单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27864 篇文献，本页显示第 16681 - 16700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16681 | 2024-08-07 |
Corrigendum: Single-cell RNA sequencing reveals the role of phosphorylation-related genes in hepatocellular carcinoma stem cells
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1045260
PMID:37954208
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 16682 | 2024-08-07 |
Identification of a prognostic evaluator from glutamine metabolic heterogeneity studies within and between tissues in hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1241677
PMID:37954858
|
研究论文 | 本研究旨在探讨谷氨酰胺代谢在肝细胞癌（HCC）异质性中的作用，并基于HCC肿瘤内和组织间的谷氨酰胺代谢异质性研究开发一个预后评估器 | 本研究发现了与谷氨酰胺代谢相关的标记基因，并构建了一个六基因预后模型，可能作为HCC患者治疗和预后的预测器 | NA | 确定谷氨酰胺代谢对HCC异质性的影响并开发预后评估器 | 肝细胞癌（HCC）及其谷氨酰胺代谢异质性 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组数据分析 | 机器学习算法（梯度提升机、支持向量机、随机森林、极端梯度提升、决策树、最小绝对收缩和选择算子） | 转录组数据 | GSE149614数据集包括10种细胞类型 |
| 16683 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic architecture and cellular communication circuits of parametrial adipose tissue in pregnant mice
2023-Dec-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2023.122214
PMID:37907153
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了怀孕小鼠参数脂肪组织中的细胞组成和功能转变 | 定义了具有独特性质的脂肪细胞亚群Adipo_5，并揭示了参数脂肪组织在建立母胎免疫耐受中的潜在贡献 | NA | 探讨参数脂肪组织在怀孕相关免疫、高血压和代谢紊乱中的作用 | 怀孕小鼠的参数脂肪组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 18,074个脂肪组织细胞 |
| 16684 | 2024-08-07 |
An atlas of immune cell transcriptomes in human immunodeficiency virus-infected immunological non-responders identified marker genes that control viral replication
2023-Nov-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000002918
PMID:37914674
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了免疫应答者和非应答者的外周血单核细胞，旨在揭示获得性免疫缺陷综合征患者中免疫非应答特征的特定免疫细胞亚型。 | 本研究首次生成了HIV感染的免疫应答者和非应答者的免疫细胞转录组图谱，并鉴定了与HIV复制相关的主机基因作为不同类型免疫细胞的标记。 | NA | 研究获得性免疫缺陷综合征患者中免疫非应答特征的特定免疫细胞亚型。 | 外周血单核细胞的单细胞转录组。 | 数字病理学 | 获得性免疫缺陷综合征 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组 | 免疫应答者（CD4+ T细胞计数>500）和免疫非应答者（CD4+ T细胞计数<300）的外周血单核细胞。 |
| 16685 | 2024-08-05 |
NRTPredictor: identifying rice root cell state in single-cell RNA-seq via ensemble learning
2023-Nov-04, Plant methods
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13007-023-01092-0
PMID:37925413
|
研究论文 | 本研究提出了一种名为NRTPredictor的系统，用于通过集成学习预测水稻根系细胞状态。 | NRTPredictor利用集成学习为水稻根系细胞分期提供自动化预测，并具备完整的模型可解释性。 | 文章未提及具体样本的多样性和样本选择的局限性。 | 研究的目的是提高水稻根细胞在单细胞RNA测序中的状态识别准确性。 | 研究对象为水稻根部细胞，重点分析其基因表达和细胞异质性。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 集成学习模型 | 基因表达数据 | 测试数据集的样本数量未明确提及 |
| 16686 | 2024-08-05 |
Integrated machine learning identifies epithelial cell marker genes for improving outcomes and immunotherapy in prostate cancer
2023-11-04, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04633-2
PMID:37925432
|
研究论文 | 本研究旨在全面探讨与前列腺癌相关的上皮细胞标记基因的作用和临床价值 | 创新性地通过机器学习算法识别出上皮细胞标记基因，并建立了预后指标ECMGPS，提高了前列腺癌的预后和免疫治疗效果 | 本研究可能存在样本量和病人个体差异的影响，限制了研究结果的普适性 | 该研究的目的是改善前列腺癌患者的预后并探索免疫治疗的潜在价值 | 研究对象为前列腺癌中的上皮细胞及其相关基因 | 机器学习 | 前列腺癌 | 单细胞测序 | 多种机器学习算法 | 基因组数据 | 分析了来自五个独立队列的101个模型的数据 |
| 16687 | 2024-08-07 |
SAA suppresses α-PD-1 induced anti-tumor immunity by driving TH2 polarization in lung adenocarcinoma
2023-11-04, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-06198-w
PMID:37925492
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析肺腺癌干细胞的特征，并探讨其与免疫微环境的相互作用 | 首次揭示了肺腺癌干细胞通过分泌急性期蛋白SAA重塑肿瘤微环境，并通过P2X7受体驱动类型2免疫极化，从而促进治疗抵抗和肿瘤纤维化 | NA | 探究肺腺癌干细胞与免疫微环境的相互作用及其对肿瘤发展的影响 | 肺腺癌干细胞及其分泌的SAA对免疫微环境的影响 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 使用公开数据集进行分析 |
| 16688 | 2024-08-05 |
Annotation of cell types (ACT): a convenient web server for cell type annotation
2023-11-03, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-023-01249-5
PMID:37924118
|
研究论文 | 本研究开发了一个便利的网络服务器ACT，用于细胞类型标注。 | 提出了一种基于分层组织标记图和加权整合基因集富集方法WISE的新策略，显著提升了细胞类型标注的准确性和速度 | 目前的研究主要依赖于输入简单的上调基因列表，对于其他类型的数据可能不适用 | 旨在提高单细胞数据集的分析和解释能力，改进细胞类型标注流程 | 从7000多篇文献中手动整理的26000个细胞标记条目 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 基因表达数据 | NA |
| 16689 | 2024-08-07 |
Combining single-cell RNA sequencing and population-based studies reveals hand osteoarthritis-associated chondrocyte subpopulations and pathways
2023-11-02, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-023-00292-7
PMID:37914703
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和人群研究相结合的方法，揭示了手骨关节炎相关的软骨细胞亚群及其通路 | 发现了新的具有炎症调节潜力的亚群——炎症软骨细胞，并揭示了铁死亡途径在手骨关节炎中的重要作用 | NA | 揭示手骨关节炎的分子机制及潜在治疗靶点 | 手骨关节炎患者的指间关节软骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 105,142个细胞，5个骨关节炎软骨样本和5个非骨关节炎软骨样本，以及UK Biobank中的332,668名参与者和湘雅骨关节炎研究中的1,241名参与者 |
| 16690 | 2024-08-07 |
KMD clustering: robust general-purpose clustering of biological data
2023-11-02, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05480-z
PMID:37919399
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为k最小距离（KMD）聚类的通用生物数据聚类方法 | KMD聚类基于单链接和平均链接层次聚类的泛化，引入了一种广义的类似轮廓函数来消除隐秘的超参数k，并使用采样技术应用于百万对象数据集 | NA | 开发一种适用于各种生物数据类型的通用且稳健的聚类方法 | 生物数据，包括模拟数据、质谱流式细胞术数据和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 聚类算法 | KMD聚类 | 生物数据 | 百万对象数据集 |
| 16691 | 2024-08-05 |
Deficiency of Complement C3a and C5a receptors Does Not Prevent Angiotensin II-Induced Hypertension and Hypertensive End-Organ Damage
2023-Nov-01, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
|
研究论文 | 该文章探讨了补体C3a和C5a受体在高血压及其导致的肾脏损伤中的作用 | 文章提出C3aR/C5aR1轴在Ang II诱导的高血压中并没有发挥作用，从而挑战了治疗高血压疾病时针对过敏源受体的概念 | 研究主要集中在小鼠模型中，可能无法完全模拟人类高血压的复杂性 | 深入理解针对C3aR和C5aR1受体在高血压治疗中的潜力 | 研究对象为接受手术的高血压患者及小鼠模型 | 数字病理学 | 高血压 | 单细胞测序和免疫组化 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 涉及人类患者和多个小鼠模型的组织样本 |
| 16692 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA Sequencing Reveals Novel Cellular Factors for Response to Immunosuppressive Therapy in Aplastic Anemia
2023-Nov, HemaSphere
IF:7.6Q1
DOI:10.1097/HS9.0000000000000977
PMID:37908861
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了健康对照组和再生障碍性贫血（AA）患者骨髓中的细胞因子，揭示了免疫抑制治疗（IST）反应的潜在细胞标志物。 | 首次使用单细胞RNA测序技术研究AA患者骨髓细胞，发现了与IST反应相关的CD8 T细胞和T细胞激活的细胞间相互作用。 | 研究仅限于诊断时的骨髓样本，未涉及治疗过程中的动态变化。 | 探究再生障碍性贫血的发病机制及免疫抑制治疗的抵抗机制。 | 健康对照组和再生障碍性贫血患者的骨髓细胞。 | 数字病理学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | 健康对照组和AA患者的骨髓样本 |
| 16693 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing revealed potential targets for immunotherapy studies in hepatocellular carcinoma
2023-11-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-46132-w
PMID:37914817
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据构建了肝细胞癌的单细胞全景图谱，并分析了不同细胞在肝细胞癌中的信号通路富集情况和细胞亚群的发展轨迹 | 本研究发现了新的肝细胞癌细胞簇和表达HP的粒细胞簇，这些新发现的细胞簇可能对免疫治疗研究具有潜在意义 | NA | 旨在揭示肝细胞癌的单细胞异质性，并发现新的细胞簇及其在免疫治疗研究中的潜在应用 | 肝细胞癌的肿瘤组织和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 27个肝细胞癌肿瘤组织和4个邻近非肿瘤组织，以及374个TCGA-肝细胞癌样本 |
| 16694 | 2024-08-05 |
In-organoid single-cell CRISPR screening reveals determinants of hepatocyte differentiation and maturation
2023-10-31, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03084-8
PMID:37907970
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于类器官的单细胞CRISPR筛选框架，以揭示肝细胞分化和成熟的遗传决定因素。 | 创新性地使用了调控活性作为读出，以解析类器官中基因敲除的效应，并识别出已知和新发现的正负调节因子 | 在单细胞测序中，由于噪音和掉失，转录因子的表达水平难以准确估计，这限制了关键调节因子的识别 | 全面了解肝细胞分化和成熟的遗传决定因素 | 主要研究成人干细胞衍生的肝类器官及其转录组 | 数字病理学 | NA | CRISPR | NA | 转录组数据 | 80,576个细胞，246个相关干扰 |
| 16695 | 2024-08-05 |
HArmonized single-cell RNA-seq Cell type Assisted Deconvolution (HASCAD)
2023-10-31, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-023-01674-w
PMID:37907883
|
研究论文 | 本文介绍了一种深度神经网络模型HASCAD，用于预测多达15种免疫细胞类型的细胞成分。 | HASCAD使用Harmony-Symphony策略处理批次效应，提供了一种新的细胞成分去卷积方法，优于当前流行的CCD方法。 | 研究中提到的局限性未在摘要中明确列出。 | 研究的目的是优化细胞组成去卷积，以提高对免疫细胞异质性影响的分析能力。 | 研究对象主要是针对免疫细胞类型的细胞成分和肝癌样本的RNA-seq数据。 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA-seq | 深度神经网络 | 基因表达数据 | 包括多个模拟的bulk RNA-seq数据集和三个人类PBMC RNA-seq数据集 |
| 16696 | 2024-08-05 |
Comprehensive analysis reveals XCL2 as a cancer prognosis and immune infiltration-related biomarker
2023-10-30, Aging
DOI:10.18632/aging.205156
PMID:37905956
|
研究论文 | 本研究揭示了XCL2作为癌症预后和免疫浸润相关的生物标志物 | 此研究首次全面分析了XCL2在多种癌症中的表达、预后关系及其在肿瘤免疫微环境中的作用 | 研究对XCL2的功能及其在各种疾病条件下的机制探讨仍然不足 | 探索XCL2在癌症中的作用及其作为潜在生物标志物的可能性 | XCL2在33种癌症中的表达、突变状态及与生存时间的关系 | 数字病理学 | 癌症 | 生物信息学 | NA | 人类样本及孤立癌细胞的实验数据 | 33种癌症相关的样本 |
| 16697 | 2024-08-07 |
Discoveries in Retina Physiology and Disease Biology Using Single-Cell RNA Sequencing
2023-10-19, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2810247
PMID:37919055
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在视网膜生理学和疾病生物学中的应用 | scRNA-seq技术能够详细研究视网膜细胞的复杂动态，揭示细胞亚群及其在疾病发生和进展中的作用 | NA | 深入理解视网膜疾病，特别是通过研究视网膜细胞异质性 | 视网膜细胞及其在疾病中的作用 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 16698 | 2024-08-07 |
Construction and Validation of a Prognostic Model of Metabolism-Related Genes Driven by Somatic Mutation in Bladder Cancer
2023-10-19, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2810242
PMID:37919060
|
研究论文 | 本研究利用生物信息学方法，基于膀胱癌患者的转录组数据，构建并验证了一个由体细胞突变驱动的与代谢相关基因的预后模型 | 本研究构建了一个新的基于临床和分子因素的预后模型，该模型与代谢重编程相关，有望改善膀胱癌患者的独立预后指标预测和管理 | NA | 利用生物信息学方法建立基于代谢相关基因的膀胱癌预后模型，筛选潜在的生物标志物 | 膀胱癌患者的代谢相关基因 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），定量实时聚合酶链反应（qRT-PCR） | Cox回归分析 | 转录组数据 | 201个差异表达的代谢相关基因 |
| 16699 | 2024-08-05 |
[Characterization of Cell Subsets Associated With Prognosis of Osteosarcoma Based on Single-Cell Sequencing Data]
2023-Oct, Zhongguo yi xue ke xue yuan xue bao. Acta Academiae Medicinae Sinicae
DOI:10.3881/j.issn.1000-503X.15573
PMID:37927019
|
研究论文 | 本研究旨在通过分析不同骨肉瘤患者的肿瘤组织样本的细胞组成，探讨与骨肉瘤预后相关的细胞亚群及其特征 | 首次建立了基于巨噬细胞分化的差异表达基因的预后模型，揭示了巨噬细胞亚群与骨肉瘤预后的密切关系 | 研究主要依赖于单细胞测序数据，样本量以及不同患者的异质性可能影响结果的普遍适用性 | 探索与骨肉瘤预后相关的细胞亚群及其特征 | 不同骨肉瘤患者的肿瘤组织样本中的细胞组成 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞测序 | NA | 细胞样本 | 不同骨肉瘤患者的样本 |
| 16700 | 2024-08-07 |
Infernape uncovers cell type-specific and spatially resolved alternative polyadenylation in the brain
2023-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.277864.123
PMID:37907328
|
研究论文 | 本文介绍了Infernape工具，用于从单细胞和空间转录组数据中推断和量化多聚腺苷酸化位点（PA）的使用，并在小鼠大脑中展示了其应用 | Infernape首次系统地揭示了大脑中细胞类型特异性和空间解析的替代多聚腺苷酸化 | NA | 研究大脑中细胞类型特异性和空间分布的差异多聚腺苷酸化位点（PA）的使用 | 小鼠大脑中的多聚腺苷酸化位点（PA） | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序, 空间转录组测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠大脑样本 |