单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 16901 - 16920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16901 | 2024-08-05 |
Metformin rescues migratory deficits of cells derived from patients with periventricular heterotopia
2023-Oct-11, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.15252/emmm.202216908
PMID:37609821
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研究论文 | 本文研究了来自腔旁神经异位患者的细胞迁移缺陷及其恢复机制 | 发现通过调节自噬可以改善来自腔旁神经异位患者的神经前体细胞迁移缺陷 | 本研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类病理情况 | 探讨腔旁神经异位患者神经前体细胞迁移缺陷的机制及其恢复方法 | 来自腔旁神经异位患者的人类神经前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、电子显微镜分析、Western blot分析 | NA | 细胞样本 | NA |
| 16902 | 2024-08-07 |
Characterization of ccl20a.3 and ccl20l as gene markers for Th17 cell in turbot
2023-Oct, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2023.109005
PMID:37604262
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术在比目鱼中鉴定了Th17细胞特异性表达的两个趋化因子相关基因ccl20a.3和ccl20l | 首次在比目鱼中鉴定出Th17细胞特异性表达的ccl20a.3和ccl20l基因，并通过实验验证了它们在Th17细胞中的表达模式和功能 | NA | 旨在阐明Th17细胞在硬骨鱼中的功能及其特异性基因标记 | 比目鱼中的Th17细胞及其相关基因ccl20a.3和ccl20l | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 16903 | 2024-08-07 |
Cellular senescence primes liver fibrosis regression through Notch-EZH2
2023-Oct, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.346
PMID:37614965
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研究论文 | 本文研究了细胞衰老通过Notch-EZH2途径促进肝纤维化逆转的机制 | 首次揭示了细胞衰老通过Notch-EZH2途径影响肝纤维化逆转的机制，并证明了清除衰老细胞和阻断EZH2信号可以减缓肝纤维化进程 | NA | 探讨细胞衰老在肝纤维化逆转中的作用及其分子机制 | 肝纤维化逆转过程中的细胞衰老及其分子机制 | NA | 肝纤维化 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用dasatinib和quercetin清除衰老细胞，以及通过EPZ6438阻断EZH2信号进行实验 |
| 16904 | 2024-08-07 |
Differential variability analysis of single-cell gene expression data
2023-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad294
PMID:37598422
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研究论文 | 本文提出并比较了12种统计流程，用于分析单细胞基因表达数据的差异变异性 | 本文首次提出并比较了多种统计方法组合，用于量化和测试细胞间转录变异性的差异 | NA | 确定单细胞基因表达数据差异变异性分析的最佳实践 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | COVID-19, 自闭症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 高质量的合成scRNA-seq数据集，COVID-19和自闭症患者的scRNA-seq数据集 |
| 16905 | 2024-08-07 |
A pan-cancer single-cell panorama of human natural killer cells
2023-09-14, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2023.07.034
PMID:37607536
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研究论文 | 本研究通过综合单细胞RNA测序分析，描绘了来自716名涵盖24种癌症类型的患者的NK细胞在肿瘤微环境中的表型和功能多样性 | 发现了肿瘤相关NK细胞群，这些细胞在肿瘤中富集，表现出受损的抗肿瘤功能，并与不良预后和免疫治疗抵抗相关 | NA | 探究NK细胞在肿瘤微环境中的表型和功能多样性及其在癌症免疫中的作用 | 人类自然杀伤细胞（NK细胞）及其在不同癌症类型中的表现 | 数字病理学 | 多种癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 716名癌症患者 |
| 16906 | 2024-08-07 |
Deciphering the landscape of transcriptional heterogeneity across cancer
2023-09-11, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.07.008
PMID:37595585
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研究论文 | 通过整合77项研究和24种癌症类型的scRNA-seq数据集，揭示了癌症中转录异质性的复发性基因表达模式及其功能意义 | 首次大规模整合多个癌症类型的scRNA-seq数据，揭示了癌症转录异质性的复发性模式 | NA | 探索癌症中转录异质性的基因表达模式及其功能意义 | 77项研究和24种癌症类型的scRNA-seq数据 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 涉及77项研究和24种癌症类型 |
| 16907 | 2024-08-05 |
CellAnn: a comprehensive, super-fast, and user-friendly single-cell annotation web server
2023-09-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad521
PMID:37610325
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CellAnn的参考基础细胞注释网络服务器，具有超快和易于使用的特点 | CellAnn整合了全面的参考数据库和新的簇对簇对齐方法，提供更高的准确性和可扩展性 | 传统的参考基础方法在可扩展性和预处理参考数据集的缺乏上存在局限 | 研究旨在提供一种高效、用户友好的单细胞注释工具 | 研究对象为204个人类和191只小鼠的单细胞数据集，涉及32个器官 | 数字病理 | NA | 单细胞测序 | NA | 数据集 | 204个人类单细胞数据集和191只小鼠单细胞数据集 |
| 16908 | 2024-08-05 |
Inhibition of Wnt activity improves peri-implantation development of somatic cell nuclear transfer embryos
2023-Sep, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwad173
PMID:37593113
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研究论文 | 这篇文章探讨了抑制Wnt活性对体细胞核转移(SCNT)胚胎围植入发育的影响 | 首次发现持续的Wnt信号阻碍了外胚层细胞向成熟多能性转变，并通过操控Wnt信号显著提高了克隆效率 | 尚未阐明SCNT胚胎在围植入阶段停滞的潜在机制 | 研究Wnt信号在SCNT胚胎围植入阶段发育中的作用 | 体细胞核转移胚胎的围植入发育 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 16909 | 2024-08-05 |
MacroH2A restricts inflammatory gene expression in melanoma cancer-associated fibroblasts by coordinating chromatin looping
2023-09, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-023-01208-7
PMID:37605008
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研究论文 | 本文揭示了MacroH2A在黑色素瘤癌相关成纤维细胞中的肿瘤抑制作用 | 首次确定了MacroH2A在肿瘤微环境中的作用及其对基因表达的调节机制 | 本研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类黑色素瘤的特点 | 探讨MacroH2A在黑色素瘤微环境中的作用及其机制 | 主要研究黑色素瘤癌相关成纤维细胞及其表型变化 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组学，空间转录组学 | NA | NA | 使用了免疫合成小鼠模型进行实验 |
| 16910 | 2024-08-05 |
Current status and prospects of GREM1 research in cancer (Review)
2023-Sep, Molecular and clinical oncology
IF:1.4Q4
DOI:10.3892/mco.2023.2665
PMID:37614374
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综述 | 本文回顾了GREM1在癌症中的作用和功能 | 探讨了GREM1在不同类型肿瘤中的不同作用，提供了GREM1作为诊断和预后指标的潜力 | 缺乏对GREM1在所有肿瘤类型中的全面分析 | 研究GREM1在肿瘤中的作用及其生物功能 | 检视GREM1在乳腺癌、结肠癌及其他肿瘤类型的作用 | 数字病理学 | 胰腺癌、乳腺癌、结肠癌 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 16911 | 2024-08-07 |
Efficacy of antiviral therapy and host-virus interactions visualised using serial liver sampling with fine-needle aspirates
2023-Sep, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2023.100817
PMID:37600958
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研究论文 | 本文通过使用细针抽吸术进行连续肝脏采样，研究了抗病毒治疗对慢性乙型肝炎患者病毒复制的影响，并揭示了宿主与病毒的相互作用。 | 采用细针抽吸术和单细胞RNA测序技术，捕捉抗病毒治疗对HBV复制状态的动态影响，并揭示了感染肝细胞中的宿主-病原体相互作用。 | 技术限制和采样频率的限制是测量治疗开始后HBV转录实际变化的障碍。 | 研究抗病毒治疗对慢性乙型肝炎患者病毒复制的影响及其机制。 | 慢性乙型肝炎患者的肝脏样本和病毒复制状态。 | 数字病理学 | 肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 慢性乙型肝炎患者的肝脏细针抽吸样本，基线及治疗后12周和24周。 |
| 16912 | 2024-08-07 |
Deciphering colorectal cancer progression features and prognostic signature by single-cell RNA sequencing pseudotime trajectory analysis
2023-Sep, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2023.101491
PMID:37601456
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，通过伪时间轨迹分析揭示结直肠癌进展特征和预后标志物 | 本研究首次使用单细胞RNA测序技术结合伪时间轨迹分析，深入研究结直肠癌的肿瘤内异质性和细胞动态事件 | 研究使用的数据集来自单一医疗机构，可能存在样本偏倚 | 探索结直肠癌的进展特征和开发新的预后标志物 | 结直肠癌的肿瘤上皮细胞亚型和相关基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO Cox回归 | 单细胞RNA测序数据 | 使用三星医疗中心（SMC）的结直肠癌单细胞RNA测序数据集 |
| 16913 | 2024-08-07 |
Homologous recombination deficiency serves as a prognostic biomarker in clear cell renal cell carcinoma
2023-Sep, Experimental and therapeutic medicine
IF:2.4Q3
DOI:10.3892/etm.2023.12128
PMID:37602311
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研究论文 | 本研究探讨了同源重组缺陷（HRD）在肾透明细胞癌（KIRC）中的预后生物标志物作用 | 首次揭示了HRD阳性肿瘤中免疫相关信号通路的激活以及肿瘤微环境中耗竭的CD8+ T细胞信号的富集 | NA | 研究HRD在KIRC中的预后价值及其对肿瘤微环境的影响 | 肾透明细胞癌患者 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组和转录组数据 | 501名KIRC患者 |
| 16914 | 2024-08-07 |
Identifying oxidative stress-related biomarkers in idiopathic pulmonary fibrosis in the context of predictive, preventive, and personalized medicine using integrative omics approaches and machine-learning strategies
2023-Sep, The EPMA journal
DOI:10.1007/s13167-023-00334-4
PMID:37605652
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研究论文 | 本研究通过综合组学方法和机器学习策略，在预测性、预防性和个性化医学框架下，识别特发性肺纤维化中与氧化应激相关的生物标志物。 | 本研究首次通过综合组学数据和机器学习方法，对特发性肺纤维化患者进行氧化应激相关基因的分类，并构建了基于五个诊断标志物的诺模图模型，为个性化抗氧化和抗纤维化治疗提供了参考。 | 本研究仅基于250名患者的转录组数据进行分析，样本量相对较小，可能影响结果的普遍性和可靠性。 | 旨在通过综合组学方法和机器学习策略，识别特发性肺纤维化中与氧化应激相关的生物标志物，以促进预测性、预防性和个性化医学的发展。 | 特发性肺纤维化患者及其氧化应激相关基因和临床指标。 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 转录组学 | 机器学习 | 转录组数据 | 250名特发性肺纤维化患者 |
| 16915 | 2024-08-05 |
Peripheral immune landscape for hypercytokinemia in myasthenic crisis utilizing single-cell transcriptomics
2023-08-24, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04421-y
PMID:37620910
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研究论文 | 本研究揭示了重症肌无力危机期间外周免疫环境的特征，采用单细胞转录组学技术分析了PBMCs的多样性 | 首次通过单细胞转录组学技术识别出一种独特的FCGR3B+单核细胞亚群，并揭示其在危机期间的促炎信号通路的显著表达 | 研究主要依赖于小样本数量，且未来的功能研究仍需探索因果关系 | 旨在探讨重症肌无力危机中的外周免疫反应及其潜在机制 | 分析来自两名AChR+MG患者在危机和危机后三个月的外围血单核细胞 | 数字病理学 | 重症肌无力 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞数据 | 33577个外围血单核细胞 |
| 16916 | 2024-08-07 |
Advances in single-cell RNA sequencing and its applications in cancer research
2023-08-24, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-023-01494-6
PMID:37612741
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术的发展及其在癌症研究中的应用 | scRNA-seq技术能够识别不同的细胞亚群，解析肿瘤微环境，并描述细胞基因组突变，从而更深入地理解肿瘤生物学的细微变化 | 传统的批量RNA测序技术只能反映样本中的平均基因表达，难以理解肿瘤异质性和肿瘤微环境 | 探讨肿瘤异质性和肿瘤微环境，增进对肿瘤发生和演化的理解 | 癌症研究中的肿瘤异质性和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 16917 | 2024-08-07 |
Expression of Cyclin E1 in hepatic stellate cells is critical for the induction and progression of liver fibrosis and hepatocellular carcinoma in mice
2023-08-24, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-06077-4
PMID:37620309
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研究论文 | 本研究探讨了Cyclin E1（Ccne1）和Cdk2基因在小鼠肝星状细胞（HSCs）中对肝纤维化和肝细胞癌发生的作用 | 首次证明Ccne1在少数HSCs中的表达足以触发广泛的肝纤维化和肝细胞癌发生，且这一过程依赖于Cdk2 | NA | 研究Ccne1和Cdk2基因在HSCs中对肝纤维化和肝细胞癌发生的影响 | 小鼠肝星状细胞（HSCs）中的Ccne1和Cdk2基因 | NA | 肝细胞癌 | 条件性基因敲除 | NA | 单细胞RNA测序 | Ccne1或Cdk2条件性敲除小鼠及野生型对照小鼠 |
| 16918 | 2024-08-07 |
Downregulation of chemokine receptor 9 facilitates CD4+CD8αα+ intraepithelial lymphocyte development
2023-08-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40950-2
PMID:37620389
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研究论文 | 研究探讨了化学因子受体9（CCR9）下调对CD4+CD8αα+上皮内淋巴细胞发育的影响 | 首次揭示了CCR9表达水平与CD4CD8αα上皮内淋巴细胞分化之间的关系，并通过单细胞RNA测序和基因组占据修饰分析，阐明了CCR9下调通过上调Cbfβ2剪接促进CD4CD8αα IEL分化的机制 | NA | 探究CCR9在CD4CD8αα上皮内淋巴细胞发育中的作用及其分子机制 | 肠道上皮内淋巴细胞（IELs）及其分化过程 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Ccr9小鼠的肠道上皮内CD4 T细胞 |
| 16919 | 2024-08-05 |
A complement atlas identifies interleukin-6-dependent alternative pathway dysregulation as a key druggable feature of COVID-19
2023-08-23, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adi0252
PMID:37611083
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研究论文 | 该文章揭示了IL-6依赖的替代途径失调作为COVID-19的一个关键可药物靶点 | 提供了补体系统在COVID-19中的作用的全面图谱，识别了IL-6和STAT1/3信号通路作为补体反应的上游驱动因子 | 尽管识别了补体失调与COVID-19治疗的关联，但具体机制仍需进一步研究 | 深入了解推动COVID-19疾病病理机制的补体系统 | 主要关注COVID-19相关的补体激活及其在肺损伤中的作用 | 数字病理学 | COVID-19 | 蛋白质组学和单细胞测序 | NA | 蛋白质相关数据 | NA |
| 16920 | 2024-08-07 |
Targeting sulfation-dependent mechanoreciprocity between matrix and osteoblasts to mitigate bone loss
2023-08-23, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adg3983
PMID:37611084
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研究论文 | 本研究通过跨表型元分析和多突变小鼠模型的表型特征，揭示了硫酸盐转运蛋白缺陷在骨质疏松中的致病作用，并探讨了通过调节硫酸化依赖的机械互作来减轻骨丢失的潜在机制。 | 首次揭示了硫酸化在骨基质与成骨细胞间机械互作中的作用，并提出了通过药物干预和运动促进YAP/TAZ活性来改善骨质疏松的新策略。 | 研究主要基于小鼠模型和人类基因型数据，尚需进一步的临床试验验证其治疗效果。 | 探讨硫酸化依赖的机械互作在骨质疏松中的作用，并寻找减轻骨丢失的新方法。 | 人类和小鼠的骨矿物质密度，以及硫酸盐转运蛋白缺陷对成骨细胞和骨基质的影响。 | NA | 骨质疏松 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 426,824名基因型人类参与者及多突变小鼠模型 |