单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 37326 篇文献，本页显示第 1681 - 1700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1681 | 2026-02-21 |
Follicular Helper T Cells and B Cell Maturation in Patients with 22q11.2 Deletion Syndrome and Recurrent Infections
2026-Feb-03, Journal of clinical immunology
IF:7.2Q1
DOI:10.1007/s10875-026-01987-2
PMID:41629437
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA-seq技术，分析了22q11.2缺失综合征患者（特别是伴有反复感染的患者）与对照组的基因表达模式，重点关注了T细胞功能异常和B细胞成熟减少的机制 | 首次在22q11.2缺失综合征患者中，通过单细胞RNA-seq技术，系统性地揭示了跨所有细胞类型的I型干扰素特征，并在滤泡辅助T细胞中识别出衰老特征，特别是在反复感染患者中最为显著 | 样本量相对较小（患者N=13，对照N=11），且研究主要基于基因表达分析，未深入验证功能机制 | 利用单细胞RNA-seq技术，更好地定义22q11.2缺失综合征患者（尤其是伴有反复感染的患者）中改变的基因表达模式，以阐明与反复感染相关的机制 | 22q11.2缺失综合征患者（包括伴有反复感染的亚组）和健康对照 | 数字病理学 | 免疫缺陷综合征 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 患者13例，对照11例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1682 | 2026-02-21 |
Metformin inhibits proliferation of residing fibroadipogenic progenitor cells from failing human hearts
2026-Feb-03, ESC heart failure
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/eschf/xvag001
PMID:41711740
|
研究论文 | 本研究探讨了二甲双胍在射血分数降低的心力衰竭（HFrEF）患者心肌中的分布及其对心脏纤维脂肪源性祖细胞（FAPs）增殖的抑制作用 | 首次使用11C-二甲双胍PET成像评估HFrEF患者心肌二甲双胍分布，并结合单细胞RNA测序鉴定心脏FAPs，揭示二甲双胍通过抑制FAP增殖可能改善心室重构 | 样本量较小（7例HFrEF患者用于PET，4例用于scRNA-seq），且为体外实验，需进一步验证临床疗效 | 探究二甲双胍在HFrEF中的治疗机制，特别是其对心肌纤维化祖细胞的影响 | HFrEF患者的心肌组织及从中分离的纤维脂肪源性祖细胞（FAPs） | 心血管疾病研究 | 心力衰竭 | 11C-二甲双胍正电子发射断层扫描（PET）、15O-H2O-PET、运动负荷超声心动图、荧光激活细胞分选（FACS）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 影像数据、基因表达数据、细胞实验数据 | 7例HFrEF患者用于PET研究，4例HFrEF患者和4例对照心脏用于scRNA-seq分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1683 | 2026-02-21 |
CHB-Induced Immune Zonation Chaos Elicited LXRα-mediated Lipid Metabolism Disorders in Kupffer Cells to Induce Cancer Stem Cell Formation
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202510275
PMID:41164971
|
研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和空间转录组学分析，揭示了慢性乙型肝炎病毒（CHB）感染中库普弗细胞（KCs）的免疫分区紊乱如何通过LXRα介导的脂质代谢失调诱导癌症干细胞形成 | 首次揭示了库普弗细胞在肝脏疾病进展中的空间分区作用，并阐明了LXRα在KCs中通过脂质代谢失调和Stat3通路介导癌症干细胞形成的分子机制 | 研究主要基于AAV-HBV小鼠模型，人类样本验证相对有限；机制研究集中在KCs与肝细胞的相互作用，其他免疫细胞类型的作用可能未完全涵盖 | 探究慢性乙型肝炎病毒（CHB）感染如何通过肝脏微环境中的细胞间通讯驱动从炎症到肝细胞癌的疾病进展 | AAV-HBV小鼠模型、人类HBV患者肿瘤组织、库普弗细胞（KCs）、肝细胞、内皮细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学分析 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | AAV-HBV小鼠模型（时间序列样本）、人类HBV患者肿瘤组织（包括正常组织、癌旁组织和肿瘤组织） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1684 | 2026-02-21 |
CD168 Identifies Proliferating Pancreatic Islet Cells in Murine and Human
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202510590
PMID:41422437
|
研究论文 | 本文发现CD168作为小鼠和人类胰岛中增殖细胞的保守表面标记物，用于富集活体增殖β细胞 | 首次鉴定CD168为胰岛增殖细胞的保守表面标记，并开发CD168-CreERT2小鼠模型进行谱系追踪，揭示新生β细胞约60天的成熟轨迹 | 未明确说明样本量限制或技术潜在偏差 | 研究糖尿病治疗中通过增殖恢复功能性β细胞质量的目标 | 小鼠和人类胰岛细胞，特别是增殖中的β细胞 | 单细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫染色，谱系追踪，多组学分析 | CD168-CreERT2小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据，流式细胞数据，免疫染色图像，谱系追踪数据 | 未明确指定具体样本数量，但提到成年胰岛细胞中CD168细胞约占0.5% | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1685 | 2026-02-21 |
BHLHE40 Orchestrates Effector Tissue-Resident Memory CD8+ T Cells and Limits Long-Term Survival of Kidney Graft
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202520518
PMID:41486507
|
研究论文 | 本研究通过小鼠肾移植模型，利用单细胞和空间转录组学技术，揭示了CD49aPD1 CD8+ T细胞作为效应性组织驻留记忆T细胞亚群在移植排斥中的作用，并发现BHLHE40是其分化和功能的关键调控因子 | 首次在小鼠肾移植模型中鉴定出CD49aPD1 CD8+ T细胞作为效应性组织驻留记忆T细胞亚群，并阐明BHLHE40通过TGF-β信号调控其分化和功能，强调了驻留免疫细胞而非循环细胞在移植排斥中的主导作用 | 研究基于小鼠模型，结果在人类肾移植中的适用性需进一步验证；长期观察机制的具体时间点未详细说明 | 探究组织驻留记忆T细胞在肾移植排斥中的分化和稳态机制 | 小鼠肾移植模型中的CD8+ T细胞，特别是CD49aPD1亚群 | 数字病理学 | 肾移植排斥 | 单细胞转录组学，空间转录组学 | NA | 转录组数据，空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 1686 | 2026-02-21 |
RBM15/IGF2BP3 promotes immune escape in bladder cancer by enhancing m6A modification of PFKFB4
2026-Feb, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.150142
PMID:41579989
|
研究论文 | 本研究揭示了RBM15通过m6A修饰和IGF2BP3依赖的机制稳定PFKFB4表达，从而促进膀胱癌糖酵解并抑制CD8 T细胞功能，为免疫治疗提供了新靶点 | 首次整合单细胞测序、空间转录组学、m6A-seq和乳酰化蛋白质组学，阐明了RBM15通过m6A-IGF2BP3-PFKFB4轴调控肿瘤糖酵解和免疫逃逸的双重机制，并验证了靶向RBM15可增强抗PD1疗法疗效 | 研究主要基于膀胱癌模型，机制在其他癌种中的普适性有待验证；体内实验仅使用了siRNA沉默策略，缺乏更特异的基因编辑验证 | 探究m6A修饰在膀胱癌肿瘤微环境塑造中的作用，特别是RBM15在调控糖酵解和免疫逃逸中的分子机制 | 膀胱癌恶性上皮细胞、CD8 T细胞、RBM15/IGF2BP3/PFKFB4分子轴 | 肿瘤免疫学 | 膀胱癌 | 单细胞测序、空间转录组学、m6A-seq、乳酰化蛋白质组学、RIP-qPCR、MeRIP-qPCR、荧光素酶报告实验、RNA稳定性检测、脂质纳米颗粒递送 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、m6A修饰数据、蛋白质组数据、体外功能实验数据、体内治疗数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 1687 | 2026-02-21 |
Agonistic GITR treatment enhances antitumor immune responses and suppresses tumor progression in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Feb-01, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-026-02347-y
PMID:41620983
|
研究论文 | 本研究探讨了激动性GITR治疗在胰腺导管腺癌中通过调节肿瘤微环境增强抗肿瘤免疫反应并抑制肿瘤进展的机制 | 首次在PDAC中系统评估GITR作为免疫治疗靶点的潜力，结合小鼠模型和人类样本的多组学分析，揭示了GITR激活对Tregs减少和效应T细胞增加的双重调节作用 | 研究主要基于Pan02小鼠模型，人类样本数量有限，且未进行长期临床疗效验证 | 探索GITR作为PDAC免疫治疗新靶点的有效性和作用机制 | 胰腺导管腺癌（PDAC）的肿瘤微环境及免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、免疫荧光 | Pan02小鼠模型 | 基因表达数据、空间转录组数据、免疫组化图像 | 未明确样本数量，包括Pan02小鼠模型和人类PDAC手术切除样本（初治患者与新辅助化疗患者） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1688 | 2026-02-21 |
Enteric nervous system and inflammatory bowel disease
2026-Feb, Gastroenterology report
IF:3.8Q2
DOI:10.1093/gastro/goag005
PMID:41696441
|
综述 | 本文综述了肠道神经系统（ENS）与炎症性肠病（IBD）之间复杂的相互作用，探讨了ENS功能障碍如何促进IBD的发病机制，并评估了靶向ENS的治疗潜力 | 强调了ENS作为“第二大脑”在IBD中的核心作用，系统阐述了ENS功能障碍（如神经兴奋性增高、突触脆弱性）与肠道炎症的双向关联，并指出了靶向ENS的神经调控疗法作为新兴治疗前沿 | 研究ENS面临神经元细胞丰度低、技术限制等挑战，需要空间转录组学等先进方法来克服 | 探讨ENS在IBD发病机制中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 肠道神经系统、炎症性肠病、肠道胶质细胞、神经免疫相互作用 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1689 | 2026-02-21 |
Identifying cell-type-specific marker genes of dental epithelial cells using single-cell RNA sequence: A review
2026-Feb, Journal of oral biosciences
IF:2.6Q1
DOI:10.1016/j.job.2026.100757
PMID:41714012
|
综述 | 本文通过整合单细胞RNA测序数据、组织学验证、表型数据库和CAGE-seq，建立了牙上皮细胞类型的更新分子图谱 | 系统性地整合了已发表的scRNA-seq牙齿发育研究中的经典和新提出的标记基因，并结合实验验证和表型数据库，为牙上皮细胞类型提供了全面的分子身份描述 | 主要基于小鼠模型数据，可能不完全适用于人类牙上皮细胞研究，且非成釉细胞群体的分子标记和功能角色仍有待进一步探索 | 识别牙上皮细胞的细胞类型特异性标记基因，以理解牙齿发育中的分子异质性 | 牙上皮细胞，包括成釉细胞（如内釉上皮、分泌期和成熟期）以及非成釉细胞群体（如外釉上皮、星网状层和中间层） | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫染色、原位杂交、CAGE-seq | NA | 文本 | 基于已发表的小鼠牙齿组织研究，具体样本数量未在摘要中指定 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1690 | 2026-02-21 |
Microbiota-dependent transcriptional priming of lung innate immune cells in a mouse model of LPS-induced sepsis-associated lung injury
2026-Feb, Journal of oral biosciences
IF:2.6Q1
DOI:10.1016/j.job.2026.100742
PMID:41714041
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序，揭示了共生微生物群在正常生理和LPS诱导的脓毒症条件下，对小鼠肺先天免疫细胞转录活性和成熟轨迹的调控作用 | 首次在单细胞分辨率下，系统比较了无菌小鼠与常规小鼠肺先天免疫细胞在稳态和脓毒症状态下的转录组差异，并明确了微生物信号通过调控Cebpb表达等机制影响免疫细胞的炎症准备状态 | 研究基于小鼠模型，结论在人体中的普适性有待验证；实验仅聚焦于LPS诱导的脓毒症模型，未涵盖其他类型的肺部损伤 | 阐明微生物信号如何塑造肺先天免疫系统的功能成熟及其在脓毒症相关肺损伤中的作用机制 | 无菌小鼠和常规小鼠的肺免疫细胞 | 单细胞组学 | 脓毒症相关肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 无菌小鼠和常规小鼠在正常及脓毒症条件下的肺免疫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1691 | 2026-02-21 |
Applications of Spatial Transcriptomics in Ischemic Stroke Research
2026-Jan-31, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2026.01.008
PMID:41628770
|
综述 | 本文综述了空间转录组学在缺血性卒中研究中的应用，重点探讨了胶质细胞在卒中病理生物学中的复杂作用 | 通过结合空间转录组学与单细胞及多组学方法，识别了新的治疗靶点，如不同激活状态的胶质细胞及其关键信号通路 | 当前研究仍面临挑战，包括需要多时间点分析、三维重建和标准化数据集以推动临床应用 | 探讨空间转录组学如何促进对卒中后细胞变化的理解，并推动卒中研究与治疗 | 缺血性卒中后的脑组织，特别是小胶质细胞、星形胶质细胞和少突胶质细胞 | 数字病理学 | 缺血性卒中 | 空间转录组学，单细胞多组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1692 | 2026-02-21 |
Diffusion-based Representation Integration for Foundation Models Improves Spatial Transcriptomics Analysis
2026-Jan-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.20.689624
PMID:41332747
|
研究论文 | 提出DRIFT框架，通过热核扩散在空间图上整合空间上下文到基础模型的输入表示中，以改进空间转录组学分析 | 利用热核扩散在空间图上传播嵌入，将ST数据的局部邻域上下文整合到现有单细胞基础模型中，弥补了空间信息利用的不足 | 未明确提及具体局限性，但可能依赖于基础模型的性能和数据质量 | 开发一个通用框架，将空间上下文整合到基础模型中，以提升空间转录组学数据的分析性能 | 空间转录组学数据及其在细胞类型注释、聚类和跨样本对齐等任务中的应用 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 基础模型（包括scRNA-seq和ST-based模型） | 基因表达谱数据（空间转录组学和单细胞RNA测序数据） | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1693 | 2026-02-21 |
A tri-omics and machine learning framework identifies prognostic biomarkers and metabolic signatures in sepsis
2026-Jan-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-37342-z
PMID:41611834
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组学、蛋白质组学、代谢组学和单细胞转录组学数据，结合机器学习方法，识别了脓毒症相关的预后生物标志物和代谢特征 | 建立了一个结合多组学数据、机器学习算法和单细胞分析的综合分析框架，首次将TPR和ERN1基因与脓毒症的免疫代谢重塑联系起来，并构建了基因-代谢物联合分类模型 | 研究缺乏独立、多组学匹配队列的外部验证，且计算筛选的中药活性单体需后续实验验证 | 阐明脓毒症的分子机制并识别候选生物标志物，为下游机制和转化研究提供可测试的假设 | 脓毒症患者的多组学数据（转录组、蛋白质组、代谢组）及单细胞转录组数据 | 机器学习 | 脓毒症 | 转录组学、蛋白质组学、代谢组学、单细胞转录组学、非靶向代谢组学筛选 | LASSO回归、SVM-RFE算法、逻辑回归、支持向量机、随机森林 | 组学数据（转录组、蛋白质组、代谢组）、单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1694 | 2026-02-21 |
scAURA: Alignment- and Uniformity-based Graph Debiased Contrastive Representation Architecture for Self-Supervised Clustering of Single-Cell Transcriptomics
2026-Jan-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.25.701579
PMID:41659516
|
研究论文 | 本文提出了一种名为scAURA的统一框架，结合图去偏对比学习和自监督聚类，用于单细胞转录组数据的细胞类型识别 | scAURA通过整合图去偏对比学习与自监督聚类，解决了单细胞RNA测序数据中的高维性、稀疏性和噪声问题，在多个数据集上超越了现有最先进方法 | NA | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的准确性和鲁棒性 | 人类和小鼠的单细胞转录组数据 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 图去偏对比学习架构 | 单细胞转录组数据 | 18个真实单细胞数据集，涵盖多种组织和细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1695 | 2026-02-21 |
HMGB1 affects the progression of neurofibromatosis type 1-associated malignant peripheral nerve sheath tumors through E2F2
2026-Jan-24, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-04165-3
PMID:41580779
|
研究论文 | 本研究揭示了HMGB1通过直接转录激活E2F2，驱动神经纤维瘤病1型相关恶性外周神经鞘瘤的细胞周期进程和肿瘤恶性进展 | 首次在单细胞水平上整合分析NF1-MPNST和PNF组织，阐明了HMGB1通过直接结合并激活E2F2转录来驱动肿瘤进展的新机制 | 研究主要基于患者来源的组织和细胞系，体内模型为异种移植小鼠模型，未来需要在更接近人类肿瘤微环境的基因工程小鼠模型中进一步验证 | 探究HMGB1在神经纤维瘤病1型相关恶性外周神经鞘瘤进展中的功能作用和分子机制 | 患者来源的NF1-MPNST和丛状神经纤维瘤组织、NF1细胞系、异种移植小鼠模型 | 肿瘤生物学 | 恶性外周神经鞘瘤 | 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq、CUT&Tag、ChIP-qPCR、qPCR、Western blot | NA | RNA测序数据、蛋白质印迹数据、染色质免疫沉淀数据 | 患者来源的NF1-MPNST和PNF组织（具体数量未在摘要中明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1696 | 2026-02-21 |
Spatially resolved transcriptome-metabolome integration reveals region-specific glial lipid dysregulation associated with Alzheimer's pathology
2026-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.23.701345
PMID:41648223
|
研究论文 | 本研究开发了一个名为iMIST的集成平台，结合代谢物成像、组织学和空间转录组学，揭示了阿尔茨海默病小鼠模型中胶质细胞脂质代谢失调的区域特异性模式及其与病理的联系 | 首次开发了iMIST集成平台，能够在同一组织切片上整合MALDI代谢物成像、组织学和空间转录组学数据，直接展示了胶质细胞稳态失调如何在不同脑区和微环境中表现，并将局部病理与整体代谢失衡联系起来 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证；技术整合的复杂性可能限制其广泛推广 | 探究阿尔茨海默病中胶质细胞脂质代谢失调的空间分布特征及其与病理的关联 | 晚发性阿尔茨海默病小鼠模型的脑组织 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | MALDI代谢物成像，空间转录组学，组织学分析 | NA | 空间多组学数据（代谢组、转录组、图像） | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1697 | 2026-02-21 |
Super-resolved, three-dimensional spatial transcriptomics reveals cell-type and brain-region-specific modulation of key epitranscriptomic switches following adolescent alcohol exposure
2026-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.22.698893
PMID:41648353
|
研究论文 | 本研究开发了一种超分辨三维空间转录组学方法，用于量化大鼠脑内关键表观转录组开关在青少年酒精暴露后的细胞类型和脑区特异性变化 | 开发了首个超分辨三维空间转录组学方法，实现了在完整脑组织中以细胞类型和脑区特异性方式量化关键表观转录组调节因子 | 研究仅针对特定表观转录组调节因子（m6A甲基转移酶），且仅在啮齿动物模型中进行，尚未在人类样本或更广泛的表观转录组标记中验证 | 阐明表观转录组机制在神经精神疾病中的作用，特别是青少年酒精暴露对大脑表观转录组调控的影响 | 大鼠脑组织（包括杏仁核中央核、海马CA1区、齿状回、杏仁基底外侧核、海马CA3区）中的神经元、星形胶质细胞和小胶质细胞 | 空间转录组学 | 神经精神疾病 | 空间转录组学，表观转录组分析 | NA | 空间转录组数据，RNA表达数据 | 青少年间歇性乙醇暴露（AIE）大鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | 超分辨三维空间转录组学方法（作者自主研发） |
| 1698 | 2026-02-21 |
Integrative multi-omics reveal a CD4⁺ T cell-derived six-gene signature linking the immune-stromal ecosystem to prognosis and immunotherapy selection in pancreatic cancer
2026-Jan-22, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-15613-2
PMID:41572218
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据，揭示了一个源自CD4⁺ T细胞的六基因特征，该特征将胰腺癌的免疫-基质生态系统与预后及免疫治疗选择联系起来 | 首次从CD4⁺ T细胞角度构建了一个六基因特征，用于连接胰腺癌的免疫-基质生态系统、预后分层和免疫治疗选择，并通过单细胞RNA测序和细胞通讯分析揭示了其细胞定位和相互作用网络 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，需要前瞻性临床队列进一步验证；体外细胞系实验未能完全模拟体内复杂的肿瘤微环境 | 开发用于胰腺癌风险分层和指导免疫治疗选择的稳健生物标志物 | 胰腺癌患者（来自TCGA、GTEx、GEO数据库）、胰腺癌细胞系（H6C7、CAPAN-1、PANC-1） | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、定量实时聚合酶链反应、Western印迹、生物信息学分析 | 六基因特征模型 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | TCGA和GTEx数据集（训练集）、GEO数据集GSE57495（验证集）、单细胞RNA测序数据集GSE212966 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1699 | 2026-02-21 |
The Camellia sinensis var. sinensis cv. Fuding Dabaicha genome unveils structural variation-driven metabolic innovation
2026-Jan-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68463-8
PMID:41535305
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序结合PacBio HiFi和ONT超长测序技术，构建了福鼎大白茶的高质量单倍型基因组，揭示了结构变异如何驱动茶叶代谢多样性 | 首次利用单细胞测序技术对茶叶精子细胞进行测序，结合长读长测序实现高精度单倍型基因组组装，并建立了基于半同胞的QTL定位平台 | 研究主要聚焦于福鼎大白茶品种，其他茶叶品种的基因组变异和代谢多样性可能未被全面覆盖 | 探究茶叶基因组结构变异与代谢多样性之间的关联 | 福鼎大白茶（Camellia sinensis var. sinensis cv. Fuding Dabaicha）的基因组和代谢产物 | 基因组学 | NA | 单细胞测序, PacBio HiFi测序, ONT超长测序 | NA | 基因组序列数据, 代谢组数据 | 107个精子细胞 | PacBio, Oxford Nanopore Technologies | 单细胞测序, 长读长测序 | PacBio HiFi, ONT | PacBio HiFi测序和ONT超长测序技术 |
| 1700 | 2026-02-21 |
Scar-associated macrophages and biliary epithelial cells interaction exacerbates hepatic fibrosis in biliary atresia
2026-Jan, Pediatric research
IF:3.1Q1
DOI:10.1038/s41390-025-04100-2
PMID:40383871
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间定位数据，揭示了胆道闭锁中疤痕相关巨噬细胞与胆道上皮细胞相互作用加剧肝纤维化的机制 | 首次结合单细胞和空间转录组技术，系统解析了胆道闭锁肝脏微环境异质性，并识别出促进纤维化的关键细胞互作及诊断标志物 | 样本量较小（仅8例组织），且缺乏长期随访数据验证治疗靶点的临床转化潜力 | 探究胆道闭锁肝纤维化的微环境机制并开发诊断模型 | 人类肝脏组织（包括正常组织、胆总管囊肿组织和胆道闭锁组织） | 数字病理学 | 胆道闭锁 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），空间转录组学 | 诊断模型（基于基因特征） | 单细胞转录组数据，空间定位数据 | 8例组织（2例正常邻近组织，2例胆总管囊肿组织，4例胆道闭锁组织） | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |