单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 16741 - 16760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16741 | 2024-08-07 |
Homologous recombination deficiency serves as a prognostic biomarker in clear cell renal cell carcinoma
2023-Sep, Experimental and therapeutic medicine
IF:2.4Q3
DOI:10.3892/etm.2023.12128
PMID:37602311
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研究论文 | 本研究探讨了同源重组缺陷（HRD）在肾透明细胞癌（KIRC）中的预后生物标志物作用 | 首次揭示了HRD阳性肿瘤中免疫相关信号通路的激活以及肿瘤微环境中耗竭的CD8+ T细胞信号的富集 | NA | 研究HRD在KIRC中的预后价值及其对肿瘤微环境的影响 | 肾透明细胞癌患者 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组和转录组数据 | 501名KIRC患者 |
| 16742 | 2024-08-07 |
Identifying oxidative stress-related biomarkers in idiopathic pulmonary fibrosis in the context of predictive, preventive, and personalized medicine using integrative omics approaches and machine-learning strategies
2023-Sep, The EPMA journal
DOI:10.1007/s13167-023-00334-4
PMID:37605652
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研究论文 | 本研究通过综合组学方法和机器学习策略，在预测性、预防性和个性化医学框架下，识别特发性肺纤维化中与氧化应激相关的生物标志物。 | 本研究首次通过综合组学数据和机器学习方法，对特发性肺纤维化患者进行氧化应激相关基因的分类，并构建了基于五个诊断标志物的诺模图模型，为个性化抗氧化和抗纤维化治疗提供了参考。 | 本研究仅基于250名患者的转录组数据进行分析，样本量相对较小，可能影响结果的普遍性和可靠性。 | 旨在通过综合组学方法和机器学习策略，识别特发性肺纤维化中与氧化应激相关的生物标志物，以促进预测性、预防性和个性化医学的发展。 | 特发性肺纤维化患者及其氧化应激相关基因和临床指标。 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 转录组学 | 机器学习 | 转录组数据 | 250名特发性肺纤维化患者 |
| 16743 | 2024-08-05 |
Peripheral immune landscape for hypercytokinemia in myasthenic crisis utilizing single-cell transcriptomics
2023-08-24, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04421-y
PMID:37620910
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研究论文 | 本研究揭示了重症肌无力危机期间外周免疫环境的特征，采用单细胞转录组学技术分析了PBMCs的多样性 | 首次通过单细胞转录组学技术识别出一种独特的FCGR3B+单核细胞亚群，并揭示其在危机期间的促炎信号通路的显著表达 | 研究主要依赖于小样本数量，且未来的功能研究仍需探索因果关系 | 旨在探讨重症肌无力危机中的外周免疫反应及其潜在机制 | 分析来自两名AChR+MG患者在危机和危机后三个月的外围血单核细胞 | 数字病理学 | 重症肌无力 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞数据 | 33577个外围血单核细胞 |
| 16744 | 2024-08-07 |
Advances in single-cell RNA sequencing and its applications in cancer research
2023-08-24, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-023-01494-6
PMID:37612741
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术的发展及其在癌症研究中的应用 | scRNA-seq技术能够识别不同的细胞亚群，解析肿瘤微环境，并描述细胞基因组突变，从而更深入地理解肿瘤生物学的细微变化 | 传统的批量RNA测序技术只能反映样本中的平均基因表达，难以理解肿瘤异质性和肿瘤微环境 | 探讨肿瘤异质性和肿瘤微环境，增进对肿瘤发生和演化的理解 | 癌症研究中的肿瘤异质性和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 16745 | 2024-08-07 |
Expression of Cyclin E1 in hepatic stellate cells is critical for the induction and progression of liver fibrosis and hepatocellular carcinoma in mice
2023-08-24, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-06077-4
PMID:37620309
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研究论文 | 本研究探讨了Cyclin E1（Ccne1）和Cdk2基因在小鼠肝星状细胞（HSCs）中对肝纤维化和肝细胞癌发生的作用 | 首次证明Ccne1在少数HSCs中的表达足以触发广泛的肝纤维化和肝细胞癌发生，且这一过程依赖于Cdk2 | NA | 研究Ccne1和Cdk2基因在HSCs中对肝纤维化和肝细胞癌发生的影响 | 小鼠肝星状细胞（HSCs）中的Ccne1和Cdk2基因 | NA | 肝细胞癌 | 条件性基因敲除 | NA | 单细胞RNA测序 | Ccne1或Cdk2条件性敲除小鼠及野生型对照小鼠 |
| 16746 | 2024-08-07 |
Downregulation of chemokine receptor 9 facilitates CD4+CD8αα+ intraepithelial lymphocyte development
2023-08-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40950-2
PMID:37620389
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研究论文 | 研究探讨了化学因子受体9（CCR9）下调对CD4+CD8αα+上皮内淋巴细胞发育的影响 | 首次揭示了CCR9表达水平与CD4CD8αα上皮内淋巴细胞分化之间的关系，并通过单细胞RNA测序和基因组占据修饰分析，阐明了CCR9下调通过上调Cbfβ2剪接促进CD4CD8αα IEL分化的机制 | NA | 探究CCR9在CD4CD8αα上皮内淋巴细胞发育中的作用及其分子机制 | 肠道上皮内淋巴细胞（IELs）及其分化过程 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Ccr9小鼠的肠道上皮内CD4 T细胞 |
| 16747 | 2024-08-05 |
A complement atlas identifies interleukin-6-dependent alternative pathway dysregulation as a key druggable feature of COVID-19
2023-08-23, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adi0252
PMID:37611083
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研究论文 | 该文章揭示了IL-6依赖的替代途径失调作为COVID-19的一个关键可药物靶点 | 提供了补体系统在COVID-19中的作用的全面图谱，识别了IL-6和STAT1/3信号通路作为补体反应的上游驱动因子 | 尽管识别了补体失调与COVID-19治疗的关联，但具体机制仍需进一步研究 | 深入了解推动COVID-19疾病病理机制的补体系统 | 主要关注COVID-19相关的补体激活及其在肺损伤中的作用 | 数字病理学 | COVID-19 | 蛋白质组学和单细胞测序 | NA | 蛋白质相关数据 | NA |
| 16748 | 2024-08-07 |
Targeting sulfation-dependent mechanoreciprocity between matrix and osteoblasts to mitigate bone loss
2023-08-23, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adg3983
PMID:37611084
|
研究论文 | 本研究通过跨表型元分析和多突变小鼠模型的表型特征，揭示了硫酸盐转运蛋白缺陷在骨质疏松中的致病作用，并探讨了通过调节硫酸化依赖的机械互作来减轻骨丢失的潜在机制。 | 首次揭示了硫酸化在骨基质与成骨细胞间机械互作中的作用，并提出了通过药物干预和运动促进YAP/TAZ活性来改善骨质疏松的新策略。 | 研究主要基于小鼠模型和人类基因型数据，尚需进一步的临床试验验证其治疗效果。 | 探讨硫酸化依赖的机械互作在骨质疏松中的作用，并寻找减轻骨丢失的新方法。 | 人类和小鼠的骨矿物质密度，以及硫酸盐转运蛋白缺陷对成骨细胞和骨基质的影响。 | NA | 骨质疏松 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 426,824名基因型人类参与者及多突变小鼠模型 |
| 16749 | 2024-08-05 |
Dose-related immunomodulatory effects of recombinant TRAIL in the tumor immune microenvironment
2023-Aug-22, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-023-02795-x
PMID:37605148
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研究论文 | 本研究探讨了重组TRAIL在肿瘤免疫微环境中的免疫调节作用及其机制 | 研究揭示了不同剂量的重组TRAIL对免疫细胞的激活及肿瘤微环境的影响 | 尚不清楚肿瘤微环境对不同剂量TRAIL反应的具体机制 | 研究重组TRAIL在肿瘤微环境中的免疫调节作用 | 使用不同肿瘤的免疫功能正常小鼠 | 数字病理学 | NA | 流式细胞术和单细胞测序 | HU-HSC-NPG.GM3人源化免疫系统小鼠模型 | 免疫学检测数据 | 使用免疫功能正常小鼠，具体样本数量未披露 |
| 16750 | 2024-08-05 |
α-parvin controls chondrocyte column formation and regulates long bone development
2023-08-22, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-023-00284-7
PMID:37607905
|
研究论文 | 该文章研究了α-parvin在软骨细胞柱状结构形成及长骨发育中的作用 | 首次揭示了α-parvin在软骨细胞旋转和长骨发育中的关键作用 | 研究仅在小鼠肢体中进行，可能不完全适用于其他物种 | 探讨α-parvin在内源性骨化和长骨发育中的功能 | 主要研究对象是小鼠的软骨细胞 | 数字病理学 | 侏儒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 小鼠肢体样本的定量分析 |
| 16751 | 2024-08-05 |
Breast cancer histopathology image-based gene expression prediction using spatial transcriptomics data and deep learning
2023-08-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-40219-0
PMID:37604916
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研究论文 | 本研究提出了一种通过组织病理图像预测乳腺癌基因表达的新方法 | 引入了BrST-Net深度学习框架，结合空间转录组学数据，显著提高了基因表达预测的准确性 | 空间转录组技术费用高，限制了其在大规模临床肿瘤学研究中的应用 | 探讨如何通过组织病理图像预测乳腺癌患者的基因表达 | 研究对象为250个与乳腺癌相关的基因 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 深度学习架构（ResNet101, Inception-v3, EfficientNet, 视觉变换器） | 图像 | NA |
| 16752 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing and multiple bioinformatics methods to identify the immunity and ferroptosis-related biomarkers of SARS-CoV-2 infections to ischemic stroke
2023-08-21, Aging
DOI:10.18632/aging.204966
PMID:37606960
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和多种生物信息学方法，研究了COVID-19与缺血性中风之间的关系及其相关机制，并鉴定了与免疫反应和铁死亡相关的生物标志物。 | 本文首次通过单细胞RNA测序技术，结合生物信息学分析，鉴定了COVID-19相关缺血性中风的免疫和铁死亡相关基因。 | NA | 研究COVID-19与缺血性中风之间的潜在关联及其相关机制。 | COVID-19感染与缺血性中风之间的关系及其生物标志物。 | 数字病理学 | 缺血性中风 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及73个与COVID-19相关的缺血性中风基因，并在单细胞RNA测序中发现了5个基因在单核细胞中高度表达。 |
| 16753 | 2024-08-05 |
Decoding pancreatic endocrine cell differentiation and β cell regeneration in zebrafish
2023-08-18, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adf5142
PMID:37595046
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研究论文 | 本文阐述了斑马鱼的胰腺内分泌细胞分化及β细胞再生的机制。 | 揭示了斑马鱼在成人阶段β细胞再生机制的独特模型和新的内分泌前体细胞。 | 研究主要集中在斑马鱼上，可能无法直接应用于人类。 | 探究斑马鱼中β细胞再生的机制，并将其结果外推至人类。 | 研究对象是斑马鱼的胰腺内分泌细胞和β细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 16754 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics reveals distinct and conserved tumor core and edge architectures that predict survival and targeted therapy response
2023-08-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40271-4
PMID:37596273
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研究论文 | 该文章综合描述了HPV阴性口腔鳞状细胞癌中肿瘤核心和前缘的转录组特点 | 文章揭示了肿瘤核心和前缘在转录组特征上的独特性，并展示了前缘基因表达与临床结果的相关性 | 文章未提及样本的多样性或样本数量的具体限制 | 研究肿瘤微环境的空间组织与生物学及治疗反应的关系 | 研究对象为HPV阴性口腔鳞状细胞癌中的恶性细胞 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞和空间转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 16755 | 2024-08-05 |
Relationship between chronic obstructive pulmonary disease and adiponectin concentrations: An updated meta-analysis and single-cell RNA sequencing
2023-Aug-18, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000034825
PMID:37603523
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meta-analysis | 这项研究分析了慢性阻塞性肺疾病(COPD)与脂联素浓度之间的关系 | 这篇文章提供了最新文献的荟萃分析，并结合单细胞RNA测序数据，强调COPD患者中脂联素的升高 | 研究可能受到文献质量和选择偏倚的限制 | 分析COPD与脂联素浓度的关系 | 研究涉及COPD患者的脂联素相关的最新文献和单细胞测序数据 | 数字病理 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文献数据和基因表达数据 | 18篇文献，24项研究 |
| 16756 | 2024-08-05 |
GTM-decon: guided-topic modeling of single-cell transcriptomes enables sub-cell-type and disease-subtype deconvolution of bulk transcriptomes
2023-08-18, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03034-4
PMID:37596691
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研究论文 | 本文提出了一种GTM-decon方法，用于从单细胞RNA-seq数据中推断细胞类型特异性的基因主题分布，以解卷总转录组 | GTM-decon能够推断每种细胞类型的多个细胞类型特异性基因主题分布，捕捉亚细胞类型的变化 | NA | 研究如何自动推断细胞类型特异的基因主题分布以解卷总转录组 | 单细胞转录组数据和肿瘤转录组数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA-seq | GTM | 转录组数据 | NA |
| 16757 | 2024-08-07 |
Heterogeneity of lipid metabolism and its clinical and immune correlation in lung adenocarcinoma
2023-Aug-18, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 研究肺腺癌中脂质代谢的异质性及其与临床和免疫的相关性 | 首次详细探讨了脂质代谢在肺腺癌中的作用及其与肿瘤微环境的关系 | 研究依赖于公开数据库的数据，可能存在样本选择偏差 | 探讨脂质代谢在肺腺癌中的作用及其与临床和免疫的关系 | 肺腺癌患者的脂质代谢特征及其与肿瘤微环境和免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | 肺癌 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 包括4001个免疫细胞，其中483个恶性细胞和3518个正常细胞 |
| 16758 | 2024-08-07 |
Increased NMDARs in neurons and glutamine synthetase in astrocytes underlying autistic-like behaviors of Gabrb1-/- mice
2023-Aug-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107476
PMID:37599823
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研究论文 | 研究探讨了Gabrb1基因突变导致自闭症样行为的机制，通过RNA测序和单细胞RNA测序等技术，发现神经元中NMDARs和星形胶质细胞中谷氨酰胺合成酶的上调可能与自闭症样行为有关。 | 首次揭示了Gabrb1基因突变导致自闭症样行为的机制，特别是在神经元和星形胶质细胞中特定蛋白质的上调。 | 研究仅限于Gabrb1基因突变的特定小鼠模型，可能不完全适用于所有自闭症患者。 | 探究Gabrb1基因突变如何导致自闭症样行为。 | Gabrb1基因突变的小鼠模型及其神经和代谢变化。 | 神经科学 | 自闭症 | RNA测序，单细胞RNA测序，免疫荧光，电生理学，代谢物检测 | NA | RNA序列数据 | 特定细胞类型的小鼠脑组织 |
| 16759 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic analysis of the identity and function of fibro/adipogenic progenitors in healthy and dystrophic muscle
2023-Aug-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107479
PMID:37599828
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了健康和肌营养不良肌肉中成纤维/脂肪生成前体细胞（FAPs）的特性和功能 | 首次揭示了FAPs与间充质干细胞（MeSCs）之间的转录相似性，并确认了PDGFRα作为FAPs的报告基因，同时发现细胞外蛋白水解是FAPs的新功能 | NA | 探究FAPs在健康和肌营养不良肌肉中的特性和功能 | 成纤维/脂肪生成前体细胞（FAPs） | 数字病理学 | 肌营养不良 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 来自多个小鼠组织的单细胞RNA测序数据 |
| 16760 | 2024-08-07 |
Construction of stemness gene score by bulk and single-cell transcriptome to characterize the prognosis of breast cancer
2023-08-18, Aging
DOI:10.18632/aging.204963
PMID:37602872
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研究论文 | 本研究构建了一个基于单细胞转录组数据的干细胞风险基因评分（SGS）模型，用于预测乳腺癌患者的预后 | 首次利用单细胞转录组数据构建干细胞风险基因评分模型，考虑了肿瘤异质性 | NA | 开发一种新的工具，用于预测乳腺癌患者的预后和治疗反应 | 乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | ssGSEA | 转录组数据 | NA |