单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 16821 - 16840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16821 | 2024-08-07 |
Mesenchymal stem cells shift the pro-inflammatory phenotype of neutrophils to ameliorate acute lung injury
2023-08-08, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-023-03438-w
PMID:37553691
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研究论文 | 研究探讨了间充质干细胞（MSC）在急性肺损伤（ALI）中对中性粒细胞表型的影响 | 首次揭示了MSC通过上调CD24表达，将激活的中性粒细胞表型转变为衰老型，从而抑制炎症反应 | NA | 研究MSC在ALI中对中性粒细胞的免疫抑制作用 | ALI小鼠肺组织中的中性粒细胞 | NA | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | ALI小鼠肺组织中的中性粒细胞 |
| 16822 | 2024-08-05 |
The single-cell transcriptome and chromatin accessibility datasets of peripheral blood mononuclear cells in Chinese holstein cattle
2023-08-07, BMC genomic data
IF:1.9Q3
DOI:10.1186/s12863-023-01139-0
PMID:37550629
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研究论文 | 本研究分析了中国荷斯坦奶牛外周血单核细胞的单细胞转录组和染色质可及性数据集 | 提供了关于LPS刺激下外周血单核细胞的单细胞层面的新见解 | 对于LPS如何在单细胞水平上刺激PBMCs仍然了解不多 | 通过分析PBMCs的单细胞转录组和染色质可及性，促进对免疫应答的理解 | 中国荷斯坦奶牛的外周血单核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞转座酶可及性染色质测序（scATAC-seq） | NA | 基因组数据 | 共计30,756个估计单细胞，经过质量控制后映射到26,141个单细胞 |
| 16823 | 2024-08-05 |
SONAR enables cell type deconvolution with spatially weighted Poisson-Gamma model for spatial transcriptomics
2023-08-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40458-9
PMID:37550279
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研究论文 | 提出SONAR模型以利用空间转录组数据进行细胞类型解卷积 | SONAR模型结合空间加权回归框架和弹性加权步骤，提升了细胞类型成分的局部估计 | 由于空间分辨率限制，测量的表达往往混合自多种细胞 | 开发一种能够更准确解卷积空间转录组数据中细胞类型的模型 | 空间转录组数据中的细胞类型 | 数字病理学 | 肝癌 | 空间转录组 | 回归模型 | 空间转录组数据 | 包括小鼠大脑、人类心脏和人类胰腺导管腺癌的样本 |
| 16824 | 2024-08-07 |
Specific subsets of urothelial bladder carcinoma infiltrating T cells associated with poor prognosis
2023-08-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-39208-0
PMID:37550396
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了来自两名膀胱尿路上皮癌患者的30,905个T细胞，识别出18种不同的T细胞亚群，并发现某些特定亚群与不良预后相关 | 首次详细描述了膀胱尿路上皮癌中浸润性T细胞的组成，并揭示了与不良预后相关的特定T细胞亚群 | 研究样本仅来自两名患者，可能影响结果的普遍性 | 探索膀胱尿路上皮癌中肿瘤浸润淋巴细胞的组成，为开发有效的肿瘤免疫疗法提供理论基础 | 膀胱尿路上皮癌中的T细胞亚群及其与患者预后的关系 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 30,905个T细胞 |
| 16825 | 2024-08-07 |
The expression and prognostic value of disulfidptosis progress in lung adenocarcinoma
2023-08-07, Aging
DOI:10.18632/aging.204938
PMID:37552140
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研究论文 | 本研究探讨了二硫化物死亡相关基因（DRGs）在肺腺癌（LUAD）中的表达及其预后价值 | 构建了一个包含五个DRGs的模型，用于评估LUAD的预后，该模型的预测准确性显著高于基于临床参数的模型 | NA | 研究二硫化物死亡相关基因在肺腺癌中的表达及其预后价值 | 二硫化物死亡相关基因在肺腺癌中的表达及预后价值 | 数字病理学 | 肺腺癌 | scRNA-seq | LASSO分析和多元Cox回归分析 | 表达谱和单细胞RNA测序数据 | 从TCGA和GEO数据库收集的表达谱和scRNA-seq数据，涉及22个DRGs在正常和肿瘤组织中的差异表达 |
| 16826 | 2024-08-07 |
A novel metabolic subtype with S100A7 high expression represents poor prognosis and immuno-suppressive tumor microenvironment in bladder cancer
2023-Aug-05, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-023-11182-w
PMID:37543645
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研究论文 | 本研究通过共识聚类将膀胱癌患者分为两种代谢亚型，并探讨了代谢亚型与免疫微环境及预后的关系 | 首次系统全面地阐述了膀胱癌的代谢异质性，并发现了S100A7高表达的代谢亚型与免疫抑制性肿瘤微环境和良好免疫治疗反应相关 | NA | 探讨膀胱癌的代谢异质性及其与免疫微环境和预后的关系 | 膀胱癌患者及其代谢亚型 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 共识聚类 | NA | 基因表达数据 | 1640个代谢相关基因，63例膀胱癌样本和16例癌旁样本 |
| 16827 | 2024-08-07 |
A single-cell transcriptional landscape of immune cells shows disease-specific changes of T cell and macrophage populations in human achalasia
2023-08-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39750-5
PMID:37542039
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了人体贲门失弛缓症患者与对照组的下食管括约肌组织和血液样本的免疫细胞转录组特征 | 首次揭示了贲门失弛缓症中C1QC巨噬细胞和组织驻留记忆T细胞的显著扩张及其与疾病进展的关系 | NA | 探讨贲门失弛缓症中免疫细胞的转录组特征及其与疾病进展的关系 | 贲门失弛缓症患者的下食管括约肌组织和血液样本 | 数字病理学 | 贲门失弛缓症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 贲门失弛缓症患者与对照组的下食管括约肌组织和血液样本 |
| 16828 | 2024-08-05 |
Decoding the prognostic significance of integrator complex subunit 9 (INTS9) in glioma: links to TP53 mutations, E2F signaling, and inflammatory microenvironments
2023-Aug-03, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-023-03006-5
PMID:37537630
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研究论文 | 本研究探讨了INTS9在胶质瘤中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 本文首次将INTS9与TP53突变、E2F信号通路和炎症微环境联系起来 | 缺乏临床试验验证结果，尚需进一步研究以确认发现 | 旨在明确INTS9在胶质瘤治疗中的潜在角色 | 研究对象包括胶质瘤的基因组、蛋白质组数据及细胞系 | 数字病理学 | NA | 全外显子测序、免疫组化 | NA | 基因组数据、蛋白组数据 | 从TCGA和CGGA收集多个肿瘤样本进行分析 |
| 16829 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics of human cholesteatoma identifies an activin A-producing osteoclastogenic fibroblast subset inducing bone destruction
2023-08-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40094-3
PMID:37537159
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析发现在人类胆脂瘤中存在一种产激活素A的成骨破坏性成纤维细胞亚群，导致骨破坏 | 本研究首次确定了胆脂瘤中特有的产激活素A的成纤维细胞亚群，并揭示了其在骨破坏中的作用 | 本研究的限制在于使用的是小鼠模型，可能与人类病理机制存在差异 | 研究胆脂瘤中骨破坏的病理生理机制 | 人类胆脂瘤样本中的单细胞 | 数字病理学 | 耳科疾病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | RNA序列数据 | 人类胆脂瘤样本NA |
| 16830 | 2024-08-05 |
Integration of single-cell sequencing and bulk expression data reveals chemokine signaling pathway in proliferating cells is associated with the survival outcome of osteosarcoma
2023-08-03, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-023-01617-5
PMID:37537613
|
研究论文 | 该文章研究了化学因子信号通路与骨肉瘤患者生存结果的关系 | 整合单细胞RNA测序和大规模转录组数据，识别与生存相关的细胞亚群体 | 未充分验证所发现的生物标志物在临床应用中的有效性 | 探讨骨肉瘤中与生存结果相关的生物标志物 | 骨肉瘤患者的细胞亚群体 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序和大规模转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 16831 | 2024-08-07 |
Extracellular matrix remodelling in dental pulp tissue of carious human teeth through the prism of single-cell RNA sequencing
2023-08-02, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-023-00238-z
PMID:37532703
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析结合免疫染色技术，生成了一份全面的龋齿人牙髓单细胞图谱，揭示了龋齿牙髓组织中细胞群的分子和细胞学变化。 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了龋齿牙髓组织的分子和细胞学景观，展示了细胞群的显著变化，如免疫细胞、间充质干细胞和成纤维细胞的改变。 | 研究仅限于龋齿牙髓组织，未涉及其他类型的牙髓疾病或病变。 | 旨在揭示龋齿牙髓组织中的分子和细胞学变化，并为未来牙科病理学研究和疾病器官的比较分析提供基础。 | 研究对象为龋齿人牙髓组织。 | 数字病理学 | 牙科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 研究涉及龋齿人牙髓组织的多个细胞群 |
| 16832 | 2024-08-07 |
Prmt5 deficiency inhibits CD4+ T-cell Klf2/S1pr1 expression and ameliorates EAE disease
2023-Aug-02, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-023-02854-2
PMID:37533053
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研究论文 | 研究探讨了蛋白精氨酸甲基转移酶5（Prmt5）在CD4+ T细胞中的作用及其对实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）的影响 | 首次详细阐述了Prmt5通过抑制Klf2-S1pr1通路来改善EAE疾病的分子机制 | NA | 阐明Prmt5在T细胞生物学中的未知作用及其对EAE疾病的影响 | CD4+ T细胞中的Prmt5功能及其对EAE的影响 | NA | 自身免疫性疾病 | 流式细胞术，单细胞RNA测序，ATAC测序，染色质免疫沉淀实验 | NA | 细胞 | Prmt5条件性敲除（CD4-cre-Prmt5fl/fl，Prmt5cko）和Prmt5fl/fl（WT）小鼠 |
| 16833 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing on CD8+ TILs revealed the nature of exhausted T cells recognizing neoantigen and cancer/testis antigen in non-small cell lung cancer
2023-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-007180
PMID:37544663
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了非小细胞肺癌中疲惫T细胞的特点，尤其是识别新抗原和癌/testis抗原的CD8+肿瘤浸润淋巴细胞(TILs) | 本文创新性地分析了疲惫T细胞的TCR克隆群体，并探讨了肿瘤抗原特异性T细胞的特征 | 研究样本量相对较小，仅限于三例手术切除的肺癌标本 | 本研究旨在揭示非小细胞肺癌中CD8+ TILs的特性和肿瘤抗原特异性T细胞的功能 | 研究对象为从三例肺癌标本中提取的CD8+ TILs | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序和单细胞T细胞受体测序 | NA | 基因表达数据 | 6998个CD8+ T细胞 |
| 16834 | 2024-08-07 |
Exploring Influenza A Virus-Induced Lung Injury and Immune Response Based on Humanized Lung-on-Chip
2023-08, Discovery medicine
IF:2.0Q3
DOI:10.24976/Discov.Med.202335177.55
PMID:37553308
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研究论文 | 本研究通过构建人源化肺芯片模型，系统分析了流感A病毒感染后外周血单个核细胞（PBMCs）的转录组特征 | 利用肺芯片结合单细胞RNA测序技术，提供了一个独特的平台来深入研究流感A病毒感染后的肺部免疫反应和新治疗策略 | NA | 旨在系统分析流感A病毒感染后PBMCs的转录组特征 | 流感A病毒感染后的外周血单个核细胞（PBMCs） | 数字病理学 | 流感 | 单细胞RNA测序 | 肺芯片 | 转录组数据 | 涉及多种细胞类型，包括肺泡上皮细胞、血管内皮细胞、肺泡巨噬细胞和PBMCs |
| 16835 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome atlas reveals spatiotemporal developmental trajectories in the basal roots of moso bamboo (Phyllostachys edulis)
2023-Aug, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhad122
PMID:37554343
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研究论文 | 本研究通过改进原生质体制备方法，报道了毛竹基部根尖的单细胞转录组图谱，揭示了其细胞类型分化和发育轨迹 | 首次报道了毛竹基部根尖的单细胞转录组图谱，并定义了新的细胞类型特异性标记基因，揭示了毛竹与水稻在根发育路径上的差异 | NA | 探究毛竹基部根尖细胞分化和根系结构的机制 | 毛竹基部根尖的单细胞转录组 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 14,279个过滤后的单细胞 |
| 16836 | 2024-08-05 |
Bioinformatics analysis and single-cell RNA sequencing: elucidating the ubiquitination pathways and key enzymes in lung adenocarcinoma
2023-Jul-31, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-23-795
PMID:37559628
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析肺腺癌中的泛素化通路及关键酶的作用 | 文章揭示了PSMD14在肺腺癌恶性调控中的关键作用，具有潜在的预后和治疗生物标志物价值 | 研究主要基于数据分析，缺乏大规模临床验证 | 鉴定与肺腺癌发展相关的关键分子及其泛素化修饰 | 重点研究了与肺腺癌相关的单细胞及 bulk 转录组数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 分析了来自GEO和TCGA数据库的单细胞和bulk转录组数据 |
| 16837 | 2024-08-07 |
Predicting key gene related to immune infiltration and myofibroblast-like valve interstitial cells in patients with calcified aortic valve disease based on bioinformatics analysis
2023-Jul-31, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-23-72
PMID:37559614
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析，预测与钙化性主动脉瓣疾病相关的关键基因CTHRC1，并探讨其在免疫细胞浸润和心肌成纤维细胞样瓣膜间质细胞中的作用 | 首次识别CTHRC1为钙化性主动脉瓣疾病的关键基因，并揭示其与免疫细胞浸润和心肌成纤维细胞样瓣膜间质细胞的关系 | NA | 探索钙化性主动脉瓣疾病的潜在生物标志物及其在疾病进展中免疫细胞浸润的作用 | 钙化性主动脉瓣疾病、关键基因CTHRC1、免疫细胞浸润、心肌成纤维细胞样瓣膜间质细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 微阵列数据分析、基因本体论（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析、机器学习算法、CIBERSORT | 机器学习算法 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 基于三个微阵列数据集：GSE12644、GSE51472和GSE83453 |
| 16838 | 2024-08-07 |
Propionyl-CoA carboxylase subunit B modulates PIK3CA-regulated immune-surveillance in a pancreatic cancer mouse model
2023-Jul-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.24.550301
PMID:37546948
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研究论文 | 研究通过基因删除筛选发现丙酰辅酶A羧化酶亚基B（PCCB）调节PIK3CA介导的免疫逃逸，影响胰腺癌的免疫治疗效果 | 首次发现PCCB在调节PIK3CA介导的胰腺癌免疫监视中的作用，并通过单细胞RNA测序揭示了T细胞的耗竭状态 | 研究主要在鼠模型中进行，需要进一步验证在人类胰腺癌中的效果 | 探索PI3K抑制剂抵抗胰腺癌的潜在因素 | 胰腺导管腺癌（PDAC）及其免疫治疗 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 使用KPC细胞系植入小鼠胰腺进行实验 |
| 16839 | 2024-08-05 |
ScopeViewer: A Browser-Based Solution for Visualizing Spatial Transcriptomics Data
2023-Jul-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.24.549256
PMID:37546786
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研究论文 | 本研究介绍了ScopeViewer，一种基于浏览器的视觉化空间转录组学数据解决方案。 | ScopeViewer提供了多种功能，以解决空间转录组学数据可视化中的挑战，如多级缩放、双重交互查看和优化带宽显示等。 | 未提及特定的局限性 | 旨在改善空间转录组学数据的可视化和用户体验。 | 主要研究对象为空间转录组学数据和相关的大型图像数据集。 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 图像 | NA |
| 16840 | 2024-08-05 |
Characterization of cell-fate decision landscapes by estimating transcription factor dynamics
2023-07-24, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100512
PMID:37533652
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研究论文 | 本文提出了一种方法FateCompass，通过特定的转录因子动力学来表征细胞命运决策景观 | FateCompass结合了单细胞转录组学数据与RNA速度，估计了转录因子的动态活动，并识别了特定谱系的调节因子 | 在单细胞水平上估计调控活动仍然具有挑战性 | 研究在分化过程中转录因子的动态调控活动 | 针对特定谱系的转录因子进行研究 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | 线性模型 | RNA数据 | 涉及胰腺内分泌细胞分化的数据集 |