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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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17021 | 2024-08-05 |
Hermansky-Pudlak syndrome type 1 causes impaired anti-microbial immunity and inflammation due to dysregulated immunometabolism
2022-06, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1038/s41385-022-00572-1
PMID:36302964
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研究论文 | 本研究探讨了Hermansky-Pudlak综合症1型中免疫代谢失调对抗微生物免疫和炎症的影响 | 揭示了HPS1缺乏如何通过Rab32介导的mTOR信号通路改变代谢程序,并影响抗微生物反应 | 该研究的细胞机制和临床显著性仍需进一步验证 | 理解Hermansky-Pudlak综合症1型中炎症的细胞基础 | 研究HPS-1患者的外周血细胞和血清 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 大规模细胞测定、蛋白组学和转录组学分析 | NA | 血液样本、组织样本 | HPS-1患者的外周血细胞和血清样本 | NA | NA | NA | NA |
17022 | 2024-08-05 |
STRT-seq-2i: dual-index 5' single cell and nucleus RNA-seq on an addressable microwell array
2017-11-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-017-16546-4
PMID:29180631
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研究论文 | 本文介绍了一种名为STRT-seq-2i的新型单细胞RNA测序技术 | STRT-seq-2i结合了可寻址的9600微孔阵列和高通量成像,具有竞争性成本的独特优势 | 该研究未提及对老龄化人脑样本的具体应用效果 | 研究旨在提高对单细胞RNA测序技术的高通量应用能力 | 研究对象包括新鲜的小鼠皮质细胞和冷冻的死后人类皮质核 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 单细胞 RNA 数据 | 使用了新鲜小鼠皮质细胞和冷冻人类皮质核的样本 | NA | NA | NA | NA |
17023 | 2024-08-05 |
VISTA deficiency exerts anti-tumor effects in breast cancer through regulating macrophage polarization
2024-Jul-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112365
PMID:38820964
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research paper | 本研究首次揭示了VISTA在乳腺癌中对巨噬细胞的影响 | 揭示了VISTA通过STAT通路调节巨噬细胞极化,进而影响肿瘤生长 | 未涉及VISTA在其他类型肿瘤中的作用 | 探讨VISTA在乳腺癌中对巨噬细胞极化的影响 | 乳腺癌中的巨噬细胞 | NA | 乳腺癌 | scRNA-seq | NA | NA | 体内实验中使用了VISTA缺失小鼠 | NA | NA | NA | NA |
17024 | 2024-08-07 |
Single-cell sequencing reveals alterations in the differentiation of bone marrow haematopoietic cells in patients with paroxysmal nocturnal haemoglobinuria
2024-Jul, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1671
PMID:38924689
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
17025 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing of human oocytes reveals a differential transcriptomic profile associated with agar-like zona pellucida
2024-Jun-26, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-024-01463-8
PMID:38926883
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研究论文 | 该文章探讨了具有琼脂样透明带的单个细胞卵母细胞的转录组特征 | 揭示了与琼脂样透明带相关的分子机制及其涉及的差异表达基因 | 研究样本数量较少,仅涉及四名患者和四名健康供体 | 阐明琼脂样透明带的分子机制及其对卵母细胞的影响 | 琼脂样透明带卵母细胞与健康卵母细胞 | 数字病理学 | 不孕症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 八个卵母细胞样本(四个琼脂样透明带患者和四个健康供体) | NA | NA | NA | NA |
17026 | 2024-08-07 |
Androgens exert multifaceted functions in sex differences analyzed through single-cell transcriptome
2024-Jun-26, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2652-y
PMID:38940831
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
17027 | 2024-08-05 |
Pan-cancer multi-omics analysis of PTBP1 reveals it as an inflammatory, progressive and prognostic marker in glioma
2024-06-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-64979-5
PMID:38918441
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研究论文 | 本研究分析了PTBP1在胶质瘤中的炎症、进展和预后标志物的角色。 | 揭示了PTBP1在多种癌症中的表达、甲基化与预后之间的关系,并首次将其作为胶质瘤的标志物。 | 尚不清楚PTBP1表达与肿瘤微环境的具体关系。 | 探讨PTBP1在胶质瘤中的作用及其作为预后标志物的潜力。 | PTBP1在不同癌症类型中的表达与甲基化模式。 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 基因集合富集分析(GSEA),单细胞转录组分析,空间转录组分析 | NA | 基因表达数据,甲基化数据 | 使用了多种数据集,包括TCGA、GTEx和CGGA | NA | NA | NA | NA |
17028 | 2024-08-05 |
Insight into Fructose-to-Sucrose Ratio as the Potential Target of Urinalysis in Bladder Cancer
2024-Jun-20, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo14060345
PMID:38921479
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研究论文 | 本文探讨了尿液中果糖与蔗糖比作为膀胱癌尿液分析的潜在目标 | 研究首次揭示了尿液中果糖与蔗糖比与膀胱癌风险之间的双向负因果关系 | 研究主要依赖于动物模型,可能无法完全反映人类膀胱癌的复杂性 | 研究膀胱癌中可操作的非侵入性筛查生物标志物 | 膀胱癌相关的尿液代谢物及其与膀胱癌风险的关系 | 数字病理学 | 膀胱癌 | scRNA-seq, Mendelian随机化分析 | BBN诱导的小鼠模型 | 生物标志物数据 | 使用BBN诱导的小鼠模型进行验证的样本 | NA | NA | NA | NA |
17029 | 2024-08-05 |
Identification of therapeutic targets and medicines for comorbid Crohn's disease and rheumatoid arthritis: A comprehensive analysis
2024-Jun-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e32406
PMID:38933947
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研究论文 | 本研究旨在识别共患克罗恩病和类风湿关节炎的潜在治疗靶点和药物 | 本研究运用单细胞RNA测序和孟德尔随机化等新方法来识别共患疾病的关键免疫细胞及其靶点 | 未提及研究的具体局限性 | 识别共患克罗恩病和类风湿关节炎的治疗靶点和潜在药物 | 共患克罗恩病和类风湿关节炎的患者的免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 克罗恩病/类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序,分子对接,分子动力学模拟 | NA | 文本 | 纳入共患克罗恩病和类风湿关节炎患者的PBMC样本 | NA | NA | NA | NA |
17030 | 2024-08-04 |
GSK3β and UCHL3 govern RIPK4 homeostasis via deubiquitination to enhance tumor metastasis in ovarian cancer
2024-Jun, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-024-03040-1
PMID:38664501
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研究论文 | 这项研究揭示了GSK3β和UCHL3在卵巢癌中通过去 ubiquitination 维持 RIPK4 稳定性并增强肿瘤转移的重要作用 | 本研究首次揭示了GSK3β诱导的RIPK4磷酸化如何增强其与UCHL3的相互作用,从而提高RIPK4的去 ubiquitination 和稳定性 | 该研究主要集中于体外和体内模型,临床验证尚需进一步研究 | 研究 RIPK4 在卵巢癌发展中的作用及其调控机制 | 研究主要对象为卵巢癌组织及细胞,重点关注RIPK4、UCHL3和GSK3β的相互作用 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序 | NA | 组织样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
17031 | 2024-08-04 |
AML/T cell interactomics uncover correlates of patient outcomes and the key role of ICAM1 in T cell killing of AML
2024-Jun, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-024-02255-1
PMID:38724673
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研究论文 | 本研究揭示了AML/T细胞相互作用对患者结果的相关性及ICAM1在T细胞杀伤AML中的关键作用 | 该研究首次揭示了ICAM1作为免疫触发因子在小鼠体内T细胞杀死AML细胞中的作用 | 研究主要集中于AML样本与T细胞的体外相互作用,可能未能全面反映整体免疫环境 | 探讨AML患者对T细胞杀伤的敏感性及其相互作用的分子机制 | AML细胞样本与人源工程化的CD4 T细胞 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞样本 | 多个AML患者样本和CD4 T细胞的组合 | NA | NA | NA | NA |
17032 | 2024-08-04 |
Beyond the marrow: insights from comprehensive next-generation sequencing of extramedullary multiple myeloma tumors
2024-Jun, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-024-02206-w
PMID:38493239
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研究论文 | 此研究对外髓性多发性骨髓瘤(EMM)肿瘤进行了全面的下一代测序分析 | 首次揭示EMM的肿瘤微环境,识别关键的分子特征和潜在的治疗靶点 | 样本规模相对较小,仅有14个样本 | 探讨EMM肿瘤的分子特征和开发有效的治疗策略 | 外髓性多发性骨髓瘤肿瘤样本 | 数字病理学 | 肿瘤 | 下一代测序(NGS) | NA | 肿瘤样本 | 14个样本 | NA | NA | NA | NA |
17033 | 2024-08-05 |
Multiome in the Same Cell Reveals the Impact of Osmotic Stress on Arabidopsis Root Tip Development at Single-Cell Level
2024-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308384
PMID:38634607
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研究论文 | 本研究探讨了渗透压胁迫对拟南芥根尖发育的影响,使用单细胞层面的转录调控网络分析 | 首次在单细胞层面重建了相应的转录调控网络,并捕捉到12,968个单细胞的基因和染色质可及性之间的联系 | 数据整合的准确性仍然是个挑战,尤其是在调查特定细胞类型的转录调控网络时 | 研究拟南芥在渗透压胁迫下的根尖发育机制 | 16,670个拟南芥根尖细胞核 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq和scATAC-seq | NA | 单细胞基因表达和染色质可及性数据 | 16,670个根尖细胞核 | NA | NA | NA | NA |
17034 | 2024-08-05 |
Recapitulation of Perturbed Striatal Gene Expression Dynamics of Donors' Brains With Ventral Forebrain Organoids Derived From the Same Individuals With Schizophrenia
2024-Jun-01, The American journal of psychiatry
DOI:10.1176/appi.ajp.20220723
PMID:37915216
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研究论文 | 本研究通过从精神分裂症患者及神经正常对照者的诱导多能干细胞衍生的腹侧前脑类器官探索与精神分裂症相关的纹状体发育变化 | 提出了一种从精神分裂症患者的诱导多能干细胞生成腹侧前脑类器官的方法,并揭示了精神分裂症患者细胞在发育轨迹上的差异 | 研究样本量较小,仅限于四名精神分裂症患者和四名神经正常对照者 | 探索与精神分裂症相关的纹状体神经发育改变 | 来自精神分裂症患者和神经正常对照者的诱导多能干细胞衍生的腹侧前脑类器官 | 数字病理学 | 精神分裂症 | 诱导多能干细胞(IPS细胞)差异化 | 腹侧前脑类器官(VFO) | 单细胞RNA测序 | 四名精神分裂症患者及四名神经正常对照者 | NA | NA | NA | NA |
17035 | 2024-08-05 |
A risk score based on polyamine metabolism and chemotherapy-related genes predicts prognosis and immune cells infiltration of lung adenocarcinoma
2024-Jun, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18387
PMID:38924680
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研究论文 | 本文探讨了铂类治疗和多胺代谢相关基因是否能够预测肺腺癌的预后 | 建立了基于铂类治疗和多胺代谢的关键基因的风险评分模型,提供了新颖的预后预测角度 | 行政性缺乏大规模临床试验验证该风险评分模型的准确性 | 研究铂类治疗和多胺代谢基因在LUAD预后预测中的作用 | 与铂类治疗和多胺代谢相关的基因及其对免疫细胞浸润的影响 | 数字病理学 | 肺癌 | scRNA-seq | 风险评分模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
17036 | 2024-08-07 |
Using single-cell transcriptomics to predict which tumors will respond to targeted therapy
2024-Jun, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00757-6
PMID:38684925
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
17037 | 2024-08-04 |
Single-Cell Sequencing Technology in Ruminant Livestock: Challenges and Opportunities
2024-May-27, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb46060316
PMID:38920988
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评论 | 该文综述了单细胞测序技术在反刍动物中的应用及其面临的挑战和机遇 | 探讨了反刍动物中特有的单细胞组学技术,以及对细胞和分子机制深入理解的潜力 | 面临精准标注独特细胞群体和细胞在组织内空间分辨率等挑战 | 旨在提高对健康和高产反刍动物所需特征的理解 | 关注牛、羊和山羊的细胞多样性及免疫细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq和单细胞ATAC-seq | NA | 基因组数据 | 已经探讨的动物种类包括牛、羊和山羊 | NA | NA | NA | NA |
17038 | 2024-08-05 |
CASi: A framework for cross-timepoint analysis of single-cell RNA sequencing data
2024-05-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-58566-x
PMID:38724550
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研究论文 | 本研究开发了CASi,一个用于多时间点单细胞RNA测序数据分析的综合框架 | 提出了一个新的框架,专门用于分析多时间点的单细胞RNA测序数据,并提供多种分析功能 | 尚未在其他类型的单细胞数据集上进行广泛验证 | 旨在改善多时间点的单细胞RNA测序数据分析 | 关注单细胞层面基因表达差异研究 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 通过综合模拟研究与真实的多时间点单细胞数据集进行验证 | NA | NA | NA | NA |
17039 | 2024-08-04 |
Dual-Targeting Nanovesicles Carrying CSF1/CD47 Identified from Single-Cell Transcriptomics of Innate Immune Cells in Heart Transplant for Alleviating Acute Rejection
2024-03, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202302443
PMID:37962054
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研究论文 | 本文研究了双靶向纳米囊泡CSF1/CD47在心脏移植中的作用,以缓解急性排斥反应 | 提出了一种新型的CSF1/CD47双靶向纳米囊泡,通过调节Ly6G Ly6C抑制性巨噬细胞来减轻免疫排斥 | 研究主要集中在小鼠模型上,临床应用可能需要更多验证 | 探讨固有免疫细胞在心脏移植急性排斥反应中的动态变化和调控机制 | 研究了Ly6G Ly6C炎性巨噬细胞及其与中性粒细胞的相互信号传导 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
17040 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing of a new transgenic t(8;21) preleukemia mouse model reveals regulatory networks promoting leukemic transformation
2024-01, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-023-02063-z
PMID:37838757
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研究论文 | 本研究描述了一种新的转基因鼠模型,揭示了促使白血病转化的调控网络 | 开发了一种新的AE9a基因敲入小鼠模型,适合研究前白血病阶段的改变 | 可能在临床上的适用性仍需进一步验证 | 研究t(8;21)的前白血病机理及其调控网络 | 使用AE9a小鼠模型分析前白血病细胞群体及其转化 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | 转基因小鼠 | 基因表达数据 | 使用AE9a小鼠模型观察多个细胞群体 | NA | NA | NA | NA |