单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
16621 2024-08-07
SARS-CoV-2 receptor ACE2 is upregulated by fatty acids in human MASH
2024-Jan, JHEP reports : innovation in hepatology IF:9.5Q1
研究论文 本文研究了代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)中SARS-CoV-2受体ACE2的表达及其细胞来源 首次揭示了脂肪酸在人类MASLD中上调ACE2表达的现象 NA 探讨MASLD患者中SARS-CoV-2受体ACE2的表达水平及其细胞来源 人类MASLD患者的肝脏组织 NA 脂肪性肝病 转录组学, 免疫组织化学, 单细胞RNA测序 NA 转录组数据, 图像 243个MASLD样本, 161个纤维炎症性肝病样本, 9个脂肪肝样本, 7个对照样本, 5个肝硬化样本, 14个正常肝脏样本, 745个初级细胞样本
16622 2024-08-05
Visium spatial transcriptomics reveals intratumor heterogeneity and profiles of Gleason score progression in prostate cancer
2023-Dec-15, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究利用Visium空间转录组学分析前列腺癌组织的转录组特征,揭示了肿瘤内异质性及Gleason评分的进展特征 首次通过空间转录组学系统分析前列腺癌不同Gleason评分的组织异质性和基因表达模式 样本数量较少,可能影响结果的普适性和可靠性 研究前列腺癌Gleason评分进展过程中的转录组表达模式 四个具有不同Gleason评分的前列腺癌组织样本 数字病理学 前列腺癌 空间转录组学 NA 转录组数据 四个前列腺癌组织样本
16623 2024-08-07
A single-cell atlas of the peripheral immune response in patients with influenza A virus infection
2023-Dec-15, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了流感A病毒感染患者外周血免疫反应的细胞亚型和分子特征 首次详细描述了流感A病毒感染患者中特定免疫细胞亚群的IFN-α诱导蛋白27(IFI27)的显著上调,并识别出与IFN信号相关的特定中性粒细胞亚群 NA 深入理解流感A病毒感染患者外周血免疫反应的细胞亚型和分子特征 流感A病毒感染患者的外周血免疫细胞 数字病理学 流感 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞全血(scWB) 来自不同人群的单细胞全血样本
16624 2024-08-07
Deciphering the role of immunoglobulin secreting malignant lineages in the invasive frontiers of small cell lung cancer by scRNA-seq and spatial transcriptomics analysis
2023-Dec-12, Cell discovery IF:13.0Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
16625 2024-08-05
Increased PAFAH1B3 was associated with poor prognosis and T-cell exhaustion microenvironment in hepatocellular carcinoma
2023-Dec-08, Discover. Oncology
研究论文 这篇文章探讨了PAFAH1B3与肝细胞癌中的T细胞耗竭的关系。 提出PAFAH1B3是肝细胞癌患者预后不良的独立效应因子,并与肿瘤微环境中的T细胞耗竭密切相关。 可能未涵盖所有相关的生物标志物或者机制。 研究PAFAH1B3在肝细胞癌中的作用以及其与T细胞耗竭的关联。 肝细胞癌患者的临床样本和公共数据集中的肿瘤样本。 数字病理学 肝癌 qRT-PCR, 免疫组化, 单细胞RNA测序 NA 组织样本 50对临床组织切片样本
16626 2024-08-07
Single-cell RNA sequencing in cancer research: discovering novel biomarkers and therapeutic targets for immune checkpoint blockade
2023-Dec-08, Cancer cell international IF:5.3Q1
综述 本文综述了单细胞RNA测序技术在癌症研究中的应用,特别是在发现免疫检查点阻断疗法的新生物标志物和治疗靶点方面 单细胞RNA测序技术能够揭示单个细胞的基因表达谱,有助于高分辨率地研究肿瘤微环境的异质性 NA 探讨单细胞RNA测序技术在免疫检查点阻断疗法中的应用,以发现新的生物标志物和治疗靶点 癌症患者的肿瘤微环境及其对免疫检查点阻断疗法的反应 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA
16627 2024-08-07
Characterization of the cellular heterogeneity and bone regenerative potential of cultured human periosteal cells
2023-Dec, Regenerative therapy IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了培养的人骨膜细胞的细胞异质性及其骨再生潜力 首次揭示了培养的人骨膜细胞在不同培养区域的组成多样性及其不同的成骨能力 NA 旨在通过单细胞RNA测序技术表征培养的人骨膜细胞的异质性,并研究其在体内的成骨潜力 培养的人骨膜细胞 细胞生物学 骨骼疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 使用了通过组织移植方法培养的人骨膜细胞,并在大鼠皮下植入模型中进行了实验
16628 2024-08-07
A deep lung cell atlas reveals cytokine-mediated lineage switching of a rare cell progenitor of the human airway epithelium
2023-Nov-29, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过构建深度肺细胞图谱,分析了311,748个单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据,揭示了人类气道中罕见的细胞前体及其在成熟tuft细胞分化中的作用 发现了罕见的双能前体细胞,即tuft-ionocyte前体细胞(TIP细胞),并揭示了其在哮喘和囊性纤维化中的免疫信号通路对细胞分化的影响 研究样本来自无法用于器官移植的捐赠肺,可能存在一定的局限性 识别人类气道中的罕见细胞前体并定义其与成熟tuft细胞的谱系关系 人类气道中的罕见上皮细胞及其在呼吸疾病中的作用 数字病理学 哮喘 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 311,748个单细胞RNA测序数据
16629 2024-08-07
Spatial Distribution of Non-Immune Cells Expressing Glycoprotein A Repetitions Predominant in Human and Murine Metastatic Lymph Nodes
2023-Nov-28, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 本文研究了人及小鼠转移性淋巴结中表达糖蛋白A重复序列主要成分(GARP)的非免疫细胞的空间分布 首次提供了人及小鼠淋巴结中GARP的分布图 NA 探讨GARP在非免疫细胞中的表达及其在转移性淋巴结中的分布 人及小鼠转移性淋巴结中的非免疫细胞 数字病理学 NA scRNA-Seq NA 单细胞RNA测序数据 人及小鼠的转移性淋巴结样本
16630 2024-08-05
Exploring the Prognostic Significance and Immunotherapeutic Potential of Single-Cell Sequencing-Identified Long Noncoding RNA (LncRNA) in Patients With Non-small Cell Lung Cancer
2023-Nov, Cureus
研究论文 本研究分析了非小细胞肺癌患者的长非编码RNA与免疫治疗之间的关系 本研究首次识别出28个具有预后风险特征的lncRNA,并探讨了它们在非小细胞肺癌中的免疫逃逸与免疫治疗的潜在作用 研究中未观察到干细胞指数mRNAsi与总体生存之间的强相关性 探索单细胞测序识别的长非编码RNA在非小细胞肺癌患者中的预后意义及免疫治疗潜力 研究对象为非小细胞肺癌患者,分析其lncRNA与预后风险的关系 数字病理学 非小细胞肺癌 单细胞RNA测序 Cox回归模型 基因表达数据 数据来自癌症基因组图谱(TCGA),具体样本数量未明确说明
16631 2024-08-05
Single-cell profiling reveals preferential reduction of memory B cell subsets in cladribine patients that correlates with treatment response
2023, Therapeutic advances in neurological disorders IF:4.7Q1
研究论文 该文章研究了克拉地宾对记忆B细胞亚群的影响及其与治疗反应的相关性 该研究首次详细描述了克拉地宾对记忆B细胞的持久影响及其潜在的免疫调节作用 本研究仅涉及小规模的样本,且为单臂研究设计 深入理解克拉地宾对多发性硬化症患者的免疫反应及其治疗效果 23名接受克拉地宾治疗的多发性硬化症患者 数字病理学 多发性硬化症 流式细胞术,RNA测序,单细胞RNA测序 NA 血液样本 23名多发性硬化症患者
16632 2024-08-05
Up-regulated SPP1 increases the risk from IPF to lung cancer via activating the pro-tumor macrophages
2023, Computational and structural biotechnology journal IF:4.4Q2
研究论文 本研究旨在调查特发性肺纤维化(IPF)到肺癌(LC)的发病机制,并开发预测因子来检测易患LC的IPF患者 通过识别42个与免疫功能相关的病理基因,并开发了一个包含五个基因的LC风险分类器,这是本研究的创新之处 研究中未提及样本的多样性或外部验证的结果 探讨IPF向LC转变的机制并开发相应风险预测工具 特发性肺纤维化患者 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序(Single-cell RNA-seq) NA 基因数据 NA
16633 2024-08-07
Retracted: Identification of the Immune Status of Hypertrophic Cardiomyopathy by Integrated Analysis of Bulk- and Single-Cell RNA Sequencing Data
2023, Computational and mathematical methods in medicine
correction 该文章已被撤回 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
16634 2024-08-07
Fangji Dihuang formulation ameliorated DNCB-induced atopic dermatitis-like skin lesions by IL-17 signaling pathway: integrating network analysis and experimental validation
2023, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 本研究探讨了方剂地黄汤通过IL-17信号通路改善DNCB诱导的特应性皮炎样皮肤病变的作用,并结合网络分析和实验验证 首次研究了方剂地黄汤的抗特应性皮炎活性,并通过网络药理学分析揭示了其核心作用通路为IL-17信号通路 研究主要集中在小鼠模型上,尚未在人体中进行临床试验 研究方剂地黄汤的抗特应性皮炎活性及其作用机制 方剂地黄汤对DNCB诱导的特应性皮炎样皮肤病变的影响 中医药 特应性皮炎 UHPLC-Q-Exactive Orbitrap MS, 单细胞RNA测序, rt-PCR, 流式细胞术 NA RNA测序数据 小鼠模型
16635 2024-08-07
Age-Related Alterations in Peripheral Immune Landscape with Magnified Impact on Post-Stroke Brain
2023, Research (Washington, D.C.)
研究论文 研究了老年小鼠外周血中免疫衰老的特征及其对缺血性中风后大脑免疫环境的影响 首次综合使用单细胞RNA测序、时间飞行流式细胞术和多种免疫学检测方法,揭示了老年小鼠外周血中免疫衰老的具体特征及其对中风后大脑免疫环境的影响 NA 探究免疫衰老对老年小鼠缺血性中风后大脑免疫环境的影响 老年小鼠的外周血和大脑免疫环境 免疫学 中风 单细胞RNA测序、时间飞行流式细胞术 NA 细胞 老年小鼠
16636 2024-08-05
IL-27 produced during acute malaria infection regulates Plasmodium-specific memory CD4+ T cells
2023-Dec-07, EMBO molecular medicine IF:9.0Q1
研究论文 该文章探讨了IL-27在急性疟疾感染中对特定CD4+ T细胞记忆的调节作用 文章揭示了IL-27如何抑制特定Th1记忆前体CD4 T细胞的发展,为疫苗研发提供了新的启示 没有提及实验的具体局限性 研究IL-27对急性疟疾感染中CD4 T细胞反应的影响 主要研究Plasmodium特异性CD4 T细胞的反应和功能 免疫学 疟疾 单细胞RNA测序 NA 细胞 IL-27中和的鼠模型
16637 2024-08-05
Ex vivo tissue perturbations coupled to single-cell RNA-seq reveal multilineage cell circuit dynamics in human lung fibrogenesis
2023-12-06, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 该研究通过单细胞RNA测序和组织扰动揭示了人类肺纤维化中的多谱系细胞电路动态 本研究结合了人类精密切割肺片的细胞因子和药物扰动,以单细胞RNA测序为基础,首次证实了肺纤维化中多谱系细胞状态的动态变化 组织模型的构建和分析技术的局限性可能影响对肺纤维化机制的全面理解 探究人类肺组织中的再生和纤维化机制 研究对象主要是人类肺组织切片,以及不同阶段的肺纤维化患者组织 数字病理学 肺纤维化 单细胞RNA测序 NA 组织切片 涉及多个临床队列的肺纤维化患者组织
16638 2024-08-05
Single-cell histone chaperones patterns guide intercellular communication of tumor microenvironment that contribute to breast cancer metastases
2023-Dec-06, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 本研究探讨了组蛋白伴随蛋白在肿瘤微环境中的作用及其对乳腺癌转移的影响 首次揭示了组蛋白伴随蛋白主导的肿瘤微环境细胞间通讯对乳腺癌转移的贡献 未具体提及多种肿瘤微环境因素的交互作用 研究组蛋白伴随蛋白在乳腺癌转移中的作用及其机制 乳腺癌患者的肿瘤微环境细胞群 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因组数据 来自6名乳腺癌患者的样本
16639 2024-08-07
Immune checkpoints are predominantly co-expressed by clonally expanded CD4+FoxP3+ intratumoral T-cells in primary human cancers
2023-Dec-06, Journal of experimental & clinical cancer research : CR IF:11.4Q1
研究论文 本文通过多参数流式细胞术和单细胞RNA测序(scRNA-Seq)结合TCR测序,研究了原发性人类肿瘤中肿瘤浸润T细胞的免疫检查点蛋白表达情况 本文揭示了免疫检查点蛋白主要由肿瘤内克隆扩增的CD4+FoxP3+ T细胞共表达,这一发现有助于设计未来的新辅助癌症免疫治疗试验 本文的研究主要基于流式细胞术和scRNA-Seq技术,这些技术在评估免疫细胞亚群的膜蛋白表达方面可能不够敏感和特异 描述原发性实体瘤中肿瘤内T细胞的免疫检查点蛋白表达,以更好地设计新辅助癌症免疫治疗试验 原发性人类肿瘤中的肿瘤内T细胞 数字病理学 NA 流式细胞术,单细胞RNA测序(scRNA-Seq) NA 细胞 多种组织类型的原发性人类肿瘤样本
16640 2024-08-05
Senescence-associated secretory phenotypes in mesenchymal cells contribute to cytotoxic immune response in oral lichen planus
2023-Dec-05, Immunity & ageing : I & A IF:5.2Q1
研究论文 这项研究提供了老年相关分泌表型在口腔扁平苔藓中对细胞毒性免疫反应的贡献的证据 首次证明了老年间充质细胞在口腔扁平苔藓中的积累对CD8+ T细胞和自然杀伤细胞的影响 该研究主要基于数据库分析,尚需进一步验证实验证明这些发现 探讨口腔扁平苔藓中老年相关分泌表型的作用及其对免疫反应的影响 口腔扁平苔藓患者的组织样本 数字病理学 口腔扁平苔藓 单细胞RNA测序 NA 组织样本 NA
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