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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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16701 | 2024-08-05 |
Research progress of single-cell sequencing in tuberculosis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1276194
PMID:37901241
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研究论文 | 这篇文章综述了单细胞测序在结核病研究中的进展 | 强调了单细胞测序技术在揭示结核病发病机制及免疫反应中的不同应用 | 文章提到各种技术的应用限制,但具体限制细节未详述 | 深入理解结核病研究中的空白和潜在的未来发展 | 单细胞测序技术在结核病的发病机制和免疫反应中的应用 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
16702 | 2024-08-05 |
Cardiac cellular diversity and functionality in cardiac repair by single-cell transcriptomics
2023, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2023.1237208
PMID:37920179
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评论 | 这篇文章总结了单细胞转录组学在心脏修复中的主要发现 | 探讨了心脏细胞异质性及其在心肌缺血修复过程中的作用 | 文章未提供新的实验数据,仅为文献综述 | 旨在探讨心脏修复机制及开发新的治疗方法 | 涵盖心脏细胞类型、成分动态和与缺血相关的分子特征 | 数字病理学 | 心脏病 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
16703 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis technologies for cancer research: from tumor-specific single cell discovery to cancer therapy
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1276959
PMID:37900181
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综述 | 该文章探讨了单细胞测序(SCS)技术在癌症研究中的应用及其临床优势 | 文章系统性地研究了多种单细胞技术的基础概念、过程步骤及其在癌症治疗中的独特临床优势 | 尽管SCS技术具有改变癌症研究的潜力,但在管理和分析大规模数据方面仍面临挑战 | 突出SCS在癌症研究中的关键作用,并促进单细胞技术在癌症治疗中的应用 | 单细胞,包括循环肿瘤细胞(CTCs)、谱系追踪、肿瘤异质性、耐药性及肿瘤免疫治疗 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序(SCS) | NA | 单细胞数据 | 成千上万到百万的单细胞 |
16704 | 2024-08-05 |
An update on methods for detection of prognostic and predictive biomarkers in melanoma
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1290696
PMID:37900283
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综述 | 本文回顾了黑色素瘤中预后和预测免疫生物标志物检测的不同技术 | 强调了多种方法用于表征黑色素瘤的免疫微环境并提供新型生物标志物 | 未明确提及具体的实验数据或样本规模 | 改善黑色素瘤的免疫生物标志物的检测方法 | 研究不同技术如何检测黑色素瘤中的生物标志物 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 基因表达谱、空间转录组学、基于人工智能的图像分析 | NA | NA | NA |
16705 | 2024-08-07 |
Proposing a novel molecular subtyping scheme for predicting distant recurrence-free survival in breast cancer post-neoadjuvant chemotherapy with close correlation to metabolism and senescence
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1265520
PMID:37900131
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研究论文 | 本研究提出了一种新的分子分型方案,用于预测乳腺癌患者在接受新辅助化疗后的无远处复发生存期,该方案与肿瘤代谢和细胞衰老密切相关。 | 本研究结合生物信息学和机器学习方法,通过综合分析确定了与乳腺癌远处复发相关的关键基因,并开发了一种新的分子分型方案。 | NA | 优化乳腺癌患者在接受新辅助化疗后远处复发的监测方案。 | 乳腺癌患者的无远处复发生存期。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 微阵列数据分析、机器学习、单细胞RNA测序、分子对接 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 101种算法组合 |
16706 | 2024-08-07 |
Cell-type-specific molecular characterization of cells from circulation and kidney in IgA nephropathy with nephrotic syndrome
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1231937
PMID:37908345
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了患有肾病综合征的IgA肾病儿童患者的外周血单核细胞和肾脏细胞的细胞类型特异性分子特征 | 首次系统地分析了肾病综合征IgA肾病患者的循环系统和肾脏组织的分子事件,为未来的靶向治疗提供了新的见解 | NA | 探究肾病综合征IgA肾病的细胞和分子状态 | 患有肾病综合征的IgA肾病儿童患者的外周血单核细胞和肾脏细胞 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 儿童患者 |
16707 | 2024-08-07 |
Unraveling the prognostic significance and molecular characteristics of tumor-infiltrating B lymphocytes in clear cell renal cell carcinoma through a comprehensive bioinformatics analysis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1238312
PMID:37908350
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研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析,探索了透明细胞肾细胞癌中肿瘤浸润B淋巴细胞的预后意义和分子特征 | 本研究首次系统地探讨了透明细胞肾细胞癌中肿瘤浸润B淋巴细胞的预后和分子特征,并提出了一个10基因标志物 | 需要进一步研究以明确肿瘤浸润B淋巴细胞在透明细胞肾细胞癌患者预后和治疗中的具体影响 | 探索透明细胞肾细胞癌中肿瘤浸润B淋巴细胞的预后和分子特征 | 透明细胞肾细胞癌中的肿瘤浸润B淋巴细胞 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | xCell算法, WGCNA方法, scRNA-seq数据分析 | NA | 转录组数据 | 使用了TCGA-KIRC和其他透明细胞肾细胞癌转录组数据集 |
16708 | 2024-08-07 |
Construction and validation of a novel senescence-related risk score can help predict the prognosis and tumor microenvironment of gastric cancer patients and determine that STK40 can affect the ROS accumulation and proliferation ability of gastric cancer cells
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1259231
PMID:37915566
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研究论文 | 本研究构建并验证了一种新型衰老相关风险评分,有助于预测胃癌患者的预后和肿瘤微环境,并确定STK40能影响胃癌细胞的ROS积累和增殖能力 | 本研究通过WGCNA算法和Lasso-Cox算法筛选出KL、SERPINE1和STK40作为构建预后模型的关键基因,并利用SSGSEA算法评估不同患者中免疫细胞和免疫功能的浸润及其与风险评分的关联 | NA | 评估胃癌患者的预后和免疫治疗效果 | 胃癌患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | WGCNA算法, Lasso-Cox方法, SSGSEA算法, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
16709 | 2024-08-07 |
Hepatitis B surface antigen reduction is associated with hepatitis B core-specific CD8+ T cell quality
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1257113
PMID:37920475
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研究论文 | 研究了慢性乙型肝炎(CHB)患者在接受核苷(酸)类似物(NUC)治疗期间,CD8 T细胞的特性及其与乙型肝炎表面抗原(HBsAg)水平的关系 | 揭示了HBV特异性CD8 T细胞在患者体内的质量差异,并发现HBcore特异性CD8 T细胞的多功能性与HBsAg水平呈负相关 | 研究样本量较小,且仅限于特定病毒基因型的患者 | 探讨CD8 T细胞在CHB患者中的作用及其对HBsAg水平的影响 | 慢性乙型肝炎患者的CD8 T细胞及其与HBsAg的关系 | 免疫学 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),多色流式细胞术 | NA | RNA | 6名捐赠者的CD69 CD8 T细胞用于scRNA-seq分析,26名捐赠者的PBMCs用于HBV特异性CD8 T细胞检测 |
16710 | 2024-08-07 |
Identification of Cell-Cell Communications by Single-Cell RNA Sequencing in End Stage Renal Disease Provides New Insights into Immune Cell Heterogeneity
2023, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S424911
PMID:37927961
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了终末期肾病患者的细胞间通讯,揭示了免疫细胞异质性的新见解 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术分析了终末期肾病患者的免疫细胞异质性及其细胞间通讯,发现了MIF信号通路在Th17/Treg细胞间通讯中的重要作用 | NA | 揭示慢性肾脏病进展过程中免疫细胞功能、组成及细胞间通讯的改变 | 终末期肾病患者及健康对照组的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括常规血液透析患者和健康对照组的临床数据、血清及外周血单个核细胞样本 |
16711 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing reveals SATB2/NOTCH1 signaling promotes the progression of malignancy of epithelial cells from papillary thyroid cancer
2024-Jan, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.23631
PMID:37877736
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研究论文 | 这篇文章揭示了SATB2/NOTCH1信号通路促进乳头状甲状腺癌上皮细胞恶性进展的机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了SATB2与NOTCH1信号通路在乳头状甲状腺癌中的作用及其与恶性转变的关系 | 样本量仅限于五名患者,可能影响结果的普遍性 | 探讨SATB2和NOTCH1信号通路在乳头状甲状腺癌进展中的作用 | 四名乳头状甲状腺癌患者和一名良性甲状腺肿瘤患者的样本 | 数字病理学 | 乳头状甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞基因表达数据 | 五名患者(包括两名乳头状甲状腺微癌患者、两名侵袭性Advanced PTC患者和一名良性甲状腺肿瘤患者) |
16712 | 2024-08-07 |
Circulating small extracellular vesicle-derived splicing factor 3b subunit 4 as a non-invasive diagnostic biomarker of early hepatocellular carcinoma
2023-Oct-30, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-023-02867-y
PMID:37899451
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研究论文 | 本研究评估了剪接因子3b亚基4(SF3B4)作为肝细胞癌(HCC)新型非侵入性生物标志物的诊断价值,并探讨了SF3B4表达与免疫细胞浸润的关联 | SF3B4在血浆中的表达水平在HCC患者中显著高于健康对照组,且EV-SF3B4在HCC的诊断性能优于α-胎蛋白(AFP) | SF3B4蛋白和自身抗体在HCC患者血浆中的诊断性能并未优于α-胎蛋白(AFP) | 评估SF3B4作为HCC非侵入性诊断生物标志物的价值及其与免疫细胞浸润的关联 | 肝细胞癌(HCC)患者及健康对照组的血浆样本 | NA | 肝细胞癌 | 酶联免疫吸附试验(ELISA)、定量逆转录PCR | NA | 血浆样本 | 健康对照组和不同阶段的HCC患者 |
16713 | 2024-08-05 |
Spatiotemporal evolution of AML immune microenvironment remodeling and RNF149-driven drug resistance through single-cell multidimensional analysis
2023-10-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04579-5
PMID:37891580
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研究论文 | 通过单细胞多维分析,分析急性髓性白血病患者骨髓免疫微环境的构成及RNF149驱动的药物耐药性演变 | 首次揭示了RNF149在急性髓性白血病进展中的作用及其对免疫微环境的影响 | 未能完全探索所有E3泛素连接酶相关基因对药物耐药的影响 | 探讨急性髓性白血病患者骨髓免疫微环境的组成及其在药物耐药中的作用 | 急性髓性白血病患者的骨髓免疫微环境中不同T细胞亚群 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 多个单细胞RNA测序数据集 |
16714 | 2024-08-05 |
Selective control of transposable element expression during T cell exhaustion and anti-PD-1 treatment
2023-10-27, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adf8838
PMID:37889984
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研究论文 | 该文章分析了在慢性感染和癌症中,T细胞耗竭和抗PD-1治疗期间转座元件的表达情况 | 揭示了在T细胞耗竭过程中,转座元件表达的选择性调控及其作为免疫检查点抑制反应生物标志物的潜力 | 本研究主要基于小鼠和人类的TIL亚群,可能限制了结果的广泛适用性 | 研究在T细胞耗竭过程中转座元件的表达及其在抗PD-1治疗中的角色 | 小鼠和人类的CD8肿瘤浸润性T淋巴细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 转录组学 | NA | RNA数据 | NA |
16715 | 2024-08-07 |
The structural and functional complexity of the integrative hypothalamus
2023-10-27, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adh8488
PMID:37883552
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review | 本文概述了哺乳动物下丘脑的组织结构、发育和连接 | 利用单细胞RNA测序研究和现代光子工具,揭示了下丘脑细胞异质性和复杂电路的高分辨率解析 | NA | 帮助新进入者了解这一激动人心的领域 | 哺乳动物的下丘脑 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
16716 | 2024-08-07 |
Prediction of Prognosis and Immunotherapy Response with a Novel Natural Killer Cell Marker Genes Signature in Osteosarcoma
2023-Oct-27, Cancer biotherapy & radiopharmaceuticals
DOI:10.1089/cbr.2023.0103
PMID:37889617
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研究论文 | 本文构建了一种基于自然杀伤细胞标记基因的新型签名,用于预测骨肉瘤患者的预后和免疫治疗反应 | 开发了一种基于自然杀伤细胞标记基因的五基因预后签名,用于预测骨肉瘤患者的生存和免疫治疗反应 | NA | 构建一种新的基于自然杀伤细胞的签名,以识别对免疫治疗更敏感的骨肉瘤患者 | 骨肉瘤患者 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | LASSO Cox回归分析 | 基因表达数据 | 共八个公开的骨肉瘤患者数据集 |
16717 | 2024-08-05 |
Immunological role and clinical prognostic significance of P2RY6 in lung adenocarcinoma: a multi-omics studies and single-cell sequencing analysis
2023-Oct-26, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-023-03216-1
PMID:37880703
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研究论文 | 本研究探讨了P2RY6在肺腺癌中的免疫学作用及其临床预后意义 | P2RY6在肺腺癌中高度表达且与患者预后相关,开发了基于P2RY6的炎症预测模型 | 目前尚不清楚P2RY6在其他类型肿瘤中的作用 | 研究P2RY6在肺腺癌中的作用及其作为免疫治疗新靶点的可能性 | 采用肿瘤基因组数据库中的数据分析P2RY6的异常状态及其预后价值 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组测序,甲基化测序 | NA | 转录组数据,基因组数据 | 涉及多种癌症组织样本,特指肺腺癌 |
16718 | 2024-08-07 |
Metabolic and senescence characteristics associated with the immune microenvironment in non-small cell lung cancer: insights from single-cell RNA sequencing
2023-10-26, Aging
DOI:10.18632/aging.205146
PMID:37889543
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了非小细胞肺癌中的细胞类型及其与免疫微环境的关系 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了非小细胞肺癌中细胞组成的基线图谱和功能表型 | NA | 深入理解非小细胞肺癌中细胞成分的复杂性和肿瘤微环境的异质性 | 非小细胞肺癌样本中的细胞类型及其与免疫微环境的关系 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 两个与非小细胞肺癌相关的单细胞RNA测序数据集 |
16719 | 2024-08-05 |
Characteristics of premanufacture CD8+T cells determine CAR-T efficacy in patients with diffuse large B-cell lymphoma
2023-10-25, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-023-01659-2
PMID:37875502
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研究论文 | 该文章探讨了预制CD8+T细胞的特征如何决定CAR-T在弥漫性大B细胞淋巴瘤患者中的疗效 | 通过分析预制T细胞的细胞和分子特征,揭示了其在CAR-T细胞治疗中疗效差异的分子基础 | 该研究为回顾性分析,结果可能受到样本选择和数据偏倚的影响 | 揭示CAR-T细胞治疗中的变化并识别反应生物标志物 | 58例接受CD19/CD20双靶向CAR-T细胞治疗的复发/难治性弥漫性大B细胞淋巴瘤患者 | 数字病理学 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | RNA-Seq,单细胞RNA-Seq,配对T细胞受体测序 | NA | 细胞,分子数据 | 58例患者的先制T细胞和CAR-T细胞产品 |
16720 | 2024-08-07 |
Multi-omics characteristics of tumor-associated macrophages in the tumor microenvironment of gastric cancer and their exploration of immunotherapy potential
2023-10-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-38822-2
PMID:37880233
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序筛选肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)中的标记基因,并结合胃癌(GC)转录组数据,分析不同亚型患者的临床特征、预后差异、免疫浸润和药物敏感性,构建了胃癌的预后模型。 | 本研究发现了MDMs中的突变如CGN、S100A6和C1QA,并揭示了不同胃癌亚型中免疫细胞和免疫检查点的浸润差异,构建了高准确性的预测评分系统。 | NA | 探索肿瘤相关巨噬细胞在胃癌肿瘤微环境中的多组学特征及其在免疫治疗中的潜力。 | 肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)和胃癌(GC)患者。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 不同数据集中的不同亚型胃癌患者 |