单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
17021 2024-08-07
A new immunological index for the elderly: high proportion of multiple TCR T cells based on scRNA-seq
2023-Sep-04, Aging and disease IF:7.0Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
17022 2024-08-07
Correction to: Clustering spatial transcriptomics data
2023-Sep-02, Bioinformatics (Oxford, England)
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
17023 2024-08-07
A bioinformatics analysis of potential cellular communication networks in non-alcoholic steatohepatitis and colorectal adenoma using scRNA-seq and bulk-seq
2023-Aug-31, Journal of gastrointestinal oncology IF:2.0Q3
研究论文 本研究通过分析单细胞数据和在线数据库中的高通量测序数据,筛选了非酒精性脂肪肝炎(NASH)和结直肠腺瘤(CRA)之间的差异表达基因和核心效应通路,以探索NASH/NAFLD-CRA的潜在机制 本研究利用scRNA-seq和bulk-seq技术,通过细胞注释和细胞通信分析,筛选了NASH-CRA共病的核心效应通路和特定信号通路,揭示了WNT通路在NASH-CRA细胞信号通信中的关键作用 本研究可能遗漏一些生物学上重要的基因表达程序 寻找NASH-CRA的潜在生物标志物、治疗靶点和相关效应通路 非酒精性脂肪肝炎(NASH)和结直肠腺瘤(CRA) 生物信息学 非酒精性脂肪肝病 scRNA-seq, bulk-seq NA 单细胞数据, 高通量测序数据 CRA患者单细胞数据和GSE37364、GSE89632数据库中的高通量测序数据
17024 2024-08-05
Single-Cell RNA-Seq Reveals Changes in Cell Subsets in the Cortical Microenvironment during Acute Phase of Ischemic Stroke Rats
2023-Aug-22, Journal of integrative neuroscience IF:2.5Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了急性缺血性中风大鼠皮层微环境中细胞亚群的变化 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了缺血再灌注损伤(CIRI)中不同细胞亚群的生物功能和信号通路 仅限于大鼠模型,可能无法完全反映人类中风的复杂生物机制 研究缺血性中风中CIRI的机制,以找到更好的预防和治疗方法 缺血性中风大鼠模型及其脑皮层细胞亚群 数字病理学 缺血性中风 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 大鼠的21个脑细胞群集以及6个显著差异的细胞亚群
17025 2024-08-05
Temporal dynamics of microglia-astrocyte interaction in neuroprotective glial scar formation after intracerebral hemorrhage
2023-Aug, Journal of pharmaceutical analysis IF:6.1Q1
研究论文 本研究探讨了微胶质细胞与星形胶质细胞的相互作用如何影响胶质瘢痕形成及其具体功能。 研究首次揭示了微胶质细胞缺失如何在不同阶段影响胶质瘢痕的形成及其修复功能的时间动态。 研究主要关注于药理学方法引导的微胶质细胞消耗,可能影响对其自然变化的理解。 旨在探讨胶质瘢痕在脑出血后的作用及其形成机制。 研究对象为脑出血后微胶质细胞与星形胶质细胞的相互作用及胶质瘢痕。 数字病理学 脑出血 空间转录组学 NA NA NA
17026 2024-08-05
Single-cell and spatial heterogeneity landscapes of mature epicardial cells
2023-Aug, Journal of pharmaceutical analysis IF:6.1Q1
研究论文 该文章研究了成熟心外膜细胞的单细胞和空间异质性景观 识别了特定于产后心外膜组织的几种基因标记,并揭示了心外膜细胞在发育过程中的转录特征 研究中未明确指出样本数量和具体的基因标记 阐明成熟心外膜细胞的基因标记和发育过程 小鼠心脏中的心外膜细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞转录组分析和空间转录组学 NA RNA 9.5天胚胎至9天后出生的小鼠心脏细胞
17027 2024-08-05
Spatial transcriptomics reveals asymmetric cellular responses to injury in the regenerating spiny mouse (Acomys) ear
2023-08, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 该论文探讨了刺鼠耳部再生过程中不对称的细胞反应 首次利用空间转录组学揭示了刺鼠耳部再生中的不对称基因表达模式 未详细研究其他哺乳动物在再生过程中的机理 理解刺鼠耳部再生的分子和细胞事件 刺鼠耳部的再生过程 数字病理 NA 空间转录组学 NA 基因表达数据 NA
17028 2024-08-07
Single-cell transcriptome analysis uncovers underlying mechanisms of acute liver injury induced by tripterygium glycosides tablet in mice
2023-Aug, Journal of pharmaceutical analysis IF:6.1Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示雷公藤多苷片诱导的小鼠急性肝损伤的细胞和分子机制 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了雷公藤多苷片诱导的急性肝损伤中的细胞亚型和分子变化 NA 阐明雷公藤多苷片诱导的急性肝损伤的细胞和分子事件 雷公藤多苷片诱导的小鼠急性肝损伤模型 数字病理学 肝损伤 单细胞RNA测序 NA RNA 包括多种肝脏细胞亚型,如内皮细胞、肝细胞、胆管细胞和肝星状细胞等
17029 2024-08-07
A single-cell landscape of triptolide-associated testicular toxicity in mice
2023-Aug, Journal of pharmaceutical analysis IF:6.1Q1
研究论文 研究了雷公藤内酯引起的雄性小鼠睾丸毒性的单细胞转录组图谱 首次在单细胞分辨率下全面剖析了雷公藤内酯相关的睾丸毒性,并构建了单细胞转录组图谱 NA 探讨雷公藤内酯引起的睾丸损伤机制及其治疗靶点 雷公藤内酯对小鼠睾丸细胞的影响 数字病理学 生殖毒性 单细胞转录组测序 NA 转录组数据 59,127个细胞
17030 2024-08-07
Single-cell RNA sequencing reveals the dynamics of hepatic non-parenchymal cells in autoprotection against acetaminophen-induced hepatotoxicity
2023-Aug, Journal of pharmaceutical analysis IF:6.1Q1
research paper 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了在对抗对乙酰氨基酚诱导的肝毒性中,肝非实质细胞(NPCs)的动态变化及其功能 首次详细描述了在对抗药物诱导的肝损伤中,肝非实质细胞的动态变化及其在自动保护机制中的作用 NA 深入理解药物诱导肝损伤的自动保护机制,为预防和治疗提供新策略 肝非实质细胞(NPCs)在自动保护机制中的动态变化及其功能 digital pathology NA 单细胞RNA测序 NA RNA 使用对乙酰氨基酚(APAP)作为模型药物,在小鼠中进行预处理和二次挑战
17031 2024-08-05
Prediction of distinct populations of innate lymphoid cells by transcriptional profiles
2023, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本研究利用单细胞转录组分析结合机器学习技术来识别先天淋巴细胞。 提出了一种新的方法,通过深度神经网络准确分类淋巴细胞,并确定了在淋巴细胞发育中起重要作用的四个基因。 研究仅聚焦于外围血液中的ILCs,未能涵盖其他组织中的ILCs。 研究先天淋巴细胞的识别及其发育功能。 647名患者的单细胞RNA-seq数据。 机器学习 NA 单细胞RNA-seq 深度神经网络 转录组数据 647名患者,共26087个转录本
17032 2024-08-05
Progress in research on tumor microenvironment-based spatial omics technologies
2023, Oncology research IF:2.0Q3
研究论文 本文总结了空间转录组学和空间蛋白组学技术在表征肿瘤免疫微环境中的研究进展 本研究创新性地将空间组学应用于肿瘤微环境研究,揭示传统研究技术无法解决的问题 本文未提及具体的实验数据或样本分析,限制了结论的普遍适用性 旨在探讨空间组学在肿瘤微环境研究中的应用 研究对象为肿瘤微环境及其相关的免疫细胞和分子信息 数字病理学 肿瘤 空间组学技术 NA 分子信息 NA
17033 2024-08-05
Spatial Transcriptomics of Aging Rat Ovaries Reveals Unexplored Cell Subpopulations with Reduced Antioxidative Defense
2023, Gerontology IF:3.1Q3
研究论文 该研究首次描述了与卵巢衰老相关的空间转录组变化,并识别了潜在的预防目标 利用空间转录组学技术探索了老化大鼠卵巢中未被探索的细胞亚群及其抗氧化防御减少的特征 研究局限于大鼠模型,结果是否适用于人类尚不明确 更好地理解卵巢衰老过程中的遗传调控,以便改善与卵巢衰老相关的疾病治疗和生育保护选择 老鼠卵巢的空间转录组特征 数字病理学 NA 空间转录组学 NA 转录组数据 年轻和老化大鼠的卵巢样本
17034 2024-08-05
Discovery of neutralizing SARS-CoV-2 antibodies enriched in a unique antigen specific B cell cluster
2023, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本文研究了从SARS-CoV-2恢复患者中分离的中和抗体,通过单细胞测序识别出特定B细胞簇 发现了一类富含SARS-CoV-2中和抗体的激活B细胞簇,并鉴定出两种有效的中和抗体 研究样本量较小,仅涉及15名参与者 探索新的SARS-CoV-2治疗抗体以应对病毒变异带来的抵抗问题 从15名SARS-CoV-2恢复患者收集的样本中分离的B细胞 数字病理学 NA 单细胞测序 NA 抗体 15名SARS-CoV-2恢复参与者
17035 2024-08-05
A 12-gene panel in estimating hormone-treatment responses of castration-resistant prostate cancer patients generated using a combined analysis of bulk and single-cell sequencing data
2023, Annals of medicine IF:4.9Q1
研究论文 本研究开发了一个12基因面板,用于估计去势抗性前列腺癌患者的激素治疗反应 提出了基于CRPC特有的肿瘤微环境特征构建的基因面板,为激素治疗反应预测提供了新工具 对CRPC特有的肿瘤微环境特征的了解仍然有限 研究去势抗性前列腺癌的激素治疗反应预测 去势抗性前列腺癌样本及相关基因表达特征 数字病理学 前列腺癌 bulk-sequencing和单细胞RNA测序(scRNAseq) NA 基因表达数据 共分析了16个正常前列腺样本、13个前列腺癌样本、11个前列腺癌样本和6个去势抗性前列腺癌样本
17036 2024-08-05
Advancement of single-cell sequencing for clinical diagnosis and treatment of pancreatic cancer
2023, Frontiers in medicine IF:3.1Q1
研究论文 单细胞测序技术在胰腺癌的临床诊断和治疗中的进展 本研究展示了单细胞测序在揭示胰腺癌转移和恶病质机制方面的独特见解 NA 探索单细胞测序在胰腺癌诊断和治疗中的应用潜力 胰腺癌中的单细胞 数字病理学 胰腺癌 单细胞测序 NA 基因组数据、转录组数据、表观基因组数据 NA
17037 2024-08-05
Combining single-cell sequencing and spatial transcriptome sequencing to identify exosome-related features of glioblastoma and constructing a prognostic model to identify BARD1 as a potential therapeutic target for GBM patients
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究探讨了胶质母细胞瘤的外泌体相关特征,以更好地理解其细胞组成和分子特性 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组测序分析胶质母细胞瘤的外泌体相关基因,并构建了基于ERGs的预后模型 研究可能存在样本量不足或临床数据验证的局限性 旨在深入了解胶质母细胞瘤的细胞异质性及外泌体相关的分子特征 研究对象为胶质母细胞瘤患者的肿瘤细胞及其外泌体相关基因 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和空间转录组RNA测序 (stRNA-seq) NA RNA NA
17038 2024-08-07
Smarca4 deficiency induces Pttg1 oncogene upregulation and hyperproliferation of tubular and interstitial cells during kidney development
2023, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究探讨了染色质重塑因子Smarca4缺失对肾脏发育中管状细胞和间质细胞增殖的影响 首次揭示了Smarca4在调控管状细胞分化和癌基因Pttg1表达中的关键作用 NA 研究Smarca4在肾脏发育中的作用及其对细胞增殖和分化的影响 肾脏发育中的管状细胞和间质细胞 NA 肾细胞癌 单细胞RNA测序 NA RNA 多种类型的间质细胞和肾单位相关细胞
17039 2024-08-07
Single-cell RNA sequencing shows the immune cell landscape in the kidneys of patients with idiopathic membranous nephropathy
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了特发性膜性肾病患者的肾脏组织,揭示了免疫细胞的特征及其在疾病发病机制中的潜在作用 首次使用单细胞RNA测序技术详细分析了特发性膜性肾病患者的肾脏免疫细胞景观,揭示了免疫细胞在疾病中的激活状态和相互作用 研究仅限于特发性膜性肾病患者,结果的普遍性和其他类型肾病的适用性有待进一步验证 探索特发性膜性肾病的分子机制 特发性膜性肾病患者的肾脏组织和健康对照组的肾脏组织 数字病理学 肾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 包括特发性膜性肾病患者和健康对照组的肾脏组织样本
17040 2024-08-07
Distribution characteristics of mitochondria-rich segments in the epididymis
2023, American journal of clinical and experimental immunology IF:1.4Q4
PMID:37736076
研究论文 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了附睾中线粒体的空间和段特异性分布模式 发现了附睾体部和尾部相比头部具有更高丰度的线粒体和线粒体转录,这一发现增加了对附睾复杂性的理解 NA 研究附睾细胞及其基因表达的空间-时间特性 附睾中的线粒体分布 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA
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