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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 1661 - 1680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1661 | 2025-10-05 |
Long-read RNA sequencing of transposable elements from single cells using CELLO-seq
2025-Jul-16, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01203-2
PMID:40670609
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研究论文 | 开发了一种名为CELLO-seq的单细胞长读长RNA测序方案，用于准确定位转座元件的表达 | 通过整合50核苷酸长UMI和高PCR重复数实现长读长的错误校正，能够将表达数据高保真地映射到高度序列相似的年轻转座元件 | 需要用户具备分子生物学和转录组分析经验 | 开发能够准确定位转座元件表达的单细胞测序方法 | 哺乳动物转座元件 | 单细胞测序 | NA | 长读长RNA测序, 单细胞测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | CELLO-seq（单细胞长读长RNA测序） |
| 1662 | 2025-10-05 |
scPlantLLM: A Foundation Model for Exploring Single-cell Expression Atlases in Plants
2025-Jul-11, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf024
PMID:40094454
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研究论文 | 开发了一个名为scPlantLLM的Transformer基础模型，用于探索植物单细胞表达图谱 | 首个专门针对植物单细胞数据的Transformer基础模型，采用序列预训练策略，在零样本学习场景下达到0.91的准确率 | 目前主要应用于拟南芥数据集，在其他植物系统中的泛化能力有待验证 | 解决植物单细胞RNA测序数据中的批次整合、细胞类型注释和基因调控网络推断等挑战 | 植物单细胞表达数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | Transformer | 单细胞基因表达数据 | 数百万个植物单细胞数据点 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1663 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA profiling identifies immune cell population shifts in diabetes associated mucosal inflammation
2025-Jun-27, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2025.06.008
PMID:40582570
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析糖尿病牙周组织，揭示γ T细胞增加、Tregs减少和中性粒细胞极化是糖尿病加重牙周炎的关键机制 | 首次在单细胞水平揭示糖尿病通过改变免疫细胞群促进牙周炎的具体机制，并发现γ T细胞作为驱动因素 | 研究样本量有限，机制验证主要在动物模型中进行 | 探究糖尿病加重牙周炎的免疫学机制 | 糖尿病牙周组织中的免疫细胞 | 单细胞生物学 | 糖尿病并发症 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据 | 糖尿病小鼠和人类糖尿病牙周标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1664 | 2025-10-05 |
A multi-omics resource of B cell activation reveals genetic mechanisms for immune-mediated diseases
2025-Jun-14, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.05.22.25328104
PMID:40475139
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研究论文 | 本研究通过多组学方法分析B细胞在不同激活状态下的基因调控机制，揭示免疫介导疾病的遗传风险机制 | 首次系统性地在26种B细胞激活状态下进行多组学分析，揭示了刺激特异性开放染色质区域与疾病风险的关联 | 研究仅纳入26名健康女性捐赠者，样本多样性有限，且未包括疾病患者样本 | 阐明B细胞激活状态下的基因调控动态及其在免疫介导疾病中的作用机制 | 来自26名健康女性捐赠者的B细胞 | 基因组学 | 自身免疫性疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, CITE-seq | NA | 基因组数据, 转录组数据, 表观基因组数据 | 26名健康女性捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 多组学分析 | NA | NA |
| 1665 | 2025-10-05 |
Spatial and multiomics analysis of human and mouse lung adenocarcinoma precursors reveals TIM-3 as a putative target for precancer interception
2025-Jun-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.04.003
PMID:40345189
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研究论文 | 本研究通过空间免疫分析和多组学技术揭示了肺腺癌前病变中TIM-3作为潜在干预靶点的重要作用 | 首次系统揭示肺腺癌前病变进展过程中免疫微环境的动态变化，并验证TIM-3在癌前阶段的治疗价值 | 样本量相对有限，动物模型数量较少，需要进一步临床验证 | 探究肿瘤微环境如何影响肺腺癌前病变的演化过程 | 人类肺腺癌及前病变组织样本、小鼠肺腺癌模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间免疫分析,单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 114例人类肺腺癌及前病变样本,5个小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1666 | 2025-10-05 |
Enhanced Production of Lipid Mediators in Plasma and Activation of DNA Damage Pathways in PBMCs Are Correlated With the Severity of Ancestral SARS-CoV-2 Infection
2025-May-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202403195R
PMID:40322970
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研究论文 | 本研究通过分析PBMCs和血浆样本，揭示了特定脂质介质与DNA损伤通路激活与SARS-CoV-2感染严重程度的相关性 | 首次将脂质代谢物变化与DNA损伤通路激活联系起来，并发现不同鼻咽细胞类型中类二十烷酸合成基因的特异性上调 | 样本量有限（10名感染者和10名未感染者），且为观察性研究无法确定因果关系 | 探索遗传因素和脂质代谢物与严重SARS-CoV-2感染的关联机制 | COVID-19患者和健康对照者的PBMCs、血浆及鼻咽拭子样本 | 生物信息学 | COVID-19 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 脂肪酸组分析 | NA | 基因表达数据, 脂质代谢数据 | 20名患者（10名感染者+10名未感染者）的PBMCs和血浆，58名参与者的鼻咽拭子 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1667 | 2025-10-05 |
Defining the host dependencies and the transcriptional landscape of RSV infection and bystander activation
2025-Mar-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.26.645108
PMID:40196489
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研究论文 | 通过全基因组CRISPR敲除筛选和单细胞RNA测序技术研究RSV感染的宿主决定因素及宿主反应 | 首次结合全基因组CRISPR筛选和单细胞RNA测序揭示RSV感染细胞与旁观者细胞的转录差异，并比较了29个已发表病毒筛选数据 | 未明确说明样本来源和具体样本量 | 阐明RSV感染的宿主依赖关系和转录特征 | RSV感染细胞和未感染的旁观者细胞 | 基因组学 | 呼吸道感染疾病 | 全基因组CRISPR敲除筛选, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1668 | 2025-10-05 |
Serine supplementation suppresses hypoxia-induced pathological retinal angiogenesis
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.105299
PMID:40303351
|
研究论文 | 本研究探讨丝氨酸补充对缺氧诱导的病理性视网膜血管生成的影响 | 首次揭示丝氨酸通过增强线粒体脂肪酸氧化和氧化磷酸化来抑制病理性视网膜新生血管的机制 | 研究仅限于小鼠氧诱导视网膜病变模型，尚未在人类临床试验中验证 | 研究丝氨酸代谢在抑制缺氧驱动的视网膜新生血管中的作用 | C57BL/6J小鼠氧诱导视网膜病变模型 | 眼科疾病研究 | 视网膜病变 | 代谢组学、脂质组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序、Western blotting | 动物模型 | 多组学数据、组织学图像、分子表达数据 | 未明确样本数量的小鼠视网膜组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1669 | 2025-10-05 |
A drug response prediction method for single-cell tumors combining attention networks and transfer learning
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1631898
PMID:40917838
|
研究论文 | 提出一种结合注意力网络和迁移学习的单细胞肿瘤药物反应预测方法 | 首次将迁移学习与注意力机制结合用于单细胞药物反应预测，通过预训练和注意力网络提升模型表达能力 | 方法仅在四种单细胞RNA测序数据集上验证，需要更多肿瘤类型和药物验证 | 提高单细胞水平肿瘤药物反应预测准确性，支持个性化癌症治疗 | 小鼠急性髓系白血病细胞和人口腔鳞状细胞癌细胞 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 注意力网络, 迁移学习 | 基因表达数据 | 四种单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1670 | 2025-10-05 |
Integrative scRNA-seq and transcriptomic analysis initially reveals monocyte/macrophage activation drives EV-A71-induced immune dysregulation and neural injury in severe HFMD
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1620633
PMID:40918094
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和转录组分析，揭示单核细胞/巨噬细胞激活驱动EV-A71诱导的免疫失调和重症手足口病神经损伤 | 首次结合单细胞测序和转录组分析系统揭示EV-A71感染中单核细胞/巨噬细胞早期激活机制及其与神经损伤的关联 | 样本量有限，仅比较一名重症患者和一名健康对照，需要更大规模验证 | 阐明EV-A71发展为重症手足口病的免疫机制，特别是巨噬细胞介导的免疫失调作用 | EV-A71病毒感染的单核细胞/巨噬细胞、外周血单个核细胞、神经细胞系SH-SY5Y | 单细胞生物学 | 手足口病 | 单细胞RNA测序, 转录组测序, 生物信息学分析, 细胞共培养 | 细胞轨迹分析, GO注释, KEGG通路分析 | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据, 细胞实验数据 | 一名EV-A71感染重症手足口病患者和一名健康对照的外周血单个核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1671 | 2025-10-05 |
Exploring research trends in cancer immunotherapy via single-cell technologies: a scientometric perspective
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1640224
PMID:40918118
|
综述 | 通过文献计量学方法分析单细胞技术在癌症免疫治疗领域的研究趋势 | 首次从文献计量学角度系统分析单细胞技术在癌症免疫治疗领域的研究现状和发展趋势 | 仅基于Web of Science数据库文献，可能存在收录偏倚 | 探索单细胞技术在癌症免疫治疗领域的研究趋势和热点 | 4856篇相关科学文献 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞测序，空间转录组学 | 文献计量分析 | 文献元数据 | 4856篇文献 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 1672 | 2025-10-05 |
Gzmk+ CD8 T cells in inflammatory diseases
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1661755
PMID:40918115
|
综述 | 本文综述了Gzmk+ CD8 T细胞在炎症性疾病中的调控机制和功能作用 | 首次系统总结Gzmk+ CD8 T细胞这一新发现细胞亚群的非细胞毒性促炎功能 | NA | 阐明Gzmk+ CD8 T细胞在炎症性疾病中的调控机制和功能作用 | Gzmk+ CD8 T细胞 | 免疫学 | 炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1673 | 2025-10-05 |
Spatial transcriptomics uncovers immune-cell plasticity and dedifferentiation signatures in aggressive lung adenocarcinoma subtypes
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1620886
PMID:40918135
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术揭示肺腺癌亚型中免疫细胞可塑性和去分化特征 | 首次在肺腺癌中系统揭示不同组织学亚型的空间细胞组成特征和去分化状态 | 样本来源单一机构，样本量有限，需要更大规模验证 | 解析肺腺癌进展过程中亚型转变的分子特征 | 肺腺癌患者手术切除的肿瘤样本 | 空间转录组学 | 肺腺癌 | 空间转录组学 | 差异基因表达分析、空间配体-受体互作分析、轨迹推断 | 空间转录组数据 | 未明确具体样本数量 | Illumina | 空间转录组学 | Illumina NovaSeq 6000 | Illumina NovaSeq 6000测序系统 |
| 1674 | 2025-10-05 |
Exploring the biological functions and immune regulatory roles of IRAK3, TNFRSF1A, CX3CR1, and JUNB in T2DM combined with MAFLD: integrated bioinformatics and single-cell analysis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1587225
PMID:40918148
|
研究论文 | 本研究通过整合生物信息学和单细胞分析，探索IRAK3、TNFRSF1A、CX3CR1和JUNB在2型糖尿病合并代谢相关脂肪肝病中的生物学功能和免疫调节作用 | 首次通过整合生物信息学分析和单细胞测序技术，系统鉴定并验证了T2DM合并MAFLD的四个自噬相关诊断生物标志物，并深入探索了细胞多样性和细胞通讯机制 | 研究主要基于公共数据库数据和动物实验，需要在人类临床样本中进一步验证 | 识别和验证与T2DM相关MAFLD的自噬相关诊断生物标志物，研究疾病进展中的调控机制 | 2型糖尿病合并代谢相关脂肪肝病的大鼠模型和人类基因表达数据 | 生物信息学 | 2型糖尿病合并代谢相关脂肪肝病 | 单细胞RNA测序, 实时荧光定量PCR, 免疫组织化学, 机器学习 | 机器学习, WGCNA分析 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 四个GEO数据集(GSE15653, GSE89632, GSE24807, GSE23343)和动物实验 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1675 | 2025-10-05 |
Multiomics Integration and Machine Learning Reveal Colony Stimulating Factor 3 Receptor as a Key Gene and Therapeutic Target in Crohn's Disease
2025, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/1619237
PMID:40918404
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研究论文 | 通过多组学整合和机器学习识别CSF3R作为克罗恩病的关键基因和治疗靶点 | 首次整合多组学数据和三种机器学习算法系统识别CSF3R在克罗恩病中的关键作用，并通过孟德尔随机化分析和实验验证其因果机制 | 样本来源和数量可能有限，需要进一步大样本验证 | 识别克罗恩病的关键分子驱动因子和潜在治疗靶点 | 克罗恩病患者和健康对照的肠道活检组织 | 机器学习 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序, qPCR, 蛋白质印迹, 免疫组织化学, 免疫荧光, 分子对接 | 随机森林, SVM-RFE, LASSO | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 克罗恩病患者和健康对照的肠道活检组织 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 1676 | 2025-10-05 |
Marker Gene-Guided Graph Neural Networks for Enhanced Spatial Transcriptomics Clustering
2025, AI medicine
DOI:10.53941/aim.2025.100001
PMID:40918416
|
研究论文 | 提出一种基于标记基因引导图神经网络的空间转录组学聚类增强方法 | 首次将标记基因信息融入图神经网络框架，通过对比学习和少量标记基因表达标注的微调来增强细胞嵌入学习和聚类效果 | 仅在两套真实数据集上验证，需要依赖标记基因的先验知识 | 提升空间转录组学数据的聚类分析性能 | 空间转录组学数据中的细胞/点 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学技术 | 图神经网络(GNN), 对比学习 | 基因表达数据, 空间位置信息 | 两套真实数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1677 | 2025-10-05 |
Role of Meox1 in promoting lung tumor vascularization and impairing CD8+ T cell mediated immunity
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1645671
PMID:40919158
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研究论文 | 本研究探讨Meox1转录因子在促进肺肿瘤血管形成和损害CD8+ T细胞介导的免疫中的作用 | 首次系统性地通过scRNA-seq和SCENIC框架揭示Meox1在非小细胞肺癌中的转录调控网络，并证实其双重功能 | 研究主要基于动物模型系统，需要进一步验证在人类临床样本中的适用性 | 探究Meox1转录因子在肺肿瘤血管形成和免疫调节中的功能机制 | 非小细胞肺癌肿瘤组织中的内皮细胞和免疫细胞 | 肿瘤生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, siRNA基因敲除, SCENIC调控网络分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1678 | 2025-10-05 |
Organelle stresses and energetic metabolisms promote endothelial-to-mesenchymal transition and fibrosis via upregulating FOSB and MEOX1 in Alzheimer's disease
2025, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2025.1605012
PMID:40919531
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研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示了阿尔茨海默病中细胞器应激和能量代谢重编程通过上调FOSB和MEOX1促进内皮-间质转化和纤维化的分子机制 | 首次发现细胞器应激和能量代谢重编程通过FOSB和MEOX1驱动阿尔茨海默病中的内皮-间质转化、细胞死亡和纤维化 | 主要基于小鼠模型研究，人类数据验证相对有限 | 阐明阿尔茨海默病中内皮-间质转化、细胞死亡和纤维化的转录组机制 | 3xTg-AD小鼠模型脑组织和人类AD患者脑组织 | 转录组学 | 阿尔茨海默病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3xTg-AD小鼠模型和人类AD患者脑组织样本 | NA | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1679 | 2025-10-05 |
Inflammation and mechanical force-induced bone remodeling
2024-Dec-30, Periodontology 2000
IF:17.5Q1
DOI:10.1111/prd.12619
PMID:39740162
|
综述 | 本文系统探讨炎症和机械力诱导的骨重塑机制，重点关注牙周炎和正畸牙齿移动中的细胞作用 | 整合分析了炎症和机械力双重作用下骨重塑的细胞机制，并探讨了单细胞RNA测序技术带来的新见解 | NA | 深入理解炎症和机械力诱导的骨重塑机制 | 角质形成细胞、白细胞、基质细胞、骨细胞、成骨细胞和破骨细胞等关键细胞类型 | NA | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1680 | 2025-10-05 |
Cellular cartography reveals mouse prostate organization and determinants of castration resistance
2024-Dec-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.27.630532
PMID:39763898
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研究论文 | 通过整合单细胞测序和空间转录组技术构建小鼠前列腺细胞图谱，揭示去势抵抗的细胞机制 | 首次系统整合单细胞RNA测序、单细胞多组学和空间转录组技术，揭示小鼠前列腺叶特异性细胞类型及其在去势抵抗中的作用 | 主要基于小鼠模型，人类前列腺数据的验证仍需进一步研究 | 解析前列腺细胞身份和去势反应的转录、表观遗传及空间基础 | 小鼠前列腺组织及人类前列腺癌数据 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,单细胞多组学,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,表观遗传数据,空间转录组数据 | 小鼠前列腺组织及人类前列腺癌荟萃分析数据 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞多组学,空间转录组学 | NA | NA |