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当前共找到 39812 篇文献，本页显示第 1661 - 1680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1661 | 2026-05-11 |
BIDCell: Biologically-informed self-supervised learning for segmentation of subcellular spatial transcriptomics data
2024-01-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44560-w
PMID:38218939
|
研究论文 | 提出BIDCell框架，利用自监督深度学习结合细胞形态和基因表达数据，实现亚细胞空间转录组数据的细胞分割 | 引入生物信息指导的损失函数，融合单细胞转录组和细胞形态信息，实现高精度细胞分割，避免碎片化或过大细胞导致的污染表达 | 未提及具体限制，但可能依赖高质量参考数据且对新型组织类型泛化能力未知 | 开发改进的细胞分割方法，提升亚细胞空间转录组数据中细胞识别的准确性和基因分配精度 | 亚细胞空间转录组数据中的细胞 | 数字病理学 | NA | 亚细胞成像转录组学、单细胞转录组学 | 自监督深度学习框架 | 空间基因表达数据、细胞形态图像 | 多种组织类型和技术平台的数据集 | NA | 空间转录组学、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1662 | 2026-05-11 |
Integrated epigenetic and transcriptional single-cell analysis of t(11;14) multiple myeloma and its BCL2 dependency
2024-01-04, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023020276
PMID:37729611
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研究论文 | 整合单细胞ATAC-seq和RNA-seq分析t(11;14)多发性骨髓瘤及其BCL2依赖性 | 首次在原发性多发性骨髓瘤细胞中整合单细胞ATAC-seq和单细胞RNA-seq分析，深入解析t(11;14)多发性骨髓瘤的表观遗传调控组和转录组及其对venetoclax耐药性的影响 | 未明确说明 | 揭示t(11;14)多发性骨髓瘤对BCL2抑制剂的依赖性及其表观遗传调控机制 | t(11;14)多发性骨髓瘤患者 | 表观遗传学 | 多发性骨髓瘤 | ATAC-seq, RNA-seq | NA | 单细胞测序数据 | 原发性MM样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1663 | 2026-05-11 |
Analysis of Single-Cell RNA-seq Data
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2986-4_6
PMID:36929075
|
综述 | 描述了单细胞RNA测序数据分析的标准工作流程和相关工具，并提供使用建议 | NA | NA | 介绍单细胞RNA测序数据分析的标准工作流程和常用方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1664 | 2026-05-11 |
Single-cell RNA-sequencing analyses identify heterogeneity of CD8+ T cell subpopulations and novel therapy targets in melanoma
2021-Mar-26, Molecular therapy oncolytics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.omto.2020.12.003
PMID:33575475
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析黑色素瘤中CD8+ T细胞亚群的异质性，并识别潜在治疗靶点 | 首次在黑色素瘤中系统描述了7个CD8+ T细胞亚群的异质性，并发现耗竭性CD8+ T细胞亚群2中的三个过表达基因（、、）可作为新型治疗靶点 | 研究基于已发表数据，未涉及实验验证；样本量可能有限；靶点的临床前验证尚未进行 | 探索黑色素瘤中CD8+ T细胞亚群的异质性及其对预后和免疫治疗的影响 | 黑色素瘤样本中的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1665 | 2026-05-11 |
Single-cell RNA-seq dissects the intratumoral heterogeneity of triple-negative breast cancer based on gene regulatory networks
2021-Mar-05, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2020.12.018
PMID:33575114
|
研究论文 | 基于单细胞RNA测序数据构建基因调控网络，解析三阴性乳腺癌的瘤内异质性 | 通过整合基因共表达和转录因子结合基序富集分析，为每个亚型构建基因调控网络，并基于中心性指标识别关键基因 | 未提及样本量大小及其他潜在局限性 | 利用单细胞RNA测序数据构建基因调控网络，以解析三阴性乳腺癌的瘤内异质性并识别关键基因 | 三阴性乳腺癌患者的恶性细胞亚型 | 机器学习 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | PAM50分型模型 | 单细胞转录组数据 | 未提供具体样本量 | 双歧杆菌 | 单细胞RNA测序 | 双歧杆菌 | 双歧杆菌 |
| 1666 | 2026-05-11 |
Systemic transcriptome comparison between early- And late-onset pre-eclampsia shows distinct pathology and novel biomarkers
2021-Feb, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.12968
PMID:33332660
|
研究论文 | 比较早发型和晚发型子痫前期的全身转录组，揭示其病理差异并发现新型生物标志物 | 首次整合胎盘和外周血转录组与母胎界面单细胞转录组，系统比较早发型和晚发型子痫前期的病理差异，并发现各自特异的新型生物标志物 | 需要更大样本量验证新标志物的临床适用性，且单细胞数据整合分析的深度有限 | 阐明早发型和晚发型子痫前期的病理差异并发现新型诊断生物标志物 | 子痫前期患者（早发型和晚发型）的胎盘和外周血样本 | 数字病理学 | 子痫前期 | 转录组测序、单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据、单细胞转录组数据 | 包含早发型和晚发型子痫前期患者及对照组的胎盘和外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 整合了母胎界面的单细胞转录组数据 |
| 1667 | 2026-05-11 |
Single-cell RNA sequencing reveals heterogeneity and differential expression of decidual tissues during the peripartum period
2021-Feb, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.12967
PMID:33300223
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析围产期蜕膜组织的异质性和差异表达基因 | 首次在单细胞分辨率下揭示围产期蜕膜中多种细胞亚型的动态变化及其功能，包括蜕膜基质细胞、绒毛外滋养细胞和T细胞的激活状态 | 未提及具体局限性 | 研究围产期蜕膜组织的细胞异质性和转录组变化，以理解其在分娩启动中的作用 | 分娩前后的蜕膜细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 29,231个蜕膜细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1668 | 2026-05-11 |
TransSynW: A single-cell RNA-sequencing based web application to guide cell conversion experiments
2021-02, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/sctm.20-0227
PMID:33125830
|
研究论文 | TransSynW是一个基于单细胞RNA测序数据的网络应用程序，用于指导细胞转化实验 | 首次开发基于单细胞RNA测序数据的网络应用来预测细胞转化转录因子，并优先识别先驱因子以促进染色质开放 | 需进一步验证预测结果的实验可行性，且可能受限于单细胞数据的质量和细胞类型的代表性 | 开发计算工具预测细胞转化所需的转录因子，推动干细胞研究和再生医学中的细胞疗法 | 用户指定的细胞群体及其转化过程中涉及的转录因子 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1669 | 2026-05-11 |
Cell-Type-Specific Immune Dysregulation in Severely Ill COVID-19 Patients
2021-01-05, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108590
PMID:33357411
|
研究论文 | 使用单细胞RNA测序分析重症COVID-19患者外周血单核细胞的免疫失调特征 | 揭示了ARDS患者单核细胞中抗原呈递和干扰素反应缺陷，而淋巴细胞中干扰素信号反应增强，以及细胞毒性活性和B细胞激活抑制的免疫失衡状态 | NA | 探究重症COVID-19患者的细胞类型特异性免疫失调机制 | 健康志愿者、中度COVID-19患者、急性呼吸窘迫综合征患者以及从ARDS恢复的患者的外周血单核细胞 | 单细胞转录组学 | COVID-19, 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3名健康人、5名中度患者、6名ARDS患者、6名恢复期患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1670 | 2026-05-11 |
Longitudinal Multi-omics Analyses Identify Responses of Megakaryocytes, Erythroid Cells, and Plasmablasts as Hallmarks of Severe COVID-19
2020-12-15, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.11.017
PMID:33296687
|
研究论文 | 通过对14名患者的多时间点样本进行纵向多组学分析，鉴定了严重COVID-19中巨核细胞、红细胞和浆母细胞的反应特征 | 首次通过纵向多组学方法揭示严重COVID-19中巨核细胞、红细胞和浆母细胞的动态变化及其与疾病预后的关联 | 样本量较小（14名患者），可能限制结果的普适性；主要基于外周血分析，未涉及组织水平的验证 | 理解严重COVID-19疾病轨迹相关的细胞特征，为开发生物标志物和靶向治疗提供依据 | COVID-19患者的外周血样本，包括浆母细胞、巨核细胞和红细胞 | 机器学习 | COVID-19 | RNA-seq, 甲基化测序, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据, DNA甲基化组数据, 单细胞转录组数据 | 14名患者，共采集多达5个时间点的外周血样本，包括超过358,000个单细胞 | Illumina | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 批量ATAC-seq | Illumina NovaSeq | Illumina NovaSeq用于批量转录组和甲基化组测序，单细胞转录组测序采用10x Chromium平台 |
| 1671 | 2026-05-10 |
Identification of circadian rhythm-related biomarkers and development of diagnostic models for Crohn's disease using machine learning algorithms
2026-May, Computer methods in biomechanics and biomedical engineering
IF:1.7Q3
DOI:10.1080/10255842.2025.2453922
PMID:39836385
|
研究论文 | 利用机器学习算法识别克罗恩病中与昼夜节律相关的生物标志物并构建诊断模型 | 首次将昼夜节律相关基因与克罗恩病诊断模型结合，利用单细胞测序验证基因表达谱 | 未明确指出样本量和外部验证的局限性 | 识别克罗恩病中与昼夜节律相关的生物标志物并开发诊断模型 | 克罗恩病患者与对照组的基因表达数据 | 机器学习 | 克罗恩病 | 基因表达芯片、单细胞测序 | 机器学习算法（具体类型未明确） | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 未明确说明 | NA | NA | NA | NA |
| 1672 | 2026-05-10 |
The construction of a breast cancer prognostic model by combining genes related to hypoxia and endoplasmic reticulum stress
2026-May, Computer methods in biomechanics and biomedical engineering
IF:1.7Q3
DOI:10.1080/10255842.2025.2453941
PMID:39868728
|
研究论文 | 结合缺氧和内质网应激相关基因构建乳腺癌预后模型 | 首次将缺氧和内质网应激相关基因结合构建乳腺癌预后模型，并分析了免疫浸润和药物敏感性 | NA | 利用缺氧和内质网应激相关基因预测乳腺癌患者预后 | 乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞测序 | Cox回归, Lasso回归 | 基因表达数据, 临床数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1673 | 2026-05-10 |
GZMK+CD8+ T cells target a specific acinar cell type in Sjögren's disease
2026-May, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.08.014
PMID:41162286
|
研究论文 | 利用单细胞和空间转录组学及空间免疫表型分析，揭示干燥综合征中GZMK+CD8+ T细胞靶向特定腺泡细胞类型及其致病机制 | 首次发现PRR4+CST3+WFDC2-浆黏液性腺泡细胞在干燥综合征中选择性丢失，并揭示了GZMK+CD8+ T细胞通过亚胞溶解效应机制损害线粒体完整性和激活先天免疫信号 | 研究仅限于唾液腺组织，可能不适用于其他外分泌腺体；体外实验可能无法完全反映体内复杂微环境 | 探究干燥综合征中唾液腺内不同细胞类型的相互作用及其在病理过程中的角色 | 人类小唾液腺组织样本，包括干燥综合征患者和非患者 | 数字病理学 | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据 | 干燥综合征患者和对照组的唾液腺样本（具体数量未在摘要中明确） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium,10x Visium | 10x Chromium用于单细胞测序，10x Visium用于空间转录组学分析 |
| 1674 | 2026-05-10 |
The transcriptome of CD14+CD163-HLA-DRlow monocytes predicts mortality in idiopathic pulmonary fibrosis
2026-May, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.00804-2025
PMID:41360505
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析CD14+CD163-HLA-DRlow单核细胞的转录组，预测特发性肺纤维化患者的死亡率 | 首次发现CD14+CD163-HLA-DRlow单核细胞的转录组特征可预测特发性肺纤维化患者的死亡风险，并识别出潜在的药物靶点 | 研究基于样本量有限（n=1054），且未在更大规模独立队列中验证；基因评分与功能的因果关系需进一步实验验证 | 探究免疫细胞特异性转录组特征与特发性肺纤维化死亡率之间的关联 | 特发性肺纤维化患者、健康对照及其他肺部疾病患者 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、细胞反卷积分析 | LASSO回归 | 单细胞转录组数据、临床随访数据 | 1054例样本（特发性肺纤维化555例，其他499例） | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | 未明确提及，可能基于10x Genomics平台，但文中仅描述scRNA-seq |
| 1675 | 2026-05-10 |
Agonistic GITR treatment enhances antitumor immune responses and suppresses tumor progression in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-May, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-026-02347-y
PMID:41620983
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研究论文 | 通过GITR激动剂治疗增强胰腺导管腺癌的抗肿瘤免疫反应并抑制肿瘤进展 | 首次在胰腺导管腺癌中证实GITR激活可减少调节性T细胞并增加细胞毒性效应细胞，结合常规化疗可能改善患者预后 | 主要基于小鼠模型和有限的人类样本，临床转化需进一步验证 | 探索GITR作为胰腺导管腺癌免疫治疗靶点的潜力及其机制 | 胰腺导管腺癌细胞、肿瘤微环境中的淋巴细胞 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、免疫荧光 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 小鼠Pan02模型及人类手术切除样本（包括未治疗和新辅助化疗患者） | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'测序，10x Visium空间转录组学 |
| 1676 | 2026-05-10 |
Heterogeneous responses of IM19 anti-CD19 CAR T-cell therapy in refractory systemic lupus erythematosus: an open-label pilot study and a mini-review
2026-May, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.12.014
PMID:41644365
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研究论文 | 评估IM19抗CD19 CAR T细胞治疗难治性系统性红斑狼疮的异质性反应，并包含一个小型综述 | 首次在难治性系统性红斑狼疮患者中评估自体抗CD19 CAR T细胞（IM19）的疗效和安全性，并结合重复肾活检和单细胞RNA测序分析肾反应异质性 | 样本量小（仅6例），为开放标签单臂试验，缺乏对照组，且随访时间有限 | 评估IM19 CAR T细胞治疗在难治性系统性红斑狼疮（特别是狼疮肾炎）中的疗效和安全性 | 难治性系统性红斑狼疮伴肾受累患者 | 机器学习 | 系统性红斑狼疮 | CAR T细胞疗法，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6例患者 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序（外周血单个核细胞） |
| 1677 | 2026-05-10 |
Multi-Scale Mapping of Gene Expression from Whole-slide Images for Identifying Phenotype-Associated Subpopulations
2026-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202521151
PMID:41736695
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研究论文 | 提出BiSCALE框架，从全切片图像预测组织和近细胞水平的基因表达，并关联临床表型 | 首次实现从全切片图像到组织和近细胞水平的双重尺度基因表达预测，结合Vision-Mamba融合模块和两阶段训练策略，解决了尺度和分布差异 | 仅基于三种癌症类型训练和验证，泛化性需进一步验证；近细胞分辨率仍受限于空间转录组数据质量 | 开发一种经济高效的方法，从常规病理切片多尺度预测基因表达，识别表型相关亚群 | 肿瘤组织和微环境中的细胞亚群 | 数字病理学 | 癌症（三种类型） | NA | Vision-Mamba融合模块 | 图像（全切片图像） | 2109个批量肿瘤样本和141,000个空间转录组斑点 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1678 | 2026-05-10 |
Single-cell transcriptomics unveils the immunologic landscape of anti-PD-1-associated indirect drug-induced liver injury
2026-May, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-026-02370-z
PMID:41739156
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示抗PD-1相关间接药物性肝损伤的免疫学机制 | 首次构建了荷瘤小鼠模型中抗PD-1诱导肝损伤的肝脏微环境单细胞图谱，揭示了代谢重编程与促纤维化表型的伴随变化，并发现NETosis激活在肝损伤进展中的关键作用 | 主要在动物模型中验证，临床患者标本用于辅助验证，需要更多人类队列研究来确认发现 | 探索抗PD-1相关肝损伤的病理机制，特别是免疫细胞相互作用和分子通路 | Lewis肺腺癌小鼠模型（C57BL/6J小鼠）及患者肝组织标本 | 机器学习 | 肺癌 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型（数量未明确说明）及患者标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1679 | 2026-05-10 |
Fibroblast pentose phosphate pathway activation upon decreased circPLCE1 exacerbates intestinal fibrosis in Crohn's disease
2026-Apr-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-336415
PMID:41390174
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研究论文 | 该研究揭示了克罗恩病肠道纤维化中成纤维细胞戊糖磷酸途径的激活机制，并发现circPLCE1下调通过XYLB/Xu5P轴加剧纤维化 | 首次多层整合代谢组、单细胞RNA测序和空间转录组分析，发现circPLCE1/XYLB/Xu5P轴调控成纤维细胞戊糖磷酸途径在肠道纤维化中的作用 | 未提及明显局限性，但可能包括动物模型与人类疾病的差异及机制验证的局限性 | 探索克罗恩病肠道纤维化过程中成纤维细胞的代谢重编程及其上游调控因子 | 克罗恩病患者的狭窄与非狭窄肠段组织、原代人肠道肌成纤维细胞、葡聚糖硫酸钠诱导的肠道纤维化小鼠模型 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 代谢组学, 单细胞RNA测序, 空间转录组, circRNA转录组, 代谢流分析, 海马分析, RNA下拉实验 | NA | 转录组数据, 代谢组数据, 空间转录组数据 | 来自克罗恩病患者狭窄和非狭窄肠段的配对黏膜和黏膜下组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium用于单细胞RNA测序，10x Visium用于空间转录组分析 |
| 1680 | 2026-05-10 |
Downregulation of SLC12A5 in glioblastoma multiforme: a novel prognostic biomarker associated with brain edema and radiomic features
2026-Apr, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05012-6
PMID:41579171
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学、影像组学和实验验证，发现SLC12A5在胶质母细胞瘤中下调，可作为新的预后生物标志物，并与脑水肿和影像组学特征相关 | 首次发现SLC12A5在胶质母细胞瘤中特异性下调，揭示了其与脑水肿体积的负相关性，并通过影像组学分析建立了分子标志物与MRI特征的非侵入性预后评估联系 | 未提供明确的局限性说明 | 鉴定胶质母细胞瘤的新型预后生物标志物 | 胶质母细胞瘤患者 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | RNA测序, 单细胞测序, 蛋白质印迹, 免疫组织化学, 影像组学 | NA | 基因表达数据, MRI图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |