单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 16641 - 16660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16641 | 2024-08-05 |
Liver Injury and Regeneration: Current Understanding, New Approaches, and Future Perspectives
2023-08-22, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12172129
PMID:37681858
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研究论文 | 这篇文章探讨了肝脏损伤和再生的当前理解、创新方法以及未来展望 | 文章强调了基因编辑、组织工程、干细胞分化等领域的最新进展在肝再生研究中的重要性 | 文章未具体提及实验数据或样本量，这可能限制了结论的广泛适用性 | 研究肝脏损伤和再生的细胞和分子机制，以开发有效的肝病治疗方法 | 解析肝脏损伤和再生过程中的信号通路、细胞类型和基质成分 | 数字病理 | 肝病 | 基因编辑、干细胞分化、单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 16642 | 2024-08-05 |
Bulk RNA-Seq Combined with Single-Cell Transcriptome Sequencing Reveals the Possible Mechanisms by Which HDGFL3 Involves in Prostate Cancer Growth and Metastasis
2023-Aug, Archivos espanoles de urologia
IF:0.6Q4
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研究论文 | 本研究探讨了肝细胞癌衍生生长因子样3（HDGFL3）在前列腺癌生长和转移中的分子机制 | 识别出HDGFL3作为内皮细胞的关键基因，可能刺激肿瘤血管生成以增强前列腺癌的生长和扩散 | 该研究可能缺乏大规模临床验证以确认结果 | 探索HDGFL3在前列腺癌发育和转移中的作用机制 | 研究对象包括前列腺癌细胞系及相关的基因表达数据 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序，RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及的样本包括前列腺癌细胞系PC-3和DU145及小鼠模型 |
| 16643 | 2024-08-07 |
Identification and validation of biomarkers for epithelial-mesenchymal transition-related cells to estimate the prognosis and immune microenvironment in primary gastric cancer by the integrated analysis of single-cell and bulk RNA sequencing data
2023-06-16, Mathematical biosciences and engineering : MBE
DOI:10.3934/mbe.2023614
PMID:37679111
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，识别和验证了与上皮-间质转化（EMT）相关细胞的生物标志物，用于预测原发性胃癌的预后和免疫微环境 | 首次通过整合单细胞和批量RNA测序数据，构建并验证了与EMT相关细胞的预后基因标志物（ERCPG） | NA | 旨在通过分析胃癌患者的单细胞和批量RNA测序数据，识别和验证与EMT相关细胞的生物标志物，以预测患者的预后和肿瘤的免疫微环境 | 胃癌患者的单细胞和批量RNA测序数据 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 来自胃癌患者的肿瘤样本 |
| 16644 | 2024-08-05 |
Upregulated CD8+ MAIT cell differentiation and KLRD1 gene expression after inactivated SARS-CoV-2 vaccination identified by single-cell sequencing
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1174406
PMID:37654490
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研究论文 | 这项研究分析了灭活新冠病毒疫苗接种后T细胞的动态和转录组基因表达 | 通过单细胞测序技术揭示了CD8+ MAIT细胞分化和KLRD1基因表达的上调 | 研究仅基于三名参与者的数据，样本量较小 | 探讨灭活新冠病毒疫苗接种后T细胞亚群的特征和机制 | 三名参与者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 三名参与者的外周血单核细胞在四个时间点提取 |
| 16645 | 2024-08-05 |
Helicase-like transcription factor (HLTF)-deleted CDX/TME model of colorectal cancer increased transcription of oxidative phosphorylation genes and diverted glycolysis to boost S-glutathionylation in lymphatic intravascular metastatic niches
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0291023
PMID:37682902
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研究论文 | 本研究探讨了缺失赫利卡酶样转录因子（HLTF）对结直肠癌的影响，发现其与代谢重编程和淋巴血管转移微环境中的S-谷胱甘肽化相关 | 首次展示了HLTF缺失在癌细胞及肿瘤微环境中的代谢重编程，减轻了淋巴血管转移微环境中的氧化应激 | 研究中未探讨肠道微生物组的多样性对代谢的潜在影响 | 研究HLTF缺失对结直肠癌细胞代谢及其微环境的作用 | 缺失HLTF的结直肠癌细胞与肿瘤微环境中的内皮细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序，空间转录组学，2D DIGE，MALDI-TOF/TOF质谱 | 细胞系源性异种移植模型（CDX） | 转录组数据，蛋白质组数据 | NA |
| 16646 | 2024-08-05 |
Identification and comprehensive analysis of super-enhancer related genes involved in epithelial-to-mesenchymal transition in lung adenocarcinoma
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0291088
PMID:37669296
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研究论文 | 该文章探讨了与肺腺癌上皮到间充质转化（EMT）相关的超增强子基因及其影响 | 文章首次识别出与肺腺癌EMT相关的超增强子调控基因，并建立了相应的预测模型 | 样本量虽然较大，但可能仍不足以全面代表所有肺腺癌患者的情况 | 探讨超增强子相关基因对肺腺癌肿瘤发展的影响 | 本研究的对象为肺腺癌中的TMSB10基因及其表达群体 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序，TCGA数据库分析 | 随机森林 | 基因表达数据 | 513个肺腺癌样本 |
| 16647 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals distinct chondrocyte states in femoral cartilage under weight-bearing load in Rheumatoid arthritis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1247355
PMID:37654485
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了类风湿性关节炎中承受体重负荷的股骨软骨中软骨细胞的不同状态 | 发现了两种新的与免疫相关的软骨细胞亚型，并验证了它们在承受体重负荷和非承受体重负荷区域的分布 | NA | 探究类风湿性关节炎中体重负荷对股骨软骨中软骨细胞状态的影响 | 类风湿性关节炎中股骨软骨的软骨细胞 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 共分析了87,542个细胞，分为9个集群，最终鉴定出6个软骨细胞亚群 |
| 16648 | 2024-08-07 |
Molecular techniques drive cutting edge advancements in management of cutaneous T cell lymphoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1228563
PMID:37654486
|
研究论文 | 本文探讨了分子技术在皮肤T细胞淋巴瘤（CTCL）诊断和治疗中的最新进展 | 介绍了通过流式细胞术、聚合酶链反应、高通量测序等分子技术在CTCL早期检测和基因表达模式识别中的应用 | 目前CTCL的诊断主要依赖临床表现、组织病理学和免疫组织化学，这些方法在敏感性和特异性上存在局限 | 提高CTCL的诊断和治疗效果 | 皮肤T细胞淋巴瘤（CTCL） | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 高通量测序 | NA | 基因表达数据 | 单细胞RNA测序 |
| 16649 | 2024-08-07 |
Mitochondrial energy metabolism correlates with an immunosuppressive tumor microenvironment and poor prognosis in esophageal squamous cell carcinoma
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.08.022
PMID:37664173
|
研究论文 | 本研究探讨了线粒体能量代谢（MEM）在食管鳞状细胞癌（ESCC）肿瘤微环境（TME）中的作用及其与预后的关系 | 首次研究了MEM在ESCC的TME中的作用，并发现了可能的新药物靶点 | 研究样本量较小，仅基于15名患者的cDNA微阵列数据 | 探讨线粒体能量代谢在食管鳞状细胞癌肿瘤微环境中的作用及其对预后的影响 | 食管鳞状细胞癌的肿瘤微环境及其线粒体能量代谢 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 15名食管鳞状细胞癌患者 |
| 16650 | 2024-08-07 |
Revealing the role of regulatory T cells in the tumor microenvironment of lung adenocarcinoma: a novel prognostic and immunotherapeutic signature
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1244144
PMID:37671160
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析，探讨了调节性T细胞在肺腺癌肿瘤微环境中的作用及其作为预后和免疫治疗标志物的潜力 | 首次构建了基于调节性T细胞标志物的风险模型，用于区分肺腺癌患者的风险亚组，并探讨了免疫治疗在不同风险组中的潜在益处 | NA | 研究调节性T细胞在肺腺癌肿瘤微环境中的作用及其作为预后和免疫治疗标志物的潜力 | 调节性T细胞及其在肺腺癌肿瘤微环境中的相互作用 | NA | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 多个肺腺癌队列 |
| 16651 | 2024-08-07 |
Exploring the optimization of autoencoder design for imputing single-cell RNA sequencing data
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.07.041
PMID:37671239
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研究论文 | 本文探讨了如何优化自编码器设计以填补单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据的稀疏性问题 | 研究结果表明，更深且更窄的自编码器通常能带来更好的填补性能，sigmoid和tanh激活函数优于ReLU等常用函数，且正则化能提高填补准确性和下游细胞聚类及差异表达基因分析 | NA | 旨在解决单细胞RNA测序数据中的稀疏性问题 | 自编码器的神经网络架构、激活函数和正则化策略对填补精度和下游分析的影响 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 自编码器 | scRNA-seq数据 | 使用了多个真实和模拟的scRNA-seq数据集 |
| 16652 | 2024-08-07 |
Single Cell RNA-Sequencing in Arabidopsis Root Tissues
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3354-0_4
PMID:37682468
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研究论文 | 本文描述了使用基于液滴的单细胞RNA测序（scRNA-seq）处理拟南芥根组织并生成单细胞转录组的方法 | 利用scRNA-seq技术，提供了前所未有的分辨率进行转录组分析，有助于深入理解组织的细胞异质性、发育进程、应激反应动态等 | NA | 介绍和建立基于液滴的单细胞RNA测序工作流程 | 拟南芥根组织 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 16653 | 2024-08-07 |
Gene Regulatory Network Modeling Using Single-Cell Multi-Omics in Plants
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3354-0_16
PMID:37682480
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研究论文 | 本文描述了一种用于分析单细胞数据以构建基因调控网络的计算流程 | 利用单细胞多组学技术在植物细胞中表征基因表达和开放染色质区域 | NA | 开发和测试一种计算流程，用于从单细胞多组学数据中构建基因调控网络 | 植物细胞中的基因表达和开放染色质区域 | 机器学习 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 单细胞数据 | 使用了模式物种拟南芥的数据 |
| 16654 | 2024-08-07 |
Maternal and embryonic signals cause functional differentiation of luminal epithelial cells and receptivity establishment
2023-11-06, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.08.004
PMID:37643613
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了怀孕小鼠子宫内膜上皮细胞在受精后2.5至4.5天的功能分化，并探讨了母体和胚胎信号对这一过程的影响。 | 首次揭示了母体和胚胎信号如何促进子宫内膜上皮细胞分化为粘附性上皮细胞和支持性上皮细胞，并探讨了这些细胞在人类和鼠类中的保守性。 | NA | 研究母体和胚胎信号如何影响子宫内膜上皮细胞的功能分化，以及这一过程在人类和鼠类中的保守性。 | 怀孕小鼠的子宫内膜上皮细胞及其在胚胎植入过程中的功能分化。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 怀孕小鼠的子宫内膜上皮细胞样本 |
| 16655 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics of a giant pilomatricoma
2023-Nov, Journal of cutaneous pathology
IF:1.6Q3
DOI:10.1111/cup.14524
PMID:37649312
|
研究论文 | 主张通过空间转录组学分析描述一个巨型毛乳头瘤病例 | 首次通过10X空间基因表达分析揭示了巨型毛乳头瘤的转录组簇特征 | 只描述了一个患者的个案，缺乏更多样本的验证 | 探索巨型毛乳头瘤的分子特征及其转录组的异质性 | 一名67岁男性的8cm巨型毛乳头瘤 | 数字病理学 | NA | 10X空间基因表达分析 | NA | 转录组数据 | 1个样本 |
| 16656 | 2024-08-07 |
Prognostic and immunological role of cancer-associated fibroblasts-derived exosomal protein in esophageal squamous cell carcinoma
2023-Nov, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.110837
PMID:37634448
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研究论文 | 本研究探讨了癌症相关成纤维细胞（CAFs）衍生的外泌体蛋白在食管鳞状细胞癌（ESCC）中的预后和免疫学作用。 | 首次揭示了CAFs衍生的外泌体蛋白在ESCC中的具体功能和预后意义。 | 研究主要基于体外实验和数据库分析，未来需要更多的临床验证。 | 研究CAFs衍生的外泌体蛋白在ESCC中的影响及其预后意义。 | 癌症相关成纤维细胞（CAFs）和食管鳞状细胞癌（ESCC）。 | 数字病理学 | 食管癌 | 液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS） | Lasso回归分析 | 蛋白质 | 842种差异表达的外泌体蛋白 |
| 16657 | 2024-08-07 |
High urea induces anxiety disorders associated with chronic kidney disease by promoting abnormal proliferation of OPC in amygdala
2023-Oct-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2023.175905
PMID:37640220
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研究论文 | 本研究探讨了高尿素水平通过促进杏仁核中少突胶质细胞前体细胞（OPC）的异常增殖，导致慢性肾脏病（CKD）患者焦虑障碍的病理作用及分子机制 | 首次揭示了高尿素在CKD相关焦虑障碍中的病理作用及其分子机制，并提供了客观的血清学指标和潜在的新药物靶点 | NA | 研究高尿素在慢性肾脏病相关焦虑障碍中的病理作用及其分子机制 | 慢性肾脏病患者的焦虑障碍及高尿素的影响 | 神经科学 | 慢性肾脏病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 使用腺嘌呤诱导的CKD小鼠模型和UT-B小鼠模型进行研究 |
| 16658 | 2024-08-07 |
Thyroid hormone receptor α1: a novel regulator of thyroid cancer cell differentiation
2023-10, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-023-02815-2
PMID:37634007
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研究论文 | 本文探讨了甲状腺激素受体α1（TRα1）在甲状腺癌细胞分化中的作用 | 发现TRα1通过调节PAX8基因表达和多条信号通路抑制甲状腺癌细胞生长，并促进细胞分化 | NA | 研究TRα1在甲状腺癌中的功能及其作为治疗靶点的潜力 | 甲状腺癌细胞分化 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞转录组分析（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用了两个甲状腺癌细胞系THJ-11T和THJ-16T，以及它们的TRα1表达细胞 |
| 16659 | 2024-08-07 |
Polyploid tubular cells initiate a TGF-β1 controlled loop that sustains polyploidization and fibrosis after acute kidney injury
2023-10-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00081.2023
PMID:37642236
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研究论文 | 本研究探讨了急性肾损伤后多倍体管状细胞在纤维化过程中的作用及其分子机制 | 首次揭示了多倍体管状细胞通过TGF-β1信号通路维持自身多倍体化和促进纤维化的自我维持机制 | NA | 阐明多倍体管状细胞在急性肾损伤后纤维化过程中的作用及其分子机制 | 多倍体管状细胞及其在急性肾损伤后的生存和纤维化作用 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用转基因小鼠模型和单细胞RNA测序技术进行研究 |
| 16660 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing analysis revealed malignant ductal cell heterogeneity and prognosis signatures in pancreatic cancer
2023-Oct, Clinics and research in hepatology and gastroenterology
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.clinre.2023.102200
PMID:37643692
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了胰腺癌中的恶性导管细胞异质性及其预后标志物 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了胰腺癌中导管细胞的两个主要亚群（S100A6+细胞和FXYD2+细胞），并发现了与肿瘤发展相关的不同通路，同时整合了批量和单细胞RNA测序数据以生成和验证胰腺癌患者的总体生存预后标志物 | NA | 探索胰腺癌中的恶性导管细胞异质性及其预后标志物 | 胰腺癌中的导管细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |