单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28027 篇文献，本页显示第 1661 - 1680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1661 | 2025-05-08 |
Serum and tear autoantibodies from NOD and NOR mice as potential diagnostic indicators of local and systemic inflammation in Sjögren's disease
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1516330
PMID:39936155
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研究论文 | 研究通过分析NOD和NOR小鼠的血清和泪液自身抗体，探讨其在干燥综合征（SjD）相关局部和全身炎症中的潜在诊断价值 | 首次在两种SjD小鼠模型中系统比较了血清和泪液自身抗体的差异，并发现泪液IgA同型自身抗体比IgG更具多样性 | 研究仅使用雄性小鼠模型，可能无法完全反映人类SjD的性别差异特征 | 探索干燥综合征相关自身抗体的诊断标志物 | NOD和NOR小鼠的泪腺组织、血清和泪液样本 | 自身免疫疾病研究 | 干燥综合征 | 免疫荧光、自身抗体微阵列、scRNA-Seq | NOD和NOR小鼠模型 | 蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | 两种SjD小鼠模型（具体数量未明确说明）与健康BALB/c小鼠对照 |
| 1662 | 2025-05-08 |
SMARCB1 loss activates patient-specific distal oncogenic enhancers in malignant rhabdoid tumors
2023-12-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43498-3
PMID:38040699
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研究论文 | 研究SMARCB1基因缺失如何激活恶性横纹肌样瘤(MRT)中患者特异性的远端致癌增强子 | 揭示了SMARCB1缺失导致患者特异性远端增强子与MYC癌基因启动子形成环状结构的机制 | 研究主要基于患者来源的类器官模型，可能无法完全反映体内肿瘤的复杂性 | 阐明SMARCB1缺失在MRT肿瘤发生中的表观遗传重编程机制 | 恶性横纹肌样瘤(MRT)患者来源的类器官组织和患者MRT组织 | 癌症表观遗传学 | 恶性横纹肌样瘤 | 多组学分析、染色体构象捕获实验、单细胞RNA-seq和ATAC-seq | NA | 基因组数据、转录组数据、表观遗传数据 | 患者来源的MRT类器官和患者MRT组织样本 |
| 1663 | 2025-05-08 |
PD-1- CD45RA+ effector-memory CD8 T cells and CXCL10+ macrophages are associated with response to atezolizumab plus bevacizumab in advanced hepatocellular carcinoma
2023-11-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43381-1
PMID:38030622
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析了接受atezo/bev治疗的晚期肝细胞癌患者的肿瘤内和周围免疫环境，揭示了与治疗反应相关的免疫细胞特征 | 首次在单细胞水平上揭示了atezo/bev治疗反应的免疫机制，发现了PD-1-CD45RA+效应记忆CD8 T细胞和CXCL10+巨噬细胞与治疗反应的相关性 | 样本量有限，需要更大规模的验证研究 | 探索atezo/bev在晚期肝细胞癌中产生持久治疗反应的免疫机制 | 晚期肝细胞癌患者 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量（晚期肝细胞癌患者） |
| 1664 | 2025-05-08 |
Integrating spatial and single-cell transcriptomics data using deep generative models with SpatialScope
2023-11-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43629-w
PMID:38030617
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research paper | 提出了一种名为SpatialScope的深度生成模型方法，用于整合空间转录组学和单细胞转录组学数据 | 通过创新的模型和算法设计，SpatialScope能够将基于测序的空间转录组数据提升至单细胞分辨率，并为基于图像的空间转录组数据准确推断全转录组表达水平 | 未明确提及具体局限性 | 解决当前空间转录组技术在细胞分辨率或全转录组分析方面的局限性 | 空间转录组数据和单细胞RNA测序参考数据 | digital pathology | NA | next-generation sequencing, fluorescence in situ hybridization, scRNA-seq | deep generative models | spatial transcriptomics data, single-cell transcriptomics data | NA |
| 1665 | 2025-05-08 |
Cellular underpinnings of the selective vulnerability to tauopathic insults in Alzheimer's disease
2023-Nov-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.06.548027
PMID:38076913
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研究论文 | 本研究探讨了阿尔茨海默病中tau病理选择性易损性的细胞基础 | 首次在全脑水平上揭示了细胞类型组成与tau病理选择性易损性的关系，并发现其与风险基因的贡献不同 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 揭示阿尔茨海默病中tau病理选择性易损性的细胞机制 | 小鼠大脑中的神经元和非神经元细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | Matrix Inversion and Subset Selection (MISS)分析流程 | 基因表达数据 | 12种不同的PS19转基因小鼠模型中的5项研究数据 |
| 1666 | 2025-05-08 |
Impact of Memory T Cells on SARS-COV-2 Vaccine Response in Hematopoietic Stem Cell Transplant
2023-Oct-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.26.564259
PMID:37961434
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研究论文 | 研究造血干细胞移植（HSCT）受者中记忆T细胞对SARS-COV-2疫苗反应的影响 | 揭示了HSCT受者在接种SARS-CoV-2 mRNA疫苗后记忆T细胞群的缺陷及其与T细胞反应缺失的关联 | 样本量较小（42名HSCT受者和5名健康对照） | 评估HSCT受者对SARS-CoV-2 mRNA疫苗的体液和适应性免疫反应 | 造血干细胞移植（HSCT）受者和健康对照 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序、TCR和BCR测序 | NA | 血清、外周血单核细胞 | 42名HSCT受者和5名健康对照 |
| 1667 | 2025-05-08 |
Predicting tumor immune microenvironment and checkpoint therapy response of head & neck cancer patients from blood immune single-cell transcriptomics
2023-Jan-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.17.524455
PMID:36789425
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研究论文 | 研究通过血液免疫单细胞转录组学预测头颈癌患者的肿瘤免疫微环境和检查点治疗反应 | 首次展示通过外周血单核细胞的单细胞RNA测序推断肿瘤免疫状态，并预测免疫治疗反应的能力 | 需要更大规模的测试验证方法的普适性 | 探索通过血液免疫状态预测肿瘤免疫微环境和免疫治疗反应的可行性 | 头颈鳞状细胞癌(HNSCC)患者 | 数字病理学 | 头颈癌 | scRNA-Seq | NA | 单细胞转录组数据 | 两个HNSCC患者数据集 |
| 1668 | 2025-05-07 |
Dual cytokine-engineered macrophages rejuvenate the tumor microenvironment and enhance anti-PD-1 therapy in renal cell carcinoma
2025-May-27, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114725
PMID:40294469
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研究论文 | 开发了一种双细胞因子工程化的巨噬细胞，用于重编程肾细胞癌的肿瘤微环境并增强抗PD-1治疗的响应 | 使用双细胞因子（IL-12和CXCL-9）工程化的巨噬细胞，能够重塑肿瘤微环境并显著增强抗PD-1治疗的效果 | 研究尚未涉及临床转化后的长期效果和安全性评估 | 克服肾细胞癌对检查点抑制剂的耐药性，提高抗PD-1治疗的疗效 | 肾细胞癌（RCC）的肿瘤微环境（TME）和肿瘤相关巨噬细胞（TAMs） | 肿瘤免疫治疗 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | NA |
| 1669 | 2025-05-07 |
Effects of Bacterial Infections under Heatwaves on Chinese Soft-Shelled Turtles and Their Single-Cell Transcriptomic Landscapes
2025-May-06, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.4c09111
PMID:40274607
|
研究论文 | 本研究探讨了细菌感染和热浪双重压力对中华鳖的影响，通过单细胞转录组、行为和生理指标的综合分析 | 首次整合单细胞转录组、行为和生理指标，研究中华鳖在细菌感染和热浪双重压力下的免疫反应 | 研究仅针对中华鳖，结果可能不适用于其他物种 | 探究细菌感染和热浪双重压力对中华鳖的影响及其免疫反应机制 | 中华鳖 | 生态学与免疫学 | 细菌感染 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据、行为数据、生理指标 | 四组中华鳖（基于温度与感染状态分组） |
| 1670 | 2025-05-07 |
Astaxanthin promotes in vitro maturation of mouse oocytes by regulating mitochondrial functions and protein homeostasis
2025-May-05, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf107
PMID:40324205
|
研究论文 | 研究虾青素通过调节线粒体功能和蛋白质稳态促进小鼠卵母细胞体外成熟的作用 | 首次报道虾青素在小鼠卵母细胞体外成熟(IVM)中的作用，并揭示其通过增强线粒体活性和调节蛋白质稳态来提高成熟率 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及其他物种或临床前研究 | 探究虾青素对小鼠卵母细胞体外成熟和早期胚胎发育的影响 | 小鼠卵母细胞 | 生殖生物学 | NA | 单细胞转录组测序、微蛋白质组学、透明带激光打孔辅助体外受精(IVF) | NA | 转录组数据、蛋白质组数据 | 未明确说明具体数量的小鼠卵母细胞 |
| 1671 | 2025-05-07 |
Single-cell RNA Sequencing Identifies Prognostic Biomarkers in Extramedullary Multiple Myeloma
2025-May-05, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序技术识别了髓外多发性骨髓瘤的预后生物标志物 | 利用LASSO方法开发预后特征，并通过外部MM队列验证其效能，揭示了CD4+ T细胞作为与MM进展相关的主要免疫细胞类型 | 研究依赖于公共数据库的转录组数据，可能受限于数据的质量和样本量 | 研究与髓外进展相关的多发性骨髓瘤克隆进化特征，识别新的预后生物标志物 | 多发性骨髓瘤（MM）患者 | digital pathology | multiple myeloma | scRNA-seq, LASSO | risk score model | transcriptomic profiles, scRNA-seq data | 126 DEGs identified, external MM cohorts for validation |
| 1672 | 2025-05-07 |
Identifying the Pattern Characteristics of Anoikis-Related Genes in Keloid
2025-May, Advances in wound care
IF:5.8Q1
DOI:10.1089/wound.2024.0027
PMID:38775414
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research paper | 该研究首次全面分析了anoikis相关基因(ARGs)在瘢痕疙瘩(KD)中的作用，并鉴定了六个核心ARGs | 首次研究ARGs在KD中的潜在价值，并鉴定了六个核心ARGs及其与KD免疫浸润的关联 | 研究仅基于三个KF RNA-seq数据集，样本量有限 | 探究ARGs在KD中的表达特征及其分子机制 | 瘢痕疙瘩(KD)和anoikis相关基因(ARGs) | 生物信息学 | 瘢痕疙瘩 | RNA-seq, 单细胞测序, LASSO-Cox回归分析 | LASSO回归模型 | 基因表达数据 | 三个KF RNA-seq数据集 |
| 1673 | 2025-05-07 |
Exploring genetic and immune cell dynamics in systemic lupus erythematosus patients with Epstein-Barr virus infection via machine learning
2025-May-01, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keae537
PMID:39361430
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research paper | 本研究通过机器学习方法探索系统性红斑狼疮（SLE）患者与EB病毒感染相关的关键基因和免疫细胞动态 | 首次识别出IFI27作为SLE患者EBV感染的关键基因，并揭示了其对CD4 CTL和B细胞亚型的影响 | 研究样本量有限，且仅基于公开数据集分析 | 阐明SLE患者EBV感染的分子机制并寻找潜在诊断和治疗靶点 | 系统性红斑狼疮患者与EB病毒感染 | machine learning | systemic lupus erythematosus | RNA-seq, single-cell RNA sequencing, CIBERSORTx | machine-learning algorithms | gene expression data | 多个GEO数据集（GSE50772、GSE81622、GSE85599、GSE45918） |
| 1674 | 2025-05-07 |
KanCell: dissecting cellular heterogeneity in biological tissues through integrated single-cell and spatial transcriptomics
2025-May, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.11.009
PMID:39577768
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research paper | KanCell是一种基于Kolmogorov-Arnold网络（KAN）的深度学习模型，旨在通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学（ST）数据来增强细胞异质性分析 | KanCell利用KAN有效捕捉非线性关系并优化计算效率，为ST提供了准确高效的工具 | NA | 通过整合单细胞和空间转录组学数据，增强细胞异质性分析，揭示疾病微环境并识别治疗靶点 | 人类淋巴结、心脏、黑色素瘤、乳腺癌、背外侧前额叶皮层和小鼠胚胎大脑 | digital pathology | melanoma, breast cancer | single-cell RNA sequencing, spatial transcriptomics (ST) | Kolmogorov-Arnold networks (KAN) | gene expression data | 模拟和真实数据集，包括STARmap、Slide-seq、Visium和Spatial Transcriptomics技术的数据 |
| 1675 | 2025-05-07 |
Single-cell multiomics reveals a gene regulatory circuit driving leukemia cell differentiation
2025-May, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03309-z
PMID:39984714
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析揭示了ATRA诱导白血病细胞分化的基因调控回路 | 整合单细胞染色质可及性和转录组分析，发现SPI1和CEBPE组成的正反馈基因调控回路驱动白血病细胞分化 | 研究主要基于NB4细胞系，在其他白血病细胞类型中的普适性需要进一步验证 | 探索ATRA诱导急性早幼粒细胞白血病细胞分化的调控机制 | PML/RARα急性早幼粒细胞白血病(APL)细胞系NB4，以及非APL白血病细胞系HL60和K562 | 单细胞多组学 | 急性早幼粒细胞白血病 | 单细胞染色质可及性分析，单细胞转录组分析 | NA | 单细胞多组学数据 | NB4、HL60和K562白血病细胞系 |
| 1676 | 2025-05-07 |
FK506-binding proteins: Emerging target and therapeutic opportunity in multiple tumors
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.141914
PMID:40064252
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review | 本文综述了FK506结合蛋白（FKBP）家族在多种肿瘤中的关键作用及其作为潜在诊断和预后生物标志物的可能性 | 总结了FKBP家族成员在不同类型肿瘤中促进或抑制肿瘤发生的双重功能，并探讨了其作为诊断和预后生物标志物的潜力 | 需要结合单细胞测序技术解决FKBP异构体的空间分布问题，并开展临床验证以促进从分子机制到精准治疗的转化 | 探讨FKBP家族在肿瘤中的作用及其作为诊断和预后生物标志物的潜力 | FK506结合蛋白（FKBP）家族及其在肿瘤中的作用 | 肿瘤生物学 | 多种肿瘤 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 1677 | 2025-05-07 |
Global and Current Research Trends of Single-Cell Sequencing in Cancer: A Bibliometric and Visualization Study
2025-Apr-18, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67880
PMID:40323789
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研究论文 | 本文通过文献计量学方法分析了2010年至2023年间单细胞测序在癌症研究中的全球趋势、合作网络和知识传播 | 首次全面分析了单细胞测序在癌症研究中的全球趋势和合作网络，识别了关键研究领域和未来研究方向 | 研究仅基于Web of Science数据库，可能未涵盖所有相关文献 | 阐明单细胞测序在癌症研究中的发展趋势、合作模式和知识传播 | 单细胞测序在癌症研究中的应用 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 文献数据 | 5,680篇出版物，涉及34,074位作者、3,129个机构和75个国家 |
| 1678 | 2025-05-07 |
Nintedanib improves bleomycin-induced pulmonary fibrosis by inhibiting the Clec7a/SPP1 pathway in interstitial macrophages
2025-Apr, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111635
PMID:39892726
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research paper | 该研究通过单细胞测序和RNA-seq数据分析，揭示了Nintedanib通过抑制间质巨噬细胞中的Clec7a/SPP1通路改善肺纤维化的新机制 | 首次发现Nintedanib通过抑制间质巨噬细胞中的Clec7a/SPP1通路减轻肺纤维化，并鉴定NFκB为该通路的关键转录因子 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类患者中进行验证 | 阐明Nintedanib治疗特发性肺纤维化的分子机制 | 特发性肺纤维化小鼠模型和间质巨噬细胞 | digital pathology | lung cancer | 单细胞测序, RNA-seq | Monocle2, Cellchat, Scenic | 基因表达数据 | 纤维化和Nintedanib治疗的纤维化小鼠肺组织样本 |
| 1679 | 2025-05-07 |
Ephrin-B2 acts as a positive regulator of osteogenesis-angiogenesis coupling
2025-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.140555
PMID:39894124
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research paper | 本研究探讨了Ephrin-B2信号在成骨-血管生成耦合中的作用及其潜在机制，为牙周组织工程提供指导 | 发现Ephrin-B2信号在牙周炎中成骨细胞系和血管内皮细胞间的信号转导缺陷，并通过构建过表达Ephrin-B2的成骨细胞与HUVECs共培养系统，证实其促进血管生成和牙周骨再生的积极作用 | 研究主要基于体外共培养系统和动物模型，尚未在临床环境中验证其效果 | 探索Ephrin-B2信号在成骨-血管生成耦合中的作用及机制，优化牙周组织工程移植策略 | 牙周组织中的成骨细胞系和血管内皮细胞 | 组织工程 | 牙周炎 | 单细胞转录组测序、细胞共培养 | NA | 单细胞转录组数据、体外实验数据 | 公开数据库中的单细胞转录组数据(GSE171213)及构建的过表达Ephrin-B2的成骨细胞与HUVECs共培养系统 |
| 1680 | 2025-05-07 |
The future of cardiology: Integrating single-cell transcriptomics with multi-omics for enhanced cardiac disease insights
2025-Apr, Current problems in cardiology
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.cpcardiol.2025.103005
PMID:39894239
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综述 | 本文探讨了单细胞转录组测序（scRNA-seq）在心血管疾病研究中的应用及其与多组学技术整合的未来发展方向 | 强调了将空间转录组学和其他组学技术与scRNA-seq整合的重要性，以增强对心脏生物学的理解 | 当前scRNA-seq应用面临数据整合的挑战，需要更全面的多组学方法来阐明心血管疾病的机制 | 探索心血管疾病的创新诊断和治疗策略 | 哺乳动物心脏中的细胞异质性 | 数字病理学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |