单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 16681 - 16700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16681 | 2024-08-05 |
The developmental dynamics of the human male germline
2023-09-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202046
PMID:37650565
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研究论文 | 本文概述了人类男性生殖细胞的发育动态及其发育过程中的细胞、信号和表观遗传级联事件 | 通过使用各种模型和单细胞测序方法提供了对人类男性生殖细胞发育的新见解 | 在研究人类发育过程时面临挑战，可能导致对某些方面的理解不够全面 | 探讨人类男性生殖细胞的发育动态及其相关机制 | 人类男性生殖细胞及其分化过程 | 生物医学 | 不孕症 | 单细胞测序 | N/A | 细胞数据 | N/A |
| 16682 | 2024-08-07 |
Multiplexed transcriptomic profiling of the fate of human CAR T cells in vivo via genetic barcoding with shielded small nucleotides
2023-09, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-023-01085-3
PMID:37652986
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研究论文 | 本文介绍了一种基于屏蔽小核酸的细胞条形码方法，用于在体内多重纵向分析人类CAR-T细胞的命运，通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）实现。 | 提出了一种名为屏蔽小核酸基础的scRNA-seq（SSN-seq）的新方法，该方法兼容3'和5'单细胞分析，并利用普遍存在的Pol III U6启动子来稳健表达经过直接捕获序列修饰的小RNA条形码。 | NA | 旨在了解CAR-T细胞在体内的命运，以改进嵌合抗原受体（CAR）T细胞的设计。 | 研究对象为人类CAR-T细胞及其在体内的动态状态。 | 生物技术 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 使用了肿瘤再挑战小鼠模型 |
| 16683 | 2024-08-07 |
Scalable production of tissue-like vascularized liver organoids from human PSCs
2023-09, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-023-01074-1
PMID:37653039
|
研究论文 | 本文开发了一种无需二维图案化、不依赖细胞外基质且使用小分子模拟胚胎肝脏发育的方法，生产大量类似肝脏的类器官 | 该方法不依赖二维图案化和细胞外基质，使用小分子模拟胚胎肝脏发育，生产出具有更高细胞复杂性和血管腔结构的肝脏类器官 | NA | 开发更接近生理状态的肝脏类器官模型 | 肝脏类器官的生成和功能 | 组织工程 | NA | 单细胞RNA测序，免疫荧光 | NA | 细胞 | 大量肝脏类器官 |
| 16684 | 2024-08-07 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA sequencing data identifies the characteristics of ferroptosis in lumbar disc herniation
2023-Sep-01, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-023-01216-8
PMID:37653201
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研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞和批量RNA测序数据，识别腰椎间盘突出症中铁死亡的特征 | 首次综合利用单细胞和批量RNA测序数据，深入分析了铁死亡在腰椎间盘突出症中的具体影响和相关生物机制 | NA | 旨在揭示铁死亡在腰椎间盘突出症发病机制中的作用 | 腰椎间盘突出症中的铁死亡相关基因和细胞类型 | 数字病理学 | 腰椎间盘突出症 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, RT-qPCR, CIBERSORT算法 | LASSO, SVM-RFE | RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |
| 16685 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals multiple chemoresistant properties in leukemic stem and progenitor cells in pediatric AML
2023-08-31, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03031-7
PMID:37653425
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学揭示了儿童急性髓性白血病患者中的多种化疗耐药特性 | 发现CD69作为化疗耐药白血病干细胞亚群的潜在生物标志物 | 样本量有限，仅涵盖13名患者，可能影响结果的普遍性 | 研究儿童急性髓性白血病患者的化疗耐药机制 | 研究对象为13名儿童急性髓性白血病患者的骨髓样本 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 13个儿童急性髓性白血病患者的骨髓样本 |
| 16686 | 2024-08-07 |
Development and validation a prognostic model based on natural killer T cells marker genes for predicting prognosis and characterizing immune status in glioblastoma through integrated analysis of single-cell and bulk RNA sequencing
2023-Aug-31, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-023-01217-7
PMID:37650991
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研究论文 | 本文通过综合分析单细胞和批量RNA测序数据，开发并验证了一种基于自然杀伤T细胞标记基因的预测胶质母细胞瘤预后和表征免疫状态的预后模型。 | 本研究首次整合单细胞和批量RNA测序数据，开发了一种包含CD44和TNFSF14两个关键自然杀伤T细胞标记基因的预后预测模型，并初步探讨了不同风险组的免疫微环境。 | NA | 开发一种预后模型，用于预测胶质母细胞瘤患者的预后并表征其免疫状态。 | 胶质母细胞瘤患者的自然杀伤T细胞标记基因及其在肿瘤微环境中的作用。 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序 | LASSO和多元Cox回归分析 | RNA测序数据 | 从Gene Expression Omnibus（GEO）数据库获取的胶质母细胞瘤单细胞RNA测序数据，以及来自The Cancer Genome Atlas（TCGA）和中国胶质瘤基因组图谱（CGGA）数据库的胶质母细胞瘤队列。 |
| 16687 | 2024-08-07 |
Interlukin-4 weakens resistance to stress injury and megakaryocytic differentiation of hematopoietic stem cells by inhibiting Psmd13 expression
2023-08-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-41479-6
PMID:37653079
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研究论文 | 本研究探讨了白细胞介素-4（IL-4）通过抑制Psmd13表达，影响造血干细胞（HSCs）对压力损伤的抵抗力和巨核细胞分化的机制 | 揭示了IL-4-Psmd13信号通路在HSCs抗压力和巨核细胞分化能力中的新调控作用 | NA | 阐明IL-4在急性髓系白血病（AML）中对造血干细胞巨核细胞分化的具体机制 | 造血干细胞（HSCs）和巨核细胞分化 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组 | 来自AML骨髓的HSCs样本 |
| 16688 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the effects of anti-PD-L1 therapy on 3LL lung cancer model and its tumor microenvironment
2023-Aug-31, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-023-02156-w
PMID:37653265
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了抗PD-L1疗法对3LL肺癌模型及其肿瘤微环境的影响 | 首次详细描述了抗PD-L1疗法对肺癌肿瘤微环境的重组，并发现了治疗后肿瘤免疫原性的增强和炎症反应的促进 | NA | 探讨抗PD-L1疗法对肺癌肿瘤微环境的具体影响及其潜在机制 | 3LL肺癌细胞模型及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括肿瘤细胞、基质细胞、髓系细胞、T细胞和NK细胞等五种主要细胞群 |
| 16689 | 2024-08-07 |
scSNPdemux: a sensitive demultiplexing pipeline using single nucleotide polymorphisms for improved pooled single-cell RNA sequencing analysis
2023-Aug-31, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05440-8
PMID:37653401
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scSNPdemux的单细胞RNA测序样本解复用管道，利用人类自然遗传变异进行样本识别 | 该管道在单细胞和单核RNA测序数据集上展示了优于CellPlex和Multi-seq技术的解复用性能，特别是在低RNA含量的免疫细胞类型上表现出更高的敏感性和特异性 | NA | 设计一个简化的单细胞样本解复用管道，旨在克服使用单细胞文库进行样本复用时可能影响数据质量和成本的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 16690 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing reveals the existence of fetal vascular endothelial stem cell-like cells in mouse liver
2023-08-30, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-023-03460-y
PMID:37649114
|
研究论文 | 本研究揭示了小鼠肝脏中胎儿血管内皮干细胞样细胞的存在。 | 首次确定了围产期血管内皮干细胞样细胞的存在及其与成年干细胞样细胞群体的关系。 | 研究仅限于小鼠模型，结果的转化性需要进一步验证。 | 探究围产期血管内皮干细胞样细胞的存在及其发育过程。 | 围产期小鼠肝脏的内皮细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自不同发育阶段的小鼠肝脏内皮细胞，样本分别为E14，E18，P7，P14和W8 |
| 16691 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing to detect age-associated genes that identify senescent cells in the liver of aged mice
2023-08-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-41352-6
PMID:37648885
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，在老年动物肝脏中鉴定出与衰老相关的基因，以识别衰老细胞 | 首次在老鼠肝脏中鉴定出Glipr1、Clec12a和Phlda3作为与年龄相关的基因 | NA | 寻找与年龄相关的基因，以识别老年动物组织中的衰老细胞 | 老年动物肝脏中的衰老细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | mRNA表达数据 | 年轻和老年大鼠的原代肝细胞，27个月大的小鼠原代肝细胞 |
| 16692 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of human non-hematopoietic bone marrow cells reveals a unique set of inter-species conserved biomarkers for native mesenchymal stromal cells
2023-08-30, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-023-03437-x
PMID:37649081
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对人类非造血骨髓细胞进行分析，揭示了原生间充质基质细胞的跨物种保守生物标志物。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术，对人类骨髓中的非造血细胞亚群进行了详细的分类和生物标志物的鉴定，特别是在间充质基质细胞方面，发现了跨物种保守的核心基因。 | 研究仅基于5个骨髓捐献者的样本，样本量相对较小，可能影响结果的普遍性。 | 旨在通过单细胞RNA测序技术，定义人类骨髓中非造血细胞亚群的正确分类，特别是间充质基质细胞。 | 人类骨髓中的非造血细胞亚群，包括内皮细胞、壁细胞和间充质基质细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 5个不同的骨髓捐献者 |
| 16693 | 2024-08-07 |
Combining bulk and single-cell RNA-sequencing data to develop an NK cell-related prognostic signature for hepatocellular carcinoma based on an integrated machine learning framework
2023-Aug-30, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-023-01300-6
PMID:37649103
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研究论文 | 本研究结合批量和单细胞RNA测序数据，基于综合机器学习框架开发了与自然杀伤细胞（NK细胞）相关的肝细胞癌（HCC）预后标志物 | 本研究创新性地结合了批量和单细胞RNA测序数据，并开发了一个包含77种算法的共识机器学习框架，以建立基因标志物，用于预测HCC患者的预后和免疫治疗反应 | NA | 开发一种基于NK细胞相关基因的基因标志物，用于评估HCC患者的预后和免疫治疗反应 | 肝细胞癌（HCC）患者的预后和免疫治疗反应 | 机器学习 | 肝癌 | RNA测序 | 机器学习框架 | RNA测序数据 | 使用了来自TCGA-LIHC、GSE14520、GSE76427和ICGC-LIRI-JP等多个数据集的数据 |
| 16694 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing of a novel model of neonatal bile duct ligation in mice identifies macrophage heterogeneity in obstructive cholestasis
2023-08-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-41207-0
PMID:37644108
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研究论文 | 本文开发了一种新生小鼠胆管结扎的模型，以研究阻塞性胆汁淤积中的巨噬细胞异质性 | 开发了一种创新的新生小鼠阻塞性胆汁淤积模型，展示了病因特异性的巨噬细胞功能 | 与人类数据的进一步比较尚待进行以验证结果 | 研究新生小鼠中阻塞性胆汁淤积的巨噬细胞极化和异质性 | 新生雌性BALB/c小鼠及其在胆管结扎手术后的反应 | 数字病理学 | 阻塞性胆汁淤积 | 单细胞RNA测序 | NA | 实验室数据、组织学、流式细胞术、RNA测序数据 | 新生小鼠，样本数量未具体说明 |
| 16695 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA reveals a tumorigenic microenvironment in the interface zone of human breast tumors
2023-08-29, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-023-01703-7
PMID:37644609
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术探索了人乳腺癌肿瘤界面区域的微环境异质性和特征 | 首次详细描述了乳腺癌肿瘤界面区域的独特肿瘤生成微环境，包括特定细胞类型及其相互作用 | NA | 深入了解乳腺癌肿瘤微环境，为乳腺癌的诊断和治疗提供资源 | 乳腺癌肿瘤界面区域的细胞类型及其转录特征 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 88,548个高质量细胞 |
| 16696 | 2024-08-07 |
Remibrutinib (LOU064) inhibits neuroinflammation driven by B cells and myeloid cells in preclinical models of multiple sclerosis
2023-Aug-26, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-023-02877-9
PMID:37633912
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研究论文 | 本文研究了Remibrutinib（LOU064）在多发性硬化症（MS）的两种实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）小鼠模型中抑制B细胞和髓样细胞驱动的神经炎症的效果和机制 | Remibrutinib通过抑制病理性B细胞自身反应和微胶质细胞的直接抗炎作用，显示出对EAE模型的双重抑制机制 | NA | 评估Remibrutinib在多发性硬化症的两种EAE小鼠模型中的疗效和作用机制 | Remibrutinib对B细胞和髓样细胞驱动的神经炎症的影响 | NA | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 组织 | 两种EAE小鼠模型 |
| 16697 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals small extracellular vesicles derived from malignant cells that contribute to angiogenesis in human breast cancers
2023-08-25, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04438-3
PMID:37626402
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了来源于恶性细胞的小型细胞外囊泡在乳腺癌中的促进血管生成作用 | 该研究首次揭示了乳腺癌恶性细胞衍生的小型细胞外囊泡通过PPP1R1B激活内皮细胞，促进血管生成的机制 | 样本量较小，仅来自八名乳腺癌患者，结果可能存在个体差异 | 研究乳腺癌微环境中细胞的异质性及其在血管生成中的作用 | 研究乳腺癌患者体内肿瘤内皮细胞和恶性细胞的相互作用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 八名乳腺癌患者的组织样本 |
| 16698 | 2024-08-07 |
A transcriptional response to replication stress selectively expands a subset of Brca2-mutant mammary epithelial cells
2023-08-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40956-w
PMID:37626143
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研究论文 | 研究报告了单等位基因Brca2乳腺类器官在复制压力下激活的转录反应，该反应选择性扩增了缺乏激素受体表达的Brca2腔细胞（HR-）。 | 首次揭示了Brca2突变在乳腺上皮亚群中的影响，特别是HR-腔细胞在复制压力下的选择性扩增。 | 研究主要集中在体外乳腺类器官模型，可能需要进一步的体内研究来验证这些发现。 | 探究BRCA2突变如何影响乳腺上皮细胞亚群，特别是在复制压力下的转录反应。 | Brca2突变乳腺上皮细胞及其在复制压力下的转录反应。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（ScRNA-seq），流式细胞术（CyTOF） | CRISPR/Cas9 | 单细胞RNA测序数据 | 涉及Brca2突变和野生型乳腺类器官的比较分析 |
| 16699 | 2024-08-07 |
Comprehensive analysis on subchondral bone marrow lesions of human osteoarthritis by integrating bulk and single-cell transcriptomes
2023-Aug-25, BMC musculoskeletal disorders
IF:2.2Q3
DOI:10.1186/s12891-023-06676-4
PMID:37626330
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研究论文 | 本研究旨在通过整合批量和单细胞转录组数据，全面分析人类骨关节炎中软骨下骨髓病变（BMLs）的细胞组成和潜在机制 | 本研究首次通过批量和单细胞转录组数据分析，揭示了BMLs中的核心枢纽基因及其分子网络，并发现了BMLs中丰富的异位软骨细胞群 | NA | 展示膝关节骨关节炎（OA）中软骨下骨髓病变（BMLs）的细胞组成和潜在机制 | 软骨下骨髓病变（BMLs） | 数字病理学 | 骨关节炎 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括3个OA-BML样本，3个配对的OA-NBML样本和3个非OA样本 |
| 16700 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing and Microarray Analysis Reveal the Role of Lipid-Metabolism-Related Genes and Cellular Immune Infiltration in Pre-Eclampsia and Identify Novel Biomarkers for Pre-Eclampsia
2023-Aug-21, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines11082328
PMID:37626824
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和微阵列分析，揭示了脂质代谢相关基因和细胞免疫浸润在先兆子痫中的作用，并识别了新的先兆子痫生物标志物 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术，结合微阵列分析，深入探讨了脂质代谢相关基因与免疫浸润在先兆子痫发病机制中的作用，并识别了新的生物标志物 | 研究主要集中在脂质代谢相关基因和免疫浸润的分析，未涉及其他可能的病理机制；样本量和数据集的多样性可能限制了结果的普遍性 | 旨在识别脂质代谢相关基因并研究其与免疫浸润的关联，以揭示先兆子痫的分子机制 | 先兆子痫患者的脂质代谢相关基因和细胞免疫浸润 | 数字病理学 | 妊娠疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 20个细胞集群，186个差异表达基因 |