单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28099 篇文献，本页显示第 16821 - 16840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16821 | 2024-08-07 |
Integrative analysis identified two subtypes and a taurine-related signature to predict the prognosis and efficacy of immunotherapy in hepatocellular carcinoma
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.11.014
PMID:38034399
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研究论文 | 本研究通过综合分析识别出两种异质性肝细胞癌亚型及与牛磺酸相关的特征，用于预测肝细胞癌的预后和免疫治疗效果 | 本研究首次识别并验证了两种具有不同牛磺酸代谢特征的肝细胞癌亚型，并构建了一个基于牛磺酸代谢相关基因的风险模型，用于评估患者的预后、免疫细胞浸润、免疫治疗反应和药物敏感性 | NA | 研究旨在识别能够预测肝细胞癌患者预后和免疫治疗反应的可靠生物标志物 | 肝细胞癌患者及其牛磺酸代谢特征 | 数字病理学 | 肝癌 | 转录组数据分析 | 风险模型 | 转录组数据 | 多个独立的外部队列 |
| 16822 | 2024-08-07 |
Construction of EMT related prognostic signature for kidney renal clear cell carcinoma, through integrating bulk and single-cell gene expression profiles
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1302142
PMID:38035023
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研究论文 | 本研究通过整合批量和单细胞基因表达数据，构建了与肾透明细胞癌（KIRC）相关的上皮-间质转化（EMT）预测模型 | 本研究构建了一个新的EMT相关预测模型，并发现si-LGALS1能够抑制KIRC细胞的迁移和侵袭能力 | NA | 挖掘更多与EMT相关的细节，并为KIRC构建预测模型 | 肾透明细胞癌（KIRC）及其EMT过程 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO Cox回归分析 | 基因表达数据 | 2,249个显著差异表达基因（DEGs）在KIRC样本中，其中289个DEGs在上皮细胞中 |
| 16823 | 2024-08-07 |
Insights on epithelial cells at the single-cell level in hepatocellular carcinoma prognosis and response to chemotherapy
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1292831
PMID:38044951
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了肝细胞癌中的上皮细胞，旨在为肝细胞癌的预后和药物治疗反应提供靶点洞察 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了肝细胞癌中上皮细胞的组成、分化演化和功能景观，并建立了一个与临床特征、上皮-间质转化及药物敏感性预测紧密相关的3基因风险模型 | NA | 专注于上皮细胞，为检测肝细胞癌的预后和药物治疗反应提供靶点洞察 | 肝细胞癌中的上皮细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 来自GSE149614的数据，包括八个主要的细胞亚群 |
| 16824 | 2024-08-05 |
The role of LSM1 in breast cancer: Shaping metabolism and tumor-associated macrophage infiltration
2023-Dec, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2023.107008
PMID:37995895
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研究论文 | 本研究探讨了LSM1在乳腺癌中的角色，尤其是在代谢和肿瘤相关巨噬细胞浸润方面 | 发现LSM1作为晚期乳腺癌的诊断标志物，并揭示其与免疫细胞和能量代谢的联系 | 需要进一步研究以确认LSM1在乳腺癌临床病理和精确肿瘤学中的潜力 | 探讨LSM1在乳腺癌进展中的角色及其作为潜在诊断和预后标志物的可能性 | 研究对象为乳腺癌及其相关的免疫微环境和代谢变化 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学和单细胞RNA测序 | NA | 组织活检样本和组织微阵列 | 54例乳腺癌患者的活检 |
| 16825 | 2024-08-07 |
Identification of potential diagnostic biomarkers for tenosynovial giant cell tumour by integrating microarray and single-cell RNA sequencing data
2023-Nov-29, Journal of orthopaedic surgery and research
IF:2.8Q1
DOI:10.1186/s13018-023-04279-2
PMID:38017559
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研究论文 | 本文通过整合微阵列和单细胞RNA测序数据，识别了腱鞘巨细胞瘤的潜在诊断生物标志物 | 本文首次通过单细胞RNA测序和微阵列数据的整合分析，识别了腱鞘巨细胞瘤中的骨吸收细胞特异性上调基因 | 研究依赖于已有的公开数据集，未进行体内外实验验证 | 旨在识别高灵敏度和特异性的生物标志物，以辅助诊断腱鞘巨细胞瘤 | 腱鞘巨细胞瘤的诊断生物标志物 | 数字病理学 | 腱鞘巨细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 微阵列 | NA | 基因表达数据 | 两个单细胞RNA测序数据集和两个微阵列数据集 |
| 16826 | 2024-08-07 |
Mouse gingival single-cell transcriptomic atlas identified a novel fibroblast subpopulation activated to guide oral barrier immunity in periodontitis
2023-Nov-28, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.88183
PMID:38015204
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术构建了小鼠牙周炎模型中的牙龈细胞图谱，并鉴定出一种新型纤维母细胞亚群，该亚群在牙周炎中引导口腔屏障免疫。 | 首次鉴定出一种新型纤维母细胞亚群（AG纤维母细胞），并揭示了其在牙周炎中引导口腔炎症的机制。 | NA | 揭示牙周炎中异常口腔屏障免疫的启动机制。 | 小鼠牙周炎模型中的牙龈细胞。 | 数字病理学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自小鼠牙周炎模型的牙龈细胞 |
| 16827 | 2024-08-05 |
LncPCD: a manually curated database of experimentally supported associations between lncRNA-mediated programmed cell death and diseases
2023-11-27, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baad087
PMID:38011720
|
研究论文 | LncPCD是一个手动整理的数据库，提供lncRNA介导的程序性细胞死亡与疾病之间的实验支持关联信息 | 建立了一个专门的数据库LncPCD，记录了lncRNA介导的程序性细胞死亡与多种疾病之间的关系 | 数据库的当前版本可能不包含所有潜在的lncRNA与PCD的关联，且需要持续更新 | 提供关于lncRNA介导的程序性细胞死亡与疾病之间关联的全面信息 | 记录lncRNA与五种主要PCD形式及331种疾病之间的6666个关联 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 数据库 | 331种疾病，1222个lncRNA |
| 16828 | 2024-08-05 |
Deciphering tumor-infiltrating dendritic cells in the single-cell era
2023-Nov-27, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-023-00459-2
PMID:38012715
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综述 | 本文概述了肿瘤微环境中树突状细胞的亚型及其功能。 | 采用单细胞测序技术对树突状细胞的异质性进行高分辨率特征描述，揭示了以前未被认识的树突状细胞群体的多样性。 | 未提及具体的实验数据和样本大小 | 旨在总结肿瘤微环境中树突状细胞的知识，以帮助了解肿瘤免疫。 | 不同人类肿瘤中树突状细胞的亚型及其功能和相互作用。 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 16829 | 2024-08-05 |
Role of arachidonic acid metabolism in intervertebral disc degeneration: identification of potential biomarkers and therapeutic targets via multi-omics analysis and artificial intelligence strategies
2023-Nov-25, Lipids in health and disease
IF:3.9Q2
DOI:10.1186/s12944-023-01962-5
PMID:38007425
|
研究论文 | 该研究探讨了花生四烯酸代谢在椎间盘退变中的作用，识别了潜在的生物标志物和治疗靶点 | 首次通过多组学分析和人工智能策略识别IVDD相关的枢纽基因并开发预测模型 | 需要在更大规模的临床样本中验证所识别的生物标志物和治疗靶点的有效性 | 探讨花生四烯酸代谢与椎间盘退变的关系，识别早期生物标志物及治疗靶点 | 主要针对椎间盘退变及其相关的生物标志物和靶向药物 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序，机器学习，人工神经网络 | NA | RNA-seq数据 | NA |
| 16830 | 2024-08-07 |
Comprehensive clinicopathological significance and putative transcriptional mechanisms of Forkhead box M1 factor in hepatocellular carcinoma
2023-Nov-25, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-023-03250-z
PMID:38001498
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研究论文 | 本研究探讨了Forkhead box M1因子（FOXM1）在肝细胞癌（HCC）中的临床病理意义及其潜在的转录机制 | 本研究首次在大规模多中心研究中证实了FOXM1在HCC中的上调，并揭示了其在细胞周期途径中通过激活其他转录因子促进HCC进展的潜在机制 | NA | 探讨FOXM1在HCC中的临床病理意义及其转录机制 | FOXM1因子在肝细胞癌中的表达及其转录机制 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 组织微阵列、免疫组化染色、基因芯片、高通量测序、染色质免疫沉淀后测序（ChIP-seq）、单细胞RNA测序 | NA | 组织样本、基因表达数据 | 4235个HCC组织样本和3461个非HCC组织样本 |
| 16831 | 2024-08-05 |
Pregnancy-responsive pools of adult neural stem cells for transient neurogenesis in mothers
2023-11-24, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abo5199
PMID:37995223
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研究论文 | 本文探讨了妊娠期间母体中成人神经干细胞的响应及其对神经发生的影响 | 研究发现多个区域特异的成人神经干细胞会在妊娠期间被招募，产生短期的嗅球间神经元波 | 未提及具体的局限性 | 研究妊娠如何影响成人神经干细胞的激活及神经发生 | 研究对象为成年小鼠的神经干细胞及其在妊娠期间的反应 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | NA | 成年小鼠 |
| 16832 | 2024-08-07 |
Molecular subtyping based on immune cell marker genes predicts prognosis and therapeutic response in patients with lung adenocarcinoma
2023-Nov-24, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-023-11579-7
PMID:38001428
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研究论文 | 本研究利用免疫细胞标记基因对肺腺癌进行分子亚型分类，并探讨其与临床结果和治疗反应的关系 | 通过单细胞RNA测序识别的免疫细胞标记基因，构建了肺腺癌免疫差异评分模型，用于预测患者的预后和治疗反应 | NA | 探索肺腺癌的分子亚型特征，明确免疫微环境、临床结果和治疗反应之间的关联 | 肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归分析 | 基因数据 | 1441个免疫细胞标记基因，GSE72094队列的患者 |
| 16833 | 2024-08-05 |
A Mendelian Randomization-Based Causal Investigation on Bacterial Infection-Related Genes and Neurodegenerative Diseases
2023-Nov-23, Studies in health technology and informatics
DOI:10.3233/SHTI230893
PMID:38007792
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研究论文 | 本研究探讨了细菌感染相关基因与神经退行性疾病之间的因果关系 | 通过孟德尔随机化，确定了7个与细菌感染途径相关的基因在阿尔茨海默病和帕金森病中的因果关联 | 尚未深入研究细菌慢性感染与神经退行性疾病的关系 | 分析细菌感染基因与神经退行性疾病之间的因果关系 | 阿尔茨海默病和帕金森病相关基因 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 孟德尔随机化 | NA | 基因组数据 | 根据全基因组关联研究（GWAS）的数据 |
| 16834 | 2024-08-05 |
Single Cell Sequencing Analysis for Blood Tissue
2023-Nov-23, Studies in health technology and informatics
DOI:10.3233/SHTI230872
PMID:38007772
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术分析血液组织样本 | 首次在血液组织中使用单细胞测序揭示细胞异质性 | 研究仅限于血液组织样本，可能无法广泛应用于其他组织类型 | 探索不同细胞类型在生理和病理条件下的分子特征和功能差异 | 血液组织样本中的单个细胞 | 数字病理学 | 老年性疾病 | 单细胞测序 | 主成分分析（PCA）和莱顿聚类 | 基因组、转录组和表观基因组数据 | 血液组织样本中的细胞 |
| 16835 | 2024-08-05 |
Transfer learning for clustering single-cell RNA-seq data crossing-species and batch, case on uterine fibroids
2023-11-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad426
PMID:37991248
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研究论文 | 本文提出了一种新的图基深度嵌入聚类方法，利用跨物种和批次的迁移学习来聚类单细胞RNA-seq数据 | 创新地提出了GDEC方法，通过图卷积网络及DEC，改善了稀疏基因表达矩阵带来的挑战，并在多种细胞群体中发现了新的细胞类型 | NA | 旨在通过迁移学习提高单细胞RNA-seq数据的聚类效果 | 单细胞RNA-seq数据，特别是子宫肌瘤数据 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | 图卷积网络 | 单细胞RNA-seq数据 | NA |
| 16836 | 2024-08-05 |
A rapid and sensitive, multiplex, whole mount RNA fluorescence in situ hybridization and immunohistochemistry protocol
2023-Nov-22, Plant methods
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13007-023-01108-9
PMID:37993896
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研究论文 | 本研究提出了一种快速、灵敏的全挂RNA荧光原位杂交和免疫组化协议 | 该研究适应了一种基于混合先前协议的三天全挂RNA-FISH方法，增强了探针信号，并实现了三种转录本的同时检测 | 目前尚未报告易于可靠应用的全挂FISH协议 | 探讨植物组织中的基因表达空间特征 | 研究对象为拟南芥花序和单子叶植物根的基因转录本 | 数字病理学 | NA | RNA荧光原位杂交（FISH） | 无抗体的杂交链反应（HCR） | NA | NA |
| 16837 | 2024-08-07 |
Liver cancer stem cell dissemination and metastasis: uncovering the role of NRCAM in hepatocellular carcinoma
2023-Nov-22, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-023-02893-w
PMID:37993901
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研究论文 | 本研究探讨了NRCAM在肝癌干细胞（LCSCs）功能和肝细胞癌（HCC）转移中的作用及其机制 | 首次揭示了NRCAM通过激活上皮-间质转化（EMT）和转移相关基质金属蛋白酶（MMPs）促进LCSCs迁移和侵袭的机制 | NA | 揭示NRCAM对LCSCs功能和HCC转移的贡献及其详细机制 | 肝癌干细胞（LCSCs）和肝细胞癌（HCC） | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 117例HCC患者和29例非HCC患者 |
| 16838 | 2024-08-05 |
The Promotion of Humoral Immune Responses in Humans via SOCS1-Mediated Th2-Bias Following SARS-CoV-2 Vaccination
2023-Nov-20, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines11111730
PMID:38006062
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研究论文 | 本研究揭示了SARS-CoV-2疫苗接种后通过SOCS1介导的Th2偏倚促进人类体液免疫反应的机制 | 研究首次指出SOCS1在T细胞中的变化与Th2偏倚及抗SARS-CoV-2抗体产生之间的关联 | 研究只关注了抗体变化的高低分组，可能未能全面反映所有个体的免疫反应 | 探讨SARS-CoV-2疫苗接种后Th1/Th2偏倚对宿主免疫反应的影响 | 接种三剂SARS-CoV-2疫苗后的抗体变化显著的个体 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 血液样本 | 三个剂量接种后的样本，具体数量未提及 |
| 16839 | 2024-08-05 |
Cancer-Associated Fibroblasts in Gastrointestinal Cancers: Unveiling Their Dynamic Roles in the Tumor Microenvironment
2023-Nov-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms242216505
PMID:38003695
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综述 | 本文总结了癌associated成纤维细胞（CAFs）在胃肠癌肿瘤微环境中的动态作用。 | 揭示了CAFs在肿瘤进展中的多重作用和与免疫系统的动态相互作用 | 未提及具体的研究限制 | 探讨胃肠癌中CAFs在肿瘤微环境中的作用 | 癌associated成纤维细胞及其在肿瘤进展中的角色 | 数字病理学 | 胃肠癌 | 单细胞转录组学 | NA | 文献数据 | NA |
| 16840 | 2024-08-05 |
Integrative multiomics analysis of neointima proliferation in human saphenous vein: implications for bypass graft disease
2023-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.14.567053
PMID:38014255
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研究论文 | 本文探讨了人类大隐静脉中新内膜增生的多组学分析及其对旁路移植物疾病的影响 | 首次揭示了新内膜增生期间基因和蛋白表达的动态变化，识别了新的人类特异性分子和细胞机制 | 研究主要基于体外组织培养模型，可能无法完全反映体内实际情况 | 研究人类大隐静脉中新内膜增生的转录组学和蛋白质组学动态 | 对73名患者的大隐静脉样本进行多组学分析 | 数字病理 | 旁路移植物疾病 | RNA测序和蛋白质组学分析 | NA | 组织样本 | 73个患者样本 |