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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1681 | 2026-03-01 |
Machine learning and single-cell RNA sequencing analyses identify MS-related monocytes and a five-gene candidate biomarker signature
2026, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2026.1739231
PMID:41756175
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研究论文 | 本研究结合机器学习与单细胞RNA测序分析,识别了与多发性硬化相关的单核细胞及一个五基因候选生物标志物签名 | 首次整合机器学习算法与单细胞RNA测序数据,系统性识别并验证了五个关键基因作为多发性硬化的候选生物标志物 | 研究主要基于实验性自身免疫性脑脊髓炎模型数据,临床样本验证有限 | 识别与多发性硬化相关的单核细胞生物标志物,以改善疾病诊断和风险分层 | 多发性硬化相关的单核细胞及基因表达 | 机器学习 | 多发性硬化 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 免疫荧光 | 逻辑回归, LDA, SVM, 朴素贝叶斯, KNN, Rpart, 随机森林 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1682 | 2026-03-01 |
Repurposed Acarbose Targets Nidogen-1 to Remodel the Tumor Stroma and Suppress Portal Vein Tumor Thrombus in Hepatocellular Carcinoma
2026, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.1161
PMID:41756725
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了肝细胞癌门静脉癌栓的免疫-基质特征,并发现阿卡波糖可通过靶向Nidogen-1重塑肿瘤基质,抑制癌栓进展 | 首次构建了PVTT微环境的空间图谱,揭示了巨噬细胞向肌成纤维样癌症相关成纤维细胞的转化过程,并首次将已获批药物阿卡波糖重新用于靶向NID1轴以改善免疫治疗反应 | 样本量相对有限(99个样本来自47名患者),且临床队列为回顾性分析,需要进一步的前瞻性临床试验验证 | 探究肝细胞癌门静脉癌栓的分子机制和免疫特征,并开发新的治疗策略 | 肝细胞癌患者样本(包括肿瘤组织和门静脉癌栓) | 数字病理学 | 肝细胞癌 | nCounter分析、单细胞RNA测序、数字空间分析、蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据、蛋白质数据 | 99个样本来自47名患者,另有一个独立临床队列包含810名肝细胞癌患者 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、蛋白质组学 | NA | NA |
| 1683 | 2026-03-01 |
Single-cell transcriptomics reveals dynamic reprogramming of testicular immunity in Brucella-infected goat testis
2025-Nov-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了布鲁氏菌感染的山羊睾丸组织中免疫微环境的动态转录重编程 | 首次在单细胞分辨率下描绘了布鲁氏菌感染后睾丸免疫微环境的动态重塑,并识别出硫氧还蛋白相互作用蛋白(TXNIP)作为潜在的免疫治疗靶点 | 研究仅在山羊模型中进行,结果向其他物种或人类的直接外推需谨慎;机制验证实验(如功能缺失/获得)未在文中报告 | 阐明布鲁氏菌感染导致睾丸免疫病理的分子机制,并寻找免疫调节干预的潜在靶点 | 山羊睾丸组织(生理状态与布鲁氏菌感染状态) | 数字病理学 | 布鲁氏菌病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1684 | 2026-03-01 |
Integrated single-nuclei and spatial transcriptomic profiling of human sacrococcygeal teratomas reveals heterogeneity in cellular composition and X-chromosome inactivation
2025-Jul-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.21.665156
PMID:40777431
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研究论文 | 本研究通过整合单核RNA测序和空间转录组学技术,揭示了人类骶尾部畸胎瘤的细胞组成异质性和X染色体失活状态 | 首次结合单核RNA-seq和空间转录组学分析SCTs,发现X染色体双等位基因表达与细胞身份和性别偏见的关联 | 样本量较小(仅8个肿瘤),且未检测到假定的多能细胞群 | 探究骶尾部畸胎瘤的细胞起源、临床分层和性别偏见机制 | 人类骶尾部畸胎瘤组织样本 | 数字病理学 | 骶尾部畸胎瘤 | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间数据 | 8个SCTs样本(6个产后,2个产前) | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1685 | 2026-03-01 |
Mutual Regulation of Cardiovascular and Hematopoietic Development
2025-Apr-22, Current cardiology reports
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s11886-025-02236-5
PMID:40261519
|
综述 | 本文探讨了心血管与造血系统在发育中的相互调控关系,特别聚焦于心内膜造血这一进化保守过程及其在心脏发育和巨噬细胞形成中的作用 | 通过单细胞RNA测序技术揭示了心内膜细胞具有独立于已知造血器官的内在造血程序,并阐明了心内膜来源巨噬细胞在心脏形态发生中的独特贡献 | NA | 探讨心血管与造血系统发育的分子机制和调控相互作用 | 心内膜造血过程、心脏发育、巨噬细胞形成 | 自然语言处理 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1686 | 2026-03-01 |
Spatial Transcriptomics Identifies Immune-Stromal Niches Associated with Cancer in Adult Dermatomyositis
2025-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.19.644147
PMID:40166232
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研究论文 | 本研究通过整合空间和单细胞转录组学分析,揭示了成人皮肌炎中与癌症相关的独特免疫和基质微环境 | 首次提供了成人皮肌炎中免疫和基质细胞的空间映射,发现了与癌症相关的DM皮肤病变中分散的免疫浸润特征,以及非癌症相关DM中独特的细胞对和IFN-β表达 | NA | 探究成人皮肌炎的免疫和基质微环境特征及其与癌症的关联 | 成人皮肌炎患者的皮肤组织 | 数字病理学 | 皮肌炎 | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1687 | 2026-03-01 |
Comprehensive biomarker profiles in hematological malignancies: improving diagnosis, prognosis, and treatment
2025-Mar, Biomarkers in medicine
IF:1.9Q3
DOI:10.1080/17520363.2025.2471745
PMID:40015744
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综述 | 本文全面概述了血液系统恶性肿瘤中生物标志物的最新进展及其在诊断、预后和治疗中的应用 | 整合了从传统形态学到先进分子技术(如PCR、NGS、质谱和单细胞RNA测序)的生物标志物发现历程,并强调了新兴技术在揭示先前无法检测的生物标志物方面的作用 | NA | 提供血液系统恶性肿瘤生物标志物的全面概述,探讨其诊断和治疗应用及未来发展方向 | 血液系统恶性肿瘤及其相关生物标志物 | NA | 血液系统恶性肿瘤 | 聚合酶链反应(PCR)、下一代测序(NGS)、质谱、单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1688 | 2026-03-01 |
Multi-omics integration in disease research
2025, Progress in brain research
DOI:10.1016/bs.pbr.2025.08.012
PMID:41314746
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综述 | 本章强调多组学整合在理解阿尔茨海默病、帕金森病和肌萎缩侧索硬化等神经退行性疾病生物学中的价值 | 通过整合基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学数据,结合单细胞测序、空间转录组学和高通量质谱等工具,重建分子网络并实现患者分子亚型分层 | 面临数据异质性和标准化不足等挑战 | 推动神经退行性疾病研究中的个性化策略 | 阿尔茨海默病、帕金森病和肌萎缩侧索硬化(ALS) | 多组学整合 | 神经退行性疾病 | 单细胞测序、空间转录组学、质谱分析 | NA | 基因组、转录组、蛋白质组、代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 1689 | 2026-03-01 |
Precision medicine in neurodegenerative diseases: From research to clinical practice
2025, Progress in brain research
DOI:10.1016/bs.pbr.2025.08.006
PMID:41314744
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综述 | 本章概述了精准医学如何重塑神经退行性疾病的理解、诊断和治疗方式 | 整合了遗传、分子、生物标志物、影像技术和数字工具等多维度信息,推动精准医学从研究向临床实践转化 | 面临试验设计、数据整合、不平等获取和监管障碍等挑战 | 探讨精准医学在神经退行性疾病中的应用,旨在改善诊断、治疗和疾病管理 | 阿尔茨海默病、帕金森病、肌萎缩侧索硬化症和亨廷顿病等神经退行性疾病 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学、影像技术、数字工具 | NA | 遗传数据、分子数据、生物标志物数据、影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1690 | 2026-03-01 |
Elevated Shear Stress Modulates Heterogenous Cellular Subpopulations to Induce Vascular Remodeling
2024-12, Tissue engineering. Part A
DOI:10.1089/ten.TEA.2023.0362
PMID:38753711
|
研究论文 | 本研究通过动物模型、单细胞RNA测序和组织病理学方法,探究了高剪切应力如何通过调控异质性细胞亚群诱导血管重塑 | 首次在单细胞分辨率下全面研究了高剪切应力诱导血管重塑的分子机制,并精确操控血流以表征所有重要的细胞亚群 | 研究基于大鼠动物模型,结果向人类临床转化的有效性有待进一步验证 | 探究高剪切应力诱导血管重塑的分子机制,以寻找预防动静脉瘘失败的新疗法 | 大鼠隐静脉中的细胞亚群,特别是内皮细胞和巨噬细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,组织病理学 | NA | 单细胞转录组数据,组织病理学图像 | 大鼠隐静脉样本(高剪切应力组与无高剪切应力对照组) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1691 | 2026-03-01 |
Loss of NLRP6 increases the severity of kidney fibrosis
2024-09, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31347
PMID:38934623
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研究论文 | 本研究探讨了NLRP6在慢性肾病纤维化中的作用,发现其缺失会加剧肾脏炎症和纤维化 | 首次揭示了NLRP6在肾脏纤维化中的保护作用,并阐明了其通过p38 MAPK通路调节TGF-β1和Klotho表达的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞培养,人类临床样本验证有限,且未深入探讨NLRP6在其他肾脏细胞类型中的功能 | 探究NLRP6在慢性肾病纤维化中的功能和分子机制 | 野生型和Nlrp6缺陷小鼠、肾小管细胞培养物、人类肾脏转录组数据库 | 数字病理学 | 慢性肾病 | 单细胞转录组测序、基因表达分析、细胞培养 | NA | 转录组数据、基因表达数据 | 小鼠模型和细胞培养样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1692 | 2026-02-28 |
Human ISG15 deficiency unveils impaired healing of ulcerations via type I interferon-mediated fibrosis
2026-May-04, Journal of human immunity
DOI:10.70962/jhi.20250011
PMID:41743834
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研究论文 | 本研究通过结合分子生物学方法和空间转录组学,揭示了ISG15缺陷导致I型干扰素介导的纤维化及溃疡愈合受损的机制 | 首次在ISG15缺陷患者样本中结合空间转录组学分析,阐明了慢性I型干扰素暴露如何通过影响上皮-间质转化、巨噬细胞极化和成纤维细胞功能导致多器官纤维化 | 研究主要基于体外模型和患者活检样本,缺乏体内动物模型的验证,且样本量有限 | 阐明ISG15缺陷导致免疫介导纤维化的分子机制 | ISG15缺陷患者皮肤活检样本、ISG15敲除的上皮细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 皮肤纤维化病变 | 空间转录组学、分子生物学方法、体外模型 | NA | 空间转录组数据、组织图像、细胞实验数据 | 患者皮肤活检样本(具体数量未明确说明) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1693 | 2026-02-28 |
Multi-omics identifies an epithelial-B cell cross-talk that drives functional B cell diversion in breast cancer lymph node metastasis
2026-May, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112394
PMID:41610965
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和体内功能模型,揭示了乳腺癌淋巴结转移中B细胞的功能异质性及其与上皮细胞的相互作用机制 | 首次系统性地绘制了乳腺癌转移过程中B细胞状态和相互作用的图谱,发现了IgA浆细胞在转移淋巴结中的特异性扩增,并鉴定了上皮来源的LPAR2信号调控B细胞功能的新机制 | 研究主要聚焦于HR/HER2乳腺癌亚型,其他亚型的普适性有待验证;功能验证主要在动物模型中进行,临床转化需要进一步研究 | 阐明乳腺癌淋巴结转移过程中B细胞的功能异质性及其在转移进展中的作用机制 | HR/HER2乳腺癌患者的配对原发肿瘤和转移淋巴结样本 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 体内功能模型 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 配对的原发肿瘤和转移淋巴结样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1694 | 2026-02-28 |
C3a-C3ar1 axis mediates macrophage M1 polarization to drive silicosis inflammation and fibrosis
2026-Apr-15, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2026.127816
PMID:41698428
|
研究论文 | 本研究揭示了C3a-C3ar1轴通过调控巨噬细胞M1极化驱动矽肺炎症和纤维化的机制 | 首次通过时间序列转录组分析系统研究了矽肺不同阶段所有补体成分的表达模式,并确定了C3a-C3ar1轴是唯一贯穿矽肺发展的补体通路,同时结合时间序列单细胞测序定位了C3ar1在M1巨噬细胞中的表达 | 未明确提及 | 阐明补体系统在矽肺进展中的作用和机制 | 矽肺患者外周血和支气管肺泡灌洗液细胞,以及矽肺模型 | 生物医学研究 | 矽肺 | 时间序列转录组分析,时间序列单细胞测序 | NA | 转录组数据,单细胞数据,临床样本数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1695 | 2026-02-28 |
Unraveling dengue virus-host interactions through transcriptomics: Insights into disease progression and severity signatures
2026-Apr, Microbial pathogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.micpath.2026.108350
PMID:41638513
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综述 | 本文综述了利用转录组学技术研究登革热病毒与宿主相互作用的最新进展,揭示了疾病进展和严重性的分子特征 | 整合了从微阵列到空间转录组学等多种转录组学技术的研究发现,强调了转录组学在阐明登革热病毒致病机制中的关键作用 | 作为综述文章,未进行原始实验研究,主要依赖现有文献的总结和整合 | 通过转录组学技术深入理解登革热病毒与宿主的相互作用,以揭示疾病进展和严重性的分子机制 | 登革热病毒(DENV)及其与宿主的相互作用 | 自然语言处理 | 登革热 | 微阵列、bulk RNA-seq、scRNA-seq、ViscRNA-seq、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1696 | 2026-02-28 |
Targeting HSPB1 inhibits tumor growth and abrogates Treg-mediated tumor immunosuppression
2026-Apr-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116333
PMID:41671620
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、TCGA WGCNA和空间转录组学,发现HSPB1是结直肠癌肿瘤内Treg/CD8+ T细胞比例的关键调节因子,并揭示了其通过CCL20-CCR6轴招募Treg、塑造免疫抑制微环境的机制 | 首次整合单细胞RNA-seq、TCGA WGCNA和空间转录组学鉴定HSPB1为Treg/CD8+比例的关键调节因子,并阐明其通过CCL20-CCR6轴招募Treg的双重抗肿瘤机制 | 研究主要基于皮下肿瘤模型和体外实验,缺乏更复杂的体内模型验证;临床转化潜力尚未在人体试验中评估 | 探究结直肠癌免疫检查点阻断疗效有限的分子机制,寻找调节肿瘤免疫抑制微环境的关键靶点 | 结直肠癌细胞系(MC38、SW480)、小鼠皮下肿瘤模型、肿瘤微环境中的Treg和CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, CRISPR-Cas9基因编辑, 多参数流式细胞术, 批量RNA-seq, Transwell实验, Western blot, T细胞极化实验 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据, 蛋白质印迹数据, 细胞迁移数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及两种结直肠癌细胞系和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1697 | 2026-02-28 |
Thrombospondin-1-mediated macrophage efferocytosis dysfunction exacerbates intestinal pathology in Hirschsprung's disease
2026-Apr-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116344
PMID:41679183
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了血栓反应蛋白-1(THBS1)在巨噬细胞胞葬功能障碍中的作用,及其在先天性巨结肠症肠道病理中的关键调控机制 | 首次发现THBS1通过CD36/Rac1信号轴调控巨噬细胞胞葬功能,并证实其在先天性巨结肠症中作为新型治疗靶点和生物标志物的潜力 | 样本量相对较小(scRNA-seq仅3对样本),且体内验证主要依赖于DSS诱导的结肠炎模型,可能不完全反映人类疾病复杂性 | 阐明先天性巨结肠症中肠道稳态破坏、持续炎症和纤维化的细胞与分子机制 | 先天性巨结肠症患者结肠活检组织、骨髓来源巨噬细胞、DSS诱导的结肠炎小鼠模型 | 单细胞组学 | 先天性巨结肠症 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫荧光、qRT-PCR、FRET生物传感器 | NA | 单细胞转录组数据、组织病理图像、流式细胞数据 | 3对配对结肠活检(scRNA-seq)+5例额外样本(验证实验) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1698 | 2026-02-28 |
NGR-modified cancer-associated fibroblast-derived exosomes deliver resveratrol to inhibit CXCR2/NF-κB signaling in myeloid-derived suppressor cells and reverse immune suppression in liver cancer
2026-Apr-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116326
PMID:41679176
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研究论文 | 本研究开发了一种NGR肽修饰的癌症相关成纤维细胞来源的外泌体,用于递送白藜芦醇,靶向肿瘤微环境中的髓源性抑制细胞,通过抑制CXCR2/NF-κB信号通路逆转免疫抑制并抑制肝癌进展 | 创新性地提出了一种靶向肿瘤相关MDSCs而非直接杀伤肿瘤细胞的免疫治疗策略,并首次鉴定和验证了CXCR2作为白藜芦醇在MDSCs中的功能靶点 | NA | 开发靶向MDSCs的精准药物递送系统,以逆转肝癌免疫抑制微环境并克服免疫治疗耐药性 | 髓源性抑制细胞、癌症相关成纤维细胞、肝癌细胞、CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝癌 | 网络药理学、分子对接、单细胞RNA测序、Western印迹、免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据、体外实验数据、体内小鼠模型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1699 | 2026-02-28 |
Necroptosis mediated by FKBP5 in alveolar fibroblasts drives Pseudomonas aeruginosa-induced acute lung injury
2026-Apr-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116368
PMID:41687524
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了肺泡成纤维细胞中FKBP5介导的坏死性凋亡在铜绿假单胞菌诱导的急性肺损伤中的核心作用机制 | 首次在单细胞水平上发现肺泡成纤维细胞中FKBP5通过促进坏死性凋亡激活NF-κB信号通路,驱动中性粒细胞募集和活化,从而加剧肺损伤 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证尚需进一步开展 | 探究铜绿假单胞菌诱导的急性肺损伤中肺泡成纤维细胞的具体作用机制 | 肺泡成纤维细胞 | 单细胞组学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1700 | 2026-02-28 |
High-cholesterol-load-triggered pyroptosis of gingival fibroblasts promotes periodontitis
2026-Apr-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116259
PMID:41707588
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研究论文 | 本研究揭示了高胆固醇通过诱导牙龈成纤维细胞焦亡加剧牙周炎的机制 | 首次发现胆固醇过载通过溶酶体损伤和CTSB依赖的NLRP3激活驱动牙龈成纤维细胞焦亡,从而促进牙槽骨吸收 | 研究主要基于动物模型和体外细胞实验,尚未在人体中进行验证 | 探究胆固醇如何加重牙周组织损伤的分子机制 | 牙周炎患者数据、高胆固醇饮食大鼠模型、牙龈成纤维细胞 | 单细胞测序与分子生物学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序、RNA测序 | NA | 单细胞测序数据、RNA测序数据 | 牙周炎患者单细胞数据集、高胆固醇饮食大鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |