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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1681 | 2026-04-25 |
Targeting the NSUN5-circPPAP2A axis reverses immunosuppression and sensitizes renal cell carcinoma to anti-PD-1 therapy
2026-Jul-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218466
PMID:41967697
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研究论文 | 揭示NSUN5-circPPAP2A轴在肾透明细胞癌中通过调控HIF-2α信号和免疫抑制微环境导致治疗抵抗,并证明靶向该轴可增强抗PD-1疗效 | 首次发现circRNA的m5C修饰通过NSUN5/circPPAP2A/YBX1轴协同激活HIF-2α信号和诱导免疫抑制,区别于以往仅关注mRNA的研究 | 未在更大规模队列或不同种族人群中验证,且纳米颗粒递送系统的临床转化可行性尚需进一步评估 | 阐明肾透明细胞癌中circRNA的m5C修饰机制及其临床意义,探索克服HIF-2α靶向治疗和免疫治疗双重耐药的新策略 | 肾透明细胞癌患者临床样本、细胞系、小鼠模型 | 机器学习 | 肾癌 | m5C-MeRIP-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, RIP, RNA pull-down, ChIP-qPCR | NA | 基因表达数据, 测序数据 | 临床样本(TCGA、ICGC队列及SYSU队列) | Illumina | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | Illumina NovaSeq | NA |
| 1682 | 2026-04-25 |
ACAT1-mediated lactylation reprogramming governs immune-stromal crosstalk in ulcerative colitis
2026-Jun-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116626
PMID:41955702
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research paper | 通过整合分析发现ACAT1通过调控乳酸化修饰在溃疡性结肠炎中发挥关键作用,并揭示了免疫-基质细胞间的相互作用网络 | 首次系统鉴定ACAT1作为溃疡性结肠炎中乳酸化修饰的核心调控基因,并构建乳酸化亚型分层系统,阐明其介导的免疫-基质细胞互作机制 | 研究主要基于生物信息学分析和动物模型验证,缺乏大规模临床样本验证,分子机制的具体下游靶点尚待进一步阐明 | 探究乳酸化修饰在溃疡性结肠炎发病机制中的作用及其潜在治疗靶点 | 溃疡性结肠炎患者结肠组织样本,GEO数据集,小鼠结肠炎模型,体外细胞实验 | machine learning | 溃疡性结肠炎 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 分子对接 | 高斯混合模型, 支持向量机, 随机森林, 梯度提升机, XGBoost, LASSO回归 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | GEO多个数据集包括健康对照和溃疡性结肠炎患者样本,具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1683 | 2026-04-25 |
Licochalcone A from Ma-Xing-Shi-Gan decoction to prevent Asthma through the inhibition of ferroptosis CD4+ T Cell by GART/HSP90α signaling pathway
2026-Jun-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116549
PMID:41967212
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研究论文 | 探究麻杏石甘汤中的甘草查尔酮A通过GART/HSP90α信号通路抑制CD4+ T细胞铁死亡预防哮喘的机制 | 首次发现甘草查尔酮A通过抑制GART/HSP90α信号通路调控T细胞铁死亡来预防哮喘,并利用单细胞RNA测序鉴定GART为关键靶点 | 研究仅在动物模型和体外实验中进行,缺乏人体临床试验验证;未深入探讨GART/HSP90α信号通路在其他呼吸系统疾病中的作用 | 揭示甘草查尔酮A预防哮喘的分子机制,重点关注T细胞铁死亡及GART/HSP90α信号通路的调控作用 | 雌性裸鼠和BALB/c小鼠的哮喘模型以及体外T细胞 | 计算机视觉 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本量,涉及多组小鼠模型实验 | NA | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 未明确说明具体平台配置 |
| 1684 | 2026-04-25 |
Myocardin-related transcription factor A contributes to diabetic nephropathy by activating integrin β2 in macrophages
2026-Jun-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2026.124394
PMID:41990912
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研究论文 | 本研究探讨了心肌相关转录因子A(MRTF-A)通过激活巨噬细胞中的整合素β2(Itgb2)促进糖尿病肾病发展的机制 | 首次发现巨噬细胞中MRTF-A通过激活Itgb2转录促进糖尿病肾病,并利用单细胞RNA测序分析证实两者在糖尿病肾病小鼠模型中的相关性 | 未提及具体局限性 | 探究巨噬细胞来源的MRTF-A对糖尿病肾病发病机制的作用 | 巨噬细胞条件性敲除MRTF-A小鼠和巨噬细胞条件性过表达MRTF-A小鼠 | 自然语言处理 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统 |
| 1685 | 2026-04-25 |
Deciphering transcriptome alterations in bone marrow immune cells at single-cell resolution under denosumab treatment
2026-Jun-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116663
PMID:41997054
|
研究论文 | 通过单细胞分辨率解析地诺单抗治疗下骨髓免疫细胞的转录组变化 | 首次在单细胞水平上揭示了地诺单抗(抗RANKL抗体)治疗后骨髓骨免疫微环境的变化,包括Mmp8hi mNeu中性粒细胞亚群的扩增及其与巨噬细胞通过THBS1-CD36信号通路的相互作用 | 需要进一步研究Mmp8hi mNeu和中性粒细胞-巨噬细胞相互作用对免疫平衡的影响 | 评估地诺单抗治疗下骨髓骨免疫微环境的变化 | 成年雌性小鼠的骨髓细胞 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫荧光 | NA | 基因表达数据 | 治疗组和对照组小鼠骨髓细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1686 | 2026-04-25 |
Beyond polarization: single-cell atlas unveils macrophage heterogeneity and neuro-immune crosstalk in bone regeneration
2026-Jun-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116592
PMID:41931958
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示了骨再生过程中巨噬细胞的异质性和神经-免疫互作 | 首次系统揭示骨再生微环境中巨噬细胞的8个异质性亚群,并发现OB和OC巨噬细胞高表达G蛋白偶联受体基因,可受神经信号调控,外源性神经生长因子补充能激活神经反应并加速骨修复 | 未提及具体局限性 | 全面分析和定义骨再生环境中巨噬细胞的异质性 | 骨缺损区域的巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 8148个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1687 | 2026-04-25 |
Sirt1 deficiency promotes dynamic fibroblast-to-myofibroblast transition in ligamentum flavum hypertrophy via the Smad2/3 pathway
2026-Jun-01, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2026.115003
PMID:41932595
|
研究论文 | 本研究探讨了Sirt1缺乏通过Smad2/3通路促进黄韧带肥厚中成纤维细胞向肌成纤维细胞转化的机制 | 首次利用单细胞RNA测序揭示Sirt1在黄韧带肥厚纤维化进程中的动态调控作用,并验证Sirt1过表达的治疗潜力 | 信息不足,无法提供 | 阐明Sirt1在黄韧带肥厚中调控成纤维细胞向肌成纤维细胞转化的分子机制 | 人黄韧带样本、大鼠黄韧带肥厚模型、黄韧带细胞 | 机器学习 | 脊柱疾病 | 单细胞RNA测序、组织学分析、免疫组化、分子生物学分析 | NA | 基因表达数据 | 人黄韧带样本和大鼠模型样本,具体数量未说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1688 | 2026-04-25 |
Nanoplastics enhance F-53B uptake and synergistically induce colonic inflammation via activation of the B cell receptor pathway
2026-Jun-01, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2026.128096
PMID:41962818
|
研究论文 | 纳米塑料增强了F-53B的摄取,并通过激活B细胞受体通路协同诱导结肠炎症 | 首次揭示纳米塑料与F-53B共暴露通过激活B细胞受体通路和NF-κB信号通路协同加剧肠道炎症的机制 | 具体样本量未在摘要中说明,仅限于小鼠模型和体外细胞实验 | 探究纳米塑料与F-53B共暴露的生物分布及肠道毒性机制 | 纳米塑料、微塑料、F-53B、Caco-2细胞、小鼠 | 机器学习 | 肠道炎症 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1689 | 2026-04-25 |
Identification of potential therapeutic target SPP1 and related RNA regulatory pathway in FECD through bioinformatics
2026-May-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115591
PMID:42028016
|
研究论文 | 通过生物信息学方法鉴定FECD的潜在治疗靶点SPP1及相关RNA调控通路 | 首次结合多个GEO数据集和单细胞RNA测序,鉴定了SPP1作为FECD的潜在生物标志物和治疗靶点,并提出了/miR-181b-5p/轴的RNA调控通路 | 研究主要基于公开数据集和动物模型验证,缺乏临床样本的进一步验证 | 发现FECD的新生物标志物和疾病进展机制 | Fuchs内皮角膜营养不良的角膜内皮细胞 | 机器学习 | 遗传性眼病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三个GEO角膜内皮数据集及大鼠内皮损伤和EndMT模型 | NA | scRNA-seq | NA | NA |
| 1690 | 2026-04-25 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Bidirectional Development of Infantile Hemangioma
2026-May, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.10.593
PMID:41177260
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示婴儿血管瘤的双向发育机制 | 首次对婴儿血管瘤增殖期进行单细胞RNA测序,构建细胞图谱,发现血管瘤壁细胞释放VEGFA和PGF促进内皮细胞增殖,并揭示肾上腺素受体在不同细胞类型中的特异性表达 | 样本数量有限(仅3名婴儿),且仅关注增殖期,缺乏对其他阶段的比较 | 深入理解婴儿血管瘤的细胞机制和潜在治疗靶点 | 3名婴儿血管瘤患者的血管瘤组织样本 | 单细胞组学 | 婴儿血管瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例婴儿血管瘤样本,共36,237个高质量细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 1691 | 2026-04-25 |
Focal Adhesion Kinase-Dependent Reprogramming of IFN-γ Signaling through PYK2 Coinhibition Sensitizes Melanoma to Immune Checkpoint Blockade
2026-May, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.09.376
PMID:41101630
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研究论文 | 本研究明确了FAK和PYK2在IFN-γ介导的免疫检查点阻断耐药中的不同作用,通过磷酸化组学分析及小鼠模型揭示了联合抑制FAK和PYK2可增强CD8 T细胞介导的肿瘤杀伤,并克服黑色素瘤对免疫治疗耐药 | 首次区分FAK(主要支架)和PYK2(辅助)在IFN-γ信号重编程中的特定角色,发现联合靶向二者可实现最大程度免疫增敏,且通过单细胞RNA测序揭示肿瘤细胞与免疫细胞中FAK/PYK2表达差异 | 研究主要基于抗PD-1耐药小鼠模型和公共数据集,需在更广泛临床样本中验证;PYK2抑制的长期安全性及联合治疗的最佳剂量未明确 | 探究FAK和PYK2在IFN-γ介导的黑色素瘤免疫检查点阻断耐药中的功能差异及治疗潜力 | 抗PD-1耐药的黑色素瘤小鼠模型、TCGA-SKCM队列及GSE91061临床数据集 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 无标磷酸化蛋白质组学, 单细胞RNA测序 | NA | 磷酸化蛋白质组数据, 单细胞转录组数据, 临床转录组数据 | 小鼠模型(样本数未提及);TCGA-SKCM队列(约470例);GSE91061数据集(约100例黑色素瘤患者) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1692 | 2025-11-16 |
Spatial Transcriptomics and Proteomics of Mycosis Fungoides Biopsies from Skin of Color Patients Reveal Biomarkers and Potential Treatment Targets
2026-May, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.10.608
PMID:41237899
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1693 | 2026-04-25 |
Lifestyle shapes preclinical social and microglial deficits in an Alzheimer's disease mouse model
2026-May, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03368-4
PMID:41388145
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研究论文 | 该研究利用新型富集范式对阿尔茨海默病敲入小鼠模型进行跟踪,发现其临床前阶段存在社会行为和免疫系统的早期缺陷 | 首次在阿尔茨海默病敲入小鼠模型中证明临床前阶段并非静默,而是存在多领域(包括社会行为、神经可塑性和免疫)相互交织的早期变化,并通过单细胞RNA测序揭示环境富集对干扰素响应小胶质细胞的抑制作用 | 该小鼠模型为简化的敲入模型,可能无法完全模拟人类阿尔茨海默病的复杂性;研究仅追踪至7个月龄,长期效果未评估 | 探究阿尔茨海默病临床前阶段的社会行为和免疫变化,以及环境富集对其的影响 | 阿尔茨海默病App敲入小鼠及其对照小鼠 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠数量未明确,但跟踪至7个月龄,包含不同时间点的行为学、血浆和小胶质细胞分析 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 1694 | 2026-04-25 |
Dysfunctional Dendritic Cells in Radiation-Induced Jaw Injury: Insights From Single-Cell Transcriptomic Analysis of the Osteoimmune Microenvironment
2026-05, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.70088
PMID:41424393
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示辐射诱导颌骨损伤中树突状细胞的功能失调 | 首次在单细胞分辨率下全面解析辐射诱导颌骨损伤的骨免疫微环境,发现迁移性树突状细胞功能受损及SPP1/CD44/NF-κB信号通路的关键作用 | 未提及具体局限性 | 探究辐射诱导颌骨损伤中骨免疫微环境的细胞和分子机制 | 小鼠下颌骨骨髓细胞 | 数字病理学 | 辐射诱导颌骨损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未提及具体样本数量 | 未提及 | 单细胞RNA-seq | 未提及 | 未提及 |
| 1695 | 2026-04-25 |
Alterations in NK Cell Function and Glucose Metabolism Characteristics in Patients With Progressive Hepatocellular Carcinoma
2026-05, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.70095
PMID:41500969
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和流式细胞术,研究进行性肝细胞癌患者NK细胞功能与葡萄糖代谢特征的改变 | 首次在单细胞水平揭示进行性肝细胞癌中TIM3+ NK细胞亚群的耗竭表型及糖酵解代谢重编程机制 | 样本量较小(6例患者),未纳入健康对照组,且未进行功能验证实验 | 阐明进行性肝细胞癌中NK细胞免疫抑制与代谢异常的特征及其机制 | 进行性肝细胞癌患者和稳定性肝细胞癌患者的外周血、肿瘤组织及癌旁组织 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、多色流式细胞术、多色荧光分析 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 6例初治肝细胞癌患者(3年随访分为进行组和稳定组) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 1696 | 2026-04-25 |
Semaphorin 3C/Plexin D1 Interaction Regulates Collagen Metabolism in Keloid Fibroblasts via the Transforming Growth Factor-β1 Signaling Pathway
2026-May, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2026.02.007
PMID:41833636
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和实验验证,揭示SEMA3C/PLXND1通路通过TGF-β1信号调控瘢痕疙瘩成纤维细胞胶原代谢 | 首次证明SEMA3C/PLXND1轴通过激活TGF-β1驱动瘢痕疙瘩纤维化,促进细胞外基质沉积,为瘢痕疙瘩治疗提供新靶点 | 未提及明显局限性 | 探究SEMA3C/PLXND1通路在瘢痕疙瘩发病机制中的作用 | 瘢痕疙瘩成纤维细胞 | 机器学习 | 瘢痕疙瘩 | scRNA-seq, 转录组测序, RT-qPCR, Western blot, 免疫荧光 | NA | 基因表达数据 | 8个瘢痕疙瘩和8个正常皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1697 | 2026-04-25 |
Single-cell and spatial transcriptomics identify PGK1-sensitized hypoxia macrophages as a therapeutic target to overcome PDT resistance in glioma
2026-May, Journal of photochemistry and photobiology. B, Biology
DOI:10.1016/j.jphotobiol.2026.113430
PMID:41880777
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学鉴定PGK1致敏的缺氧肿瘤相关巨噬细胞,并揭示其在胶质瘤光动力疗法抵抗中的关键作用 | 首次结合单细胞和空间转录组学技术,在配对的人胶质瘤样本中系统解析缺氧肿瘤相关巨噬细胞的代谢重编程机制,并发现PGK1-PDHK1磷酸化与SPP1-CD44旁分泌轴共同驱动光动力疗法抵抗 | 研究主要基于体外功能实验和原位小鼠模型,仍需在更大临床队列中验证靶向PGK1或SPP1的治疗潜力 | 阐明缺氧肿瘤相关巨噬细胞在胶质瘤光动力疗法抵抗中的作用机制,并探索新的治疗靶点 | 人胶质瘤配对样本(治疗前与复发后),以及原位小鼠模型 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫共沉淀, 原位小鼠模型 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 配对的人胶质瘤样本(治疗前与复发后) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium FFPE |
| 1698 | 2026-04-25 |
[Half a century of gene expression analysis : The path to modern spatial transcriptomics in autopsy tissue]
2026-May, Pathologie (Heidelberg, Germany)
DOI:10.1007/s00292-026-01551-0
PMID:41979651
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综述 | 回顾基因表达分析五十年发展,重点介绍现代空间转录组学在尸检组织中的应用并评估当前平台 | 首次系统评估Visium HD、GeoMx、CosMx和Xenium等平台在FFPE和尸检组织中的分辨率、适用性和挑战 | RNA质量对FFPE和尸检样本分析可靠性构成关键制约因素 | 呈现基因表达分析的方法学发展并评估当前空间转录组学平台 | FFPE组织和尸检组织样本 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像 | NA | 10x Genomics, NanoString, 华大智造 | 空间转录组学 | Visium HD, GeoMx, CosMx, Xenium | Visium HD用于FFPE组织分析,GeoMx和CosMx用于空间转录组学分析,Xenium用于亚细胞分辨率基因表达分析 |
| 1699 | 2026-04-25 |
Patterns of mitochondrial ATP predict tissue folding
2026-Apr-24, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aee6175
PMID:42018613
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研究论文 | 研究发现线粒体ATP模式可预测组织折叠 | 首次揭示化学能以空间模式驱动组织折叠,并通过多物种实验验证线粒体富集与ATP增加对组织折叠的预测能力 | NA | 探索胚胎发育中组织形状构建的化学能量模式及其调控机制 | 果蝇、鸡和小鼠胚胎中的上皮细胞 | 计算生物学 | NA | 时间延时成像、空间转录组学、氧消耗速率测量 | 计算预测模型 | 时间序列图像、空间转录组数据、代谢率数据 | 果蝇、鸡和小鼠胚胎样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1700 | 2026-04-25 |
High altitude-mediated immune remodeling accelerates aging
2026-Apr-24, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aeb5599
PMID:42018634
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研究论文 | 通过多组学分析揭示高原环境诱导的免疫重塑加速衰老进程的机制 | 首次结合人类群体数据和模拟高原缺氧的小鼠模型,利用单细胞RNA测序和空间增强分辨率组学测序,系统描绘高原免疫重塑特征,并发现其与加速肠道衰老的关联 | 研究主要基于高海拔人群和小鼠模型,可能无法完全反映其他海拔环境或长期暴露的影响 | 探究高海拔介导的免疫重塑如何加速衰老轨迹 | 青藏高原海拔3656米(拉萨)和5070米(推瓦村)的居民,以及模拟5000米缺氧条件下的小鼠 | 免疫学与衰老研究 | 高原相关病理生理过程 | 单细胞RNA测序、空间增强分辨率组学测序(Stereo-seq) | NA | 单细胞基因表达数据、空间转录组数据 | 高海拔人群队列(具体样本量未说明)和小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, Stereo-seq | 10x Chromium单细胞3'测序, Stereo-seq空间转录组学 |