单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
16901 2024-08-07
The Transcriptome Landscape of the In Vitro Human Airway Epithelium Response to SARS-CoV-2
2023-Jul-27, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 研究使用体外人呼吸道上皮细胞模型(ALI和iALI)感染SARS-CoV-2后的基因表达谱变化 首次详细描述了SARS-CoV-2感染后呼吸道上皮细胞的基因表达变化,特别是干扰素刺激基因和炎症基因的表达增加 NA 探究SARS-CoV-2感染对人呼吸道上皮细胞基因表达的影响 人呼吸道上皮细胞(ALI和iALI模型) 数字病理学 呼吸系统疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 使用了自有的和公开的批量及单细胞转录组数据集
16902 2024-08-05
Dissecting the brain with spatially resolved multi-omics
2023-Jul, Journal of pharmaceutical analysis IF:6.1Q1
研究论文 本论文探讨了空间分辨的多组学技术在解析大脑空间异质性方面的应用 介绍了空间转录组学和质谱成像技术在神经科学中的应用 需要在活细胞中的实时空间多组学分析以及功能验证的整合应用方面做更多努力 研究空间分辨的多组学技术在神经科学中的应用 空间基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学技术 数字病理学 中枢神经系统疾病 NGS、质谱成像 NA 空间组学数据 NA
16903 2024-08-05
The role of signaling crosstalk of microglia in hippocampus on progression of ageing and Alzheimer's disease
2023-Jul, Journal of pharmaceutical analysis IF:6.1Q1
研究论文 本文研究了小胶质细胞在海马区在衰老和阿尔茨海默病进展中的信号交叉作用 研究首次揭示了小胶质细胞在衰老和阿尔茨海默病进程中的免疫调节作用及其信号交叉的复杂性 研究仅基于小鼠模型,可能无法完全反映人类疾病的生物学机制 揭示小胶质细胞在衰老和阿尔茨海默病中的作用机制 使用5×FAD小鼠和野生型小鼠进行单细胞测序,分析小胶质细胞的功能和信号通路 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞测序 NA 基因表达数据 5×FAD小鼠和野生型小鼠,年龄为2、12和24个月
16904 2024-08-07
Single-cell analyses reveal cannabidiol rewires tumor microenvironment via inhibiting alternative activation of macrophage and synergizes with anti-PD-1 in colon cancer
2023-Jul, Journal of pharmaceutical analysis IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序技术,揭示了大麻二酚(CBD)通过抑制巨噬细胞的替代激活并增强M1样巨噬细胞,从而调节结直肠肿瘤微环境并增强抗PD-1免疫疗法的效果 本研究首次通过单细胞测序技术揭示了CBD如何通过调节巨噬细胞的代谢模式和信号通路,影响肿瘤微环境,并增强抗PD-1免疫疗法的效果 NA 阐明大麻二酚(CBD)在结直肠癌中的具体抗癌机制 结直肠肿瘤微环境及巨噬细胞的激活状态 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞ATAC测序(scATAC-seq) NA 单细胞转录组和ATAC序列数据 NA
16905 2024-08-07
Single-cell transcriptome analysis reveals the regulatory effects of artesunate on splenic immune cells in polymicrobial sepsis
2023-Jul, Journal of pharmaceutical analysis IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了青蒿琥酯对脓毒症模型小鼠脾脏免疫细胞微环境的保护作用及其机制 首次通过单细胞RNA测序技术详细揭示了青蒿琥酯对脓毒症中脾脏免疫细胞的调节作用 NA 探究青蒿琥酯对脓毒症诱导的免疫细胞过度炎症或免疫抑制状态的保护作用及其机制 脓毒症模型小鼠的脾脏免疫细胞 数字病理学 脓毒症 单细胞RNA测序 NA RNA NA
16906 2024-08-07
New discoveries in the field of metabolism by applying single-cell and spatial omics
2023-Jul, Journal of pharmaceutical analysis IF:6.1Q1
综述 本文综述了单细胞多组学(SCM-Omics)和空间多组学(SM-Omics)技术在代谢疾病研究中的应用进展 结合SCM-Omics和SM-Omics技术,探索细胞的分子和空间分析,为揭示代谢过程的异质性提供了有前景的工具 NA 探讨SCM-Omics和SM-Omics技术在代谢相关疾病中的应用,揭示代谢疾病的分子机制 代谢相关疾病,包括肥胖、糖尿病、非酒精性脂肪肝病(NAFLD)和心血管疾病(CVD) 代谢学 代谢疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间多组学(SM-Omics) NA 细胞 NA
16907 2024-08-07
Single-cell analysis of cellular heterogeneity and interactions in the ischemia-reperfusion injured mouse intestine
2023-Jul, Journal of pharmaceutical analysis IF:6.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序技术分析了小鼠肠道缺血再灌注损伤中的细胞异质性和细胞间相互作用 发现了新的细胞亚群,如EC1、EC3和EC8,并揭示了它们在消化吸收和细胞连接中的作用 NA 研究小鼠肠道缺血再灌注损伤中的细胞异质性和细胞间相互作用 小鼠肠道中的九种主要细胞群体 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 细胞数据 46,716个细胞
16908 2024-08-07
Single-cell RNA-sequencing and subcellular spatial transcriptomics facilitate the translation of liver microphysiological systems for regulatory application
2023-Jul, Journal of pharmaceutical analysis IF:6.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
16909 2024-08-07
Cux1+ proliferative basal cells promote epidermal hyperplasia in chronic dry skin disease identified by single-cell RNA transcriptomics
2023-Jul, Journal of pharmaceutical analysis IF:6.1Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序和原位杂交技术,在慢性干燥皮肤疾病模型中识别出一种新型增殖性基底细胞(PBC),该细胞特异性表达转录因子Cux1,并探讨了其在皮肤表皮增生中的作用。 首次在干燥皮肤疾病模型中通过单细胞RNA测序技术识别出表达Cux1的增殖性基底细胞,并揭示了Cux1在角质形成细胞增殖中的关键作用。 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床应用的直接证据尚需进一步验证。 探讨慢性干燥皮肤疾病中表皮增生的分子机制,并寻找潜在的治疗靶点。 慢性干燥皮肤疾病模型中的增殖性基底细胞及其在表皮增生中的作用。 数字病理学 皮肤病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 小鼠模型及部分皮肤病患者样本
16910 2024-08-05
Therapeutic implications for localized prostate cancer by multiomics analyses of the ageing microenvironment landscape
2023, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 本文探讨了衰老微环境在前列腺癌中的作用及其治疗意义 首次全面阐明了前列腺癌中衰老微环境的复杂特征,并建立了衰老微环境指数(AMI) 缺乏大规模临床数据以进一步验证AMI的临床相关性 研究衰老微环境如何影响前列腺癌的进展及个性化治疗 813例前列腺癌患者及其衰老微环境特征 数字病理学 前列腺癌 NMF算法、空间转录组学、GDSC、CMap和CellMiner数据库 NA 基因组数据、细胞实验数据 813例前列腺癌患者
16911 2024-08-05
Machine learning-based integration develops a neutrophil-derived signature for improving outcomes in hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究开发了一个基于中性粒细胞特征的风险模型,以改善肝细胞癌患者的预后 首次将中性粒细胞异质性用于肝细胞癌患者分层,并建立了新的风险模型 未详细讨论不同中性粒细胞特征对个体治疗决策的影响 探讨中性粒细胞在肝细胞癌免疫微环境中的作用,并开发相关的风险模型 肝细胞癌患者的中性粒细胞特征及其与预后的关系 数字病理学 肝细胞癌 肿瘤组织大规模测序、单细胞测序 机器学习模型 基因组数据 涉及了两组肝细胞癌患者
16912 2024-08-05
Study on the cytokines related to SARS-Cov-2 in testicular cells and the interaction network between cells based on scRNA-seq data
2023, Open life sciences IF:1.7Q3
研究论文 本研究探讨了与SARS-Cov-2相关的细胞因子在睾丸细胞中的表达及其细胞间相互作用网络。 研究整合了单细胞测序数据,分析了睾丸细胞中的细胞因子表达和细胞间的通信机制。 关于睾丸细胞细胞因子表达的研究相对较少,尚需进一步探索其在其他生理和病理状态下的作用。 本研究旨在分析COVID-19中细胞因子风暴对男性生育的潜在影响。 研究对象为睾丸细胞及其间的细胞相互作用。 数字病理学 NA scRNA-seq NA NA 20个细胞簇
16913 2024-08-05
Integrative multi-omics analyses unravel the immunological implication and prognostic significance of CXCL12 in breast cancer
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究综合分析CXCL12在乳腺癌中的免疫学意义和预后价值 通过整合多组学分析,识别出CXCL12相关的生物标志物并构建强有力的乳腺癌预后模型 尚未说明样本来源和选择标准的具体细节 探究CXCL12在乳腺癌中的作用及其相关生物标志物 乳腺癌患者的CXCL12表达水平及其与预后的关系 数字病理学 乳腺癌 免疫组织化学分析、单细胞RNA测序、批量RNA测序、WGCNA分析 Cox回归模型、LASSO回归 RNA测序数据、基因表达数据 总共分析了402个基因,并包括了不同风险组的验前结果
16914 2024-08-05
NR2F6, a new immune checkpoint that acts as a potential biomarker of immunosuppression and contributes to poor clinical outcome in human glioma
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 该研究系统地探索了NR2F6在胶质瘤中的临床特征和生物功能 首次调查了NR2F6在胶质瘤中的作用,并提出其可能作为免疫抑制的生物标志物 本研究的样本主要来自公共数据库,可能存在样本选择偏倚 研究NR2F6在胶质瘤中的作用及其作为免疫检查点的潜力 NR2F6在663个胶质瘤样本中的表达及其相关临床特征 数字病理学 胶质瘤 RNA测序 NA RNA-seq数据 663个胶质瘤样本用于训练,325个样本用于验证,60个样本用于确认
16915 2024-08-05
Molecular mechanisms regulating natural menopause in the female ovary: a study based on transcriptomic data
2023, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2
研究论文 本研究探讨了女性卵巢在自然绝经前后的分子和细胞变化 揭示了卵巢颗粒细胞的分化轨迹和调控其状态的基因,为理解绝经过程中的分子机制提供了新视角 研究中可能存在样本量不足,且仅基于特定人群的转录组数据 探究女性卵巢在自然绝经期间的分子机制和细胞变化 研究对象包括不同年龄段女性的卵巢组织与单细胞测序数据 数字病理学 NA 单细胞测序、转录组测序 NA 转录组数据 总共112个个体,分为30-39岁(14个),40-49岁(37个)和50-59岁(61个)
16916 2024-08-07
Prognostic and immunomodulatory roles of schizophrenia-associated genes HTR2A, COMT, and PRODH in pan-cancer analysis and glioma survival prediction model
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究探讨了与精神分裂症相关的基因HTR2A、COMT和PRODH在泛癌分析中的表达及其在胶质瘤生存预测模型中的作用 本研究首次在泛癌分析中探讨了精神分裂症相关基因HTR2A、COMT和PRODH的表达,并构建了一个胶质母细胞瘤和低级别胶质瘤的生存预测模型 研究主要集中在基因表达和免疫细胞浸润分析,未涉及其他可能影响癌症发展的因素 探讨精神分裂症相关基因在癌症中的表达及其对生存的影响,并构建胶质瘤生存预测模型 精神分裂症相关基因HTR2A、COMT和PRODH在多种癌症中的表达及其对胶质瘤生存的影响 数字病理学 脑瘤 单细胞RNA测序 COX回归分析 基因表达数据 多个癌症类型的数据
16917 2024-08-07
Unveiling efferocytosis-related signatures through the integration of single-cell analysis and machine learning: a predictive framework for prognosis and immunotherapy response in hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞分析和机器学习技术,揭示了与肝细胞癌(HCC)预后和免疫治疗反应相关的吞噬作用相关基因(EFRGs)特征 首次系统地探讨了吞噬作用相关基因在肝细胞癌中的作用,并构建了一个预测模型,用于评估患者的预后和免疫治疗反应 NA 发现新的早期生物标志物,以改善肝细胞癌相关的死亡率 肝细胞癌患者及其吞噬作用相关基因 机器学习 肝细胞癌 RNA测序, 单细胞RNA测序 机器学习算法 RNA测序数据, 临床特征数据 来自TCGA数据库的肝细胞癌患者数据
16918 2024-08-07
Crosstalk between Placental Trophoblast and Decidual Immune Cells in Recurrent Miscarriage
2023, International journal of medical sciences IF:3.2Q1
research paper 本研究旨在识别复发性流产中滋养层细胞与蜕膜免疫细胞之间的功能障碍相互作用 通过单细胞RNA测序技术,揭示了复发性流产中母胎界面细胞组织的改变、细胞类型特异性转录组及免疫与非免疫细胞间的通讯 NA 识别复发性流产中滋养层细胞与蜕膜免疫细胞之间的功能障碍相互作用 滋养层细胞与蜕膜免疫细胞 digital pathology recurrent miscarriage scRNA-seq NA single-cell RNA sequencing data 22976个细胞,包括11种细胞类型
16919 2024-08-07
Heterogeneity in quiescent Müller glia in the uninjured zebrafish retina drive differential responses following photoreceptor ablation
2023, Frontiers in molecular neuroscience IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)探讨了斑马鱼视网膜中静息状态的Müller胶质细胞在光感受器选择性消融后的基因表达异质性及其对再生反应的影响 首次揭示了斑马鱼视网膜中静息状态的Müller胶质细胞在不同区域的基因表达异质性,并展示了这些细胞在神经消融后的独特激活和再生特征 尚未完全阐明Müller胶质细胞激活及视网膜再生的分子机制 探究斑马鱼视网膜中Müller胶质细胞在神经消融后的激活及再生特征 斑马鱼视网膜中的Müller胶质细胞及光感受器 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 涉及斑马鱼视网膜中不同区域的Müller胶质细胞样本
16920 2024-08-07
Integrative single-cell analysis of cardiac and pulmonary sarcoidosis using publicly available cardiac and bronchoalveolar lavage fluid sequencing datasets
2023, Frontiers in cardiovascular medicine IF:2.8Q2
研究论文 本研究利用公开的心脏和支气管肺泡灌洗液单细胞RNA测序数据集,对心脏和肺部结节病进行了综合单细胞分析 首次综合分析了心脏和肺部结节病的单细胞转录组数据,揭示了两种结节病之间的共享转录趋势 研究依赖于公开数据集,可能无法涵盖所有相关细胞类型和病理情况 探讨心脏和肺部结节病的病理机制及其在转录水平上的差异和共性 心脏结节病(CS)和肺部结节病(PS)的细胞类型及其转录特征 数字病理学 结节病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 使用了两个公开的支气管肺泡灌洗单细胞RNA测序数据集和两个公开的心脏单核RNA测序数据集
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