单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28786 篇文献，本页显示第 16841 - 16860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16841 | 2024-08-05 |
SORBET: Automated cell-neighborhood analysis of spatial transcriptomics or proteomics for interpretable sample classification via GNN
2024-Jan-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.30.573739
PMID:38260586
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研究论文 | 提出了一种名为SORBET的深度学习框架，用于分析空间转录组学或蛋白质组学数据以分类样本 | 利用图神经网络的最新进展，开发了一种新的自动化细胞邻域分析方法 | 在技术上仍然面临与空间信息、复合标记和观察到的表型相关的分析挑战 | 研究空间转录组学和蛋白质组学数据在生物表型分类中的应用 | 聚焦于不同疾病过程和技术下的组织表型预测，如对免疫治疗的反应 | 计算机视觉 | NA | 深度学习 | 图神经网络 (GNN) | 空间转录组学和蛋白质组学数据 | NA |
| 16842 | 2024-08-07 |
[Future Perspectives of Single-Cell RNA Sequencing in Cancer Research]
2024-Jan, Gan to kagaku ryoho. Cancer & chemotherapy
PMID:38247085
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在癌症研究中的进展和应用 | scRNA-seq技术使得能够在单细胞水平上分析动态基因表达特性，从而在癌症研究中取得了显著进展 | NA | 探讨scRNA-seq技术在理解癌症病理生物学中的应用 | 癌症及其相关的基因表达变化 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 16843 | 2024-08-07 |
G-protein signaling of oxytocin receptor as a potential target for cabazitaxel-resistant prostate cancer
2024-Jan, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgae002
PMID:38250514
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了卡巴他赛耐药前列腺癌患者的循环肿瘤细胞，发现催产素受体信号通路的激活，并验证了氯哌斯汀作为克服卡巴他赛耐药性的候选药物。 | 首次揭示了卡巴他赛耐药前列腺癌中催产素受体信号通路的激活，并发现氯哌斯汀可能通过抑制该通路来克服耐药性。 | 研究仅限于少数病例，需要进一步扩大样本量以验证结果的普遍性。 | 旨在识别卡巴他赛耐药前列腺癌的潜在机制和治疗靶点。 | 卡巴他赛耐药前列腺癌患者的循环肿瘤细胞。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自卡巴他赛耐药前列腺癌患者的循环肿瘤细胞 |
| 16844 | 2024-08-05 |
Systematic analysis of apoptosis-related genes in the prognosis of lung squamous cell carcinoma: a combined single-cell RNA sequencing study
2023-Dec-30, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-23-1712
PMID:38249925
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研究论文 | 本研究分析了与肺鳞状细胞癌预后相关的凋亡相关基因。 | 构建了一个基于凋亡相关基因的预后风险模型，并通过单细胞RNA测序提供了肿瘤发展新见解。 | 未提及研究的局限性 | 探讨凋亡相关基因在肺鳞状细胞癌预后中的价值。 | 与肺鳞状细胞癌相关的凋亡相关基因。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | NA |
| 16845 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals the brain evolution of web-building spiders
2023-Dec, Nature ecology & evolution
IF:13.9Q1
DOI:10.1038/s41559-023-02238-y
PMID:37919396
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研究论文 | 这篇文章揭示了网建筑蜘的单细胞转录组学及其大脑进化. | 本研究首次提供了网建筑蜘蛛大脑细胞图谱，并揭示了保留下来的祖先神经元类型和相关基因的作用. | 本文未探讨其他非网建筑蜘蛛的相关进化情况. | 探讨网建筑蜘蛛神经系统的进化以及与行为相关的分子机制. | 研究对象为网建筑蜘蛛（Hylyphantes graminicola）及其相关基因. | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 超过30,000个单细胞转录组样本 |
| 16846 | 2024-08-07 |
A novel role of TGFBI in macrophage polarization and macrophage-induced pancreatic cancer growth and therapeutic resistance
2023-12-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2023.216457
PMID:37865162
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研究论文 | 本研究探讨了TGFBI在巨噬细胞极化和巨噬细胞诱导的胰腺癌生长及治疗抵抗中的新作用 | 首次发现TGFBI作为肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）产生的因子，在胰腺癌中发挥关键作用，并通过单细胞RNA测序技术验证了其功能 | NA | 揭示TGFBI在胰腺癌发展中的作用，并探索其作为治疗靶点的可能性 | TGFBI在巨噬细胞极化和胰腺癌生长中的作用 | NA | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用siRNA和Cre-Lox策略在体外和体内进行了实验 |
| 16847 | 2024-08-07 |
Deep analysis of CD4 T cells in the rhesus CNS during SIV infection
2023-Dec, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1011844
PMID:38060615
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研究论文 | 研究了SIV感染的恒河猴中枢神经系统中CD4 T细胞的分布和反应，以及抗逆转录病毒治疗（ART）启动后的潜在恢复情况 | 首次详细分析了SIV感染恒河猴中枢神经系统中CD4 T细胞的分布和功能，以及它们在感染过程中的反应和ART治疗后的变化 | 研究仅限于SIV感染的恒河猴模型，且ART治疗方案模拟了次优依从性，可能限制了结果的普遍性 | 探讨CD4 T细胞在SIV感染恒河猴中枢神经系统中的作用和ART治疗的影响 | SIVmac251感染的恒河猴中枢神经系统中的CD4 T细胞 | NA | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 10只SIVmac251感染的恒河猴 |
| 16848 | 2024-08-05 |
Cell composition inference and identification of layer-specific spatial transcriptional profiles with POLARIS
2023-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.add9818
PMID:36857450
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研究论文 | 本文介绍了一种称为POLARIS的空间转录组学分析方法 | POLARIS方法能够进行细胞类型去卷积，并能从组织学图像推断细胞组成及鉴定层特异性差异表达基因 | 该方法的应用仍依赖于高质量的组织学图像数据 | 研究空间转录组学技术在健康和疾病相关关键生物过程中的应用 | 四种组织的细胞组成和差异表达基因 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 组织学图像 | 四种组织样本 |
| 16849 | 2024-08-05 |
Identification of diagnostic molecules and potential traditional Chinese medicine components for Alzheimer's disease by single cell RNA sequencing combined with a systematic framework for network pharmacology
2023, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2023.1335512
PMID:38249960
|
研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和网络药理学框架，发现与阿尔茨海默病相关的关键基因和潜在的传统中药成分 | 创新点在于整合单细胞RNA测序与网络药理学，以识别潜在的治疗阿尔茨海默病的传统中药成分 | 研究可能受限于数据集的多样性和样本规模，影响结果的普适性 | 研究旨在探索与阿尔茨海默病相关的分子以及中药成分的潜在治疗作用 | 研究对象包括与阿尔茨海默病相关的基因和传统中药成分 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 使用了多种样本的数据集，具体样本数量不详 |
| 16850 | 2024-08-07 |
The purinergic P2Y14 receptor links hepatocyte death to hepatic stellate cell activation and fibrogenesis in the liver
2022-04-06, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abe5795
PMID:35385339
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研究论文 | 本文探讨了嘌呤能受体P2Y14在肝细胞死亡与肝星状细胞激活及纤维化中的作用 | 首次揭示了P2Y14受体及其配体在肝细胞死亡与肝纤维化之间的直接联系 | NA | 研究肝纤维化的机制及潜在的治疗靶点 | 肝细胞、肝星状细胞及P2Y14受体 | NA | 肝病 | 蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质、RNA | 多个小鼠模型及人类样本 |
| 16851 | 2024-08-07 |
scRNA-Seq Reveals New Enteric Nervous System Roles for GDNF, NRTN, and TBX3
2021, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2020.12.014
PMID:33444816
|
研究论文 | 本研究通过单核和单细胞RNA测序技术，揭示了GDNF、NRTN和TBX3在肠神经系统中的新作用 | 首次通过单细胞分析定义了肠神经系统中不同神经元亚型的差异表达基因，并发现了TBX3、GDNF和NRTN的新作用 | NA | 旨在通过定义神经元亚型的基因表达，促进针对肠神经病变的新型治疗策略的开发，并深入了解肠神经系统功能 | 成年小鼠和人类结肠的肠神经元亚型 | 数字病理学 | 肠神经病变 | 单核RNA测序和单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 635个成年小鼠结肠肠神经元和707个E17.5小鼠肠神经元，以及48个人类结肠肠神经元和其他细胞类型 |
| 16852 | 2024-08-05 |
The gut microbiota and its biogeography
2024-Feb, Nature reviews. Microbiology
DOI:10.1038/s41579-023-00969-0
PMID:37740073
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综述 | 本文探讨了肠道微生物群的生物地理学及其在生态系统中的重要性 | 文章介绍了更高分辨率的测序和单细胞数据在理解肠道微生物多样性方面的重要性 | 缺乏针对微观交互的系统长期研究 | 研究肠道微生物群的分布和多样性以及与宿主的关系 | 肠道微生物群落及其空间异质性 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 16853 | 2024-08-05 |
Multi-omics data integration shines a light on the renal medulla
2024-Feb, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2023.11.014
PMID:38245213
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研究论文 | 该文章研究了肾髓质在肾功能中的作用，并构建了肾髓质标记基因的参考集 | 创新点在于利用多组学数据整合来定义肾髓质的分子程序 | 获取高质量组织的挑战限制了对调控髓质的分子程序的表征 | 研究肾髓质在维持盐和水平衡中的作用 | 研究标记基因以定义肾髓质在肾功能中的角色 | 数字病理学 | NA | 基因表达、染色质可及性、长程染色体相互作用和空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 16854 | 2024-08-07 |
Specialized Retinal Endothelial Cells Modulate Blood-Retina Barrier in Diabetic Retinopathy
2024-Feb-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db23-0368
PMID:37976214
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了视网膜内皮细胞的异质性和功能多样性，特别是在糖尿病视网膜病变中的作用 | 发现了一种新的糖尿病特异性视网膜内皮细胞群，并通过上调ACER2表达来减少神经酰胺含量和内皮细胞功能障碍的负反馈调节途径 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术揭示视网膜内皮细胞的异质性和功能多样性，特别是在糖尿病视网膜病变中的作用 | 视网膜内皮细胞及其在糖尿病视网膜病变中的作用 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括非增生性糖尿病视网膜病变（NPDR）伴有或不伴有糖尿病黄斑水肿（DME/NDME）和活动性增生性DR（PDR）患者的血浆样本，以及糖尿病小鼠模型 |
| 16855 | 2024-08-07 |
Changes in cuproptosis-related gene expression in periodontitis: An integrated bioinformatic analysis
2024-Feb-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2023.122388
PMID:38181851
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析探讨了牙周炎中铜死亡相关基因（CRGs）的表达变化及其生物学功能 | 首次全面分析了不同表达的CRGs（DE-CRGs）在牙周炎中的综合效应，并探讨了其与免疫浸润、免疫因子、线粒体功能障碍、诊断效能及预测药物的相关性 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分有限 | 探讨牙周炎中铜死亡相关基因的表达变化及其在疾病发生和治疗中的作用 | 牙周炎中的铜死亡相关基因及其生物学功能 | NA | 牙周病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 使用了正常和牙周炎牙龈样本，具体数量未详细说明 |
| 16856 | 2024-08-05 |
Exploring the mechanism of Celastrol in the treatment of rheumatoid arthritis based on systems pharmacology and multi-omics
2024-01-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-48248-5
PMID:38238321
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研究论文 | 本研究探索了Celastrol在类风湿关节炎治疗中的分子网络机制 | 提出了一种新的策略，将系统药理学、蛋白质组学、转录组学和单细胞转录组学相结合 | NA | 揭示Celastrol在类风湿关节炎治疗中的作用机制 | 类风湿关节炎相关基因和Celastrol的潜在靶标 | 系统药理学 | 类风湿关节炎 | 系统药理学、转录组学、蛋白质组学、单细胞转录组学 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据 | 195个靶标、2068个差异基因、294个差异蛋白 |
| 16857 | 2024-08-05 |
PROST: quantitative identification of spatially variable genes and domain detection in spatial transcriptomics
2024-Jan-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-44835-w
PMID:38238417
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研究论文 | 本文提出了一个框架（PROST），用于定量识别空间转录组中的空间变异基因和组织域 | 提出了PROST Index，可以有效定量表征基因表达的空间变异，并通过自注意力机制进行空间域的无监督聚类 | 现有方法在均匀量化空间变异基因方面存在不足，且大部分方法在技术上将空间变异基因和空间域的描绘割裂开 | 研究空间转录组数据的定量识别和分析 | 针对空间表达模式的基因和组织域进行定量识别 | 数字病理学 | NA | 空间转录组测序 | 自注意力机制 | 基因表达数据 | 不同空间分辨率的样本，包括多细胞和细胞级别的数据 |
| 16858 | 2024-08-05 |
Anoikis related genes may be novel markers associated with prognosis for ovarian cancer
2024-01-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-52117-0
PMID:38238592
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研究论文 | 本研究旨在确定与凋亡相关基因在卵巢癌中的预后意义，并基于ARG表达开发预后标志。 | 本研究首次提出ARG可能在卵巢癌预后中发挥新颖作用，并建立了基于ARG表达的预后签名。 | 需要进一步研究来验证结果并探索潜在机制。 | 探讨凋亡相关基因在卵巢癌预后中的作用。 | 卵巢癌患者的临床数据和单细胞测序数据的分析。 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单样本基因集富集分析（ssGSEA），非负矩阵分解（NMF），LASSO | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据 | NA |
| 16859 | 2024-08-07 |
Immune characteristics of kidney transplant recipients with acute respiratory distress syndrome induced by COVID-19 at single-cell resolution
2024-Jan-18, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-024-02682-9
PMID:38238762
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，构建了肾移植受者（KTRs）和健康个体的外周血单个核细胞（PBMCs）的单细胞免疫图谱，以探讨COVID-19诱导的急性呼吸窘迫综合征（ARDS）在KTRs中的免疫微环境异质性 | 本研究首次在单细胞分辨率下探讨了COVID-19诱导的ARDS在肾移植受者中的免疫特征，揭示了KTRs在病毒感染和免疫抑制双重影响下的免疫微环境异质性 | 研究样本量较小，仅包括八名COVID-19诱导的ARDS患者和五名KTRs，可能影响结果的普遍性 | 旨在深入理解COVID-19诱导的ARDS在肾移植受者中的免疫特征 | 肾移植受者（KTRs）和健康个体的外周血单个核细胞（PBMCs） | 数字病理学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞数据 | 八名COVID-19诱导的ARDS患者，五名KTRs，五名健康个体 |
| 16860 | 2024-08-05 |
Multipotent progenitors instruct ontogeny of the superior colliculus
2024-Jan-17, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.11.009
PMID:38096816
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研究论文 | 这篇文章探讨了哺乳动物上丘的多能前体细胞如何指导细胞类型的多样性生成 | 首次建立了单细胞水平上哺乳动物上丘发育的新框架 | 目前尚不清楚其他因素如何进一步影响上丘细胞的多样性 | 研究上丘细胞类型多样性的生成原理 | 主要研究了上丘的放射胶质前体细胞的多能性 | 数字病理学 | NA | 基因马赛克分析和单细胞测序 | NA | 细胞谱系数据 | 使用了多个标记的遗传马赛克小鼠 |