单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 16981 - 17000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16981 | 2024-08-05 |
An information-theoretic approach to single cell sequencing analysis
2023-Aug-12, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05424-8
PMID:37573291
|
研究论文 | 本文正式量化了单细胞测序实验获得的信息，并展示了其与基因表达异质性之间的直观关系 | 提出了一种基于信息论的定义，能够有效区分细胞类型间的异质性，并发展出自动无监督聚类的高效方法 | 未提及具体限制 | 旨在深入理解单细胞测序数据中的基因表达异质性及其与细胞类型的关系 | 单细胞测序实验数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | 聚类算法 | 基因表达数据 | NA |
| 16982 | 2024-08-07 |
Co-inhibition of glutaminolysis and one-carbon metabolism promotes ROS accumulation leading to enhancement of chemotherapeutic efficacy in anaplastic thyroid cancer
2023-08-12, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-06041-2
PMID:37573361
|
研究论文 | 研究探讨了抑制谷氨酰胺代谢和一碳代谢在增加细胞内活性氧（ROS）积累以及增强化疗效果中的作用，特别是在未分化甲状腺癌中的应用。 | 首次发现同时抑制谷氨酰胺代谢和一碳代谢可以增强未分化甲状腺癌的化疗效果，并通过单细胞RNA测序分析揭示了一碳代谢在甲状腺癌进化过程中的作用。 | 研究主要基于细胞和分子层面的实验，尚未进行临床试验验证其在患者中的实际效果。 | 探索通过抑制谷氨酰胺代谢和一碳代谢来增强未分化甲状腺癌化疗效果的机制。 | 未分化甲状腺癌细胞及其代谢途径。 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | RNA测序, ATAC-Sequencing | NA | mRNA, 单细胞RNA | 具体样本数量未在摘要中明确 |
| 16983 | 2024-08-07 |
Potential immunosuppressive clonal hematopoietic mutations in tumor infiltrating immune cells in breast invasive carcinoma
2023-08-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-40256-9
PMID:37573441
|
研究论文 | 本文研究了乳腺癌中肿瘤浸润免疫细胞中的克隆性造血突变，这些突变可能抑制免疫反应 | 首次研究了肿瘤浸润免疫细胞中的体细胞突变，这些突变可能通过抑制有效的抗肿瘤免疫反应来促进肿瘤生长 | 需要进一步的实验验证来确认这些突变对实体瘤进展的影响 | 识别肿瘤浸润免疫细胞中潜在的免疫抑制性克隆性造血突变 | 乳腺癌患者的肿瘤和正常血液样本中的肿瘤浸润免疫细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 外显子测序、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 乳腺癌患者的肿瘤和正常血液样本 |
| 16984 | 2024-08-05 |
Identification of immunotherapy biomarkers for improving the clinical outcome of homologous recombination deficiency patients with lung adenocarcinoma
2023-08-11, Aging
DOI:10.18632/aging.204957
PMID:37578930
|
研究论文 | 该文章研究了HRD在肺腺癌中的转录组学角色，并识别了与之相关的免疫治疗生物标志物 | 首次探讨了HRD分数与肺腺癌患者生存结果之间的相关性，并确认了MS4A6A作为潜在生物标志物的作用 | 研究缺乏广泛的临床验证和多中心数据支持 | 旨在识别与HRD相关的生物标志物，以改善肺腺癌患者的临床治疗效果 | 肺腺癌患者，特别关注HRD相关转录组变化 | 数字病理 | 肺癌 | SNP阵列数据分析、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 912名肺腺癌患者的转录组数据和9名肺腺癌患者的单细胞RNA-seq数据 |
| 16985 | 2024-08-05 |
CCIDB: a manually curated cell-cell interaction database with cell context information
2023-08-11, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baad057
PMID:37566630
|
研究论文 | 构建了一个包含细胞间互动和上下文信息的数据库（CCIDB） | 首次提供了细胞-细胞互动（CCI）的生物和临床上下文信息 | 数据库中的信息可能随着新的研究进展而过时 | 旨在为研究人员提供分析单细胞测序数据或通过分子实验研究细胞-细胞互作的资源 | 手动收集和整理来自272项研究的520个细胞间互动及其相关上下文特征 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 数据库 | 520个细胞间互动 |
| 16986 | 2024-08-07 |
Comprehensive landscape of resistance mechanisms for neoadjuvant therapy in esophageal squamous cell carcinoma by single-cell transcriptomics
2023-08-11, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-023-01518-0
PMID:37563120
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 16987 | 2024-08-07 |
Single-cell and bulk RNA sequencing reveal cancer-associated fibroblast heterogeneity and a prognostic signature in prostate cancer
2023-Aug-11, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000034611
PMID:37565899
|
研究论文 | 本研究利用单细胞和批量RNA测序技术揭示了前列腺癌中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的异质性，并构建了一个预测前列腺癌预后的CAF相关特征。 | 首次构建了一个CAF相关的预后模型，并揭示了前列腺癌中三种具有不同功能的CAF亚群。 | NA | 旨在检查前列腺癌中CAF的特性，并构建一个CAF衍生的特征来预测前列腺癌的预后。 | 前列腺癌中的癌症相关成纤维细胞（CAFs）及其在肿瘤微环境中的作用。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 单细胞RNA测序分析确定了783个CAF细胞，并在4个独立的批量RNA测序队列中验证了预后模型。 |
| 16988 | 2024-08-07 |
Plasma Exosome Proteins ILK1 and CD14 Correlated with Organ-Specific Metastasis in Advanced Gastric Cancer Patients
2023-Aug-05, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15153986
PMID:37568802
|
研究论文 | 研究探讨了胃癌患者血浆外泌体蛋白ILK1和CD14与特定器官转移的关系 | 首次详细研究了外泌体蛋白在胃癌特定器官转移中的作用 | 研究样本量较小，需要进一步的大规模研究验证 | 探究外泌体蛋白在胃癌特定器官转移中的作用及其机制 | 胃癌患者的血浆外泌体蛋白及胃癌细胞系 | 数字病理学 | 胃癌 | Nano-HPLC-MS/MS, 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质, RNA | 12名胃癌伴有特定器官转移的患者 |
| 16989 | 2024-08-07 |
Crosstalk between Cancer Cells and Cancer-Associated Fibroblasts Mediated by TGF-β1-IGFBP7 Signaling Promotes the Progression of Infiltrative Gastric Cancer
2023-Aug-04, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15153965
PMID:37568781
|
研究论文 | 本研究探讨了转化生长因子β1（TGF-β1）与胰岛素样生长因子结合蛋白7（IGFBP7）信号通路在癌相关成纤维细胞（CAFs）与癌细胞间对话中的作用，及其对浸润性胃癌进展的影响 | 首次揭示了TGF-β1通过上调IGFBP7表达，促进CAFs的活化和肿瘤进展的机制 | 研究主要基于体外实验和数据库分析，未来需进一步通过体内实验验证 | 阐明TGF-β1-IGFBP7信号通路在浸润性胃癌中的作用及其机制 | 浸润性胃癌、癌相关成纤维细胞、TGF-β1和IGFBP7信号通路 | 数字病理学 | 胃癌 | 蛋白质组学、单细胞转录组学、免疫荧光染色 | NA | 蛋白质表达数据、转录组数据 | 涉及XGC-1和MGC-803细胞系及多种组织样本 |
| 16990 | 2024-08-05 |
Continuous lifelong learning for modeling of gene regulation from single cell multiome data by leveraging atlas-scale external data
2023-Aug-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.01.551575
PMID:37577525
|
研究论文 | 该文章介绍了一种新型的深度学习方法LINGER，用于从单细胞多组学数据中推断基因调控网络。 | LINGER结合了来自不同细胞环境的大规模外部数据和转录因子基序匹配知识，以应对数据有限和参数空间广泛的挑战。 | 尽管提出了新方法，文章中并未提及LINGER的具体应用限制。 | 旨在提高基因调控网络的推断准确性。 | 以单细胞多组学数据为基础，研究基因表达和染色质可及性的数据。 | 计算生物学 | NA | 深度学习 | NA | 基因组数据 | NA |
| 16991 | 2024-08-07 |
CDDO-Methyl Ester Inhibits BRAF Inhibitor Resistance and Remodels the Myeloid Compartment in BRAF-mutant Melanoma
2023-Aug-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.01.551524
PMID:37577680
|
研究论文 | 研究探讨了CDDO-甲酯在抑制BRAF抑制剂耐药性和重塑BRAF突变黑色素瘤髓系细胞中的作用 | 首次使用scRNA-seq技术分析BRAF抑制剂耐药肿瘤中的髓系细胞群体，并证明CDDO-甲酯能恢复治疗反应 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步的人体临床试验验证 | 研究CDDO-甲酯在抑制BRAF抑制剂耐药性中的作用及其机制 | BRAF突变的黑色素瘤及其耐药性 | NA | 黑色素瘤 | scRNA-seq | NA | RNA | 使用Braf/Pten移植小鼠模型 |
| 16992 | 2024-08-05 |
ClusterDE: a post-clustering differential expression (DE) method robust to false-positive inflation caused by double dipping
2023-Aug-02, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3211191/v1
PMID:37577698
|
研究论文 | 本文提出了ClusterDE，一种能够控制假阳性率的聚类后差异表达（DE）方法 | ClusterDE通过生成基于真实数据的合成零数据，克服了传统方法中的双重引用问题 | 对一些聚类算法和差异表达测试的适应性可能存在局限性 | 研究聚类后差异表达分析中假阳性控制的方法 | 单细胞RNA-seq (scRNA-seq) 数据及其他单细胞多组学数据 | 数字病理 | NA | scRNA-seq | NA | 真实数据分析与模拟数据 | 多种真实数据及模拟数据 |
| 16993 | 2024-08-07 |
Excitatory Neurons Derived from Human-Induced Pluripotent Stem Cells Show Transcriptomic Differences in Alzheimer's Patients from Controls
2023-08-02, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12151990
PMID:37566069
|
研究论文 | 本文通过将人类诱导多能干细胞（iPSCs）分化为兴奋性神经元，并进行RNA测序，比较了阿尔茨海默病（AD）患者与对照组的转录组差异 | 发现了621个基因在AD患者与对照组的神经元中表达水平有显著差异，并与单细胞转录组研究中的AD相关基因有显著重叠和方向一致性 | NA | 旨在通过转录组分析精确识别阿尔茨海默病患者的不同生物学亚型，以促进精准医疗策略的实施 | 阿尔茨海默病患者与对照组的诱导多能干细胞分化出的兴奋性神经元 | 干细胞研究 | 阿尔茨海默病 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 8名阿尔茨海默病患者和6名对照组的iPSCs分化出的神经元 |
| 16994 | 2024-08-07 |
Deciphering the Biology of Circulating Tumor Cells through Single-Cell RNA Sequencing: Implications for Precision Medicine in Cancer
2023-Aug-02, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241512337
PMID:37569711
|
综述 | 本文综述了通过单细胞RNA测序技术研究循环肿瘤细胞的生物学特性及其在精准医学中的应用 | 利用单细胞RNA测序技术深入解析循环肿瘤细胞的转录组特征，为探索新的治疗靶点提供新视角 | 循环肿瘤细胞极为稀有且异质性强，缺乏特定标记物来识别启动转移的循环肿瘤细胞 | 全面描述当前通过单细胞RNA测序技术对循环肿瘤细胞转录组分析的研究 | 循环肿瘤细胞及其与血液中其他细胞类型的相互作用，特别是免疫系统细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 单个循环肿瘤细胞 |
| 16995 | 2024-08-05 |
The Bladder Tumor Microenvironment Components That Modulate the Tumor and Impact Therapy
2023-Aug-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241512311
PMID:37569686
|
综述 | 本综述探讨了膀胱肿瘤微环境中不同细胞类型的作用及其对免疫激活和微环境的影响 | 文章结合单细胞测序技术和临床数据，强调了肿瘤微环境中细胞互作对癌症发展的重要性 | 缺乏对具体机制的深入探讨 | 旨在更好地理解膀胱肿瘤微环境中的细胞如何共同作用 | 研究膀胱肿瘤微环境中的多种细胞类型 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序 | NA | 临床数据 | NA |
| 16996 | 2024-08-07 |
Spatial transcriptomics of the human heart
2023-08, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01918-1
PMID:37568021
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 16997 | 2024-08-07 |
Targeted Single-cell Isolation of Spontaneously Escaping Live Melanoma Cells for Comparative Transcriptomics
2023-08, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-22-0305
PMID:37575281
|
研究论文 | 本文介绍了一种新的单细胞分离技术，用于详细分析黑色素瘤生长和侵袭的三维数据，并能够分离具有不同形态和侵袭参数的自发侵袭性癌细胞 | 该技术通过表达光转换荧光蛋白，标记并分离了处于不同迁移状态的癌细胞，进行了单细胞RNA测序，为研究癌细胞在不同状态下的转录组提供了新方法 | 主要由于缺乏直接比较不同迁移状态下自发侵袭性癌细胞转录组的方法，导致调控上皮、间质和阿米巴状态之间转换的基因转录仍不完全清楚 | 研究癌细胞从上皮样状态向侵袭性迁移状态转变过程中的基因转录变化 | 黑色素瘤细胞及其在不同迁移状态下的转录组 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 462个差异表达基因 |
| 16998 | 2024-08-07 |
scNCL: transferring labels from scRNA-seq to scATAC-seq data with neighborhood contrastive regularization
2023-08-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad505
PMID:37584660
|
研究论文 | 本文提出了一种新的迁移学习方法scNCL，利用先验知识和对比学习解决scRNA-seq到scATAC-seq数据的信息传递问题 | scNCL通过引入邻域对比学习来保留scATAC-seq细胞在原始特征空间中的邻域结构，并使用特征投影损失和对齐损失来协调scRNA-seq和scATAC-seq之间的嵌入 | NA | 开发一种新的迁移学习方法，以克服scATAC-seq数据的高维度、极端稀疏性和大规模带来的细胞类型识别挑战 | scRNA-seq和scATAC-seq数据 | 机器学习 | NA | 对比学习 | NA | 基因活性矩阵 | 百万级数据集 |
| 16999 | 2024-08-07 |
Heterogeneity and Functional Analysis of Cardiac Fibroblasts in Heart Development
2023-Jul-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.30.551164
PMID:37577541
|
研究论文 | 本文通过单细胞mRNA测序和生物信息学方法分析了心脏成纤维细胞在心脏发育中的异质性和功能 | 首次系统比较了心脏成纤维细胞的转录组特征，并揭示了其在不同发育阶段的作用 | NA | 探究心脏成纤维细胞在心脏发育中的异质性和功能 | 心脏成纤维细胞及其在心脏发育中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞mRNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 18个阶段来自两种小鼠品系的心脏成纤维细胞 |
| 17000 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptome and Pigment Biochemistry Analysis Reveals the Potential for the High Nutritional and Medicinal Value of Purple Sea Cucumbers
2023-Jul-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241512213
PMID:37569587
|
研究论文 | 本文分析了紫色海参的单细胞转录组和色素生物化学，以揭示它们的营养和药用价值 | 首次通过单细胞RNA-seq揭示了海参色彩形态的基因活性和相应的细胞群体 | 缺乏对活性化学物质来源的深入了解 | 研究紫色海参的营养和药用价值，及其色素的生物化学机制 | 紫色海参及其色素合成相关细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA |