单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 16921 - 16940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16921 | 2024-08-05 |
Effective Preprocessing of Single-Cell RNA-Seq for Unravelling Alzheimer's Disease Signatures
2023, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-31978-5_25
PMID:37525052
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研究论文 | 本研究探讨了单细胞RNA测序数据的预处理方法，以揭示阿尔茨海默病的特征 | 开发了一个探索性数据分析方法论，结合多种工具有效处理单细胞RNA测序数据 | 数据复杂性可能导致分析挑战，需要谨慎处理 | 研究单细胞RNA测序在阿尔茨海默病诊断中的应用 | 阿尔茨海默病的数据集 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 16922 | 2024-08-05 |
Cuproptosis/ferroptosis-related gene signature is correlated with immune infiltration and predict the prognosis for patients with breast cancer
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1192434
PMID:37521466
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研究论文 | 本研究开发了一个与铜致死/铁死亡相关的基因预测模型，以预测乳腺癌患者的生存情况 | 提出了一种新的生存预测模型，该模型基于铜致死和铁死亡相关基因，能够有效评估乳腺癌患者的预后 | 该研究的样本来源主要依赖于TCGA和GEO数据库，可能存在样本选择偏倚 | 研究的目的是构建一个用于预测乳腺癌患者生存的预后模型 | 研究对象为乳腺浸润性癌（BRCA）患者的转录组和临床数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 基因组数据分析 | 比例风险回归模型 | 转录组数据 | 共涉及验证集和训练集的乳腺癌样本，具体数量未说明 |
| 16923 | 2024-08-05 |
Integrative analysis of multi-omics data for discovery of ferroptosis-related gene signature predicting immune activity in neuroblastoma
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1162563
PMID:37521469
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研究论文 | 本研究构建了一种与铁死亡相关的基因签名，以预测神经母细胞瘤的免疫活性 | 提出了一种新的FRG签名，可用于评估神经母细胞瘤免疫治疗效果，并整合多组学数据进行预测 | 尚需更多临床验证以确保在不同患者群体中的普遍适用性 | 探索神经母细胞瘤的免疫治疗结果的评估签名 | 神经母细胞瘤患者及其相关基因 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | RNA测序和蛋白质组学 | Cox回归模型 | 基因数据 | 训练队列(GSE62564)及外部验证队列(TCGA)中的患者数据 |
| 16924 | 2024-08-05 |
Spatial metabolomics in head and neck tumors: a review
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1213273
PMID:37519782
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综述 | 该文章全面回顾了空间代谢组学在头颈肿瘤研究中的应用进展 | 文章创新性地对传统代谢组学和空间代谢组学进行了比较，并讨论了空间代谢组学结合多组学在肿瘤代谢重编程研究中的应用挑战 | 对头颈肿瘤代谢机制的研究仍然处于未充分开发的阶段 | 探讨头颈肿瘤的代谢机制及其发生、发展和预后的研究进展 | 头颈肿瘤的代谢机制 | 数字病理学 | NA | 空间代谢组学 | NA | NA | NA |
| 16925 | 2024-08-05 |
A Consensus Gene Regulatory Network for Neurodegenerative Diseases Using Single-Cell RNA-Seq Data
2023, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-31978-5_20
PMID:37525047
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研究论文 | 该文章提出了一种基于单细胞RNA测序数据的神经退行性疾病共识基因调控网络 | 创新点在于开发了一种集成方法，通过整合不同的基因调控网络算法来提升生物学见解 | 尽管采用了集成方法，但每个基因调控网络算法仍然基于其自身的假设，可能会限制预测的生物学意义 | 本研究旨在构建一个共识基因调控网络，以更好地理解神经退行性疾病的基因调控机制 | 研究对象为来自CK-p25小鼠模型的单细胞RNA测序数据集 | 系统生物学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 集成基因调控网络算法 | 基因表达数据 | NA |
| 16926 | 2024-08-05 |
High throughput isolation of RNA from single-cells within an intact tissue for spatial and temporal sequencing a reality
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0289279
PMID:37527243
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研究论文 | 本研究开发了一种自动化的纳米吸管技术，以高通量从完整组织中分离单细胞RNA | 创新点在于结合了全自动纳米吸管技术与磁性纳米粒子，消除了手动操作的需求 | 研究未针对不同类型组织的适用性进行深入探讨 | 研究旨在提高从组织样本中获取高质量单细胞测序数据的效率 | 研究对象为来自乳腺癌组织切片的单个细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | NA | RNA数据 | 22个乳腺癌组织切片中的细胞 |
| 16927 | 2024-08-07 |
Autoimmune thyroid disease disrupts immune homeostasis in the endometrium of unexplained infertility women-a single-cell RNA transcriptome study during the implantation window
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1185147
PMID:37501789
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了自身免疫性甲状腺疾病（AITD）患者在着床窗口期子宫内膜的免疫微环境 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了AITD患者子宫内膜中免疫细胞亚型的组成和基因表达模式的差异 | 样本量较小，仅包括3名AITD患者和3名对照组 | 探讨AITD如何影响不明原因不孕女性子宫内膜的免疫稳态及其对着床的影响 | 不明原因不孕女性中AITD患者的子宫内膜免疫细胞 | NA | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 3名AITD患者和3名对照组 |
| 16928 | 2024-08-07 |
Integrating scRNA and bulk-RNA sequencing develops a cell senescence signature for analyzing tumor heterogeneity in clear cell renal cell carcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1199002
PMID:37503331
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（Bulk RNA-seq），开发了一种细胞衰老标志物，用于分析透明细胞肾细胞癌（ccRCC）的肿瘤异质性 | 本研究创新性地结合了scRNA-seq和Bulk RNA-seq技术，以识别ccRCC中恶性与非恶性表型在三个衰老相关通路中的差异，并构建了一个新的风险模型 | NA | 分析细胞衰老在透明细胞肾细胞癌中的生化特性 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的细胞衰老 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（Bulk RNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 16929 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals tumor immune microenvironment in human hypopharygeal squamous cell carcinoma and lymphatic metastasis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1168191
PMID:37503341
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了人喉下鳞状细胞癌及其淋巴转移的肿瘤免疫微环境 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了喉下鳞状细胞癌及其淋巴转移中的肿瘤免疫微环境，并识别了特定的细胞群和标记基因 | 研究样本仅来自五名患者，可能影响结果的普遍性 | 研究喉下鳞状细胞癌的肿瘤免疫微环境，以提供新的治疗靶点和策略 | 喉下鳞状细胞癌、癌旁组织及淋巴组织 | 数字病理学 | 头颈部癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 132,869个单细胞样本，来自五名喉下鳞状细胞癌患者 |
| 16930 | 2024-08-07 |
A chemotherapy response prediction model derived from tumor-promoting B and Tregs and proinflammatory macrophages in HGSOC
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1171582
PMID:37519793
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于肿瘤促进B细胞、Tregs和促炎性巨噬细胞的高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）化疗反应预测模型 | 该模型包含43个特征基因，AUC值达到0.97，显著优于现有预测模型 | NA | 开发新的预测标志物，以准确预测高级别浆液性卵巢癌患者的化疗反应 | 高级别浆液性卵巢癌患者的化疗反应 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 预测模型 | RNA-seq数据 | 88个样本 |
| 16931 | 2024-08-07 |
Aerosolized miR-138-5p and miR-200c targets PD-L1 for lung cancer prevention
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1166951
PMID:37520581
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研究论文 | 本研究探讨了通过吸入方式递送miR-138-5p和miR-200c模拟物在肺癌预防中的联合效果 | 采用吸入方式递送微小RNA（miRNA）作为肺癌预防的新方法 | NA | 研究通过吸入方式递送miR-138-5p和miR-200c在肺癌预防中的效果 | miR-138-5p和miR-200c在肺癌预防中的作用 | NA | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和成像质谱流式细胞术（IMC） | NA | NA | 小鼠 |
| 16932 | 2024-08-07 |
Smart Microfluidics: Synergy of Machine Learning and Microfluidics in the Development of Medical Diagnostics for Chronic and Emerging Infectious Diseases
2023, Critical reviews in biomedical engineering
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研究论文 | 本文探讨了机器学习与微流控技术在慢性及新兴传染病医疗诊断中的协同作用 | 结合微流控技术和机器学习算法，开发智能微流控即时诊断设备，以应对传染病和慢性疾病的挑战 | 微流控系统的设计、制造和操作复杂性限制了其广泛应用 | 开发适用于发展中国家的智能微流控即时诊断设备，以改善临床结果 | 慢性及新兴传染病 | 机器学习 | NA | 微流控技术 | 机器学习算法 | NA | NA |
| 16933 | 2024-08-07 |
Identifying Network Biomarkers for Alzheimer's Disease Using Single-Cell RNA Sequencing Data
2023, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-31978-5_19
PMID:37525046
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研究论文 | 本文提出了一种R工作流程，用于从通路网络中提取疾病扰动的子通路，并结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）表达谱构建基因-基因相互作用网络，以识别阿尔茨海默病（AD）的网络生物标志物。 | 本文采用了单细胞RNA测序技术，并结合系统层面的网络方法，提取疾病扰动的子通路，为复杂疾病如阿尔茨海默病的研究提供了新的网络生物标志物。 | NA | 开发一种新的方法来识别阿尔茨海默病的网络生物标志物。 | 阿尔茨海默病（AD）的网络生物标志物。 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 16934 | 2024-08-07 |
Oral cavity infection by the SARS-CoV-2: emphasizing the essence of masking and peptide therapeutics
2022, The Egyptian journal of medical human genetics
DOI:10.1186/s43042-022-00213-z
PMID:37521842
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研究论文 | 本文研究了SARS-CoV-2通过口腔黏膜感染的机制，并探讨了口罩预防和肽类治疗药物的潜在应用 | 设计了一种潜在的肽类治疗药物，用于抑制TMPRSS2，并强调了预防性口罩的重要性 | NA | 探讨SARS-CoV-2通过口腔黏膜感染的机制及开发新的治疗方法 | SARS-CoV-2的感染机制及TMPRSS2的抑制 | NA | COVID-19 | scRNA-Seq | NA | 蛋白质表达数据 | NA |
| 16935 | 2024-08-07 |
Comprehensive analysis of anoikis-related genes in prognosis and immune infiltration of gastric cancer based on bulk and single-cell RNA sequencing data
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05157-4
PMID:37474682
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研究论文 | 本研究基于批量和单细胞RNA测序数据，全面分析了与胃癌预后和免疫浸润相关的凋亡相关基因 | 建立了基于七个凋亡相关基因的预后风险模型，该模型在多个数据集中表现良好，并能指导药物治疗 | NA | 探索凋亡抵抗在胃癌细胞转移中的关键作用，并开发新的胃癌治疗方法 | 胃癌患者的预后和免疫细胞浸润情况 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA测序 | Cox回归模型 | RNA测序数据 | 涉及多个数据集的胃癌样本 |
| 16936 | 2024-08-07 |
Invariant natural killer T cells drive hepatic homeostasis in nonalcoholic fatty liver disease via sustained IL-10 expression in CD170+ Kupffer cells
2023-11, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350474
PMID:37489253
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研究论文 | 通过高维单细胞RNA测序技术，研究了胚胎来源的枯否细胞（KCs）在非酒精性脂肪肝病（NAFLD）中的作用，并揭示了不变自然杀伤T细胞（iNKT）通过维持CD170+枯否细胞中的IL-10表达来驱动肝脏稳态的机制 | 首次鉴定了两种具有不同基因表达谱的枯否细胞亚群（KC-1和KC-2），并揭示了iNKT细胞与KC-1细胞之间的CD206介导的交叉对话对IL-10表达的影响 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步在人类样本中验证这些发现 | 探讨枯否细胞亚群在非酒精性脂肪肝病中的作用及其与iNKT细胞的相互作用 | 枯否细胞亚群、iNKT细胞、IL-10表达 | NA | 非酒精性脂肪肝病 | 高维单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胚胎来源的枯否细胞 |
| 16937 | 2024-08-07 |
MTHFD2 ablation in T cells protects against heart transplant rejection by perturbing IRF4/PD-1 pathway through the metabolic-epigenetic nexus
2023-Nov, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2023.07.009
PMID:37495036
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研究论文 | 本研究探讨了一碳代谢酶MTHFD2在T细胞中的缺失如何通过代谢-表观遗传机制影响IRF4/PD-1通路，从而保护心脏移植免受排斥反应。 | 首次揭示了一碳代谢酶MTHFD2在心脏移植排斥反应中的作用，并阐明了其通过代谢-表观遗传机制影响IRF4/PD-1通路的机制。 | NA | 研究一碳代谢酶MTHFD2在心脏移植排斥反应中的作用及其机制。 | 心脏移植排斥反应中的T细胞和一碳代谢酶MTHFD2。 | NA | 心血管疾病 | 转录组学、代谢组学、单细胞RNA测序、免疫荧光、流式细胞术、酶联免疫吸附试验、Cleavage Under Targets and Tagmentation assay | NA | 转录组数据、代谢数据、单细胞RNA数据 | 人类和小鼠心脏移植受者的组织样本 |
| 16938 | 2024-08-05 |
SCM is potential resource for non-invasive preimplantation genetic testing based on human embryos single-cell sequencing
2023-Oct-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2023.147647
PMID:37473972
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研究论文 | 本研究探讨了使用胎胚单细胞测序的非侵入性植入前基因检测的潜力 | 本文章创新点在于提出了使用花球液（SCM）作为更有效的胚胎DNA来源进行植入前基因检测 | 目前非侵入性植入前基因检测的临床应用受到灵敏度和特异性不足的限制 | 本研究旨在提高非侵入性植入前基因检测的有效性 | 本研究的对象为218个人胚胎 | 数字病理学 | NA | 单细胞全基因组扩增（WGA） | NA | 基因组数据 | 218个人胚胎 |
| 16939 | 2024-08-05 |
T-cell subsets in allergy and tolerance induction
2023-10, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202249983
PMID:37489248
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研究论文 | 讨论抗原特异性T淋巴细胞在过敏和耐受诱导中的作用 | 介绍了通过多参数流式细胞术和单细胞测序直接表征过敏原特异性T细胞的新技术 | 目前对过敏免疫治疗（AIT）机制的理解仍不完全 | 研究T细胞亚群在健康状态、过敏敏感化过程和AIT中的作用 | 抗原特异性T细胞的不同表型和功能特征 | 数字病理学 | 过敏 | 单细胞测序、多参数流式细胞术 | NA | 细胞 | NA |
| 16940 | 2024-08-05 |
m6A regulator-mediated RNA methylation modification remodels immune microenvironment in dilated cardiomyopathy
2023-Oct, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31085
PMID:37475583
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研究论文 | 本研究探讨了m6A调节因子介导的RNA甲基化对扩张型心肌病中的免疫微环境的重塑作用 | 本研究首次验证了IGFBP2在扩张型心肌病中的关键作用及其在免疫微环境中的重塑机制 | 此研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类的病理情况 | 探讨m6A RNA甲基化如何影响扩张型心肌病患者的免疫微环境 | 扩张型心肌病小鼠模型及相关免疫细胞的研究 | 数字病理 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | RNA、蛋白质 | N/A |