单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 16721 - 16740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16721 | 2024-08-07 |
Deciphering the landscape of transcriptional heterogeneity across cancer
2023-09-11, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.07.008
PMID:37595585
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研究论文 | 通过整合77项研究和24种癌症类型的scRNA-seq数据集，揭示了癌症中转录异质性的复发性基因表达模式及其功能意义 | 首次大规模整合多个癌症类型的scRNA-seq数据，揭示了癌症转录异质性的复发性模式 | NA | 探索癌症中转录异质性的基因表达模式及其功能意义 | 77项研究和24种癌症类型的scRNA-seq数据 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 涉及77项研究和24种癌症类型 |
| 16722 | 2024-08-05 |
CellAnn: a comprehensive, super-fast, and user-friendly single-cell annotation web server
2023-09-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad521
PMID:37610325
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CellAnn的参考基础细胞注释网络服务器，具有超快和易于使用的特点 | CellAnn整合了全面的参考数据库和新的簇对簇对齐方法，提供更高的准确性和可扩展性 | 传统的参考基础方法在可扩展性和预处理参考数据集的缺乏上存在局限 | 研究旨在提供一种高效、用户友好的单细胞注释工具 | 研究对象为204个人类和191只小鼠的单细胞数据集，涉及32个器官 | 数字病理 | NA | 单细胞测序 | NA | 数据集 | 204个人类单细胞数据集和191只小鼠单细胞数据集 |
| 16723 | 2024-08-05 |
Inhibition of Wnt activity improves peri-implantation development of somatic cell nuclear transfer embryos
2023-Sep, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwad173
PMID:37593113
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研究论文 | 这篇文章探讨了抑制Wnt活性对体细胞核转移(SCNT)胚胎围植入发育的影响 | 首次发现持续的Wnt信号阻碍了外胚层细胞向成熟多能性转变，并通过操控Wnt信号显著提高了克隆效率 | 尚未阐明SCNT胚胎在围植入阶段停滞的潜在机制 | 研究Wnt信号在SCNT胚胎围植入阶段发育中的作用 | 体细胞核转移胚胎的围植入发育 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 16724 | 2024-08-05 |
MacroH2A restricts inflammatory gene expression in melanoma cancer-associated fibroblasts by coordinating chromatin looping
2023-09, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-023-01208-7
PMID:37605008
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研究论文 | 本文揭示了MacroH2A在黑色素瘤癌相关成纤维细胞中的肿瘤抑制作用 | 首次确定了MacroH2A在肿瘤微环境中的作用及其对基因表达的调节机制 | 本研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类黑色素瘤的特点 | 探讨MacroH2A在黑色素瘤微环境中的作用及其机制 | 主要研究黑色素瘤癌相关成纤维细胞及其表型变化 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组学，空间转录组学 | NA | NA | 使用了免疫合成小鼠模型进行实验 |
| 16725 | 2024-08-05 |
Current status and prospects of GREM1 research in cancer (Review)
2023-Sep, Molecular and clinical oncology
IF:1.4Q4
DOI:10.3892/mco.2023.2665
PMID:37614374
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综述 | 本文回顾了GREM1在癌症中的作用和功能 | 探讨了GREM1在不同类型肿瘤中的不同作用，提供了GREM1作为诊断和预后指标的潜力 | 缺乏对GREM1在所有肿瘤类型中的全面分析 | 研究GREM1在肿瘤中的作用及其生物功能 | 检视GREM1在乳腺癌、结肠癌及其他肿瘤类型的作用 | 数字病理学 | 胰腺癌、乳腺癌、结肠癌 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 16726 | 2024-08-07 |
Efficacy of antiviral therapy and host-virus interactions visualised using serial liver sampling with fine-needle aspirates
2023-Sep, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2023.100817
PMID:37600958
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研究论文 | 本文通过使用细针抽吸术进行连续肝脏采样，研究了抗病毒治疗对慢性乙型肝炎患者病毒复制的影响，并揭示了宿主与病毒的相互作用。 | 采用细针抽吸术和单细胞RNA测序技术，捕捉抗病毒治疗对HBV复制状态的动态影响，并揭示了感染肝细胞中的宿主-病原体相互作用。 | 技术限制和采样频率的限制是测量治疗开始后HBV转录实际变化的障碍。 | 研究抗病毒治疗对慢性乙型肝炎患者病毒复制的影响及其机制。 | 慢性乙型肝炎患者的肝脏样本和病毒复制状态。 | 数字病理学 | 肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 慢性乙型肝炎患者的肝脏细针抽吸样本，基线及治疗后12周和24周。 |
| 16727 | 2024-08-07 |
Deciphering colorectal cancer progression features and prognostic signature by single-cell RNA sequencing pseudotime trajectory analysis
2023-Sep, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2023.101491
PMID:37601456
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，通过伪时间轨迹分析揭示结直肠癌进展特征和预后标志物 | 本研究首次使用单细胞RNA测序技术结合伪时间轨迹分析，深入研究结直肠癌的肿瘤内异质性和细胞动态事件 | 研究使用的数据集来自单一医疗机构，可能存在样本偏倚 | 探索结直肠癌的进展特征和开发新的预后标志物 | 结直肠癌的肿瘤上皮细胞亚型和相关基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO Cox回归 | 单细胞RNA测序数据 | 使用三星医疗中心（SMC）的结直肠癌单细胞RNA测序数据集 |
| 16728 | 2024-08-07 |
Homologous recombination deficiency serves as a prognostic biomarker in clear cell renal cell carcinoma
2023-Sep, Experimental and therapeutic medicine
IF:2.4Q3
DOI:10.3892/etm.2023.12128
PMID:37602311
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研究论文 | 本研究探讨了同源重组缺陷（HRD）在肾透明细胞癌（KIRC）中的预后生物标志物作用 | 首次揭示了HRD阳性肿瘤中免疫相关信号通路的激活以及肿瘤微环境中耗竭的CD8+ T细胞信号的富集 | NA | 研究HRD在KIRC中的预后价值及其对肿瘤微环境的影响 | 肾透明细胞癌患者 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组和转录组数据 | 501名KIRC患者 |
| 16729 | 2024-08-07 |
Identifying oxidative stress-related biomarkers in idiopathic pulmonary fibrosis in the context of predictive, preventive, and personalized medicine using integrative omics approaches and machine-learning strategies
2023-Sep, The EPMA journal
DOI:10.1007/s13167-023-00334-4
PMID:37605652
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研究论文 | 本研究通过综合组学方法和机器学习策略，在预测性、预防性和个性化医学框架下，识别特发性肺纤维化中与氧化应激相关的生物标志物。 | 本研究首次通过综合组学数据和机器学习方法，对特发性肺纤维化患者进行氧化应激相关基因的分类，并构建了基于五个诊断标志物的诺模图模型，为个性化抗氧化和抗纤维化治疗提供了参考。 | 本研究仅基于250名患者的转录组数据进行分析，样本量相对较小，可能影响结果的普遍性和可靠性。 | 旨在通过综合组学方法和机器学习策略，识别特发性肺纤维化中与氧化应激相关的生物标志物，以促进预测性、预防性和个性化医学的发展。 | 特发性肺纤维化患者及其氧化应激相关基因和临床指标。 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 转录组学 | 机器学习 | 转录组数据 | 250名特发性肺纤维化患者 |
| 16730 | 2024-08-05 |
Peripheral immune landscape for hypercytokinemia in myasthenic crisis utilizing single-cell transcriptomics
2023-08-24, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04421-y
PMID:37620910
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研究论文 | 本研究揭示了重症肌无力危机期间外周免疫环境的特征，采用单细胞转录组学技术分析了PBMCs的多样性 | 首次通过单细胞转录组学技术识别出一种独特的FCGR3B+单核细胞亚群，并揭示其在危机期间的促炎信号通路的显著表达 | 研究主要依赖于小样本数量，且未来的功能研究仍需探索因果关系 | 旨在探讨重症肌无力危机中的外周免疫反应及其潜在机制 | 分析来自两名AChR+MG患者在危机和危机后三个月的外围血单核细胞 | 数字病理学 | 重症肌无力 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞数据 | 33577个外围血单核细胞 |
| 16731 | 2024-08-07 |
Advances in single-cell RNA sequencing and its applications in cancer research
2023-08-24, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-023-01494-6
PMID:37612741
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术的发展及其在癌症研究中的应用 | scRNA-seq技术能够识别不同的细胞亚群，解析肿瘤微环境，并描述细胞基因组突变，从而更深入地理解肿瘤生物学的细微变化 | 传统的批量RNA测序技术只能反映样本中的平均基因表达，难以理解肿瘤异质性和肿瘤微环境 | 探讨肿瘤异质性和肿瘤微环境，增进对肿瘤发生和演化的理解 | 癌症研究中的肿瘤异质性和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 16732 | 2024-08-07 |
Expression of Cyclin E1 in hepatic stellate cells is critical for the induction and progression of liver fibrosis and hepatocellular carcinoma in mice
2023-08-24, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-06077-4
PMID:37620309
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研究论文 | 本研究探讨了Cyclin E1（Ccne1）和Cdk2基因在小鼠肝星状细胞（HSCs）中对肝纤维化和肝细胞癌发生的作用 | 首次证明Ccne1在少数HSCs中的表达足以触发广泛的肝纤维化和肝细胞癌发生，且这一过程依赖于Cdk2 | NA | 研究Ccne1和Cdk2基因在HSCs中对肝纤维化和肝细胞癌发生的影响 | 小鼠肝星状细胞（HSCs）中的Ccne1和Cdk2基因 | NA | 肝细胞癌 | 条件性基因敲除 | NA | 单细胞RNA测序 | Ccne1或Cdk2条件性敲除小鼠及野生型对照小鼠 |
| 16733 | 2024-08-07 |
Downregulation of chemokine receptor 9 facilitates CD4+CD8αα+ intraepithelial lymphocyte development
2023-08-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40950-2
PMID:37620389
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研究论文 | 研究探讨了化学因子受体9（CCR9）下调对CD4+CD8αα+上皮内淋巴细胞发育的影响 | 首次揭示了CCR9表达水平与CD4CD8αα上皮内淋巴细胞分化之间的关系，并通过单细胞RNA测序和基因组占据修饰分析，阐明了CCR9下调通过上调Cbfβ2剪接促进CD4CD8αα IEL分化的机制 | NA | 探究CCR9在CD4CD8αα上皮内淋巴细胞发育中的作用及其分子机制 | 肠道上皮内淋巴细胞（IELs）及其分化过程 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Ccr9小鼠的肠道上皮内CD4 T细胞 |
| 16734 | 2024-08-05 |
A complement atlas identifies interleukin-6-dependent alternative pathway dysregulation as a key druggable feature of COVID-19
2023-08-23, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adi0252
PMID:37611083
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研究论文 | 该文章揭示了IL-6依赖的替代途径失调作为COVID-19的一个关键可药物靶点 | 提供了补体系统在COVID-19中的作用的全面图谱，识别了IL-6和STAT1/3信号通路作为补体反应的上游驱动因子 | 尽管识别了补体失调与COVID-19治疗的关联，但具体机制仍需进一步研究 | 深入了解推动COVID-19疾病病理机制的补体系统 | 主要关注COVID-19相关的补体激活及其在肺损伤中的作用 | 数字病理学 | COVID-19 | 蛋白质组学和单细胞测序 | NA | 蛋白质相关数据 | NA |
| 16735 | 2024-08-07 |
Targeting sulfation-dependent mechanoreciprocity between matrix and osteoblasts to mitigate bone loss
2023-08-23, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adg3983
PMID:37611084
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研究论文 | 本研究通过跨表型元分析和多突变小鼠模型的表型特征，揭示了硫酸盐转运蛋白缺陷在骨质疏松中的致病作用，并探讨了通过调节硫酸化依赖的机械互作来减轻骨丢失的潜在机制。 | 首次揭示了硫酸化在骨基质与成骨细胞间机械互作中的作用，并提出了通过药物干预和运动促进YAP/TAZ活性来改善骨质疏松的新策略。 | 研究主要基于小鼠模型和人类基因型数据，尚需进一步的临床试验验证其治疗效果。 | 探讨硫酸化依赖的机械互作在骨质疏松中的作用，并寻找减轻骨丢失的新方法。 | 人类和小鼠的骨矿物质密度，以及硫酸盐转运蛋白缺陷对成骨细胞和骨基质的影响。 | NA | 骨质疏松 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 426,824名基因型人类参与者及多突变小鼠模型 |
| 16736 | 2024-08-05 |
Dose-related immunomodulatory effects of recombinant TRAIL in the tumor immune microenvironment
2023-Aug-22, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-023-02795-x
PMID:37605148
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研究论文 | 本研究探讨了重组TRAIL在肿瘤免疫微环境中的免疫调节作用及其机制 | 研究揭示了不同剂量的重组TRAIL对免疫细胞的激活及肿瘤微环境的影响 | 尚不清楚肿瘤微环境对不同剂量TRAIL反应的具体机制 | 研究重组TRAIL在肿瘤微环境中的免疫调节作用 | 使用不同肿瘤的免疫功能正常小鼠 | 数字病理学 | NA | 流式细胞术和单细胞测序 | HU-HSC-NPG.GM3人源化免疫系统小鼠模型 | 免疫学检测数据 | 使用免疫功能正常小鼠，具体样本数量未披露 |
| 16737 | 2024-08-05 |
α-parvin controls chondrocyte column formation and regulates long bone development
2023-08-22, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-023-00284-7
PMID:37607905
|
研究论文 | 该文章研究了α-parvin在软骨细胞柱状结构形成及长骨发育中的作用 | 首次揭示了α-parvin在软骨细胞旋转和长骨发育中的关键作用 | 研究仅在小鼠肢体中进行，可能不完全适用于其他物种 | 探讨α-parvin在内源性骨化和长骨发育中的功能 | 主要研究对象是小鼠的软骨细胞 | 数字病理学 | 侏儒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 小鼠肢体样本的定量分析 |
| 16738 | 2024-08-05 |
Breast cancer histopathology image-based gene expression prediction using spatial transcriptomics data and deep learning
2023-08-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-40219-0
PMID:37604916
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研究论文 | 本研究提出了一种通过组织病理图像预测乳腺癌基因表达的新方法 | 引入了BrST-Net深度学习框架，结合空间转录组学数据，显著提高了基因表达预测的准确性 | 空间转录组技术费用高，限制了其在大规模临床肿瘤学研究中的应用 | 探讨如何通过组织病理图像预测乳腺癌患者的基因表达 | 研究对象为250个与乳腺癌相关的基因 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 深度学习架构（ResNet101, Inception-v3, EfficientNet, 视觉变换器） | 图像 | NA |
| 16739 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing and multiple bioinformatics methods to identify the immunity and ferroptosis-related biomarkers of SARS-CoV-2 infections to ischemic stroke
2023-08-21, Aging
DOI:10.18632/aging.204966
PMID:37606960
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和多种生物信息学方法，研究了COVID-19与缺血性中风之间的关系及其相关机制，并鉴定了与免疫反应和铁死亡相关的生物标志物。 | 本文首次通过单细胞RNA测序技术，结合生物信息学分析，鉴定了COVID-19相关缺血性中风的免疫和铁死亡相关基因。 | NA | 研究COVID-19与缺血性中风之间的潜在关联及其相关机制。 | COVID-19感染与缺血性中风之间的关系及其生物标志物。 | 数字病理学 | 缺血性中风 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及73个与COVID-19相关的缺血性中风基因，并在单细胞RNA测序中发现了5个基因在单核细胞中高度表达。 |
| 16740 | 2024-08-05 |
Decoding pancreatic endocrine cell differentiation and β cell regeneration in zebrafish
2023-08-18, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adf5142
PMID:37595046
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研究论文 | 本文阐述了斑马鱼的胰腺内分泌细胞分化及β细胞再生的机制。 | 揭示了斑马鱼在成人阶段β细胞再生机制的独特模型和新的内分泌前体细胞。 | 研究主要集中在斑马鱼上，可能无法直接应用于人类。 | 探究斑马鱼中β细胞再生的机制，并将其结果外推至人类。 | 研究对象是斑马鱼的胰腺内分泌细胞和β细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |