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当前共找到 37547 篇文献，本页显示第 1661 - 1680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1661 | 2026-03-01 |
Integrated bulk and single-cell RNA sequencing reveals peripheral immune dysregulation in adolescent major depressive disorder
2026-Feb-23, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2026.106512
PMID:41740874
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研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序，揭示了青少年重度抑郁症患者外周免疫失调的分子特征 | 首次结合bulk和单细胞RNA测序技术，系统比较青少年与成人MDD的免疫相关基因表达差异，并评估抗抑郁药物对免疫失调的影响 | 样本量有限，单细胞测序仅涉及8个样本，且研究为横断面设计，无法确定因果关系 | 表征青少年重度抑郁症外周转录组变化，探索免疫失调机制及潜在治疗靶点 | 青少年重度抑郁症患者和健康对照者的外周血样本 | 生物信息学 | 重度抑郁症 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, EPIC分析, 流式细胞术 | NA | RNA测序数据 | 180名MDD患者和99名健康对照进行bulk RNA测序，其中4名MDD患者和4名健康对照进行单细胞测序 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1662 | 2026-03-01 |
Singe cell RNA sequencing data processing using cloud-based serverless computing
2026-Feb-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.26.650787
PMID:41756869
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研究论文 | 本文提出了一种利用云无服务器计算加速单细胞RNA测序数据处理的新方法 | 创新点在于使用云无服务器计算构建按需“超级计算机”，通过自动配置的计算单元加速计算密集型工作流，无需预先设置服务器 | 未明确说明方法在小规模数据集上的适用性或成本效益的具体量化 | 研究目的是优化单细胞RNA测序数据处理流程，利用云无服务器计算提高计算效率 | 研究对象包括公开可用的外周血单个核细胞数据集和NIH MorPhiC项目生成的人类单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 两个PBMC数据集和一个包含86个细胞系的450 GB人类scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1663 | 2026-03-01 |
The Stochastic System Identification Toolkit (SSIT) to model, fit, predict, and design experiments
2026-Feb-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.20.707039
PMID:41756942
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研究论文 | 本文介绍了随机系统识别工具包（SSIT），这是一个用于建模、拟合、预测和设计实验的快速、灵活的开源软件包 | SSIT整合了多种计算方法（如ODE、SSA、CME截断），并提供了参数拟合、敏感性分析和实验设计功能，支持处理实验噪声和测量误差 | NA | 开发一个工具包，以处理生物数据中的随机性和异质性，用于机制推断和实验设计 | 化学反应模型和实验数据集（如mRNA计数数据和单细胞RNA测序数据） | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，单分子荧光原位杂交 | NA | 计数数据，测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1664 | 2026-03-01 |
Photo-click Decellularized Matrix Hydrogels for Generating Pancreatic Ductal Organoids
2026-Feb-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.16.706185
PMID:41757071
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研究论文 | 本研究探索了使用光点击脱细胞小肠黏膜下层-降冰片烯水凝胶作为Matrigel的替代品，用于生成人诱导多能干细胞来源的胰腺导管类器官 | 开发了可调节硬度的光点击脱细胞基质水凝胶，以替代成分未定义且机械性能弱的肿瘤来源Matrigel，用于生成胰腺导管类器官，并揭示了基质硬度对导管细胞分化的关键影响 | 研究主要关注基质硬度的影响，可能未全面评估其他微环境因素；且实验基于特定水凝胶系统，其普适性需进一步验证 | 开发一种定义明确、机械性能可调的基质材料，用于生成功能性的胰腺导管类器官，以改进疾病建模和药物筛选 | 人诱导多能干细胞分化的胰腺祖细胞及其生成的胰腺导管类器官 | 组织工程与再生医学 | 胰腺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、形态学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1665 | 2026-03-01 |
Mechano-activation of synovial fibroblasts and macrophages during OA progression in the dynamically stiffening synovial microenvironment
2026-Feb-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.16.706240
PMID:41757118
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研究论文 | 本研究探讨了骨关节炎进展中，滑膜微环境力学变化如何通过机械激活滑膜成纤维细胞和巨噬细胞，驱动滑膜病理发展 | 首次结合原子力显微镜量化滑膜微力学与单细胞RNA测序分析，揭示了动态硬化滑膜微环境中机械信号通路和免疫细胞-成纤维细胞交互在OA进展中的核心作用 | 研究仅使用雄性C57BL/6J小鼠模型，未考虑性别差异或人类样本的验证 | 阐明骨关节炎进展中滑膜微环境力学变化对细胞行为的影响及滑膜病理的驱动机制 | 小鼠滑膜组织中的成纤维细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序, RNA荧光原位杂交, 流式细胞术, 原子力显微镜 | NA | 基因表达数据, 空间组织数据, 力学测量数据 | 使用C57BL/6J雄性小鼠，包括DMM手术组、假手术组和未手术对照组，在4周和8周时间点评估 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1666 | 2026-03-01 |
Parameter-free representations outperform single-cell foundation models on downstream benchmarks
2026-Feb-18, ArXiv
PMID:41757283
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研究论文 | 本文探讨了在单细胞RNA测序数据分析中，简单的参数无关表示方法是否能够超越基于深度学习的单细胞基础模型在下游任务中的表现 | 研究发现，通过简单的归一化和线性方法，无需依赖计算密集的深度学习表示，即可在多个基准测试中达到或接近最先进的性能，特别是在涉及训练数据中未见的新细胞类型和生物体的分布外任务上超越了基础模型 | NA | 评估和比较不同表示方法在单细胞RNA测序数据下游任务中的性能 | 单细胞RNA测序数据及其在细胞类型分类、疾病状态预测和跨物种学习等任务中的应用 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 线性方法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1667 | 2026-03-01 |
Wnt5a Regulates Embryonic Müllerian Duct Development Through the Non-Canonical Wnt PCP Pathway
2026-Feb-17, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15040359
PMID:41744802
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了WNT5A通过非经典Wnt PCP通路调控胚胎期苗勒氏管发育的分子机制 | 首次在单细胞水平上解析了WNT5A缺失导致苗勒氏管发育异常的细胞类型特异性变化，并发现前段子宫角向输卵管转化的新现象 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床样本验证不足；单细胞测序样本量有限 | 阐明WNT5A在胚胎期苗勒氏管发育中的具体作用机制 | 小鼠胚胎期苗勒氏管组织 | 发育生物学 | 生殖系统发育异常 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 野生型与Wnt5a敲除小鼠胚胎苗勒氏管组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1668 | 2026-03-01 |
Loss of the Coronary Artery Disease Risk Gene Leiomodin1 in Vascular Smooth Muscle Cells Triggers Rapid Onset Coronary Atherosclerosis
2026-Feb-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.15.705944
PMID:41757042
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研究论文 | 本研究揭示了冠状动脉疾病风险基因Leiomodin1在血管平滑肌细胞中的缺失会迅速引发冠状动脉粥样硬化 | 首次发现VSMC特异性缺失Lmod1可在促动脉粥样硬化条件下迅速引发弥漫性和闭塞性冠状动脉粥样硬化，并证明该表型独立于LMOD1的肌动蛋白成核功能，且与Thbs1介导的脂质摄取有关 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性仍需进一步验证；未全面探索其他血管床为何不受影响的具体机制 | 探究冠状动脉疾病风险基因Leiomodin1在血管平滑肌细胞中对冠状动脉粥样硬化发生的作用机制 | Leiomodin1基因敲除小鼠模型、小鼠主动脉平滑肌细胞、人类冠状动脉样本 | 心血管疾病研究 | 冠状动脉疾病 | CRISPR基因编辑、单细胞RNA测序、空间代谢组学/转录组学、免疫金谱系追踪、共聚焦免疫荧光显微镜 | 基因敲除小鼠模型 | 组织病理学图像、单细胞基因表达数据、空间组学数据、免疫荧光数据 | 多种Lmod1突变小鼠模型，包括对照组(Lmod1 WT)和VSMC特异性敲除小鼠(Lmod1 SMKO) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 1669 | 2026-03-01 |
EZH2 Inhibition Restores Tumor Suppressor SFRP1 Activity by Reprogramming Extrachromosomal Circular DNA Dynamics in Ovarian Cancer
2026-Feb-15, Biology
DOI:10.3390/biology15040340
PMID:41744650
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研究论文 | 本研究揭示了EZH2抑制剂Tazemetostat通过重编程卵巢癌中的染色体外环状DNA动态，从而恢复肿瘤抑制因子SFRP1活性的新机制 | 首次建立了EZH2抑制与eccDNA动态重编程之间的关联，并发现了SFRP1作为关键效应因子；通过整合多组学与空间单细胞转录组学，揭示了一个新的表观遗传-eccDNA轴 | 研究主要基于体外实验和组学数据分析，体内功能验证和临床相关性有待进一步探索；效应基因的具体作用机制尚未完全阐明 | 探究EZH2抑制剂如何通过调控eccDNA动态影响卵巢癌的基因表达和肿瘤抑制功能 | 卵巢癌细胞 | 表观遗传学与癌症生物学 | 卵巢癌 | Circle-seq, RNA测序, 空间单细胞转录组学, 多组学整合分析 | NA | 基因组测序数据, 转录组数据, 空间表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1670 | 2026-03-01 |
Multi-Modal Metabolomics Deciphers Pan-Cancer Metabolic Landscapes and Spatial-Niche-Specific Alternations
2026-Feb-13, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo16020129
PMID:41745610
|
研究论文 | 本研究通过整合批量代谢组学和空间代谢组学，解析了泛癌症代谢景观及空间生态位特异性变化 | 首次在泛癌症层面结合批量与空间代谢组学，揭示代谢重编程的跨癌种共性和空间异质性，并识别出在多个分析层面一致改变的代谢物 | NA | 系统理解癌症代谢重编程的跨癌种共性和肿瘤微环境内的空间异质性 | 多种癌症类型的肿瘤组织和正常组织 | 代谢组学 | 泛癌症 | 批量代谢组学, 空间代谢组学, 空间转录组学 | NA | 代谢组数据, 转录组数据 | NA | NA | 批量代谢组学, 空间代谢组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1671 | 2026-02-10 |
CiCLoDS: Joint cell clustering and gene selection for single-cell spatial transcriptomics
2026-Feb-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-39168-1
PMID:41656346
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1672 | 2026-03-01 |
Spatial transcriptomics reveals coordinated endothelial and epithelial activator protein-1 activation in chronic lung allograft dysfunction
2026-Feb-07, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2026.01.028
PMID:41663041
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析，揭示了慢性肺移植功能障碍中内皮和上皮细胞协调性激活蛋白-1激活的机制 | 首次在CLAD中利用空间转录组学技术，同时揭示了上皮和内皮细胞中AP-1靶基因的协同激活及其在促炎、促纤维化基因网络中的枢纽作用 | 研究样本量有限，且为观察性研究，需要进一步的功能实验验证机制 | 阐明慢性肺移植功能障碍的基因表达特征和发病机制 | 人类肺组织样本（来自CLAD患者、非CLAD移植受者和非移植对照） | 空间转录组学 | 肺移植功能障碍 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 人类肺组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1673 | 2026-03-01 |
Advances in Spatial Transcriptomics for Infectious Disease Research: Insight for Vaccine Development
2026-Feb-07, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines14020158
PMID:41746079
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术在传染病研究中的进展及其对疫苗开发的启示 | 系统总结了空间转录组学如何通过保留组织架构来揭示宿主-病原体相互作用，并比较了测序与成像两类平台的优势，强调了其在识别组织特异性免疫程序和疫苗设计中的应用潜力 | 面临RNA质量限制、分辨率与转录本广度之间的权衡、高成本以及分析复杂性等约束 | 探讨空间转录组学在传染病研究中的应用，以促进疫苗开发 | 传染病（包括病毒、细菌和寄生虫感染）中的宿主组织与病原体相互作用 | 空间转录组学 | 传染病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据与组织图像 | NA | 10x Genomics, NanoString, BGI, Vizgen, NanoString, Vizgen | 空间转录组学 | Visium, GeoMx, Stereo-seq, Xenium, CosMx, MERFISH | 测序方法（如Visium、GeoMx、Stereo-seq）提供全转录组覆盖但分辨率适中，成像平台（如Xenium、CosMx、MERFISH）提供单细胞或亚细胞细节但基因面板靶向 |
| 1674 | 2026-03-01 |
Advances in Single-Cell Transcriptomics for Livestock Health
2026-Feb-06, Veterinary sciences
IF:2.0Q2
DOI:10.3390/vetsci13020161
PMID:41745955
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在解析家畜物种细胞异质性、免疫系统复杂性及宿主-病原体相互作用方面的最新进展与应用 | 系统总结了单细胞转录组学在家畜健康研究中的关键应用，包括构建大规模多组织细胞图谱（如牛细胞图谱）、揭示物种特异性免疫特征（如反刍动物中γδ T细胞的重要作用），并探讨了整合空间转录组学与多组学方法的未来方向 | 面临基因组注释不完整、组织处理限制、跨平台数据整合等技术与分析挑战 | 提升家畜疾病抵抗力、疫苗效力及转化研究，为家畜健康提供新的研究框架 | 牛、猪、家禽及小型反刍动物 | 单细胞组学 | 家畜疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞免疫受体测序、空间转录组学、多组学方法 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1675 | 2026-03-01 |
Tumour-brain crosstalk restrains cancer immunity via a sensory-sympathetic axis
2026-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-10028-8
PMID:41639447
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研究论文 | 本研究揭示了肺癌通过迷走感觉神经元与大脑之间的双向通讯，建立免疫抑制微环境，从而促进肿瘤生长的机制 | 首次发现肺癌通过激活迷走感觉神经元传递信号至脑干，驱动交感神经输出增强，进而通过β肾上腺素信号抑制肺泡巨噬细胞的抗肿瘤免疫 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性尚需进一步验证 | 探究肿瘤与大脑之间的通讯机制及其对癌症免疫的影响 | 肺癌小鼠模型、迷走感觉神经元、交感神经系统、肺泡巨噬细胞 | 神经免疫学 | 肺癌 | 单细胞转录组学、神经示踪、组织成像 | 基因工程小鼠模型 | 转录组数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1676 | 2026-03-01 |
A multi-omics study unravels the mechanism of water pollutants in gastric cancer: integrating network toxicology, machine learning, and tumor microenvironment remodeling
2026-Feb, Toxicology research
IF:2.2Q3
DOI:10.1093/toxres/tfag015
PMID:41756097
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研究论文 | 本研究通过整合网络毒理学、机器学习和肿瘤微环境重塑，探讨了水污染物在胃癌中的多靶点作用机制 | 首次将网络毒理学、机器学习与单细胞测序相结合，系统解析水污染物通过关键靶点（如预测的基因）影响胃癌发生及肿瘤微环境重塑的机制 | 研究主要基于计算和生物信息学方法，缺乏实验验证；污染物与靶点的相互作用仅通过分子对接模拟，需进一步体内外实验确认 | 探究水污染物促进胃癌发生的多靶点分子机制，为环境风险评估提供假设框架 | 美国环保署列出的69种水污染物及其在胃癌中的潜在作用靶点 | 机器学习 | 胃癌 | 网络毒理学、机器学习算法、分子对接、单细胞测序 | 三种机器学习算法（未具体说明类型） | 基因表达数据（GSE54129数据集）、污染物靶点预测数据 | 基于公共数据集GSE54129，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1677 | 2026-03-01 |
Integrative Multi-Omics and Machine Learning Identify ID1 as a Candidate Gene Associated with Abdominal Aortic Aneurysm
2026-Jan-30, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb48020156
PMID:41751419
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研究论文 | 本研究通过整合多组学与机器学习方法，识别出ID1作为与腹主动脉瘤相关的候选基因，并探讨其在血管免疫重塑和细胞外基质通路中的作用 | 首次结合多组学数据（包括两个批量转录组数据集和单细胞RNA测序）与三种机器学习算法（LASSO、随机森林和SVM-RFE）系统识别并验证ID1在腹主动脉瘤中的稳定下调及其与免疫细胞浸润的关联 | 研究主要基于公共数据集的分析，缺乏实验验证以确认ID1的功能机制；样本来源和数量可能限制结果的普适性 | 探究腹主动脉瘤的分子机制，特别是ID1基因在疾病发生发展中的作用 | 腹主动脉瘤患者的相关基因表达数据，包括ID1和CYP4B1等候选基因 | 机器学习 | 心血管疾病 | RNA-seq | LASSO, Random Forest, SVM-RFE | 转录组数据 | 涉及两个批量转录组数据集（GSE232911和GSE183464）和一个单细胞RNA测序数据集（GSE226492），具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1678 | 2026-03-01 |
Field-Evolved Resistance to Bt Cry Toxins in Lepidopteran Pests: Insights into Multilayered Regulatory Mechanisms and Next-Generation Management Strategies
2026-Jan-25, Toxins
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/toxins18020060
PMID:41745726
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综述 | 本文综述了鳞翅目害虫对Bt Cry毒素田间进化抗性的多层次调控机制，并探讨了下一代管理策略 | 提出了一个综合统一的机制框架，整合了Bt毒素作用模式、多层抗性调控机制（包括信号转导、免疫逃避、微生物群互作）以及基于CRISPR、AlphaFold3和AI的下一代抗性管理策略 | 这是一篇综述文章，主要总结现有研究，未报告新的原始实验数据 | 阐明鳞翅目害虫对Bt Cry毒素田间进化抗性的机制，并提出可持续的管理策略 | 鳞翅目害虫及其对Bt Cry毒素的抗性 | NA | NA | 单细胞转录组学、CRISPR/Cas9基因编辑、噬菌体辅助连续进化(PACE)、AlphaFold3结构预测、AI加速蛋白质设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1679 | 2026-03-01 |
Multimodal single-cell protein and RNA profiling unveils dysregulated immature neutrophil dynamics in gestational diabetes mellitus
2026-Jan-07, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09468-9
PMID:41501166
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研究论文 | 本研究通过多模态单细胞蛋白质和RNA分析，揭示了妊娠期糖尿病中未成熟中性粒细胞动态的失调 | 首次结合InfinityFlow表面标记分析和单细胞RNA测序，在妊娠期糖尿病中识别出低密度未成熟中性粒细胞亚群及其与胰岛素敏感性的关联 | 研究样本量有限，且未深入探讨未成熟中性粒细胞功能机制 | 探究妊娠期糖尿病中中性粒细胞的异质性及其与疾病的关系 | 健康孕妇和妊娠期糖尿病孕妇的外周血中性粒细胞 | 数字病理学 | 妊娠期糖尿病 | InfinityFlow表面标记分析, 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质表达数据, RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1680 | 2026-03-01 |
Extracellular Matrix-Associated Biomarkers for Hepatocellular Carcinoma: Insights From Machine Learning and Single-Cell Analysis
2026, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/6654142
PMID:41755885
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研究论文 | 本研究通过整合组学数据和机器学习，识别了肝细胞癌中与细胞外基质相关的关键生物标志物，并利用单细胞RNA测序验证了其表达模式 | 结合系统生物学框架、机器学习与单细胞分析，首次识别出八个上调的ECM相关基因作为诊断生物标志物，并揭示了它们在单细胞水平上的表达特异性 | 研究主要基于公共数据库（如TCGA）的数据，可能需要进一步实验验证这些生物标志物的功能机制和临床适用性 | 识别肝细胞癌中与细胞外基质相关的生物标志物，以改善早期检测、预后评估和治疗靶向 | 肝细胞癌患者的基因表达和调控网络 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 基于TCGA、GSE104310和GSE144269数据集，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |