单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
16781 2024-08-07
Integrated bulk and single-cell transcriptome data identify clinically relevant cell populations in clear cell renal cell carcinoma
2024-Jan, Genes & diseases IF:6.9Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
16782 2024-08-07
Single-cell analysis reveals key differences between early-stage and late-stage systemic sclerosis skin across autoantibody subgroups
2023-12, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了弥漫性皮肤系统性硬化症(dcSSc)患者与健康对照组之间的细胞差异 发现了dcSSc患者中抗RNA聚合酶III(ARA)和抗拓扑异构酶抗体(ATA)亚组在疾病早期和晚期皮肤细胞表达谱和细胞间相互作用的差异 NA 探究dcSSc患者皮肤在不同疾病阶段和抗体亚组间的细胞差异 弥漫性皮肤系统性硬化症患者和健康对照组 数字病理学 系统性硬化症 单细胞RNA测序 NA 皮肤活检样本 15个前臂皮肤活检样本,包括12名dcSSc患者和3名健康对照组
16783 2024-08-05
Single-cell analysis of spinal cord injury reveals functional heterogeneity of oligodendrocyte lineage cells
2023-Nov-30, Gene IF:2.6Q2
研究论文 本研究揭示了脊髓损伤后少突胶质细胞谱系细胞的功能异质性 首次揭示了Junb在成熟少突胶质细胞中的独特作用,并预测了可能的转录因子 尚缺乏对脊髓损伤后少突胶质细胞状态和细胞间相互作用的深入研究 探讨脊髓损伤后少突胶质细胞谱系细胞的功能变化和相互作用 脊髓损伤后的少突胶质细胞谱系细胞 数字病理学 脊髓损伤 单细胞转录组测序 NA 细胞转录组数据 NA
16784 2024-08-07
Integrating single-cell imaging and RNA sequencing datasets links differentiation and morphogenetic dynamics of human pancreatic endocrine progenitors
2023-11-06, Developmental cell IF:10.7Q1
research paper 本文通过监测NEUROG3基因表达和蛋白质在单细胞水平上的动态变化,结合单细胞转录组数据,研究了人类胰腺内分泌前体细胞的分化和形态发生动力学 提出了将单细胞转录组数据与活细胞动态行为统计整合的数据映射方法,并发现了KLK12在NEUROG3表达初期对细胞迁移的作用 NA 研究人类胰腺内分泌前体细胞的分化和形态发生动力学 NEUROG3基因在人类胰腺内分泌前体细胞中的表达和功能 digital pathology NA RNA sequencing NA image 单细胞水平的数据
16785 2024-08-05
Integrated single-cell and bulk sequencing analyses with experimental validation identify the prognostic and immunological implications of CD226 in pan-cancer
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3
研究论文 本研究探讨了CD226在泛癌中的生物功能、肿瘤免疫作用及其作为预后和免疫治疗反应预测因子的潜力 CD226被提出作为一种创新生物标志物,能预测患者预后和免疫治疗反应 CD226在多种癌症类型中的具体机制仍需进一步深入研究 研究CD226在肿瘤免疫中的作用及其预后预测潜力 CD226在肿瘤浸润的CD8+和NK细胞中的表达及其功能 数字病理学 泛癌 单细胞和整体测序分析 NA 基因表达数据 NA
16786 2024-08-07
Aging impairs the ability of vascular endothelial stem cells to generate endothelial cells in mice
2023-11, Angiogenesis IF:9.2Q1
研究论文 本研究比较了年轻和老年小鼠的血管内皮干细胞(VESCs)在体外和体内分化为内皮细胞的潜力 首次阐明了衰老如何影响血管内皮干细胞(VESCs) NA 探讨衰老对血管内皮干细胞功能的影响 年轻和老年小鼠的血管内皮干细胞 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA 年轻(2-3个月大)和老年(27-28个月大)小鼠的血管内皮干细胞
16787 2024-08-05
Two distinct molecular faces of preeclampsia revealed by single-cell transcriptomics
2023-Oct-13, Med (New York, N.Y.)
研究论文 本研究揭示了妊娠高血压疾病的两种不同分子特征 首次通过单细胞转录组学研究早发和晚发妊娠高血压疾病的分子变化 研究仅集中于胎盘细胞类型,可能无法全面反映妊娠高血压的全貌 探讨在两种类型的妊娠高血压中胎盘功能的分子变化 早发和晚发妊娠高血压患者及相应的妊娠匹配对照 数字病理学 妊娠高血压 单细胞转录组学 NA 基因表达数据 包含早发和晚发妊娠高血压病例及相应对照的多个样本
16788 2024-08-05
Single-cell RNA sequencing reveals blastomere heterogeneity of 2-cell embryos in pigs
2023-Oct, Reproduction in domestic animals = Zuchthygiene
研究论文 本研究分析了猪2-cell胚胎中的单细胞RNA测序数据,揭示了其胚胎芽细胞异质性。 该研究首次系统地揭示了不同类型的猪2-cell胚胎中,芽细胞的分子异质性及其调控机制。 研究主要集中于猪的2-cell胚胎,结果可能不适用于其他物种的胚胎发育研究。 探讨猪2-cell胚胎芽细胞的异质性及其与胚胎随后发育的关系。 本研究对象为猪2-cell胚胎中的单个芽细胞。 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA mRNA 包含3种不同类型的2-cell胚胎:体内受精、体外受精和单性激活
16789 2024-08-05
Single-cell RNA-seq reveals a microenvironment and an exhaustion state of T/NK cells in acute myeloid leukemia
2023-Oct, Cancer science IF:4.5Q1
研究论文 本研究揭示了急性髓性白血病(AML)中T/NK细胞的微环境及其耗竭状态 分析了急性髓性白血病的肿瘤微环境,揭示了T/NK细胞在此环境中的耗竭状态及其表达分子 未提到具体的限制 探讨急性髓性白血病中的免疫微环境及T/NK细胞的状态 包括21名急性髓性白血病患者及8名健康供体的骨髓样本 数字病理学 急性髓性白血病 单细胞RNA测序 NA 细胞数据 128,688个细胞,来自29个骨髓抽取
16790 2024-08-05
Single-cell sequencing provides insights into the landscape of ovary in PCOS and alterations induced by CUMS
2023-10-01, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism
研究论文 这项研究通过单细胞RNA测序探讨多囊卵巢综合症(PCOS)卵巢的转录特征及其与抑郁间的机制。 提供了PCOS及其抑郁相关的分子机制的新见解,突出了炎症在PCOS发病机制中的重要性。 主要使用大鼠模型,是否能完全反映人类的情况仍需进一步验证。 探索PCOS卵巢的独特转录组特征及抑郁的影响机制。 使用了由来曲唑和慢性不可预测轻度压力(CUMS)诱导的PCOS大鼠模型。 数字病理学 多囊卵巢综合症 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) NA 转录组数据 采用了多个细胞类型进行分析,包括颗粒细胞和成纤维细胞等12种细胞类型
16791 2024-08-07
Single-cell transcriptional profiling reveals immunomodulatory properties of stromal and epithelial cells in periodontal immune milieu with diabetes in rats
2023-Oct, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析,揭示了糖尿病大鼠牙周炎环境中基质细胞和上皮细胞的免疫调节特性 首次详细描述了糖尿病相关牙周炎中牙龈细胞的异质性及其免疫微环境的改变,并揭示了基质细胞和上皮细胞在牙龈免疫微环境中的免疫调节功能 研究仅限于大鼠模型,未来研究需在人类样本中验证这些发现 探讨糖尿病与牙周炎之间的分子联系,并揭示牙龈细胞在糖尿病相关牙周炎中的细胞特异性变化 糖尿病大鼠牙周炎环境中的牙龈基质细胞和上皮细胞 数字病理学 糖尿病 单细胞转录组分析 NA 转录组数据 45,259个细胞
16792 2024-08-07
Toward the functional interpretation of somatic structural variations: bulk- and single-cell approaches
2023-09-20, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
综述 本文综述了基于全基因组测序(WGS)检测组织和单细胞水平体细胞结构变异(SVs)的最新进展,并讨论了其优势和局限性 介绍了先进的计算算法用于体细胞SV的识别,并比较了有无匹配正常对照的体细胞SV检测器的性能 体细胞SVs的检测具有挑战性,且目前研究较少 探讨体细胞结构变异的功能解释 体细胞结构变异(SVs)及其在细胞发育和衰老中的作用 数字病理学 NA 全基因组测序(WGS) NA 基因组数据 NA
16793 2024-08-07
An Atlas of Grass Carp IgM+ B Cells in Homeostasis and Bacterial Infection Helps to Reveal the Unique Heterogeneity of B Cells in Early Vertebrates
2023-09-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了草鱼IgM+ B细胞在稳态和细菌感染下的景观 发现了草鱼IgM+ B细胞的六个主要群体,包括罕见的先天B细胞和增殖B细胞,并揭示了单个B细胞可能通过共表达重组的IgM亚类基因产生多种抗体 NA 揭示早期脊椎动物B细胞的独特异质性 草鱼IgM+ B细胞 免疫学 NA 单细胞RNA测序,单细胞分选结合Sanger测序 NA RNA 多个草鱼IgM+ B细胞样本
16794 2024-08-05
Mechanism of breast cancer immune microenvironment in prognosis of heart failure
2023-09, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1
研究论文 本文探讨了乳腺癌免疫微环境对心力衰竭预后的影响机制 研究揭示了乳腺癌与心力衰竭之间通过免疫途径的联系,并构建了一种能够预测心力衰竭发生的变换器模型 尚未明确乳腺癌治疗对心力衰竭影响的所有潜在机制 研究乳腺癌患者心力衰竭预后的潜在机制 1260名乳腺癌患者的基因表达数据 数字病理学 乳腺癌 基因表达分析,单细胞测序,变换器模型 变换器 基因表达数据 1260名乳腺癌患者
16795 2024-08-05
Dissecting human placental cells heterogeneity in preeclampsia and gestational diabetes using single-cell sequencing
2023-09, Molecular immunology IF:3.2Q3
研究论文 本研究通过单细胞测序分析妊娠高血压和妊娠糖尿病患者的胎盘细胞异质性 首次揭示了妊娠高血压和妊娠糖尿病患者胎盘细胞类型及其分化顺序的异质性变化 样本量较小,仅涉及15名患者,可能影响结果的普遍适用性 深入了解妊娠高血压和妊娠糖尿病对胎盘细胞类型的异质性变化 研究对象包括妊娠高血压、妊娠糖尿病患者和健康对照组的胎盘细胞 数字病理学 妊娠高血压, 妊娠糖尿病 单细胞测序 NA 细胞数据 共涉及15个样本(妊娠高血压5个,妊娠糖尿病5个,健康对照5个)
16796 2024-08-07
Simultaneous profiling of chromatin architecture and transcription in single cells
2023-09, Nature structural & molecular biology IF:12.5Q1
研究论文 本文开发了一种单细胞多组学方法,能够同时检测染色质结构和信使RNA表达 提出了一种新的单细胞多组学方法scCARE-seq,能够同时检测染色质结构和转录活性 NA 探究染色质三维结构与基因表达之间的调控关系 单细胞染色质结构和转录活性 基因组学 NA 单细胞转录组测序(scCARE-seq) NA 基因组数据 单个小鼠胚胎干细胞
16797 2024-08-07
CellBender removes technical artifacts from single-cell RNA sequencing data
2023-09, Nature methods IF:36.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
16798 2024-08-05
FoxM1 coordinates cell division, protein synthesis, and mitochondrial activity in a subset of β cells during acute metabolic stress
2023-08-29, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本文探讨了在急性代谢压力下,FoxM1如何协调细胞分裂、蛋白质合成和线粒体活性 揭示了FoxM1在代谢压力下对β细胞增殖和功能的调控作用 对β细胞异质性的整体作用机制尚未完全理解 研究急性代谢压力下β细胞的功能与转录异质性 特定亚群的β细胞在代谢压力下的反应 数字病理学 NA RNA测序、ATAC-seq、单细胞RNA-seq、ChIP-seq、实时成像 NA 基因表达数据 NA
16799 2024-08-07
Metformin escape in prostate cancer by activating the PTGR1 transcriptional program through a novel super-enhancer
2023-08-16, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1
研究论文 本研究探讨了二甲双胍在前列腺癌中治疗失败的可能机制,发现超增强子与前列腺素还原酶1(PTGR1)表达的关联,以及PTGR1过表达如何促进细胞周期进展并降低对二甲双胍的敏感性 揭示了二甲双胍耐药性的细胞机制,并提出了通过调控SE-TFs-PTGR1轴来增强二甲双胍治疗效果的新途径 NA 探讨二甲双胍在前列腺癌治疗中的耐药机制 前列腺癌细胞 数字病理学 前列腺癌 单细胞转录组测序 NA 转录组 NA
16800 2024-08-05
Spatial transcriptomics reveal markers of histopathological changes in Duchenne muscular dystrophy mouse models
2023-08-15, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文采用空间转录组技术识别杜氏肌营养不良症小鼠模型中与组织病理变化相关的基因表达特征 首次在不同病程严重程度的杜氏肌营养不良症小鼠模型中利用空间转录组技术直接关联基因表达与肌肉组织学 未明确提及研究的具体局限性 识别驱动组织重塑的基因和细胞类型,以开发有效的疗法 使用了两种不同病程严重程度的杜氏肌营养不良症小鼠模型 数字病理学 杜氏肌营养不良症 空间转录组 NA 基因表达数据 使用了两种杜氏肌营养不良症小鼠模型
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