单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 16901 - 16920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16901 | 2024-08-05 |
Follicular development and ovary aging: single-cell studies
2023-Jul-28, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioad080
PMID:37504504
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综述 | 本文总结了卵泡发育与卵巢衰老的单细胞研究进展 | 强调单细胞测序技术在揭示个体细胞独特分子机制方面的创新 | 总结了传统方法在卵泡发育研究中的局限性 | 探讨卵泡发育的生理与病理机制 | 聚焦卵巢内的卵母细胞、颗粒细胞、冠层细胞和卵泡膜细胞等各种细胞 | 数字病理学 | 不育症 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 16902 | 2024-08-05 |
Evaluating imputation methods for single-cell RNA-seq data
2023-Jul-28, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05417-7
PMID:37507764
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研究论文 | 本研究对11种最新的单细胞RNA测序数据插补方法进行了评估 | 评估了多种插补算法在不同真实和模拟数据集上的表现，并揭示了它们的优缺点 | 一些方法在真实数据集上的表现差，且未能成功插补所有标记基因 | 系统评估不同的单细胞RNA测序数据插补算法 | 12个真实的生物数据集和4个模拟数据集 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 生物数据集 | 12个真实数据集和4个模拟数据集 |
| 16903 | 2024-08-07 |
Small Leucine-Rich Proteoglycan PODNL1 Identified as a Potential Tumor Matrix-Mediated Biomarker for Prognosis and Immunotherapy in a Pan-Cancer Setting
2023-Jul-22, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb45070386
PMID:37504302
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研究论文 | 本文研究了小亮氨酸丰富蛋白聚糖家族成员PODNL1在泛癌环境中的预后价值和免疫治疗作用 | 首次系统评估了PODNL1在泛癌环境中的预后价值及其在肿瘤微环境中的作用 | NA | 探讨PODNL1作为泛癌环境下肿瘤基质介导的生物标志物在预后和免疫治疗中的潜力 | PODNL1在不同癌症中的表达及其与预后和免疫治疗反应的关系 | 数字病理学 | 泛癌 | 多重免疫荧光染色 | NA | 转录组数据 | 涉及33种癌症类型的样本 |
| 16904 | 2024-08-07 |
Tissue Inhibitor of Metalloproteinases-1 Interacts with CD74 to Promote AKT Signaling, Monocyte Recruitment Responses, and Vascular Smooth Muscle Cell Proliferation
2023-07-20, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12141899
PMID:37508563
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研究论文 | 研究探讨了组织金属蛋白酶抑制剂-1（TIMP-1）与CD74相互作用对AKT信号传导、单核细胞招募反应和血管平滑肌细胞增殖的影响 | 首次详细研究了TIMP-1通过CD74介导的生物学效应，包括对单核细胞和血管平滑肌细胞的影响 | NA | 评估TIMP-1-CD74轴在血管炎症和动脉粥样硬化中的作用 | TIMP-1与CD74的相互作用及其对单核细胞和血管平滑肌细胞的影响 | NA | 心血管疾病 | 序列比对、蛋白质-蛋白质对接分析、磷酸化激酶阵列、Transwell迁移、3D-基于趋化性、流粘附试验、活细胞成像 | NA | scRNA-seq数据 | THP-1前单核细胞、初级人类单核细胞、血管平滑肌细胞 |
| 16905 | 2024-08-07 |
Smooth Muscle Heterogeneity and Plasticity in Health and Aortic Aneurysmal Disease
2023-Jul-20, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241411701
PMID:37511460
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综述 | 本文综述了血管平滑肌细胞（VSMCs）在健康和主动脉瘤疾病中的异质性和可塑性 | 通过高分辨率研究方法，如谱系追踪和单细胞RNA测序，揭示了VSMCs前所未有的异质性和多样性及其与主动脉瘤的复杂关系 | NA | 旨在增进对健康和动脉瘤疾病中VSMC多样性的理解 | 血管平滑肌细胞（VSMCs）及其在主动脉瘤中的作用 | NA | 主动脉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 16906 | 2024-08-07 |
Cuproptosis and Immune-Related Gene Signature Predicts Immunotherapy Response and Prognosis in Lung Adenocarcinoma
2023-Jul-19, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life13071583
PMID:37511958
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研究论文 | 研究探讨了铜死亡及其相关免疫基因在肺腺癌中的作用，以及它们对免疫治疗反应和预后的影响 | 首次揭示了铜死亡相关免疫基因在肺腺癌中的作用，并建立了一个风险模型和诺模图来预测免疫治疗反应和预后 | 研究主要基于生物信息学方法和体外实验，需要进一步的临床验证 | 评估铜死亡相关免疫基因在肺腺癌中的作用，并预测免疫治疗反应和预后 | 肺腺癌患者及其免疫治疗反应和预后 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 实时定量PCR (RT-qPCR), 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 风险模型和诺模图 | 基因表达数据 | 具体的样本数量未在摘要中明确提及 |
| 16907 | 2024-08-07 |
Embryonic Development of Parthenogenetic and Sexual Eggs in Lower Termites
2023-Jul-15, Insects
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/insects14070640
PMID:37504646
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研究论文 | 本研究观察并描述了低等白蚁中孤雌生殖和有性卵的胚胎发育阶段 | 首次完成了孤雌生殖和有性卵的数据库 | NA | 研究低等白蚁中孤雌生殖和有性卵的胚胎发育 | 低等白蚁的孤雌生殖和有性卵 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 16908 | 2024-08-05 |
Scaffold-Based (Matrigel™) 3D Culture Technique of Glioblastoma Recovers a Patient-like Immunosuppressive Phenotype
2023-07-14, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12141856
PMID:37508520
|
研究论文 | 本研究探讨了支架基础（Matrigel™）3D培养技术如何改善2D培养的局限性 | 发现支架基础（Matrigel™）3D培养技术可影响GBM模型的转录谱，体现肿瘤-免疫相互作用的临床相关性 | 研究中未提到的局限性 | 研究支架基础3D培养技术在癌症研究中的应用 | 比较2D和3D模型中与免疫相关基因转录的变化 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | NGS | 未提及 | 基因组数据 | 未明确提及的配对样本数量 |
| 16909 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptomics for Unlocking Personalized Cancer Immunotherapy: Toward Targeting the Origin of Tumor Development Immunogenicity
2023-Jul-14, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15143615
PMID:37509276
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综述 | 本文探讨了单细胞转录组学如何用于开发个性化癌症免疫疗法。 | 本研究创新性地将未分化肿瘤细胞群体与个性化免疫治疗联系起来，强调了OTD在肿瘤异质性中的作用。 | 缺乏具体的实验数据来支持OTD的功能和生物标志物的验证。 | 研究如何利用单细胞转录组学信息来增强癌症免疫疗法的个性化效果。 | 研究主要集中在不同患者的肿瘤细胞及其微环境，特别是OTD细胞群体。 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞转录组学 | NA | 基因数据 | NA |
| 16910 | 2024-08-07 |
Cryobiopsy: A Breakthrough Strategy for Clinical Utilization of Lung Cancer Organoids
2023-07-14, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12141854
PMID:37508518
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research paper | 本文探讨了使用冷冻活检技术从晚期肺癌患者中成功生成肺肿瘤类器官（LCOs）的方法 | 首次尝试从冷冻活检样本中创建肺肿瘤类器官，提高了类器官培养的成功率，并保留了原发肿瘤的特征 | 肺肿瘤类器官培养中正常肺细胞的过度生长问题以及最佳培养条件的确定仍待解决 | 解决晚期肺癌患者无法通过手术获取肺肿瘤类器官的问题，提高类器官培养的成功率 | 晚期肺癌患者的冷冻活检样本 | digital pathology | lung cancer | 冷冻活检 | NA | 组织样本 | 113例晚期肺癌患者 |
| 16911 | 2024-08-07 |
Crk/Crkl regulates early angiogenesis in mouse embryos by accelerating endothelial cell maturation
2023-Jul-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.12.548782
PMID:37503032
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研究论文 | 本文研究了Crk和Crkl在胚胎早期血管发育中的作用，通过单细胞RNA测序揭示了它们对内皮细胞成熟的影响 | 首次在单细胞水平上揭示了Crk和Crkl在胚胎血管发育中的作用，并通过单细胞RNA测序分析了其分子机制 | 研究仅限于小鼠胚胎，且未探讨Crk和Crkl在其他物种或成人中的作用 | 确定Crk和Crkl在胚胎中胚层早期小鼠血管发育中的功能，并探索其分子机制 | Crk和Crkl在小鼠胚胎血管发育中的作用及内皮细胞的分子机制 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及小鼠胚胎的中胚层细胞 |
| 16912 | 2024-08-07 |
Single-Cell Atlas Reveals the Hemocyte Subpopulations and Stress Responses in Asian Giant Softshell Turtle during Hibernation
2023-Jul-12, Biology
DOI:10.3390/biology12070994
PMID:37508424
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，比较了亚洲巨型软壳龟在活跃状态和冬眠期间血细胞的分子特征，揭示了血细胞亚群及其在冬眠期间的应激反应 | 发现了六种细胞类型及每个细胞亚群的新标记基因，并确定了冬眠期间上调的热休克基因和免疫相关基因 | NA | 探究龟类冬眠期间的季节性适应机制 | 亚洲巨型软壳龟的血细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 16913 | 2024-08-07 |
Derivation of Human Extraembryonic Mesoderm-like Cells from Primitive Endoderm
2023-Jul-12, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241411366
PMID:37511125
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研究论文 | 本研究开发了一种从原始内胚层样细胞（nEnd）生成人类胚外中胚层样细胞（ExM-like）的协议 | 首次证实了人类胚外中胚层可以从原始内胚层衍生，并建立了一个细胞培养系统来研究人类胚外中胚层在胚胎发育早期的作用 | NA | 探讨人类胚外中胚层的起源及其在胚胎发育中的作用 | 人类胚外中胚层样细胞及其在胚胎发育中的功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 细胞 | NA |
| 16914 | 2024-08-07 |
Molecular Subtypes and Tumor Microenvironment Characteristics of Small-Cell Lung Cancer Associated with Platinum-Resistance
2023-Jul-11, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15143568
PMID:37509231
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研究论文 | 本文旨在通过基因表达分类细化小细胞肺癌（SCLC）的分子亚型，并探索与铂类耐药相关的肿瘤微环境（TME）特征 | 首次揭示了SCLC的四种分子亚型及其与铂类耐药的关系，特别是EndMT在SCLC-I亚型中的不良预后作用，并提出了BET抑制剂作为克服铂类耐药的新候选药物 | NA | 细化小细胞肺癌的分子亚型并揭示与铂类耐药相关的肿瘤微环境特征 | 小细胞肺癌的分子亚型及其与铂类耐药的关系 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 81个基因表达样本和87个验证样本 |
| 16915 | 2024-08-05 |
Disease-Associated Oligodendrocyte: New Player in Alzheimer's Disease and CNS Pathologies
2023-Jul-07, Journal of integrative neuroscience
IF:2.5Q3
DOI:10.31083/j.jin2204090
PMID:37519162
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评论 | 本文章探讨了与阿尔茨海默病相关的少突胶质细胞的作用 | 强调了少突胶质细胞在阿尔茨海默病及中枢神经系统病理中的潜在新角色 | 研究主要为综述，缺乏实证研究支持 | 探讨少突胶质细胞在认知下降中的角色及其分子特征 | 与阿尔茨海默病相关的少突胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 16916 | 2024-08-05 |
Spatial Omics Sequencing Based on Microfluidic Array Chips
2023-Jul-06, Biosensors
DOI:10.3390/bios13070712
PMID:37504111
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综述 | 这篇文章介绍了基于微流体阵列芯片的空间组学测序技术的发展 | 文章创新点在于展示了不同微流体设计中条形码策略的简便性和高效性 | 文章未具体指出实验数据和案例研究 | 研究空间组学测序技术及其在微流体芯片上的应用 | 基于微流体阵列芯片的空间组学测序技术 | 数字病理学 | NA | 微流体阵列芯片 | NA | NA | NA |
| 16917 | 2024-08-07 |
Relationship between Macrophages and Tissue Microenvironments in Diabetic Kidneys
2023-Jul-03, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines11071889
PMID:37509528
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研究论文 | 本文探讨了巨噬细胞与糖尿病肾脏组织微环境之间的关系及其在糖尿病肾病发展中的作用 | 利用单细胞RNA测序技术确认了糖尿病肾病中巨噬细胞的异质性和可塑性 | NA | 研究巨噬细胞在糖尿病肾病中的作用及其与组织微环境的关系 | 巨噬细胞及其在糖尿病肾病中的功能和与组织微环境的相互作用 | NA | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 16918 | 2024-08-07 |
Identification of Gene Markers Associated with COVID-19 Severity and Recovery in Different Immune Cell Subtypes
2023-Jul-02, Biology
DOI:10.3390/biology12070947
PMID:37508378
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研究论文 | 本研究旨在揭示COVID-19不同阶段不同免疫细胞亚群的分子特征，通过机器学习工作流程分析scRNA-seq数据，识别与COVID-19严重程度和恢复相关的基因标记 | 采用机器学习方法分析scRNA-seq数据，结合多种特征选择算法和分类算法，提取关键基因特征并构建高性能分类器 | NA | 揭示COVID-19不同阶段不同免疫细胞亚群的分子特征 | COVID-19患者的免疫细胞亚群及其分子水平变化 | 机器学习 | COVID-19 | scRNA-seq | 机器学习模型（决策树、k-最近邻、随机森林） | scRNA-seq数据 | 403,700个B细胞样本，634,595个T细胞样本，346,547个髓系细胞样本 |
| 16919 | 2024-08-07 |
Profiling A-to-I RNA editing during mouse somatic reprogramming at the single-cell level
2023-Jul, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e18133
PMID:37519753
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据分析了小鼠体细胞重编程过程中A-to-I RNA编辑位点的变化 | 首次在单细胞水平上分析了A-to-I RNA编辑频率的广泛变化及其与ADAR1表达的相关性 | NA | 研究小鼠体细胞重编程过程中A-to-I RNA编辑的动态变化及其生物学意义 | 小鼠体细胞重编程过程中的A-to-I RNA编辑 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 16920 | 2024-08-07 |
Quantitative Spatial Analysis of Neuroligin-3 mRNA Expression in the Enteric Nervous System Reveals a Potential Role in Neuronal-Glial Synapses and Reduced Expression in Nlgn3R451C Mice
2023-06-30, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13071063
PMID:37509099
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研究论文 | 本文通过结合RNAScope原位杂交和免疫荧光技术，量化分析了Neuroligin-3 mRNA在肠道神经系统中的空间表达，并探讨了其在神经-胶质突触中的潜在作用及在Nlgn3R451C小鼠中的表达减少情况。 | 首次详细描述了Neuroligin-3 mRNA在肠道神经系统中的细胞特异性表达模式，并验证了其在神经-胶质相互作用中的作用。 | 研究仅限于小鼠模型，且依赖于特定的基因突变，可能限制了结果的普遍性。 | 探讨Neuroligin-3 mRNA在肠道神经系统中的表达及其在自闭症谱系障碍和胃肠功能障碍中的潜在作用。 | Neuroligin-3 mRNA在肠道神经系统中的表达，特别是在Nlgn3R451C突变小鼠中的表达。 | NA | 自闭症谱系障碍 | RNAScope原位杂交, 免疫荧光, 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 野生型和Nlgn3R451C突变小鼠 |