单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
16601	2024-08-07	Unravelling the imbalanced Th17-like cell differentiation by single-cell RNA sequencing in multiple myeloma 2023-Nov, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2023.110852 PMID:37657245	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了多发性骨髓瘤患者和健康个体骨髓样本中CD4 T细胞的转录组特征，揭示了Th17样细胞分化的不平衡现象及其与多发性骨髓瘤的关联。	首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了多发性骨髓瘤中Th17样细胞分化的不平衡现象，并探讨了相关的分子机制和细胞间相互作用。	研究样本量较小，仅包括3名健康个体和10名多发性骨髓瘤患者，可能影响结果的普遍性。	揭示多发性骨髓瘤中Th17样细胞分化的不平衡模式及其与免疫抑制特征的关联。	多发性骨髓瘤患者的骨髓样本中的CD4 T细胞。	数字病理学	多发性骨髓瘤	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	3名健康个体和10名多发性骨髓瘤患者的骨髓样本
16602	2024-08-07	Single-cell profiling reveals the heterogeneity of NK cells during anti-PD-1 therapy in non-small-cell lung cancer 2023-Nov, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2023.110743 PMID:37657247	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析，揭示了非小细胞肺癌中自然杀伤细胞在抗PD-1治疗期间的异质性	首次详细描述了非小细胞肺癌患者在接受抗PD-1治疗期间，自然杀伤细胞的不同亚群及其与治疗反应的关系	研究仅基于单细胞转录组数据，未涉及其他类型的生物标志物或临床数据	探讨自然杀伤细胞在非小细胞肺癌抗PD-1治疗中的作用及其对治疗效果的影响	非小细胞肺癌患者在接受抗PD-1治疗期间的自然杀伤细胞	数字病理学	肺癌	单细胞转录组分析	NA	转录组数据	来自接受抗PD-1治疗的非小细胞肺癌患者的活检样本
16603	2024-08-07	VDR is an essential regulator of hair follicle regression through the progression of cell death 2023-11, Life science alliance IF:3.3Q1 DOI:10.26508/lsa.202302014 PMID:37673445	研究论文	研究探讨了维生素D受体（VDR）在调控毛囊退化过程中的作用	首次揭示了VDR在毛囊退化阶段的关键作用，并通过单细胞RNA测序分析了其机制	NA	探究VDR在毛囊退化过程中的作用机制	VDR缺陷小鼠的毛囊退化过程	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	VDR缺陷小鼠的毛囊样本
16604	2024-08-07	A single-cell transcriptomic atlas characterizes age-related changes of murine cranial stem cell niches 2023-11, Aging cell IF:8.0Q1 DOI:10.1111/acel.13980 PMID:37681346	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了小鼠颅骨干细胞微环境随年龄变化的情况	首次在单细胞分辨率下全面研究了两种不同的颅骨干细胞微环境，并揭示了与年龄相关的变化	NA	研究颅骨干细胞微环境随年龄的变化，以加深对颅骨和缝合生物学的理解，并为抗衰老和再生医学提供治疗靶点	小鼠颅骨干细胞微环境	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	具体样本数量未在摘要中提及
16605	2024-08-07	Metabolic and functional remodeling of colonic macrophages in response to high-fat diet-induced obesity 2023-Oct-20, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2023.107719 PMID:37674984	研究论文	本文研究了高脂饮食诱导的肥胖对结肠固有层巨噬细胞功能和代谢的影响	通过单细胞RNA测序识别出在高脂饮食中增加的负责脂质相关巨噬细胞特征的亚群	NA	探究高脂饮食诱导的肥胖对结肠固有层巨噬细胞的影响	结肠固有层巨噬细胞的功能和代谢	NA	肥胖	单细胞RNA测序	NA	基因表达	NA
16606	2024-08-05	Spatial transcriptomics of a lycophyte root sheds light on root evolution 2023-10-09, Current biology : CB IF:8.1Q1 DOI:10.1016/j.cub.2023.08.030 PMID:37683643	研究论文	本研究通过空间转录组学探讨了蕨类植物根部的进化及相关基因的表达模式	首次揭示了在蕨类植物根冠形成中WOX基因的新潜在作用	主要集中于一种蕨类植物，缺乏对其他种类蕨类植物的比较研究	研究蕨类植物根部的进化及其分子机制	蕨类植物Selaginella moellendorffii的根部	数字病理学	NA	空间转录组学	NA	基因表达数据	根部相关的97个基因
16607	2024-08-05	Noninvasive radiomics model reveals macrophage infiltration in glioma 2023-10-01, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2023.216380 PMID:37660885	研究论文	本研究评估了放射组学生物标志物在胶质瘤中的预后作用，并探讨其与肿瘤微环境和巨噬细胞浸润的关系	文章创新性地开发了放射组学生存生物标志物RadSurv，显示出其在胶质瘤风险分层中的高效性	研究中使用的样本仅限于三个独立的数据集，可能存在外部验证不足的局限性	旨在评估胶质瘤的放射组学生物标志物的预后方面	研究对象为664名胶质瘤患者的术前MRI数据	数字病理学	胶质瘤	MRI	NA	影像	664名胶质瘤患者的术前MRI
16608	2024-08-05	System analysis based on glutamine catabolic-related enzymes identifies GPT2 as a novel immunotherapy target for lung adenocarcinoma 2023-10, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107415 PMID:37657356	研究论文	本文研究了谷氨酸代谢相关酶在肺腺癌中的作用，并确定GPT2作为一种新的免疫治疗靶点	首次揭示了谷氨酸代谢相关酶在肿瘤免疫微环境中的关键作用，并确认了GPT2作为一种有前景的治疗靶点	当前文献关于谷氨酸代谢相关酶在肺腺癌中的功能仍然有限	探讨谷氨酸依赖性对肺腺癌细胞生长的影响及其在肿瘤免疫微环境中的作用	肺腺癌细胞及其相关基因	数字病理学	肺癌	单细胞测序	NA	基因组数据	C57BL/6小鼠中注射了Lewis肺癌细胞
16609	2024-08-05	The role of regulatory T cells in the pathogenesis of acute kidney injury 2023-Oct, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2 DOI:10.1111/jcmm.17771 PMID:37667551	研究论文	本研究探讨调节性T细胞在急性肾损伤发病机制中的作用	揭示了AKI组与非AKI组在调节性T细胞及免疫微环境的显著差异	目前对调节性T细胞与AKI其他免疫微环境成分之间的关系了解不够	研究调节性T细胞在急性肾损伤发病机制中的作用	急性肾损伤患者与正常肾组织的免疫细胞差异研究	数字病理	急性肾损伤	单细胞测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	五个AKI数据集和五个正常肾组织样本
16610	2024-08-07	Intratumoral CD103+ CD8+ T cells predict response to neoadjuvant chemoimmunotherapy in advanced head and neck squamous cell carcinoma 2023-10, Cancer communications (London, England) DOI:10.1002/cac2.12480 PMID:37658605	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和多重免疫荧光染色技术，探讨了肿瘤内CD103+ CD8+ T细胞在预测头颈部鳞状细胞癌患者对新辅助化疗免疫治疗反应中的作用	首次确定肿瘤内CD103+ CD8+ T细胞密度作为新辅助化疗免疫治疗效果的决定因素，并发现PD-1阻断和靶向TREM2+巨噬细胞可能增强这些T细胞的抗肿瘤活性	需要进一步的临床研究来验证提升CD103+ CD8+ T细胞群体的策略	识别预测头颈部鳞状细胞癌患者对新辅助化疗免疫治疗反应的准确生物标志物	头颈部鳞状细胞癌患者及其对新辅助化疗免疫治疗的反应	NA	头颈部鳞状细胞癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、多重免疫荧光（mIHC）	NA	细胞数据、图像数据	来自接受新辅助化疗免疫治疗的头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤样本
16611	2024-08-07	scAAGA: Single cell data analysis framework using asymmetric autoencoder with gene attention 2023-10, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107414 PMID:37660567	研究论文	本文提出了一种名为scAAGA的新型单细胞RNA测序数据分析框架，利用带有基因注意力模块的不对称自编码器来适应性地学习重要的基因特征，以提高聚类效果	scAAGA框架采用不对称自编码器与基因注意力模块，能够适应性地学习单细胞RNA测序数据中的重要基因特征，从而提升聚类效果	NA	提高单细胞RNA测序数据分析中的聚类效果，特别是在COVID-19研究中的应用	COVID-19患者外周血单个核细胞（PBMC）的单细胞RNA测序数据	机器学习	COVID-19	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	不对称自编码器	单细胞RNA测序数据	外周血单个核细胞（PBMC）
16612	2024-08-07	Deciphering the heterogeneity and immunosuppressive function of regulatory T cells in osteosarcoma using single-cell RNA transcriptome 2023-Oct, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107417 PMID:37669584	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术分析了骨肉瘤中的调节性T细胞及其在肿瘤微环境中的作用	首次通过单细胞RNA测序揭示了骨肉瘤中调节性T细胞的异质性及其在肿瘤生长和进展中的作用	研究主要基于数据分析，需要进一步的实验验证	探究骨肉瘤中调节性T细胞的异质性及其在肿瘤微环境中的免疫抑制功能	骨肉瘤中的调节性T细胞及其在肿瘤微环境中的作用	数字病理学	骨肉瘤	单细胞RNA测序	NA	RNA	多个骨肉瘤样本及其邻近组织
16613	2024-08-07	Dual-scRNA-seq analysis reveals rare and uncommon parasitized cell populations in chronic L. donovani infection 2023-Sep-26, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2023.113097 PMID:37682713	研究论文	本研究利用无偏倚的单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）同时分析宿主细胞和利什曼原虫转录组，以识别和注释在慢性感染小鼠的脾脏和骨髓中的寄生细胞群体	本研究采用的双重scRNA-seq方法能够检测到异质性的寄生细胞群体，并首次发现了一些非预期的寄生细胞类型，如巨核细胞、嗜碱性粒细胞和自然杀伤细胞	NA	旨在揭示慢性利什曼原虫感染中罕见的和不常见的寄生细胞群体	慢性感染利什曼原虫的小鼠的脾脏和骨髓中的寄生细胞	数字病理学	利什曼病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	慢性感染利什曼原虫的小鼠的脾脏和骨髓样本
16614	2024-08-05	Single-cell transcriptomics identifies new blood cell populations in Drosophila released at the onset of metamorphosis 2023-09-15, Development (Cambridge, England) DOI:10.1242/dev.201767 PMID:37681301	研究论文	本文通过单细胞转录组学识别出果蝇在蛹期的新型血细胞群体	首次对蛹期果蝇血细胞进行分子描述，并揭示其功能多样化和可塑性	未深入探讨果蝇血细胞在其他生物体内的相似性	研究果蝇在蛹期血细胞的多样性和功能可塑性	果蝇的血细胞，特别是蛹期的血细胞	数字病理学	NA	单细胞转录组学，高分辨率显微镜	NA	分子数据	NA
16615	2024-08-07	Human iPS cell-derived sensory neurons can be infected by SARS-CoV-2 2023-Sep-15, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2023.107690 PMID:37680484	研究论文	研究使用诱导多能干细胞衍生的感觉神经元感染SARS-CoV-2及其变种，通过单细胞RNA测序分析感染情况	首次证明人类感觉神经元可以被SARS-CoV-2及其变种感染，但不能产生传染性病毒	研究仅限于特定SARS-CoV-2株及其变种，未涵盖所有可能的病毒株	探究SARS-CoV-2对周围神经系统的影响	诱导多能干细胞衍生的感觉神经元	NA	COVID-19	单细胞RNA测序	NA	RNA	特定SARS-CoV-2株WA1/2020及其变种delta和omicron
16616	2024-08-07	The regulatory role of cancer stem cell marker gene CXCR4 in the growth and metastasis of gastric cancer 2023-Sep-07, NPJ precision oncology IF:6.8Q1 DOI:10.1038/s41698-023-00436-2 PMID:37679408	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq）揭示了癌症干细胞标记基因CXCR4在胃癌生长和转移中的分子机制	首次通过scRNA-seq和bulk RNA-seq结合的方法，详细研究了CXCR4在胃癌中的作用及其对恶性表型、肿瘤发生和肝转移的影响	研究主要集中在体外和体内功能实验，可能需要更多的临床样本验证	揭示CXCR4作为癌症干细胞标记基因在胃癌生长和转移中的分子机制	胃癌组织样本中的CXCR4基因及其对恶性表型、肿瘤发生和肝转移的影响	数字病理学	胃癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq）	NA	RNA序列	大量胃癌组织样本，以及裸鼠模型
16617	2024-08-07	Large-scale production of human blastoids amenable to modeling blastocyst development and maternal-fetal cross talk 2023-09-07, Cell stem cell IF:19.8Q1 DOI:10.1016/j.stem.2023.08.002 PMID:37683605	研究论文	本文报道了一种优化的人类囊胚样体生成协议，用于高效生产大量高保真的人类囊胚样体，并探讨了其在早期人类发育和植入模型中的应用	提出了一个优化的人类囊胚样体生成协议，提高了生成效率，并进行了蛋白质组学分析和单细胞RNA测序，揭示了囊胚样体与母体-胎儿交流中的新发现	NA	研究人类囊胚样体在早期人类发育和植入模型中的应用	人类囊胚样体及其在母体-胎儿交流中的作用	NA	NA	蛋白质组学分析，单细胞RNA测序	NA	蛋白质组学数据，RNA测序数据	大量高保真的人类囊胚样体
16618	2024-08-05	HMGCS2 serves as a potential biomarker for inhibition of renal clear cell carcinoma growth 2023-09-05, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-023-41343-7 PMID:37670031	研究论文	HMGCS2在透明细胞肾细胞癌中的表达及其作为潜在生物标志物的作用	首次提出HMGCS2作为清晰细胞肾细胞癌的预后标志物	研究主要依赖多数据集分析，缺乏临床试验验证	探讨HMGCS2在肾透明细胞癌中的作用及其作为生物标志物的潜力	主要关注肾透明细胞癌及其与HMGCS2的关系	数字病理学	肾癌	单细胞测序	NA	基因组数据	多癌种数据库中的肿瘤组织与正常组织对照
16619	2024-08-07	Single cell multiomic analysis reveals diabetes-associated β-cell heterogeneity driven by HNF1A 2023-09-05, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-023-41228-3 PMID:37669939	研究论文	本研究通过整合单细胞转录组、单核染色质可及性和细胞类型特异性3D基因组图谱，揭示了与2型糖尿病相关的β细胞异质性，并发现HNF1A是其主要驱动因素	开发了一种计算方法来解析单个β细胞之间的供体内和供体间异质性，并揭示了HNF1A在β细胞异质性中的作用	NA	研究2型糖尿病相关的β细胞异质性及其机制	人类胰岛中的β细胞	数字病理学	糖尿病	单细胞转录组、单核染色质可及性分析	NA	转录组、染色质可及性数据	来自多个供体的人类胰岛样本
16620	2024-08-07	Neutrophil metalloproteinase driven spleen damage hampers infection control of trypanosomiasis 2023-09-05, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-023-41089-w PMID:37669943	研究论文	本文研究了中性粒细胞金属蛋白酶在布氏锥虫感染中对脾脏损伤的影响及其对睡眠病感染控制的影响。	首次揭示了布氏锥虫感染导致脾脏中四种中性粒细胞亚群的扩张和分化，并发现这些中性粒细胞通过金属蛋白酶导致脾脏结构重塑。	NA	探讨中性粒细胞在布氏锥虫感染中的作用及其对脾脏结构和功能的影响。	布氏锥虫感染引起的中性粒细胞亚群及其对脾脏的影响。	免疫学	睡眠病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	NA