单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28534 篇文献，本页显示第 16881 - 16900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16881 | 2024-08-05 |
The multi-omic landscape of sex chromosome abnormalities: current status and future directions
2023-Aug-01, Endocrine connections
IF:2.6Q3
DOI:10.1530/EC-23-0011
PMID:37399516
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综述 | 本文总结了性染色体异常的基因组学当前见解 | 探讨了单细胞组学、空间转录组学等新研究方向对解密性染色体异常基因组学的贡献 | 没有提及该研究的具体限制 | 旨在理清性染色体异常的基因组学 | 性染色体异常，包括特纳综合征、克兰费尔特综合征等 | 数字病理学 | 性染色体异常 | 单细胞组学、空间转录组学 | 动物模型 | 基因组数据 | NA |
| 16882 | 2024-08-07 |
scPreGAN, a deep generative model for predicting the response of single-cell expression to perturbation
2022-06-27, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac357
PMID:35639705
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研究论文 | 本文提出了一种名为scPreGAN的深度生成模型，用于预测单细胞表达对外部扰动的响应 | scPreGAN结合了自编码器和生成对抗网络，能够提取未扰动数据和扰动数据的共同信息，并预测扰动数据，实验表明其预测性能优于现有方法 | NA | 开发一种能够准确预测单细胞表达对外部扰动响应的深度生成模型 | 单细胞表达数据及其对外部扰动的响应 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 生成对抗网络（GAN） | 单细胞表达数据 | 三个真实数据集 |
| 16883 | 2024-08-07 |
Targeting of the CD161 Inhibitory Receptor Enhances T cell-mediated Immunity Against Hematological Malignancies
2023-Dec-28, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023022882
PMID:38153903
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研究论文 | 本文研究了CD161抑制性受体在血液恶性肿瘤中的作用，并开发了高亲和力的人源化单克隆抗体，增强了T细胞介导的免疫反应。 | 开发了高亲和力的人源化CD161单克隆抗体，增强了T细胞的细胞毒性、细胞因子和增殖能力，并在人源化小鼠模型中显著提高了生存率。 | NA | 评估CD161受体在血液恶性肿瘤中的作用，并开发新的免疫治疗策略。 | CD161抑制性受体及其配体CLEC2D在血液恶性肿瘤中的表达和功能。 | 免疫学 | 血液恶性肿瘤 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | mRNA，蛋白质 | 多种血液恶性肿瘤细胞系，包括B细胞和T细胞淋巴瘤以及淋巴细胞和髓系白血病。 |
| 16884 | 2024-08-07 |
Integrative analysis reveals the recurrent genetic etiologies in idiopathic pulmonary fibrosis
2023-Dec-27, QJM : monthly journal of the Association of Physicians
DOI:10.1093/qjmed/hcad206
PMID:37688571
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研究论文 | 本研究通过综合分析全外显子测序、批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，揭示了特发性肺纤维化中的复发性遗传病因 | 本研究采用了综合分析方法，结合全外显子测序、批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，以更全面地理解特发性肺纤维化的分子基础 | NA | 旨在通过综合分析遗传变异和转录组改变，提高对特发性肺纤维化分子基础的理解 | 特发性肺纤维化的遗传和转录组变异 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 全外显子测序（WES）、批量RNA测序（RNA-seq）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA |
| 16885 | 2024-08-07 |
Rescuing the cytolytic function of APDS1 patient T cells via TALEN-mediated PIK3CD gene correction
2023-Dec-14, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2023.101133
PMID:38152700
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研究论文 | 本研究通过TALEN介导的基因编辑技术修复APDS1患者T细胞中的PIK3CD基因，恢复其细胞溶解功能 | 首次展示了通过基因编辑技术修复APDS1患者T细胞中的PIK3CD基因，从而恢复其正常信号传导和细胞毒性功能 | 目前仅为概念验证研究，尚未进行临床试验 | 探索通过基因编辑技术修复APDS1患者T细胞中的PIK3CD基因，作为新的治疗途径 | APDS1患者的T细胞 | NA | 免疫缺陷 | TALEN介导的基因编辑 | NA | 单细胞RNA测序 | 未具体说明样本数量 |
| 16886 | 2024-08-07 |
Lateralized response of skull bone marrow via osteopontin signaling in mice after ischemia reperfusion
2023-Dec-09, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-023-02980-x
PMID:38071333
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析了小鼠实验性中风后同侧和对侧颅骨骨髓细胞的反应，发现颅骨骨髓在应对中风时表现出侧化反应，主要通过骨髓中髓系和淋巴系细胞的增殖和分化来实现，且中性粒细胞比例增加。 | 首次揭示了颅骨骨髓在应对中风时的侧化反应，并发现骨桥蛋白（OPN）在特定区域激活颅骨骨髓中的炎症反应中的作用。 | NA | 探讨颅骨骨髓在中枢神经系统疾病中的作用及其分子机制。 | 小鼠实验性中风后的颅骨骨髓细胞。 | 数字病理学 | 中风 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | RNA | NA |
| 16887 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics of B cell and T cell receptors reveals lymphocyte clonal dynamics
2023-12-08, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adf8486
PMID:38060664
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研究论文 | 本文开发了一种空间转录组学方法，以揭示B细胞和T细胞受体的克隆动态 | 提出了空间VDJ方法，能够在组织切片中绘制B细胞和T细胞受体序列 | NA | 研究淋巴细胞克隆在组织中的空间分布对其发育、选择和扩展的影响 | 主要研究人类组织切片中的B细胞和T细胞受体序列 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 计算框架 | 序列数据 | 人类组织切片 |
| 16888 | 2024-08-05 |
TsImpute: an accurate two-step imputation method for single-cell RNA-seq data
2023-12-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad731
PMID:38039139
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研究论文 | 本文提出了一种名为tsImpute的两步插补方法，用于单细胞RNA测序数据的插补 | 创新点在于采用零膨胀负二项分布来区分dropouts和真实零，并通过改造后的表达矩阵进行最终加权插补 | 未提及具体的限制 | 旨在恢复单细胞RNA测序数据中的生物信息 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 数据矩阵 | 基于模拟和真实数据的多个样本进行评估 |
| 16889 | 2024-08-05 |
Respiratory epithelial cell types, states and fates in the era of single-cell RNA-sequencing
2023-07-12, The Biochemical journal
DOI:10.1042/BCJ20220572
PMID:37410389
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综述 | 本文章回顾了单细胞转录组学在呼吸道内细胞类型、状态和命运的研究中的基本概念 | 强调了呼吸道中细胞异质性和可塑性的发现，并提出了生成参考注释和标准化文献术语的必要性 | 研究涉及的数据归纳和标准化面临新的挑战，需要解决的关键限制 | 探讨单细胞RNA测序在呼吸道细胞身份理解中的应用 | 呼吸道上皮细胞类型、状态和命运 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组和转录组数据 | NA |
| 16890 | 2024-08-05 |
Genetic and immune determinants of E. coli liver abscess formation
2023-Jun-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.11.543319
PMID:37398354
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研究论文 | 本研究表征了小鼠肝脓肿的形成及其宿主决定因素 | 首次揭示了肝脓肿形成的免疫细胞集群和宿主遗传易感性 | 研究主要集中于小鼠模型，可能无法完全反映人类的情况 | 探讨肝脓肿形成的遗传和免疫决定因素 | 小鼠模型及其与肝脓肿形成相关的免疫反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | C57BL/6及其系谱小鼠 |
| 16891 | 2024-08-07 |
Single-cell and spatiotemporal transcriptomic analyses reveal the effects of microorganisms on immunity and metabolism in the mouse liver
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.06.020
PMID:38152123
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研究论文 | 本研究通过构建无菌（GF）和特定病原体无（SPF）小鼠肝脏的单细胞和空间转录组（ST）图谱，揭示了微生物对肝脏免疫和代谢的影响 | 首次综合运用单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单核RNA测序（snRNA-seq）和空间增强分辨率组学测序（Stereo-seq）技术，详细分析了微生物对小鼠肝脏免疫细胞比例和代谢过程的影响 | NA | 探究微生物对小鼠肝脏免疫和代谢的具体细胞和分子影响 | 无菌（GF）和特定病原体无（SPF）小鼠的肝脏 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单核RNA测序（snRNA-seq）、空间增强分辨率组学测序（Stereo-seq） | NA | 转录组 | 无菌（GF）和特定病原体无（SPF）小鼠的肝脏样本 |
| 16892 | 2024-08-07 |
CXCL14 as a potential marker for immunotherapy response prediction in renal cell carcinoma
2023, Therapeutic advances in medical oncology
IF:4.3Q2
DOI:10.1177/17588359231217966
PMID:38152696
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研究论文 | 本研究探讨了CXCL14在预测肾细胞癌（RCC）患者免疫治疗效果中的作用 | 首次阐明了CXCL14在塑造肿瘤免疫微环境中的作用，并发现其在免疫治疗反应预测中的潜在价值 | NA | 旨在阐明CXCL14在预测RCC患者免疫治疗效果中的作用 | CXCL14表达与RCC患者免疫治疗效果的关系 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA | RCC的公共数据库中的数据集 |
| 16893 | 2024-08-07 |
RNA-seq characterization of histamine-releasing mast cells as potential therapeutic target of osteoarthritis
2022-Nov, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2022.109117
PMID:36109004
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研究论文 | 本研究通过RNA测序分析和药物阻断组胺活性，探讨肥大细胞在骨关节炎中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序和批量RNA测序，结合流式细胞术和免疫组化分析，对骨关节炎中的肥大细胞进行详细表征 | 研究主要基于小鼠模型，未来需在人体中进一步验证 | 进一步阐明肥大细胞在骨关节炎中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 骨关节炎的滑膜组织和滑液中的肥大细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | RNA测序 | NA | RNA | 包括40名骨关节炎患者和使用组胺H1受体拮抗剂西替利嗪治疗的小鼠模型 |
| 16894 | 2024-08-07 |
Construction and validation of a novel lysosomal signature for hepatocellular carcinoma prognosis, diagnosis, and therapeutic decision-making
2023-12-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-49985-3
PMID:38114725
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研究论文 | 本研究构建并验证了一种新的溶酶体相关风险评分（LRRS），用于肝细胞癌（HCC）的预后、诊断和治疗决策 | 首次构建了基于溶酶体的肝细胞癌预后标志物，并验证了其在诊断和治疗决策中的应用 | NA | 探索溶酶体在肝细胞癌中的作用，并开发新的预后、诊断和治疗决策工具 | 肝细胞癌（HCC）患者 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO-惩罚Cox回归算法 | 基因表达数据 | TCGA和ICGC队列的数据 |
| 16895 | 2024-08-05 |
Dysregulated Repeat Element Viral-like Immune Response in Hepatocellular Carcinoma
2023-Dec-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.04.570014
PMID:38105940
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研究论文 | 本研究探讨了肝细胞癌中调控失衡的病毒样重复RNA与免疫反应之间的关系 | 首次系统性研究了肝细胞癌中病毒样重复RNA的表达及其与临床结果的相关性 | 本研究样本数量有限，需进一步研究以验证结果 | 了解肝细胞癌中重复RNA的表达如何影响免疫反应和临床结果 | 分析43个切除的肝细胞癌标本中的重复RNA表达及免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA原位杂交（RNA-ISH）、免疫组化（IHC）、空间转录组学 | NA | 组织标本 | 43个切除的肝细胞癌标本和28个空间转录组学样本 |
| 16896 | 2024-08-07 |
An inducible genetic tool for tracking and manipulating specific microglial states in development and disease
2023-Dec-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.01.569597
PMID:38106187
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研究论文 | 本文报道了一种可诱导的Cre驱动线Clec7a-CreER，用于追踪和操纵大脑实质中发育和疾病中的特定小胶质细胞状态 | 开发了一种新的工具Clec7a-CreER，用于追踪和操纵特定的小胶质细胞状态，揭示了这些状态的动态性和可塑性 | NA | 研究小胶质细胞在发育和疾病中的特定状态及其功能意义 | 小胶质细胞的特定状态，如增殖区域相关小胶质细胞（PAM）和疾病相关小胶质细胞（DAM） | NA | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达 | NA |
| 16897 | 2024-08-05 |
Cella: 3D data visualization for plant single-cell transcriptomics in Blender
2023 Nov-Dec, Physiologia plantarum
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/ppl.14068
PMID:38148248
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Cella的工具，它利用开源3D软件Blender进行植物单细胞转录组数据的可视化 | 创新点在于使用Blender设计了一个可视化工具，将复杂数据转换为可理解的3D热图 | 该工具主要针对阿拉伯芥的根尖组织，其他组织的适用性需进一步验证 | 研究复杂生物过程的可视化方法，特别是植物发育研究 | 阿拉伯芥根尖的单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 图像 | 映射了21,489个基因的42,978张图像 |
| 16898 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analyses reveal cellular and molecular responses to low nitrogen in burley tobacco leaves
2023 Nov-Dec, Physiologia plantarum
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/ppl.14118
PMID:38148214
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，分析了在正常和低氮条件下生长的烟草叶片中的细胞和分子响应 | 首次构建了烟草叶片的单细胞图谱，并揭示了低氮胁迫下细胞类型的特异性基因表达模式 | NA | 研究烟草在低氮条件下的细胞和分子响应机制 | 烟草叶片的单细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 10种细胞类型，17个转录上不同的细胞集群 |
| 16899 | 2024-08-05 |
TEAD1 trapping by the Q353R-Lamin A/C causes dilated cardiomyopathy
2023-04-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ade7047
PMID:37058558
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研究论文 | 本文探讨了突变的Lamin A/C如何通过捕获TEAD1导致扩张型心肌病的分子机制 | 发现了突变Lamin A/C通过在核膜捕获TEAD1导致心肌细胞结构成熟不足，并揭示了干预转录失调的潜在治疗方法 | NA | 阐明扩张型心肌病的分子机制 | 突变的Lamin A/C及其相关的扩张型心肌病 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，ATAC-seq，蛋白质阵列，电子显微镜分析 | NA | RNA，蛋白质 | 来自患有扩张型心肌病的患者的心脏组织样本 |
| 16900 | 2024-08-07 |
Apoptosis recognition receptors regulate skin tissue repair in mice
2023-Jan-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.17.523241
PMID:36711968
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了小鼠皮肤伤口早期炎症过程中的细胞动态变化，发现凋亡途径和吞噬凋亡细胞的受体在成纤维细胞和免疫细胞中上调，并探讨了这些受体在组织修复中的作用。 | 首次揭示了凋亡细胞识别受体在组织修复中的具体作用机制，并提供了慢性伤口治疗的新潜在靶点。 | 研究主要集中在小鼠模型上，对人类糖尿病足伤口的适用性需要进一步验证。 | 探讨凋亡细胞识别和清除在组织修复中的作用机制。 | 小鼠皮肤伤口中的成纤维细胞、免疫细胞及人类糖尿病足伤口。 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠皮肤伤口和人类糖尿病足伤口样本 |