单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28099 篇文献，本页显示第 17021 - 17040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 17021 | 2024-08-07 |
Decoding the immune landscape following hip fracture in elderly patients: unveiling temporal dynamics through single-cell RNA sequencing
2023-Oct-17, Immunity & ageing : I & A
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12979-023-00380-6
PMID:37848979
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了老年髋部骨折患者从创伤后到恢复期的免疫谱动态变化。 | 研究首次揭示了老年髋部骨折患者在不同阶段免疫细胞亚群的比例变化和基因表达差异，特别是发现了新的CD14单核细胞亚群。 | 研究样本量较小，仅包括四名老年患者，可能影响结果的普遍性。 | 探讨老年髋部骨折患者在创伤后到恢复期间的免疫微环境动态变化。 | 老年髋部骨折患者的外周血样本。 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 四名老年髋部骨折患者的外周血样本，包括两名男性和两名女性，年龄均大于75岁。 |
| 17022 | 2024-08-07 |
Systematic analysis of glutamine metabolism family genes and exploration of the biological role of GPT in colorectal cancer
2023-10-17, Aging
DOI:10.18632/aging.205079
PMID:37851339
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研究论文 | 本研究系统分析了谷氨酰胺代谢家族基因在结直肠癌中的生物学作用，并探索了GPT在结直肠癌中的重要性 | 首次系统分析了谷氨酰胺代谢相关基因（GMRGs）在结直肠癌中的生物学作用，并发现GPT是结直肠癌的重要诊断、预后标志物和治疗靶点 | NA | 探索谷氨酰胺代谢相关基因在结直肠癌中的生物学作用及GPT的重要性 | 结直肠癌患者的基因表达数据、临床数据及单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序 | SVM-REF和RandomForest | 基因表达数据 | 结直肠癌患者的基因表达数据和临床数据来自TCGA数据库，单细胞RNA测序数据来自GEO数据库 |
| 17023 | 2024-08-05 |
Zfp335 establishes eTreg lineage and neonatal immune tolerance by targeting Hadha-mediated fatty acid oxidation
2023-10-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI166628
PMID:37843279
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研究论文 | 本研究探讨了Zfp335在调节性T细胞(eTregs)谱系建立和新生免疫耐受中的作用 | 揭示了Zfp335通过调控脂肪酸氧化介导的eTreg分化机制 | 本研究未探讨其他可能影响Treg分化的因素 | 阐明Zfp335在调节性T细胞分化及免疫耐受中的作用 | 研究调节性T细胞及其功能 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | KO小鼠 | RNA数据 | 涉及Zfp335缺失的调节性T细胞相关样本 |
| 17024 | 2024-08-05 |
Adenine crosses the biomarker bridge: from 'omics to treatment in diabetic kidney disease
2023-10-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI174015
PMID:37843281
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研究论文 | 本研究通过多组学方法识别腺苷作为早期糖尿病肾病的非侵入性生物标志物 | 首次提出腺苷作为糖尿病肾病进展的机制性生物标志物，并展示了多组学方法的潜力 | 研究未明确提及样本量和其他潜在的干扰因素 | 识别糖尿病肾病的机制性生物标志物以预测病程并作为治疗靶点 | 早期糖尿病肾病患者的尿腺苷/肌酐比率 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 多组学方法 | NA | 尿液样本 | 独立队列中的早期糖尿病肾病参与者 |
| 17025 | 2024-08-05 |
Single-cell landscape and spatial transcriptomic analysis reveals macrophage infiltration and glycolytic metabolism in kidney renal clear cell carcinoma
2023-10-16, Aging
DOI:10.18632/aging.205128
PMID:37847178
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研究论文 | 本研究探讨了肾脏透明细胞癌肿瘤微环境中糖酵解因子PGAM1的临床相关性 | 揭示了PGAM1在肾脏透明细胞癌中的表达及其与免疫细胞浸润的关系，具有重要的诊断和预后意义 | PGAM1的具体机制和如何在不同的肾脏区域发挥作用尚不明确 | 研究PGAM1在肾脏透明细胞癌中的作用及其对肿瘤微环境的影响 | 肾脏透明细胞癌患者的肿瘤样本以及小鼠肾损伤模型 | 数字病理学 | 肾脏癌症 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | 基因表达数据和临床数据 | 60名肾脏透明细胞癌患者的肿瘤标本 |
| 17026 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing distinctly characterizes the wide heterogeneity in pediatric mixed phenotype acute leukemia
2023-10-16, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-023-01241-z
PMID:37845689
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术对儿童混合表型急性白血病（MPAL）的骨髓样本进行了分析，以揭示其细胞异质性和微环境特征。 | 首次描述了儿童MPAL的单细胞转录组景观，并展示了B/My和T/My MPAL在单细胞RNA测序中的独特特征。 | 需要更大规模的研究来验证基于治疗反应的转录组差异。 | 更好地理解MPAL的亚型异质性及其与急性髓系白血病（AML）和急性淋巴细胞白血病（ALL）的比较。 | 儿童MPAL的骨髓样本。 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | 分析了来自九名儿童MPAL骨髓样本的超过40,000个细胞。 |
| 17027 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics map of the embryonic mouse brain - a tool to explore neurogenesis
2023-10-15, Biology open
IF:1.8Q3
DOI:10.1242/bio.060151
PMID:37855382
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研究论文 | 这篇文章提供了一个关于胚胎小鼠大脑的空间转录组图谱，旨在探索神经发生 | 建立了一个空间转录组图谱，并结合了单细胞RNAseq数据，揭示了特定解剖领域内的独特转录特征 | NA | 研究胚胎小鼠大脑发育中细胞类型及其相互作用 | 胚胎小鼠大脑的不同类型神经和非神经细胞 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA数据 | 胚胎第13.5天小鼠脑切片的RNA测序数据 |
| 17028 | 2024-08-05 |
Integrative analysis of miRNA in cartilage-derived extracellular vesicles and single-cell RNA-seq profiles in knee osteoarthritis
2023-10-15, Archives of biochemistry and biophysics
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.abb.2023.109785
PMID:37844826
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研究论文 | 该文章探讨了膝关节骨关节炎中源自软骨的细胞外囊泡的miRNA及单细胞RNA测序的整合分析 | 首次整合了源自软骨的EV-DE-miRNA靶基因与每个软骨细胞亚群特异性标记基因之间的关联 | 关于EV-miRNA与软骨细胞群体特征标记基因的关联尚需进一步验证 | 研究源自软骨的EV-miRNA在膝关节骨关节炎中的作用及其潜在的诊断和治疗方法 | 研究对象包括膝关节骨关节炎患者的软骨细胞及其来源的细胞外囊泡 | 数字病理学 | 膝关节骨关节炎 | miRNA测序和单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 涉及来自膝关节骨关节炎患者的软骨细胞及细胞外囊泡 |
| 17029 | 2024-08-05 |
Telomere maintenance mechanism subtype reveals different immune activity in vestibular schwannoma
2023-Oct, Journal of neuro-oncology
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s11060-023-04458-5
PMID:37864645
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研究论文 | 本文研究了端粒酶及端粒的替代延长机制在前庭神经瘤中的作用 | 本研究揭示了不同端粒维护机制亚型在前庭神经瘤患者中的免疫活动差异 | 当前对前庭神经瘤中端粒酶活性和替代延长机制的了解仍然有限 | 阐明端粒酶和端粒替代延长机制在前庭神经瘤中的作用 | 前庭神经瘤患者，分为高端粒酶组和高ALT样组 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 基因数据 | NA |
| 17030 | 2024-08-07 |
Cartilage tissue from sites of weight bearing in patients with osteoarthritis exhibits a differential phenotype with distinct chondrocytes subests
2023-10, RMD open
IF:5.1Q1
DOI:10.1136/rmdopen-2023-003255
PMID:37848267
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研究论文 | 本研究探讨了骨关节炎患者负重区域的软骨组织中是否存在不同亚群的软骨细胞，并分析了这些亚群在不同负重条件下的表型差异。 | 首次鉴定并验证了骨关节炎软骨组织负重区域中存在一种名为OA肥大软骨细胞的亚群，这些细胞具有独特的表型和分子特征。 | NA | 阐明骨关节炎患者负重区域软骨组织中不同软骨细胞亚群的表型差异及其分子机制。 | 骨关节炎患者的软骨组织，特别是负重区域的软骨细胞亚群。 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 蛋白质组分析，单细胞RNA测序，全转录组测序 | NA | 组织，细胞 | NA |
| 17031 | 2024-08-07 |
Divergent tumor and immune cell reprogramming underlying immunotherapy response and immune-related adverse events in lung squamous cell carcinoma
2023-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-007305
PMID:37857527
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析，研究了免疫检查点抑制剂治疗前后肺鳞状细胞癌中的肿瘤和免疫细胞重编程，以及其与治疗反应和免疫相关不良事件的关系 | 揭示了免疫检查点抑制剂治疗中肿瘤和免疫细胞的特定重编程，以及肿瘤坏死因子信号通路在抗肿瘤免疫和免疫相关不良事件中的不同作用 | NA | 深入了解免疫检查点抑制剂治疗肺鳞状细胞癌的抗肿瘤反应和免疫相关不良事件的免疫特征，以最大化患者的治疗益处 | 肺鳞状细胞癌患者的肿瘤和免疫细胞 | 数字病理学 | 肺鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 两个独立的肺鳞状细胞癌患者队列和一个已发表的免疫检查点抑制剂治疗患者队列 |
| 17032 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals neurovascular-osteochondral network crosstalk during temporomandibular joint osteoarthritis: Pilot study in a human condylar cartilage
2023-Oct, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e20749
PMID:37867837
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了颞下颌关节骨关节炎中神经血管-骨软骨网络的交叉对话 | 首次使用单细胞RNA测序技术识别人类颞下颌关节骨关节炎软骨中的细胞和基因，并展示了神经血管-骨软骨网络在人类颞下颌关节骨关节炎过程中的交叉对话 | NA | 旨在发现人类颞下颌关节骨关节炎中神经血管-骨软骨网络交叉对话中起重要作用的细胞和基因 | 颞下颌关节骨关节炎患者的髁状软骨 | 数字病理学 | 颞下颌关节骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 颞下颌关节骨关节炎患者的髁状软骨样本及其他良性髁状增生患者的对照样本 |
| 17033 | 2024-08-07 |
Combining Bulk RNA-seq and scRNA-seq data to identify RNA m5C methyltransferases NSUN1: a rising star as a biomarker for cancer diagnosis, prognosis and therapy
2023-Sep-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-23-66
PMID:37859740
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研究论文 | 本研究结合Bulk RNA-seq和scRNA-seq数据，全面分析了NSUN1在癌症中的表达及其作为癌症诊断、预后和治疗标志物的潜力 | 首次在多种癌症中全面分析NSUN1的基因表达、生存状态、遗传改变、甲基化和磷酸化以及浸润性免疫细胞的关系 | 研究主要基于在线资源和公共数据库，缺乏实验验证 | 探讨NSUN1作为癌症诊断、预后和治疗标志物的有效性 | NSUN1在不同癌症中的表达及其与预后和免疫浸润的关系 | 数字病理学 | 乳腺癌，结肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)，Bulk RNA-seq | NA | RNA序列数据 | 多种人类癌症样本 |
| 17034 | 2024-08-07 |
Characterization of the tumor microenvironment by single-cell RNA sequencing in non-small cell lung cancer treated with neo-adjuvant immunotherapy
2023-Sep-28, Translational lung cancer research
IF:4.0Q1
DOI:10.21037/tlcr-23-413
PMID:37854164
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17035 | 2024-08-05 |
NG-SEM: an effective non-Gaussian structural equation modeling framework for gene regulatory network inference from single-cell RNA-seq data
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad369
PMID:37864293
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研究论文 | 提出了一种新的非高斯结构方程模型框架NG-SEM，用于从单细胞RNA测序数据中推断基因调控网络。 | 引入了一种灵活的噪声建模策略，以高斯混合模型近似生物系统的复杂随机特性，改进了传统结构方程模型。 | 未提及具体限制因素 | 提高单细胞RNA-seq数据中基因调控网络推断方法的准确性。 | 单细胞RNA测序数据中的基因调控网络。 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | 非高斯结构方程模型 | 生物数据集 | 合成数据和真实生物数据集的多种控制实验 |
| 17036 | 2024-08-05 |
Screening single-cell trajectories via continuity assessments for cell transition potential
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad356
PMID:37864296
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研究论文 | 本文提出了一种评估细胞转变潜力的连续性的方法，用于单细胞轨迹分析 | 创新地生成了一种简单的评分算法来评估轨迹的连续性 | 当前缺乏评估指标，使得确定轨迹何时偏离连续性变得困难 | 研究单细胞轨迹的连续性评估，以提高推断准确性 | 对肠道干细胞发育和CD8+ T细胞分化的真实案例进行了研究 | 数字病理学 | 牛皮癣关节炎和急性肾损伤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 在模拟和真实的单细胞数据中分析了断裂情况 |
| 17037 | 2024-08-07 |
[Identification of Peripheral Blood GZMK + CD8 + T Cells As Biomarkers of Alzheimer's Disease Based on Single-Cell Transcriptome]
2023-Sep, Sichuan da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Sichuan University. Medical science edition
DOI:10.12182/20230960107
PMID:37866940
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序技术，探索阿尔茨海默病（AD）患者外周血中的免疫特征，并识别GZMK+ CD8+ T细胞作为潜在的生物标志物 | 首次发现AD患者外周血中GZMK+ CD8+ T细胞含量增加，并与其异常信号传导及RESISTIN信号通路的增强相关 | 研究仅基于单一数据集GSE168522，可能存在样本偏倚；未涉及临床验证 | 识别阿尔茨海默病的潜在血液生物标志物 | 阿尔茨海默病患者的外周血免疫细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用来自Gene Expression Omnibus数据库的GSE168522数据集 |
| 17038 | 2024-08-05 |
Dipeptidyl peptidase 4 inhibition sensitizes radiotherapy by promoting T cell infiltration
2023, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2023.2268257
PMID:37849962
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研究论文 | 本研究探讨了二肽基肽酶4抑制对放疗中T细胞浸润的促进作用 | 发现DPP4抑制可以增强放疗的抗肿瘤效果，通过促进化学趋化因子表达及T细胞浸润来实现 | 未明确提到样本数量及研究局限性 | 研究如何通过DPP4抑制增强放疗的疗效和T细胞的浸润 | 肺腺癌和黑色素瘤患者接受放疗后的T细胞浸润情况 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 17039 | 2024-08-05 |
Expression of CKS2 in Hepatocellular Carcinoma: Correlation with Survival Outcomes and Immune Microenvironment
2023, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S427624
PMID:37841370
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研究论文 | 本研究探讨了CKS2在肝细胞癌中的表达及其与生存结果和免疫微环境的关系 | 通过多组学分析揭示了CKS2在肝细胞癌进展中的作用，并提出其作为免疫治疗靶点的潜力 | 本研究主要依赖数据库分析，可能缺乏样本的多样性和临床验证 | 明确CKS2在肝细胞癌中的作用及其与免疫微环境的关系 | 肝细胞癌患者的CKS2表达及其与免疫细胞浸润等相关性的研究 | 数字病理 | 肝癌 | qRT-PCR和Western blot | NA | 转录数据 | 使用多种数据库进行分析，具体样本数量未说明 |
| 17040 | 2024-08-05 |
Beneficial effects of ginkgetin on improving nonalcoholic steatohepatitis characterized by bulk and single-cell RNA sequencing analysis
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1267445
PMID:37860111
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研究论文 | 本研究评估了金固素对非酒精性脂肪性肝炎的影响及其相关机制 | 首次通过大规模和单细胞RNA测序分析揭示了金固素对NASH的影响和相关信号通路 | 该研究主要基于小鼠模型，可能无法完全代表人类的NASH情况 | 探究金固素对非酒精性脂肪性肝炎的改善作用及其机制 | 使用高脂饮食构建的NASH小鼠模型 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 构建高脂饮食小鼠模型，样本数量未具体描述 |