单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 16941 - 16960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16941 | 2024-08-05 |
High expression of centromere protein A and its molecular mechanism and clinical significance in prostate cancer: A study based on data mining and immunohistochemistry
2023-10, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.12073
PMID:37488766
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研究论文 | 这项研究揭示了中心体蛋白A在前列腺癌中的重要作用及其分子机制和临床意义 | 本研究首次将中心体蛋白A的表达与前列腺癌和转移性前列腺癌的临床病理特征关联起来 | 本研究的局限性在于需要进一步实验验证CENPA在前列腺癌中的具体作用 | 阐明中心体蛋白A在前列腺癌中的重要作用及其临床意义 | 本研究的对象为前列腺癌及转移性前列腺癌患者的数据 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA测序和免疫组化 | NA | RNA数据 | 使用了大量的RNA测序数据及内部免疫组化数据 |
| 16942 | 2024-08-05 |
Transcriptomic evidence for Brachyury expression in the caudal tip region of adult Ptychodera flava (Hemichordata)
2023-Oct, Development, growth & differentiation
DOI:10.1111/dgd.12882
PMID:37483093
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研究论文 | 本文展示了在成年Ptychodera flava的尾端区域中Brachyury基因的表达情况 | 首次在成年阶段发现Brachyury基因的表达，扩展了对这一基因在发育过程中作用的理解 | 需要进一步研究Brachyury在成年个体中的具体功能 | 探讨Brachyury基因在成年Ptychodera flava中的表达模式及其潜在功能 | 成人Ptychodera flava的尾端区域细胞 | NA | NA | Iso-Seq, 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA序列数据 | 使用了成年Ptychodera flava的样本 |
| 16943 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis profiles cellular and molecular alterations in submandibular gland and blood in IgG4-related disease
2023-10, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-224363
PMID:37474274
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了IgG4相关疾病中颌下腺和外周血单个核细胞的细胞和分子改变 | 发现了IgG4相关疾病中颌下腺内三种新的组织驻留免疫细胞亚群，并揭示了免疫细胞与非免疫细胞间的通信模式变化 | NA | 旨在通过单细胞水平分析IgG4相关疾病受累组织和外周血单个核细胞的转录组图谱，以识别细胞群体及其间的相互作用，从而理解IgG4相关疾病的病因 | IgG4相关疾病患者的颌下腺和外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | IgG4相关疾病患者和匹配对照组的颌下腺和外周血单个核细胞样本 |
| 16944 | 2024-08-07 |
Dual-GCN-based deep clustering with triplet contrast for ScRNA-seq data analysis
2023-Oct, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本文提出了一种基于双图卷积网络（Dual-GCN）和三元组对比的深度聚类方法（scDGDC），用于单细胞RNA测序（ScRNA-seq）数据分析中的降维和聚类 | 引入了双图卷积网络编码器以捕获更全面的拓扑信息，并使用三元组对比来减少图卷积网络的过度平滑问题 | 现有的基于图的深度聚类算法在构建细胞图时忽略了节点的分布信息，导致嵌入表示中的信息不完整 | 优化单细胞RNA测序数据分析中的聚类和降维任务 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（ScRNA-seq） | 图卷积网络（GCN） | 基因表达数据 | 八个真实单细胞RNA测序数据集 |
| 16945 | 2024-08-07 |
Glyoxal as an alternative fixative for single-cell RNA sequencing
2023-09-30, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkad160
PMID:37494060
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研究论文 | 本文开发并测试了使用甘油醛作为固定剂进行单细胞RNA测序的协议 | 提出甘油醛作为单细胞RNA测序的新型固定剂，有效保留了细胞转录组状态 | NA | 探索甘油醛作为单细胞RNA测序固定剂的效果 | 果蝇和人类细胞的转录组 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 果蝇和人类细胞 |
| 16946 | 2024-08-07 |
AtacAnnoR: a reference-based annotation tool for single cell ATAC-seq data
2023-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad268
PMID:37497729
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研究论文 | 本文介绍了一种基于参考的单细胞ATAC-seq数据注释工具AtacAnnoR | AtacAnnoR采用两轮注释方法，使用高质量注释的scRNA-seq数据作为参考，并实现了'Combine and Discard'策略以提高多参考注释的准确性 | NA | 开发和评估一种新的单细胞ATAC-seq数据注释方法 | 单细胞ATAC-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 序列数据 | 11个基准数据集 |
| 16947 | 2024-08-07 |
Combining single-cell RNA sequencing with spatial transcriptome analysis reveals dynamic molecular maps of cambium differentiation in the primary and secondary growth of trees
2023-09-11, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2023.100665
PMID:37491818
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和空间转录组测序技术，揭示了树木初生和次生生长过程中形成层分化的转录组图谱 | 研究首次详细比较了初生和次生生长组织的细胞图谱和分化轨迹，揭示了不同的调控网络 | NA | 深入理解树木初生和次生生长过程中的细胞身份和分化过程 | 树木初生和次生生长组织中的形成层分化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组测序 | NA | 转录组数据 | 涉及杨树茎部的初生和次生生长组织 |
| 16948 | 2024-08-05 |
Voltage-Seq: all-optical postsynaptic connectome-guided single-cell transcriptomics
2023-09, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-01965-1
PMID:37474808
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研究论文 | 本研究介绍了一种新方法Voltage-Seq，通过全光学技术对神经元连接进行功能特征化，为单细胞转录组学提供指导 | 创新点在于结合全光学电压成像和单细胞RNA测序，能够基于特定的突触后反应类型精准选取神经元 | 本研究的局限性可能在于仅使用小鼠模型，不能代表其他物种或更广泛的生理条件 | 本研究的目的是开发一种新方法，以改进神经元的信息路由分析 | 研究对象为小鼠的周脑导水管灰质中的8347个神经元 | 数字病理学 | NA | 全光学电压成像，单细胞RNA测序 | NA | 神经元电活动数据 | 8347个神经元 |
| 16949 | 2024-08-05 |
FTO-mediated m6A modification alleviates autoimmune uveitis by regulating microglia phenotypes via the GPC4/TLR4/NF-κB signaling axis
2023-Sep, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2022.09.008
PMID:37492748
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研究论文 | 本研究探讨了FTO介导的m6A修饰如何通过GPC4/TLR4/NF-κB信号轴调控小胶质细胞表型，从而缓解自身免疫性葡萄膜炎 | 揭示了FTO在小胶质细胞中的作用及其通过GPC4/TLR4/NF-κB通路调节炎症的机制 | 尚未在临床样本中进行全面验证，且对FTO的治疗潜力需要进一步研究 | 研究FTO在自身免疫性葡萄膜炎中的作用及其机制 | 研究对象为小胶质细胞及其在自身免疫性葡萄膜炎中的表现 | 数字病理学 | 自身免疫性葡萄膜炎 | 单细胞测序(scRNA-seq)和RNA测序(RNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 以小鼠模型和人小胶质细胞克隆3(HMC3)细胞为样本进行验证 |
| 16950 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome, phagocytic activity and immunohistochemical analysis of crucian carp (Carassius auratus) in response to Rahnella aquatilis infection
2023-Sep, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2023.108970
PMID:37488042
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研究论文 | 研究报道了感染拉恩氏菌的鲫鱼后肾的单细胞转录组景观、免疫组织化学和吞噬特性 | 首次详细描述了鲫鱼免疫细胞和宿主-拉恩氏菌相互作用，有助于理解鲤科鱼类肾脏免疫细胞的生物学特性和潜在标记 | NA | 阐明鲫鱼在拉恩氏菌感染下的免疫细胞和细胞标记 | 鲫鱼的后肾免疫细胞及其在拉恩氏菌感染下的反应 | NA | NA | 单细胞转录组测序、免疫组织化学、TUNEL检测 | NA | 单细胞转录组数据 | 18种主要的免疫细胞群，包括单核细胞/巨噬细胞、树突状细胞、B细胞、T细胞、粒细胞和造血祖细胞 |
| 16951 | 2024-08-05 |
A combined microscopy and single-cell sequencing approach reveals the ecology, morphology, and phylogeny of uncultured lineages of zoosporic fungi
2023-08-31, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01313-23
PMID:37486265
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研究论文 | 该研究结合显微镜和单细胞测序方法，揭示了未经培养的水生真菌谱系的生态、形态和系统发育。 | 本研究为未描述的水生早期分支真菌线系提供了新的单细胞DNA序列，显示出其潜在的丰富多样性。 | 由于样本主要来自水生环境，研究结果未必适用于其他生态环境的真菌。 | 旨在通过单细胞测序深入了解未描述的水生真菌的生态功能和形态。 | 研究对象为127个主机关联真菌的单细胞样本。 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | DNA序列 | 127个真菌细胞样本 |
| 16952 | 2024-08-07 |
Sox10 escalates vascular inflammation by mediating vascular smooth muscle cell transdifferentiation and pyroptosis in neointimal hyperplasia
2023-08-29, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112869
PMID:37481722
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，发现Sox10在血管平滑肌细胞向巨噬细胞样细胞转化及焦亡过程中的作用，揭示了其在血管炎症和新生内膜增生中的调控机制 | 首次揭示Sox10通过PI3K/AKT信号通路诱导血管平滑肌细胞转化和焦亡，从而加剧血管炎症 | NA | 探讨Sox10在血管炎症和新生内膜增生中的作用及机制 | 血管平滑肌细胞、巨噬细胞样细胞、Sox10、新生内膜增生 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠 |
| 16953 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic characterization of sheep conceptus elongation and implantation
2023-Aug-29, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112860
PMID:37494181
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了绵羊胚胎在植入前和植入期的转录组动态变化 | 首次详细描述了绵羊胚胎在植入前和植入期的细胞类型分化和基因表达特征，揭示了胚胎与子宫内膜之间的分子对话机制 | NA | 探究绵羊胚胎在植入前和植入期的转录组动态变化及其与子宫内膜的相互作用 | 绵羊胚胎和子宫内膜在植入前和植入期的细胞类型和基因表达 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个绵羊胚胎和子宫内膜样本 |
| 16954 | 2024-08-07 |
Transcriptomic differences between human 8-cell-like cells reprogrammed with different methods
2023-08-08, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2023.06.009
PMID:37478859
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research paper | 本文总结了产生人类8细胞样细胞（8CLCs）的方法，并通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集与人类胚胎数据，比较了它们的转录组特征。 | 首次系统总结了产生人类8CLCs的方法，并通过scRNA-seq数据集的整合，比较了不同方法产生的8CLCs的转录组差异。 | 人类胚胎激活（EGA）的研究仍因缺乏体外细胞模型而未完全阐明。 | 旨在比较和验证不同方法产生的8CLCs模型，并促进对人类胚胎激活和植入前发育相关基因的深入研究。 | 人类8细胞样细胞（8CLCs）及其转录组特征。 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 16955 | 2024-08-05 |
Convergent alteration of the mesenchymal stem cell heterogeneity in adipose tissue during aging
2023-08, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202300807R
PMID:37498236
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研究论文 | 本研究分析了年龄对脂肪来源干细胞（ASCs）异质性的影响，发现ASCs在衰老过程中的异质性丧失 | 该研究揭示了不同年龄组ASCs的五种亚型及其随着年龄增长的异质性丧失，并识别出ASC-4特异性转录因子 | 仅分析了来自C57BL/6小鼠的单细胞RNA测序数据，可能存在物种或模型特异性 | 探讨年龄对脂肪来源干细胞异质性影响及其生物学过程 | 来自不同年龄组C57BL/6小鼠的脂肪来源干细胞 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 来自不同年龄（2周、8周、18个月）的小鼠的脂肪组织 |
| 16956 | 2024-08-05 |
Analysis of intercellular communication in the osteosarcoma microenvironment based on single cell sequencing data
2023-Aug, Journal of bone oncology
IF:3.1Q2
DOI:10.1016/j.jbo.2023.100493
PMID:37501717
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研究论文 | 本研究分析了骨肉瘤微环境中的细胞间通讯 | 首次通过单细胞测序数据深入探讨了骨肉瘤微环境中不同细胞类型的相互关系 | 本研究的样本量较小，仅涉及六位未治疗的骨肉瘤患者 | 理解骨肉瘤微环境中不同细胞之间的通讯机制 | 针对六名未治疗的骨肉瘤患者进行的单细胞测序数据分析 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 六名患者的46046个细胞 |
| 16957 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics of human placentas reveal distinct RNA patterns associated with morphology and preeclampsia
2023-08, Placenta
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.placenta.2023.07.004
PMID:37481829
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研究论文 | 该文章展示了空间转录组学在研究人类胎盘中的应用 | 首次将空间转录组学应用于人类胎盘组织，揭示不同形态结构对应的RNA模式 | 未提到具体的样本数量和购买的样本特征 | 研究人类胎盘组织中RNA水平的模式与形态的关联 | 全程健康妊娠与妊娠高血压疾病的胎盘样本 | 数字病理学 | 妊娠高血压 | 空间转录组学 | NA | RNA水平数据 | NA |
| 16958 | 2024-08-07 |
ARGLRR: A Sparse Low-Rank Representation Single-Cell RNA-Sequencing Data Clustering Method Combined with a New Graph Regularization
2023-08, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2023.0077
PMID:37471220
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研究论文 | 本文提出了一种名为ARGLRR的新型单细胞RNA测序数据聚类方法，该方法结合了稀疏低秩表示和新的图正则化技术 | ARGLRR方法通过引入调整后的随机游走图正则化，能够同时捕捉单细胞RNA测序数据的局部和全局结构，并通过相似性约束进一步提高细胞间相似性和全局结构关系的估计能力 | NA | 开发一种新的单细胞RNA测序数据聚类方法，以提高细胞类型识别的准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 稀疏低秩表示模型 | 基因表达数据 | 九个已知的单细胞RNA测序数据集 |
| 16959 | 2024-08-07 |
Liver macrophages show an immunotolerance phenotype in nonalcoholic fatty liver combined with Porphyromonas gingivalis-lipopolysaccharide infection
2023-Aug-01, Hua xi kou qiang yi xue za zhi = Huaxi kouqiang yixue zazhi = West China journal of stomatology
DOI:10.7518/hxkq.2023.2023111
PMID:37474470
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研究论文 | 本研究旨在探讨非酒精性脂肪肝合并牙龈卟啉单胞菌感染中局部巨噬细胞的功能及其潜在调控靶点 | 研究揭示了牙龈卟啉单胞菌脂多糖诱导非酒精性脂肪肝中局部巨噬细胞的免疫耐受表型，这一发现可能为临床治疗提供潜在的治疗靶点 | NA | 探索非酒精性脂肪肝合并牙龈卟啉单胞菌感染中局部巨噬细胞的功能及其潜在调控靶点 | 非酒精性脂肪肝合并牙龈卟啉单胞菌感染中的局部巨噬细胞 | NA | 非酒精性脂肪肝 | 单细胞RNA测序, 实时聚合酶链反应, 酶联免疫吸附测定, 免疫荧光染色 | NA | RNA | NASH小鼠的肝脏组织及小鼠腹膜巨噬细胞 |
| 16960 | 2024-08-07 |
Liquid extramedullary disease in multiple myeloma strongly predicts a poor prognosis and is associated with bortezomib resistance gene upregulation
2023-Aug-01, Clinica chimica acta; international journal of clinical chemistry
DOI:10.1016/j.cca.2023.117497
PMID:37479009
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研究论文 | 本研究回顾性分析了多发性骨髓瘤（MM）患者中伴有髓外疾病（EMD）复发的基线特征和治疗情况，特别是髓外疾病中的浆液性渗出（ME）亚型 | 发现髓外恶性浆细胞中存在高表达的硼替佐米耐药基因 | 研究为回顾性分析，样本量相对较小 | 探讨多发性骨髓瘤患者髓外疾病复发的预后因素及硼替佐米耐药基因的表达情况 | 多发性骨髓瘤伴有髓外疾病复发的患者 | NA | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 14例伴有ME复发的EMD患者和21例不伴有ME复发的EMD患者 |