蛋白(TAGAP)在肺腺癌(LUAD)中的表达及其对CD4+ T细胞功能和预后的影响 本研究首次揭示了TAGAP通过STAT途径影响CD4+ T细胞的分化和功能,促进免疫浸润和细胞毒性 NA 研究TAGAP在肺腺癌中的表达及其对CD4+ T细胞功能和预后的影响 肺腺癌(LUAD)患者中的TAGAP表达及其与免疫浸润和临床数据的相关性 数字病理学 肺腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 使用了多个数据集,包括TCGA-LUAD、GEO和scRNA-seq数据集
17044 2024-08-07
No NLRP3 inflammasome activity in kidney epithelial cells, not even when the NLRP3-A350V Muckle-Wells variant is expressed in podocytes of diabetic mice
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文通过单细胞转录组分析和实验验证,探讨了NLRP3炎症小体在糖尿病小鼠肾小管上皮细胞中的表达及活性,特别是Muckle-Wells变异体的影响。 首次证实肾小管上皮细胞(包括足细胞)即使表达NLRP3-A350V变异体,也不产生IL-1β和IL-18,表明NLRP3介导的肾小球炎症主要限于免疫细胞。 研究主要集中在小鼠模型和体外人足细胞实验,可能需要进一步的人体临床研究来验证结果。 验证NLRP3炎症小体在糖尿病肾病中肾小管上皮细胞的作用。 肾小管上皮细胞、足细胞、糖尿病小鼠模型。 数字病理学 糖尿病肾病 单细胞转录组分析、STED显微镜、组织清除技术 深度学习 转录组数据、图像 包括人肾组织、人足细胞、糖尿病小鼠模型
17045 2024-08-07
The Cxcr2+ subset of the S100a8+ gastric granylocytic myeloid-derived suppressor cell population (G-MDSC) regulates gastric pathology
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文研究了胃髓源性抑制细胞(MDSCs)中S100a8+Cxcr2+亚群在胃病理中的调节作用 识别S100a8作为胃粒细胞MDSC(G-MDSC)群体的泛特异性标记,并研究了Cxcr2敲低的效果 先前研究中对胃CD11b+Ly6G+群体的异质性特征和不同亚群的靶向存在局限 探讨胃MDSCs的异质性和功能,特别是S100a8+Cxcr2+亚群的作用 胃髓源性抑制细胞(MDSCs)及其亚群 免疫学 胃癌 转录组和单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 涉及6个月Helicobacter felis感染的小鼠模型
17046 2024-08-07
Single-cell RNA sequencing in juvenile idiopathic arthritis
2024-Mar, Genes & diseases IF:6.9Q1
review 本文综述了单细胞RNA测序在幼年特发性关节炎(JIA)研究中的最新发现,并探讨了主要细胞亚群如何驱动JIA发病机制 利用单细胞RNA测序技术揭示JIA中细胞群体的生物学异质性和功能 NA 提供JIA诊断和治疗的新思路和潜在靶点 幼年特发性关节炎(JIA)及其发病机制 digital pathology 幼年特发性关节炎 单细胞RNA测序 NA RNA NA
17047 2024-08-07
Single-cell transcriptome analysis reveals dynamic changes of the preclinical A549 cancer models, and the mechanism of dacomitinib
2023-Dec-05, European journal of pharmacology IF:4.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了A549细胞和A549异种移植模型在达可替尼处理后的转录组动态变化及其机制 首次揭示了两种经典模型的异质性,并探讨了达可替尼在更广泛患者群体中的转化潜力 NA 研究A549细胞和A549异种移植模型在达可替尼处理后的生物学和分子特征及其转录组动态变化 A549细胞和A549异种移植模型 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA
17048 2024-08-05
Microbial stimulation of oxytocin release from the intestinal epithelium via secretin signaling
2023-12, Gut microbes IF:12.2Q1
研究论文 本文报告了肠上皮细胞中通过促胆囊收缩素信号通路刺激催产素释放的过程 揭示了肠道微生物促进催产素分泌的机制,并确定催产素作为肠道激素 研究的具体适应症和在体内其他途径的影响尚不明确 探讨肠道微生物与催产素分泌之间的关系 人类肠道组织及其类器官 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 组织样本 人类和小鼠肠道组织
17049 2024-08-05
Microfluidic-based technologies in cancer liquid biopsy: Unveiling the role of horizontal gene transfer (HGT) materials
2023-12-01, Environmental research IF:7.7Q1
综述 该文审视了微流体技术在癌症液体活检中横向基因转移材料的作用 提出了微流体技术与癌症液体活检中横向基因转移材料研究的结合,提供了高灵敏度和快速分析的优势 对微流体技术应用于HGT研究的挑战和机会进行了讨论,但未提供具体的实验数据支持 旨在探讨微流体技术在癌症液体活检中对横向基因转移的影响 关注癌细胞及其周围基质细胞之间的基因材料转移 数字病理学 癌症 微流体技术 NA 生物样本 NA
17050 2024-08-07
Corrigendum to "Single-cell RNA sequencing of mouse lower respiratory tract epithelial cells: A meta-analysis" [Cells Dev. 174C (2023) 203847]
2023-Dec, Cells & development IF:2.1Q3
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
17051 2024-08-05
Creation of a High-Throughput Microfluidic Platform for Single-Cell Transcriptome Sequencing of Cell-Cell Interactions
2023-11, Small methods IF:10.7Q1
研究论文 提出了一种基于液滴的微流体平台用于细胞间相互作用的转录组测序 开发了高通量液滴微流体平台以研究细胞间相互作用的影响 尚未明确提及具体的限制 探讨细胞间相互作用对癌症治疗的影响 主要研究抗原呈递细胞与T细胞之间的相互作用 数字病理学 癌症 单细胞测序 NA 基因表达数据 NA
17052 2024-08-05
Architecture of skin inflammation in psoriasis revealed by spatial transcriptomics
2023-11, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
研究论文 本文创建了牛皮癣皮肤炎症的全面图谱,探讨了炎症的组织模式。 揭示了牛皮癣中存在的三大主要炎症区域及其独特的细胞因子回路和趋化因子。 只在四位中度至重度患者的病变皮肤上进行了空间转录组测序,样本数量有限。 研究牛皮癣中皮肤炎症的空间异质性及相关分子机制。 四名中度至重度牛皮癣患者的病变皮肤样本。 数字病理学 牛皮癣 空间转录组测序 NA 基因表达数据 四名患者的病变皮肤样本
17053 2024-08-07
Urinary SPP1 has potential as a non-invasive diagnostic marker for focal segmental glomerulosclerosis
2023-11, FEBS open bio IF:2.8Q3
研究论文 研究探讨尿液中的SPP1蛋白作为非侵入性诊断标记物在局灶节段性肾小球硬化症(FSGS)中的潜力 首次报道尿液SPP1蛋白与FSGS的诊断相关性,并探讨了其在肾功能评估中的作用 研究样本量较小,需要进一步的大规模验证 探索尿液生物标志物作为非侵入性诊断工具在FSGS中的应用 尿液细胞和肾脏组织中的EP-Genes 数字病理学 肾脏疾病 scRNA-seq, 免疫组化染色, bulk RNA sequencing NA RNA 20个尿液细胞样本和3个肾脏组织样本
17054 2024-08-07
Mesenchymal stem cell attenuates spinal cord injury by inhibiting mitochondrial quality control-associated neuronal ferroptosis
2023-11, Redox biology IF:10.7Q1
研究论文 本文研究了间充质干细胞通过抑制与线粒体质量控制相关的神经元铁死亡来减轻脊髓损伤的作用 首次阐明了线粒体质量控制在神经元铁死亡中的作用,并揭示了间充质干细胞通过线粒体转移抑制铁死亡的分子机制 NA 探讨间充质干细胞在脊髓损伤中通过抑制神经元铁死亡的作用及其分子机制 脊髓损伤中的神经元铁死亡及线粒体质量控制 细胞生物学 脊髓损伤 单细胞RNA测序 NA RNA NA
17055 2024-08-07
scNanoCOOL-seq: a long-read single-cell sequencing method for multi-omics profiling within individual cells
2023-11, Cell research IF:28.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
17056 2024-08-07
Single-Cell RNA Sequencing of Coronary Perivascular Adipose Tissue From End-Stage Heart Failure Patients Identifies SPP1+ Macrophage Subpopulation as a Target for Alleviating Fibrosis
2023-11, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了终末期心衰患者冠状动脉周围脂肪组织中的细胞类型和分子特征,发现SPP1+巨噬细胞亚群在促进冠状动脉纤维化中起关键作用。 首次揭示了SPP1+巨噬细胞在冠状动脉周围脂肪组织中的积累及其通过OPN-CD44/整合素途径促进纤维化 progenitor 细胞迁移和增殖的作用。 研究样本量较小,且仅限于心移植接受者,可能限制了结果的普遍性。 探究冠状动脉周围脂肪组织在冠状动脉粥样硬化中的功能障碍机制。 终末期心衰患者冠状动脉周围脂肪组织中的细胞类型和分子特征。 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 细胞数据 共分析了来自10名患者的67,936个细胞
17057 2024-08-07
Single-cell analysis of the miRNA activities in tuberculous meningitis (TBM) model mice injected with the BCG vaccine
2023-Nov, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,深入探索了结核性脑膜炎(TBM)模型小鼠中特定细胞类型的miRNA活性及其靶mRNA表达 首次在单细胞分辨率下探索了TBM中miRNA的活性,并构建了miRNA-mRNA功能网络 NA 研究结核性脑膜炎(TBM)模型小鼠中特定细胞类型的miRNA活性及其对疾病进展的影响 结核性脑膜炎(TBM)模型小鼠中的miRNA活性及其靶mRNA 数字病理学 结核性脑膜炎 scRNA-Seq NA 转录组数据 15种细胞类型
17058 2024-08-07
Arl4c is involved in tooth germ development through osteoblastic/ameloblastic differentiation
2023-10-30, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和功能丧失实验,探讨了Arl4c在小鼠牙胚发育中的作用及其通过成骨细胞/成釉细胞分化的机制 首次揭示了Arl4c在牙胚发育中的具体作用,并通过RNA测序和基因本体分析验证了其在成骨细胞/成釉细胞分化中的关键作用 实验主要集中在小鼠模型上,未来研究需要进一步验证在其他物种中的适用性 探究Arl4c在牙胚发育中的作用及其分子机制 小鼠牙胚发育过程中的成骨细胞/成釉细胞分化 NA NA 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), RNA测序 (RNA-seq) NA RNA 涉及P1和P7小鼠磨牙和切牙的成牙本质细胞和成釉上皮细胞
17059 2024-08-07
Gut bacteria induce IgA expression in pituitary hormone-secreting cells during aging
2023-Oct-20, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序研究了衰老过程中垂体细胞群的变化和全局转录变化,发现免疫球蛋白A(IgA)在衰老的垂体中表达增加,并且这种表达受肠道微生物的调控。 首次发现垂体激素分泌细胞在衰老过程中能够产生IgA,并且这一过程受肠道细菌的影响。 NA 研究衰老过程中垂体激素分泌的基因调控机制。 衰老过程中的垂体细胞和肠道微生物。 NA NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 具体样本数量未提及
17060 2024-08-05
Single-cell characterization of neovascularization using hiPSC-derived endothelial cells in a 3D microenvironment
2023-10-10, Stem cell reports IF:5.9Q2
研究论文 这篇文章研究了利用人诱导 pluripotent 干细胞衍生的内皮细胞在 3D 微环境中进行新血管生成的单细胞特征。 文章提出了一种全面的单细胞转录组学研究,探讨了内皮细胞和共演化的壁细胞的发展与塑性,并发现了新的血管生成信号。 文章未详细说明在不同微环境中内皮细胞的具体生长条件和限制因素。 本研究的目的是为未来组织工程中的血管化提供体外的指导。 研究对象为人诱导 pluripotent 干细胞衍生的内皮细胞及其与其他细胞的相互作用。 数字病理学 NA 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA
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