单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27621 篇文献，本页显示第 16981 - 17000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16981 | 2024-08-05 |
A robust platform for integrative spatial multi-omics analysis to map immune responses to SARS-CoV-2 infection in lung tissues
2023-Nov, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13679
PMID:37605469
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研究论文 | 开发了一种创新的空间多组学平台以研究COVID-19感染的肺组织 | 结合了五种组织分析技术与新颖的计算映射方法以深度表征肺部对病毒感染的反应 | 研究中对于深层组织特征描绘的局限性尚未被完全消除 | 深入理解SARS-CoV-2对肺部细胞环境的影响 | COVID-19感染和未感染的肺组织样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学与蛋白质组学 | NA | 组织样本 | 包含COVID-19感染和未感染的肺组织样本的比较 |
| 16982 | 2024-08-07 |
GPR109A expressed on medullary thymic epithelial cells affects thymic Treg development
2023-11, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350521
PMID:37595951
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研究论文 | 本研究探讨了GPR109A在胸腺髓质上皮细胞中的表达对胸腺Treg细胞发育的影响 | 首次发现GPR109A在胸腺髓质上皮细胞中的表达影响胸腺Treg细胞的发育 | NA | 研究GPR109A在胸腺Treg细胞发育中的作用 | GPR109A在胸腺髓质上皮细胞中的表达及其对Treg细胞发育的影响 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | RNA | 小鼠和人类样本 |
| 16983 | 2024-08-07 |
Identification an innovative classification and nomogram for predicting the prognosis of thyroid carcinoma patients and providing therapeutic schedules
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05252-6
PMID:37596371
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研究论文 | 本研究探讨了程序性细胞死亡（PCD）模式与甲状腺癌患者预后的关系，并基于PCD基因开发了一个预测模型 | 本研究首次深入分析了多种细胞死亡模式，开发了一种新的PCD模型，能够准确预测甲状腺癌患者的临床预后和药物敏感性 | NA | 探讨程序性细胞死亡模式与甲状腺癌预后的关系，并开发一个基于PCD基因的预测模型 | 甲状腺癌患者及其预后和药物敏感性 | 机器学习 | 甲状腺癌 | 非负矩阵分解（NMF） | 支持向量机（SVM） | 基因表达谱 | 568名甲状腺癌患者 |
| 16984 | 2024-08-07 |
Fasting-Mimicking Diet Drives Antitumor Immunity against Colorectal Cancer by Reducing IgA-Producing Cells
2023-11-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-0323
PMID:37602826
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研究论文 | 本研究探讨了模拟禁食饮食（FMD）通过减少产生IgA的细胞来驱动结直肠癌的抗肿瘤免疫的作用机制 | 首次揭示了FMD通过抑制B细胞向IgA类别转换来延缓肿瘤生长，并通过增强脂肪酸氧化（FAO）触发RUNX3乙酰化，从而抑制Cα基因转录和IgA类别转换 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步的人体临床试验来验证FMD在人类结直肠癌治疗中的效果 | 阐明FMD诱导的代谢重编程在激活结直肠癌抗肿瘤免疫中的作用 | 结直肠癌及其免疫细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠结直肠癌模型 |
| 16985 | 2024-08-07 |
Expressed Barcoding Enables High-Resolution Tracking of the Evolution of Drug Tolerance
2023-11-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-0144
PMID:37603596
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研究论文 | 本研究利用表达条形码系统结合单细胞RNA测序技术，高分辨率地追踪了非小细胞肺癌患者中EGFR突变细胞对EGFR抑制剂耐药性的起源和克隆进化 | 首次使用表达条形码系统结合单细胞RNA测序技术，实现对药物耐受细胞克隆进化的纵向基因表达和药物敏感性分析 | NA | 阐明敏感细胞与耐药存活细胞之间的生物学差异，以及耐药细胞如何响应治疗，以提高EGFR抑制剂的疗效 | 非小细胞肺癌中EGFR突变细胞对EGFR抑制剂的耐药性 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 表达条形码系统 | 基因表达数据 | 大量克隆 |
| 16986 | 2024-08-07 |
Solute carrier (SLC) expression reveals skeletogenic cell diversity
2023-11, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2023.08.004
PMID:37611888
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了紫海胆晚期胚胎阶段的转运蛋白表达模式，揭示了细胞类型的多样性 | 通过基于转运蛋白的聚类分析，发现了跨细胞谱系共享及特定细胞类型独有的转运蛋白表达模式 | NA | 探索紫海胆晚期胚胎阶段ABC和SLC家族转运蛋白的表达模式 | 紫海胆晚期胚胎阶段的细胞类型多样性 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 紫海胆晚期胚胎阶段的细胞样本 |
| 16987 | 2024-08-05 |
Metformin rescues migratory deficits of cells derived from patients with periventricular heterotopia
2023-Oct-11, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.15252/emmm.202216908
PMID:37609821
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研究论文 | 本文研究了来自腔旁神经异位患者的细胞迁移缺陷及其恢复机制 | 发现通过调节自噬可以改善来自腔旁神经异位患者的神经前体细胞迁移缺陷 | 本研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类病理情况 | 探讨腔旁神经异位患者神经前体细胞迁移缺陷的机制及其恢复方法 | 来自腔旁神经异位患者的人类神经前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、电子显微镜分析、Western blot分析 | NA | 细胞样本 | NA |
| 16988 | 2024-08-07 |
Characterization of ccl20a.3 and ccl20l as gene markers for Th17 cell in turbot
2023-Oct, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2023.109005
PMID:37604262
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术在比目鱼中鉴定了Th17细胞特异性表达的两个趋化因子相关基因ccl20a.3和ccl20l | 首次在比目鱼中鉴定出Th17细胞特异性表达的ccl20a.3和ccl20l基因，并通过实验验证了它们在Th17细胞中的表达模式和功能 | NA | 旨在阐明Th17细胞在硬骨鱼中的功能及其特异性基因标记 | 比目鱼中的Th17细胞及其相关基因ccl20a.3和ccl20l | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 16989 | 2024-08-07 |
Cellular senescence primes liver fibrosis regression through Notch-EZH2
2023-Oct, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.346
PMID:37614965
|
研究论文 | 本文研究了细胞衰老通过Notch-EZH2途径促进肝纤维化逆转的机制 | 首次揭示了细胞衰老通过Notch-EZH2途径影响肝纤维化逆转的机制，并证明了清除衰老细胞和阻断EZH2信号可以减缓肝纤维化进程 | NA | 探讨细胞衰老在肝纤维化逆转中的作用及其分子机制 | 肝纤维化逆转过程中的细胞衰老及其分子机制 | NA | 肝纤维化 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用dasatinib和quercetin清除衰老细胞，以及通过EPZ6438阻断EZH2信号进行实验 |
| 16990 | 2024-08-07 |
Differential variability analysis of single-cell gene expression data
2023-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad294
PMID:37598422
|
研究论文 | 本文提出并比较了12种统计流程，用于分析单细胞基因表达数据的差异变异性 | 本文首次提出并比较了多种统计方法组合，用于量化和测试细胞间转录变异性的差异 | NA | 确定单细胞基因表达数据差异变异性分析的最佳实践 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | COVID-19, 自闭症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 高质量的合成scRNA-seq数据集，COVID-19和自闭症患者的scRNA-seq数据集 |
| 16991 | 2024-08-07 |
A pan-cancer single-cell panorama of human natural killer cells
2023-09-14, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2023.07.034
PMID:37607536
|
研究论文 | 本研究通过综合单细胞RNA测序分析，描绘了来自716名涵盖24种癌症类型的患者的NK细胞在肿瘤微环境中的表型和功能多样性 | 发现了肿瘤相关NK细胞群，这些细胞在肿瘤中富集，表现出受损的抗肿瘤功能，并与不良预后和免疫治疗抵抗相关 | NA | 探究NK细胞在肿瘤微环境中的表型和功能多样性及其在癌症免疫中的作用 | 人类自然杀伤细胞（NK细胞）及其在不同癌症类型中的表现 | 数字病理学 | 多种癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 716名癌症患者 |
| 16992 | 2024-08-07 |
Deciphering the landscape of transcriptional heterogeneity across cancer
2023-09-11, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.07.008
PMID:37595585
|
研究论文 | 通过整合77项研究和24种癌症类型的scRNA-seq数据集，揭示了癌症中转录异质性的复发性基因表达模式及其功能意义 | 首次大规模整合多个癌症类型的scRNA-seq数据，揭示了癌症转录异质性的复发性模式 | NA | 探索癌症中转录异质性的基因表达模式及其功能意义 | 77项研究和24种癌症类型的scRNA-seq数据 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 涉及77项研究和24种癌症类型 |
| 16993 | 2024-08-05 |
CellAnn: a comprehensive, super-fast, and user-friendly single-cell annotation web server
2023-09-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad521
PMID:37610325
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为CellAnn的参考基础细胞注释网络服务器，具有超快和易于使用的特点 | CellAnn整合了全面的参考数据库和新的簇对簇对齐方法，提供更高的准确性和可扩展性 | 传统的参考基础方法在可扩展性和预处理参考数据集的缺乏上存在局限 | 研究旨在提供一种高效、用户友好的单细胞注释工具 | 研究对象为204个人类和191只小鼠的单细胞数据集，涉及32个器官 | 数字病理 | NA | 单细胞测序 | NA | 数据集 | 204个人类单细胞数据集和191只小鼠单细胞数据集 |
| 16994 | 2024-08-05 |
Inhibition of Wnt activity improves peri-implantation development of somatic cell nuclear transfer embryos
2023-Sep, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwad173
PMID:37593113
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研究论文 | 这篇文章探讨了抑制Wnt活性对体细胞核转移(SCNT)胚胎围植入发育的影响 | 首次发现持续的Wnt信号阻碍了外胚层细胞向成熟多能性转变，并通过操控Wnt信号显著提高了克隆效率 | 尚未阐明SCNT胚胎在围植入阶段停滞的潜在机制 | 研究Wnt信号在SCNT胚胎围植入阶段发育中的作用 | 体细胞核转移胚胎的围植入发育 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 16995 | 2024-08-05 |
MacroH2A restricts inflammatory gene expression in melanoma cancer-associated fibroblasts by coordinating chromatin looping
2023-09, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-023-01208-7
PMID:37605008
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研究论文 | 本文揭示了MacroH2A在黑色素瘤癌相关成纤维细胞中的肿瘤抑制作用 | 首次确定了MacroH2A在肿瘤微环境中的作用及其对基因表达的调节机制 | 本研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类黑色素瘤的特点 | 探讨MacroH2A在黑色素瘤微环境中的作用及其机制 | 主要研究黑色素瘤癌相关成纤维细胞及其表型变化 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组学，空间转录组学 | NA | NA | 使用了免疫合成小鼠模型进行实验 |
| 16996 | 2024-08-05 |
Current status and prospects of GREM1 research in cancer (Review)
2023-Sep, Molecular and clinical oncology
IF:1.4Q4
DOI:10.3892/mco.2023.2665
PMID:37614374
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综述 | 本文回顾了GREM1在癌症中的作用和功能 | 探讨了GREM1在不同类型肿瘤中的不同作用，提供了GREM1作为诊断和预后指标的潜力 | 缺乏对GREM1在所有肿瘤类型中的全面分析 | 研究GREM1在肿瘤中的作用及其生物功能 | 检视GREM1在乳腺癌、结肠癌及其他肿瘤类型的作用 | 数字病理学 | 胰腺癌、乳腺癌、结肠癌 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 16997 | 2024-08-07 |
Efficacy of antiviral therapy and host-virus interactions visualised using serial liver sampling with fine-needle aspirates
2023-Sep, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2023.100817
PMID:37600958
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研究论文 | 本文通过使用细针抽吸术进行连续肝脏采样，研究了抗病毒治疗对慢性乙型肝炎患者病毒复制的影响，并揭示了宿主与病毒的相互作用。 | 采用细针抽吸术和单细胞RNA测序技术，捕捉抗病毒治疗对HBV复制状态的动态影响，并揭示了感染肝细胞中的宿主-病原体相互作用。 | 技术限制和采样频率的限制是测量治疗开始后HBV转录实际变化的障碍。 | 研究抗病毒治疗对慢性乙型肝炎患者病毒复制的影响及其机制。 | 慢性乙型肝炎患者的肝脏样本和病毒复制状态。 | 数字病理学 | 肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 慢性乙型肝炎患者的肝脏细针抽吸样本，基线及治疗后12周和24周。 |
| 16998 | 2024-08-07 |
Deciphering colorectal cancer progression features and prognostic signature by single-cell RNA sequencing pseudotime trajectory analysis
2023-Sep, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2023.101491
PMID:37601456
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，通过伪时间轨迹分析揭示结直肠癌进展特征和预后标志物 | 本研究首次使用单细胞RNA测序技术结合伪时间轨迹分析，深入研究结直肠癌的肿瘤内异质性和细胞动态事件 | 研究使用的数据集来自单一医疗机构，可能存在样本偏倚 | 探索结直肠癌的进展特征和开发新的预后标志物 | 结直肠癌的肿瘤上皮细胞亚型和相关基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO Cox回归 | 单细胞RNA测序数据 | 使用三星医疗中心（SMC）的结直肠癌单细胞RNA测序数据集 |
| 16999 | 2024-08-07 |
Homologous recombination deficiency serves as a prognostic biomarker in clear cell renal cell carcinoma
2023-Sep, Experimental and therapeutic medicine
IF:2.4Q3
DOI:10.3892/etm.2023.12128
PMID:37602311
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研究论文 | 本研究探讨了同源重组缺陷（HRD）在肾透明细胞癌（KIRC）中的预后生物标志物作用 | 首次揭示了HRD阳性肿瘤中免疫相关信号通路的激活以及肿瘤微环境中耗竭的CD8+ T细胞信号的富集 | NA | 研究HRD在KIRC中的预后价值及其对肿瘤微环境的影响 | 肾透明细胞癌患者 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组和转录组数据 | 501名KIRC患者 |
| 17000 | 2024-08-07 |
Identifying oxidative stress-related biomarkers in idiopathic pulmonary fibrosis in the context of predictive, preventive, and personalized medicine using integrative omics approaches and machine-learning strategies
2023-Sep, The EPMA journal
DOI:10.1007/s13167-023-00334-4
PMID:37605652
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研究论文 | 本研究通过综合组学方法和机器学习策略，在预测性、预防性和个性化医学框架下，识别特发性肺纤维化中与氧化应激相关的生物标志物。 | 本研究首次通过综合组学数据和机器学习方法，对特发性肺纤维化患者进行氧化应激相关基因的分类，并构建了基于五个诊断标志物的诺模图模型，为个性化抗氧化和抗纤维化治疗提供了参考。 | 本研究仅基于250名患者的转录组数据进行分析，样本量相对较小，可能影响结果的普遍性和可靠性。 | 旨在通过综合组学方法和机器学习策略，识别特发性肺纤维化中与氧化应激相关的生物标志物，以促进预测性、预防性和个性化医学的发展。 | 特发性肺纤维化患者及其氧化应激相关基因和临床指标。 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 转录组学 | 机器学习 | 转录组数据 | 250名特发性肺纤维化患者 |