单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 1661 - 1680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1661 | 2025-10-05 |
A drug response prediction method for single-cell tumors combining attention networks and transfer learning
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1631898
PMID:40917838
|
研究论文 | 提出一种结合注意力网络和迁移学习的单细胞肿瘤药物反应预测方法 | 首次将迁移学习与注意力机制结合用于单细胞药物反应预测，通过预训练和注意力网络提升模型表达能力 | 方法仅在四种单细胞RNA测序数据集上验证，需要更多肿瘤类型和药物验证 | 提高单细胞水平肿瘤药物反应预测准确性，支持个性化癌症治疗 | 小鼠急性髓系白血病细胞和人口腔鳞状细胞癌细胞 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 注意力网络, 迁移学习 | 基因表达数据 | 四种单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1662 | 2025-10-05 |
Integrative scRNA-seq and transcriptomic analysis initially reveals monocyte/macrophage activation drives EV-A71-induced immune dysregulation and neural injury in severe HFMD
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1620633
PMID:40918094
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和转录组分析，揭示单核细胞/巨噬细胞激活驱动EV-A71诱导的免疫失调和重症手足口病神经损伤 | 首次结合单细胞测序和转录组分析系统揭示EV-A71感染中单核细胞/巨噬细胞早期激活机制及其与神经损伤的关联 | 样本量有限，仅比较一名重症患者和一名健康对照，需要更大规模验证 | 阐明EV-A71发展为重症手足口病的免疫机制，特别是巨噬细胞介导的免疫失调作用 | EV-A71病毒感染的单核细胞/巨噬细胞、外周血单个核细胞、神经细胞系SH-SY5Y | 单细胞生物学 | 手足口病 | 单细胞RNA测序, 转录组测序, 生物信息学分析, 细胞共培养 | 细胞轨迹分析, GO注释, KEGG通路分析 | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据, 细胞实验数据 | 一名EV-A71感染重症手足口病患者和一名健康对照的外周血单个核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1663 | 2025-10-05 |
Exploring research trends in cancer immunotherapy via single-cell technologies: a scientometric perspective
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1640224
PMID:40918118
|
综述 | 通过文献计量学方法分析单细胞技术在癌症免疫治疗领域的研究趋势 | 首次从文献计量学角度系统分析单细胞技术在癌症免疫治疗领域的研究现状和发展趋势 | 仅基于Web of Science数据库文献，可能存在收录偏倚 | 探索单细胞技术在癌症免疫治疗领域的研究趋势和热点 | 4856篇相关科学文献 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞测序，空间转录组学 | 文献计量分析 | 文献元数据 | 4856篇文献 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 1664 | 2025-10-05 |
Gzmk+ CD8 T cells in inflammatory diseases
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1661755
PMID:40918115
|
综述 | 本文综述了Gzmk+ CD8 T细胞在炎症性疾病中的调控机制和功能作用 | 首次系统总结Gzmk+ CD8 T细胞这一新发现细胞亚群的非细胞毒性促炎功能 | NA | 阐明Gzmk+ CD8 T细胞在炎症性疾病中的调控机制和功能作用 | Gzmk+ CD8 T细胞 | 免疫学 | 炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1665 | 2025-10-05 |
Spatial transcriptomics uncovers immune-cell plasticity and dedifferentiation signatures in aggressive lung adenocarcinoma subtypes
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1620886
PMID:40918135
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术揭示肺腺癌亚型中免疫细胞可塑性和去分化特征 | 首次在肺腺癌中系统揭示不同组织学亚型的空间细胞组成特征和去分化状态 | 样本来源单一机构，样本量有限，需要更大规模验证 | 解析肺腺癌进展过程中亚型转变的分子特征 | 肺腺癌患者手术切除的肿瘤样本 | 空间转录组学 | 肺腺癌 | 空间转录组学 | 差异基因表达分析、空间配体-受体互作分析、轨迹推断 | 空间转录组数据 | 未明确具体样本数量 | Illumina | 空间转录组学 | Illumina NovaSeq 6000 | Illumina NovaSeq 6000测序系统 |
| 1666 | 2025-10-05 |
Exploring the biological functions and immune regulatory roles of IRAK3, TNFRSF1A, CX3CR1, and JUNB in T2DM combined with MAFLD: integrated bioinformatics and single-cell analysis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1587225
PMID:40918148
|
研究论文 | 本研究通过整合生物信息学和单细胞分析，探索IRAK3、TNFRSF1A、CX3CR1和JUNB在2型糖尿病合并代谢相关脂肪肝病中的生物学功能和免疫调节作用 | 首次通过整合生物信息学分析和单细胞测序技术，系统鉴定并验证了T2DM合并MAFLD的四个自噬相关诊断生物标志物，并深入探索了细胞多样性和细胞通讯机制 | 研究主要基于公共数据库数据和动物实验，需要在人类临床样本中进一步验证 | 识别和验证与T2DM相关MAFLD的自噬相关诊断生物标志物，研究疾病进展中的调控机制 | 2型糖尿病合并代谢相关脂肪肝病的大鼠模型和人类基因表达数据 | 生物信息学 | 2型糖尿病合并代谢相关脂肪肝病 | 单细胞RNA测序, 实时荧光定量PCR, 免疫组织化学, 机器学习 | 机器学习, WGCNA分析 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 四个GEO数据集(GSE15653, GSE89632, GSE24807, GSE23343)和动物实验 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1667 | 2025-10-05 |
Multiomics Integration and Machine Learning Reveal Colony Stimulating Factor 3 Receptor as a Key Gene and Therapeutic Target in Crohn's Disease
2025, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/1619237
PMID:40918404
|
研究论文 | 通过多组学整合和机器学习识别CSF3R作为克罗恩病的关键基因和治疗靶点 | 首次整合多组学数据和三种机器学习算法系统识别CSF3R在克罗恩病中的关键作用，并通过孟德尔随机化分析和实验验证其因果机制 | 样本来源和数量可能有限，需要进一步大样本验证 | 识别克罗恩病的关键分子驱动因子和潜在治疗靶点 | 克罗恩病患者和健康对照的肠道活检组织 | 机器学习 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序, qPCR, 蛋白质印迹, 免疫组织化学, 免疫荧光, 分子对接 | 随机森林, SVM-RFE, LASSO | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 克罗恩病患者和健康对照的肠道活检组织 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 1668 | 2025-10-05 |
Marker Gene-Guided Graph Neural Networks for Enhanced Spatial Transcriptomics Clustering
2025, AI medicine
DOI:10.53941/aim.2025.100001
PMID:40918416
|
研究论文 | 提出一种基于标记基因引导图神经网络的空间转录组学聚类增强方法 | 首次将标记基因信息融入图神经网络框架，通过对比学习和少量标记基因表达标注的微调来增强细胞嵌入学习和聚类效果 | 仅在两套真实数据集上验证，需要依赖标记基因的先验知识 | 提升空间转录组学数据的聚类分析性能 | 空间转录组学数据中的细胞/点 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学技术 | 图神经网络(GNN), 对比学习 | 基因表达数据, 空间位置信息 | 两套真实数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1669 | 2025-10-05 |
Role of Meox1 in promoting lung tumor vascularization and impairing CD8+ T cell mediated immunity
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1645671
PMID:40919158
|
研究论文 | 本研究探讨Meox1转录因子在促进肺肿瘤血管形成和损害CD8+ T细胞介导的免疫中的作用 | 首次系统性地通过scRNA-seq和SCENIC框架揭示Meox1在非小细胞肺癌中的转录调控网络，并证实其双重功能 | 研究主要基于动物模型系统，需要进一步验证在人类临床样本中的适用性 | 探究Meox1转录因子在肺肿瘤血管形成和免疫调节中的功能机制 | 非小细胞肺癌肿瘤组织中的内皮细胞和免疫细胞 | 肿瘤生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, siRNA基因敲除, SCENIC调控网络分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1670 | 2025-10-05 |
Organelle stresses and energetic metabolisms promote endothelial-to-mesenchymal transition and fibrosis via upregulating FOSB and MEOX1 in Alzheimer's disease
2025, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2025.1605012
PMID:40919531
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示了阿尔茨海默病中细胞器应激和能量代谢重编程通过上调FOSB和MEOX1促进内皮-间质转化和纤维化的分子机制 | 首次发现细胞器应激和能量代谢重编程通过FOSB和MEOX1驱动阿尔茨海默病中的内皮-间质转化、细胞死亡和纤维化 | 主要基于小鼠模型研究，人类数据验证相对有限 | 阐明阿尔茨海默病中内皮-间质转化、细胞死亡和纤维化的转录组机制 | 3xTg-AD小鼠模型脑组织和人类AD患者脑组织 | 转录组学 | 阿尔茨海默病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3xTg-AD小鼠模型和人类AD患者脑组织样本 | NA | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1671 | 2025-10-05 |
Inflammation and mechanical force-induced bone remodeling
2024-Dec-30, Periodontology 2000
IF:17.5Q1
DOI:10.1111/prd.12619
PMID:39740162
|
综述 | 本文系统探讨炎症和机械力诱导的骨重塑机制，重点关注牙周炎和正畸牙齿移动中的细胞作用 | 整合分析了炎症和机械力双重作用下骨重塑的细胞机制，并探讨了单细胞RNA测序技术带来的新见解 | NA | 深入理解炎症和机械力诱导的骨重塑机制 | 角质形成细胞、白细胞、基质细胞、骨细胞、成骨细胞和破骨细胞等关键细胞类型 | NA | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1672 | 2025-10-05 |
Cellular cartography reveals mouse prostate organization and determinants of castration resistance
2024-Dec-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.27.630532
PMID:39763898
|
研究论文 | 通过整合单细胞测序和空间转录组技术构建小鼠前列腺细胞图谱，揭示去势抵抗的细胞机制 | 首次系统整合单细胞RNA测序、单细胞多组学和空间转录组技术，揭示小鼠前列腺叶特异性细胞类型及其在去势抵抗中的作用 | 主要基于小鼠模型，人类前列腺数据的验证仍需进一步研究 | 解析前列腺细胞身份和去势反应的转录、表观遗传及空间基础 | 小鼠前列腺组织及人类前列腺癌数据 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,单细胞多组学,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,表观遗传数据,空间转录组数据 | 小鼠前列腺组织及人类前列腺癌荟萃分析数据 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞多组学,空间转录组学 | NA | NA |
| 1673 | 2025-10-05 |
Genetically Engineered Mouse Models for Alzheimer Disease and Frontotemporal Dementia: New Insights from Single-Cell and Spatial Transcriptomics
2024-Dec-19, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.11.006
PMID:39743215
|
综述 | 本文总结了阿尔茨海默病和额颞叶痴呆基因工程小鼠模型的最新研究成果，重点介绍了单细胞和空间转录组学技术带来的新见解 | 整合了单细胞转录组学、多组学和空间转录组学技术对神经退行性疾病小鼠模型的研究成果 | 承认没有任何模型是完美的，存在模型局限性 | 研究神经退行性疾病的病因学和潜在治疗方法 | 基因工程小鼠模型，特别是阿尔茨海默病和额颞叶痴呆模型 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病, 额颞叶痴呆 | 单细胞转录组学, 多组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多组学 | NA | NA |
| 1674 | 2025-10-05 |
Modeling Lewy body disease with SNCA triplication iPSC-derived cortical organoids and identifying therapeutic drugs
2024-09-13, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adk3700
PMID:39259788
|
研究论文 | 利用SNCA基因三倍化iPSC来源的皮质类器官模拟路易体病并筛选治疗药物 | 首次建立人类皮质路易体病模型，通过高通量药物筛选发现四种能抑制α-突触核蛋白聚集的FDA批准药物 | 研究基于基因三倍化特定突变模型，可能无法完全代表散发性路易体病的病理机制 | 阐明α-突触核蛋白在皮质神经元中的病理机制并筛选治疗药物 | 路易体病患者来源的iPSC皮质类器官和兴奋性神经元 | 数字病理学 | 路易体病 | 单细胞RNA测序, 实时震动诱导转化试验 | 皮质类器官模型 | 基因表达数据, 蛋白质聚集数据 | 1280种FDA批准药物筛选 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1675 | 2025-10-05 |
A pheromone receptor in cichlid fish mediates attraction to females but inhibits male parental care
2024-Sep-09, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2024.07.029
PMID:39094572
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和基因编辑技术揭示了慈鲷鱼类中信息素受体Or113a在调控雄性求偶行为和抑制父本育幼行为中的双重功能 | 发现单一信息素受体Or113a既能介导对雌性的吸引又能在演化中获得抑制父本育幼行为的新功能 | 研究仅针对慈鲷鱼类，其他鱼类物种的信息素感知机制仍需进一步探索 | 探究脊椎动物信息素信号演化如何导致新生殖行为策略的产生 | 慈鲷鱼类（特别是单倍色鲷类群）的生殖行为调控机制 | NA | NA | 单细胞转录组学，CRISPR基因编辑 | NA | 基因表达数据，行为观察数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1676 | 2025-10-05 |
Glioblastoma induces the recruitment and differentiation of dendritic-like "hybrid" neutrophils from skull bone marrow
2024-Sep-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.08.008
PMID:39255776
|
研究论文 | 本研究揭示了胶质母细胞瘤通过招募和分化颅骨骨髓中的树突状样“杂交”中性粒细胞来抑制肿瘤生长的机制 | 首次发现颅骨骨髓来源的具有树突状特征的杂交中性粒细胞在胶质母细胞瘤中发挥抗肿瘤作用 | NA | 探究胶质母细胞瘤中肿瘤相关中性粒细胞的来源、分化和功能 | 胶质母细胞瘤患者和小鼠模型中的肿瘤相关中性粒细胞 | NA | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1677 | 2025-10-05 |
Translatome profiling reveals Itih4 as a novel smooth muscle cell-specific gene in atherosclerosis
2024-07-02, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae028
PMID:38289873
|
研究论文 | 本研究通过翻译核糖体亲和纯化测序技术鉴定出Itih4作为动脉粥样硬化中平滑肌细胞特异性表达的新基因 | 开发了SMCTRAP转基因小鼠模型，首次应用TRAP测序技术直接分析组织中的平滑肌细胞特异性基因表达 | 研究样本量较小，仅使用15月龄小鼠的胸主动脉样本 | 研究动脉粥样硬化中血管平滑肌细胞的基因表达特征 | SMCTRAP和SMCTRAP-AS转基因小鼠的胸主动脉样本 | 单细胞组学 | 动脉粥样硬化 | TRAP-seq, 免疫荧光染色, 空间转录组学, 全基因组关联分析 | 转基因小鼠模型 | 测序数据, 图像数据 | 15月龄SMCTRAP和SMCTRAP-AS小鼠的胸主动脉样本 | NA | 翻译核糖体亲和纯化测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1678 | 2025-10-05 |
Serine protease inhibitor, SerpinA3n, regulates cardiac remodelling after myocardial infarction
2024-07-02, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae075
PMID:38666458
|
研究论文 | 本研究通过基因敲除小鼠模型揭示了丝氨酸蛋白酶抑制剂SerpinA3n在心肌梗死后心脏重塑中的关键调控作用 | 首次发现SerpinA3n通过调节基质功能和蛋白酶活性影响心肌梗死后心脏重塑过程 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类临床样本中验证 | 探究丝氨酸蛋白酶抑制剂在心肌梗死后瘢痕形成中的作用机制 | SerpinA3n条件性基因敲除小鼠模型 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、蛋白质组学、组织学分析 | 基因敲除动物模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、组织图像 | 基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq、蛋白质组分析 | NA | NA |
| 1679 | 2025-10-05 |
Small nucleolar RNA host gene 18 controls vascular smooth muscle cell contractile phenotype and neointimal hyperplasia
2024-05-29, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae055
PMID:38498586
|
研究论文 | 本研究揭示了长链非编码RNA SNHG18通过调控miR-22-3p生物合成来维持血管平滑肌细胞收缩表型并抑制损伤诱导的新内膜增生 | 首次发现SNHG18在血管疾病中的功能作用，揭示了其通过竞争性结合ADAR2促进miR-22-3p生成的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验，人类样本验证相对有限 | 探索SNHG18在血管平滑肌细胞表型调控和血管损伤修复中的作用机制 | 血管平滑肌细胞、小鼠损伤血管模型、人类动脉样本 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、转录组分析、基因功能增益/缺失研究 | NA | 基因表达数据、测序数据 | 小鼠和人类动脉样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1680 | 2025-10-05 |
Interleukin-1 receptor accessory protein blockade limits the development of atherosclerosis and reduces plaque inflammation
2024-05-07, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae046
PMID:38563353
|
研究论文 | 研究通过新型抗IL1RAP阻断抗体探究其在动脉粥样硬化中的作用机制 | 首次使用非消耗性IL1RAP阻断抗体研究动脉粥样硬化，发现其能减少斑块大小和炎症细胞积累 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床应用效果需进一步验证 | 探究IL1RAP在动脉粥样硬化发展中的作用及其治疗潜力 | 载脂蛋白E缺陷小鼠和人类动脉粥样硬化斑块样本 | 心血管疾病研究 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，组织学分析，体外细胞实验 | 动物疾病模型 | 基因表达数据，细胞计数数据，组织图像数据 | 未明确具体样本数量，使用Apoe-/-小鼠模型和人类斑块样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |