单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 16941 - 16960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16941 | 2024-08-05 |
LIDER: cell embedding based deep neural network classifier for supervised cell type identification
2023, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.15862
PMID:37601262
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研究论文 | 本文介绍了一种名为LIDER的新型深度学习方法，用于自动识别细胞类型 | LIDER结合了细胞嵌入和深度神经网络分类器，提高了细胞类型识别的自动化水平 | 本研究可能在某些特定情况下的适用性和范围有限 | 本研究旨在提高单细胞RNA-seq数据的自动细胞类型识别准确性 | 研究对象为单细胞RNA-seq数据中的细胞类型 | 计算机视觉 | NA | 深度学习 | 堆叠去噪自编码器 | 单细胞RNA-seq数据 | 八种类型的单细胞数据 |
| 16942 | 2024-08-05 |
MMP12 serves as an immune cell-related marker of disease status and prognosis in lung squamous cell carcinoma
2023, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.15598
PMID:37601247
|
研究论文 | 本研究揭示了基质金属蛋白酶12在肺鳞状细胞癌中的表达、临床意义和潜在分子机制 | 发现MMP12在肺鳞状细胞癌中表达上调，并与较差的临床预后和较高的免疫细胞浸润水平相关 | 未提及具体的局限性 | 研究MMP12在肺鳞状细胞癌中的角色及其相关的临床意义 | 主要研究肺鳞状细胞癌中的MMP12的表达和免疫相关功能 | 数字病理学 | 肺癌 | 免疫组化(IHC)，基因富集分析，单细胞测序 | NA | mRNA样本和组织样本 | 2,738个mRNA样本和125个组织样本 |
| 16943 | 2024-08-05 |
Analyzation of the Peripheral Blood Mononuclear Cells Atlas and Cell Communication of Rheumatoid Arthritis Patients Based on Single-Cell RNA-Seq
2023, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/2023/6300633
PMID:37600067
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研究论文 | 本研究描述了类风湿关节炎（RA）患者外周血免疫系统及细胞通讯的全景。 | 创新点在于识别出类风湿关节炎患者中双阴性T细胞（DNT）及经典单核细胞的关键角色，并发现多个特定基因的表达改变。 | 研究样本数量较少，仅使用了四个RA样本和四个健康对照样本，可能影响结果的普遍性。 | 研究类风湿关节炎外周血免疫机制与细胞通讯的变化。 | 研究对象为类风湿关节炎患者的外周血单核细胞和健康对照者的单细胞转录组数据。 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 8个样本（4个RA样本和4个健康对照样本） |
| 16944 | 2024-08-05 |
Immune cell type signature discovery and random forest classification for analysis of single cell gene expression datasets
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1194745
PMID:37609075
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研究论文 | 本文建立了一种新颖的工作流程，用于发现免疫细胞类型特征。 | 创新点在于利用多种集成的数据集发现免疫细胞特征，而不仅仅依赖单一基因表达数据集。 | 本文未提及特定的局限性 | 研究的目的是提高单细胞基因表达数据集的分析质量。 | 研究对象为七个来自六种不同癌症类型的单细胞基因表达数据集。 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 随机森林 | 基因表达数据 | 七个单细胞基因表达数据集 |
| 16945 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq and bulk-seq identify RAB17 as a potential regulator of angiogenesis by human dermal microvascular endothelial cells in diabetic foot ulcers
2023, Burns & trauma
IF:6.3Q1
DOI:10.1093/burnst/tkad020
PMID:37605780
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研究论文 | 本研究分析了糖尿病足溃疡患者和健康对照的皮肤微血管内皮细胞HDMECs，并识别了RAB17作为潜在的血管生成调节因子 | 首次明确了RAB17在糖尿病足溃疡中作为血管生成的潜在调节因子，并揭示了其表达下调与血管生成能力受损的关系 | 仅通过磁性细胞分选技术获取细胞样本，可能存在选择偏差，且部分结果需进一步通过临床实验验证 | 全面分析糖尿病足溃疡患者的HDMECs，以确认潜在的血管生成调节因子 | 糖尿病足溃疡患者和健康对照的皮肤微血管内皮细胞HDMECs | 数字病理学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序和传统RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从糖尿病足溃疡患者和健康对照中获取的皮肤样本 |
| 16946 | 2024-08-05 |
Identification of cuproptosis and immune-related gene prognostic signature in lung adenocarcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1179742
PMID:37622116
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研究论文 | 本研究旨在基于cuproptosis和免疫相关基因创建肺腺癌患者的生存预测模型 | 首次结合cuproptosis和免疫相关基因进行肺腺癌预后模型的建立 | 未提及具体的临床验证和临床应用效果 | 用于提高肺腺癌患者的个性化治疗效果 | 肺腺癌患者的RNA序列数据和相关基因 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | 比例风险回归模型 | RNA数据 | 来自TCGA和GEO数据库的多个肺腺癌患者的数据 |
| 16947 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the transcriptomic characteristics of peripheral blood mononuclear cells in hepatitis B vaccine non-responders
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1091237
PMID:37593735
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了乙型肝炎疫苗无应答者外周血单个核细胞的转录组特征 | 首次揭示了乙型肝炎疫苗无应答者中抗原呈递细胞的活性、MAPK通路活性及效应T细胞活性显著降低，以及NKT细胞的细胞毒性显著增加 | 样本量较小，仅包括三名高应答者和三名无应答者 | 探究乙型肝炎疫苗无应答者的分子机制 | 外周血单个核细胞（PBMCs） | 数字病理学 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 6名志愿者（3名高应答者和3名无应答者） |
| 16948 | 2024-08-07 |
Integrating Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Reveals Heterogeneity, Tumor Microenvironment, and Immunotherapeutic Efficacy Based on Sialylation-Related Genes in Bladder Cancer
2023, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S418433
PMID:37600224
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研究论文 | 本研究通过整合批量和单细胞RNA测序数据，揭示了膀胱癌中与唾液酸化相关基因的异质性、肿瘤微环境及免疫治疗效果 | 建立了基于唾液酸化相关基因的膀胱癌风险分层，并展示了其在预测患者预后、临床病理特征、免疫微环境和免疫治疗效果方面的良好准确性 | NA | 旨在基于唾液酸化相关基因建立膀胱癌风险分层，并阐明其在膀胱癌预后、肿瘤微环境和免疫治疗中的作用 | 膀胱癌样本及其唾液酸化相关基因 | 数字病理学 | 膀胱癌 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 批量RNA测序样本分为3种肿瘤亚型，基于19个与预后相关的唾液酸化基因；单细胞RNA测序数据中识别出5种核心细胞类型 |
| 16949 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing identifies a novel proliferation cell type affecting clinical outcome of pancreatic ductal adenocarcinoma
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1236435
PMID:37601684
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，识别出一种新的增殖细胞类型Prol，该细胞类型在胰腺导管腺癌中富集，并与患者的生存率降低相关 | 首次发现并描述了一种新的增殖细胞类型Prol，并证实其在胰腺导管腺癌中的作用及其与免疫抑制微环境的关联 | NA | 旨在识别影响胰腺导管腺癌患者临床结果的细胞类型 | 胰腺导管腺癌中的细胞类型及其对患者生存率的影响 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学（ST） | 机器学习集成算法 | RNA测序数据 | 使用了来自癌症基因组图谱（TCGA）队列的批量RNA测序数据 |
| 16950 | 2024-08-07 |
GADD45B regulates the carcinogenesis process of chronic atrophic gastritis and the metabolic pathways of gastric cancer
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1224832
PMID:37608794
|
研究论文 | 本研究探讨了GADD45B在慢性萎缩性胃炎（CAG）致癌过程中的作用及其在胃癌代谢途径中的影响。 | 首次揭示了GADD45B在CAG致癌过程中的关键作用，并探讨了其在胃癌发展和代谢途径中的影响。 | 研究主要基于转录组数据分析，未来研究可结合更多实验验证。 | 探究GADD45B在慢性萎缩性胃炎致癌过程中的作用及其在胃癌代谢途径中的影响。 | 慢性萎缩性胃炎和胃癌的致癌机制及代谢途径。 | 数字病理学 | 胃癌 | hdWGCNA, LASSO, SVM-RFE, RF | NA | 转录组数据 | 涉及CAG、非萎缩性胃炎（NAG）和胃癌的组织样本 |
| 16951 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq to unravel the molecular mechanisms underlying the immune microenvironment in the development of intestinal-type gastric cancer
2024-01, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2023.166849
PMID:37591405
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序，探讨肠型胃癌发展过程中免疫微环境的分子机制 | 发现了IGC（肠型胃癌）的新型生物标志物，并阐明了免疫细胞之间的相互作用和肿瘤生长的机制 | 本研究依赖于已有数据库的数据，可能存在样本选择偏差 | 研究肠型胃癌发展的分子机制，特别是免疫微环境的作用 | 使用了来自GEO和TCGA数据库的肠型胃癌相关样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，整体RNA测序 | Cox比例风险回归模型 | 转录组数据 | 使用了GEO和TCGA数据库中的IGC样本 |
| 16952 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals abnormal transcriptome signature of erythroid progenitors in pure red cell aplasia
2024-Jan, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2023.03.002
PMID:37588205
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 16953 | 2024-08-07 |
Integrated bulk and single-cell transcriptome data identify clinically relevant cell populations in clear cell renal cell carcinoma
2024-Jan, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2023.03.007
PMID:37588222
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 16954 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis reveals key differences between early-stage and late-stage systemic sclerosis skin across autoantibody subgroups
2023-12, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-224184
PMID:37580109
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了弥漫性皮肤系统性硬化症（dcSSc）患者与健康对照组之间的细胞差异 | 发现了dcSSc患者中抗RNA聚合酶III（ARA）和抗拓扑异构酶抗体（ATA）亚组在疾病早期和晚期皮肤细胞表达谱和细胞间相互作用的差异 | NA | 探究dcSSc患者皮肤在不同疾病阶段和抗体亚组间的细胞差异 | 弥漫性皮肤系统性硬化症患者和健康对照组 | 数字病理学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 皮肤活检样本 | 15个前臂皮肤活检样本，包括12名dcSSc患者和3名健康对照组 |
| 16955 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of spinal cord injury reveals functional heterogeneity of oligodendrocyte lineage cells
2023-Nov-30, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2023.147713
PMID:37579960
|
研究论文 | 本研究揭示了脊髓损伤后少突胶质细胞谱系细胞的功能异质性 | 首次揭示了Junb在成熟少突胶质细胞中的独特作用，并预测了可能的转录因子 | 尚缺乏对脊髓损伤后少突胶质细胞状态和细胞间相互作用的深入研究 | 探讨脊髓损伤后少突胶质细胞谱系细胞的功能变化和相互作用 | 脊髓损伤后的少突胶质细胞谱系细胞 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞转录组测序 | NA | 细胞转录组数据 | NA |
| 16956 | 2024-08-07 |
Integrating single-cell imaging and RNA sequencing datasets links differentiation and morphogenetic dynamics of human pancreatic endocrine progenitors
2023-11-06, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.07.019
PMID:37591246
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research paper | 本文通过监测NEUROG3基因表达和蛋白质在单细胞水平上的动态变化，结合单细胞转录组数据，研究了人类胰腺内分泌前体细胞的分化和形态发生动力学 | 提出了将单细胞转录组数据与活细胞动态行为统计整合的数据映射方法，并发现了KLK12在NEUROG3表达初期对细胞迁移的作用 | NA | 研究人类胰腺内分泌前体细胞的分化和形态发生动力学 | NEUROG3基因在人类胰腺内分泌前体细胞中的表达和功能 | digital pathology | NA | RNA sequencing | NA | image | 单细胞水平的数据 |
| 16957 | 2024-08-05 |
Integrated single-cell and bulk sequencing analyses with experimental validation identify the prognostic and immunological implications of CD226 in pan-cancer
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05268-y
PMID:37580402
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研究论文 | 本研究探讨了CD226在泛癌中的生物功能、肿瘤免疫作用及其作为预后和免疫治疗反应预测因子的潜力 | CD226被提出作为一种创新生物标志物，能预测患者预后和免疫治疗反应 | CD226在多种癌症类型中的具体机制仍需进一步深入研究 | 研究CD226在肿瘤免疫中的作用及其预后预测潜力 | CD226在肿瘤浸润的CD8+和NK细胞中的表达及其功能 | 数字病理学 | 泛癌 | 单细胞和整体测序分析 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 16958 | 2024-08-07 |
Aging impairs the ability of vascular endothelial stem cells to generate endothelial cells in mice
2023-11, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-023-09891-8
PMID:37563497
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研究论文 | 本研究比较了年轻和老年小鼠的血管内皮干细胞（VESCs）在体外和体内分化为内皮细胞的潜力 | 首次阐明了衰老如何影响血管内皮干细胞（VESCs） | NA | 探讨衰老对血管内皮干细胞功能的影响 | 年轻和老年小鼠的血管内皮干细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 年轻（2-3个月大）和老年（27-28个月大）小鼠的血管内皮干细胞 |
| 16959 | 2024-08-05 |
Two distinct molecular faces of preeclampsia revealed by single-cell transcriptomics
2023-Oct-13, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2023.07.005
PMID:37572658
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研究论文 | 本研究揭示了妊娠高血压疾病的两种不同分子特征 | 首次通过单细胞转录组学研究早发和晚发妊娠高血压疾病的分子变化 | 研究仅集中于胎盘细胞类型，可能无法全面反映妊娠高血压的全貌 | 探讨在两种类型的妊娠高血压中胎盘功能的分子变化 | 早发和晚发妊娠高血压患者及相应的妊娠匹配对照 | 数字病理学 | 妊娠高血压 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 包含早发和晚发妊娠高血压病例及相应对照的多个样本 |
| 16960 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals blastomere heterogeneity of 2-cell embryos in pigs
2023-Oct, Reproduction in domestic animals = Zuchthygiene
DOI:10.1111/rda.14454
PMID:37568261
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研究论文 | 本研究分析了猪2-cell胚胎中的单细胞RNA测序数据，揭示了其胚胎芽细胞异质性。 | 该研究首次系统地揭示了不同类型的猪2-cell胚胎中，芽细胞的分子异质性及其调控机制。 | 研究主要集中于猪的2-cell胚胎，结果可能不适用于其他物种的胚胎发育研究。 | 探讨猪2-cell胚胎芽细胞的异质性及其与胚胎随后发育的关系。 | 本研究对象为猪2-cell胚胎中的单个芽细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA | 包含3种不同类型的2-cell胚胎：体内受精、体外受精和单性激活 |